pubmed检索方法
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主题词概念与优势：统一概念，可扩展 检索方法
例：欲查肾衰竭（renal failure）饮食疗法(diet therapy) 的相关 文献？
Mesh Search
Mesh Search
Subheadings
款目词
树状词表
检索
检索结果
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
（五）Gopubmed知识挖掘分析工具
Gopubmed概述 2. Gopubmed的分类统计功能
1.
(1) 主题分布 (2) 作者分布 (3) 文献来源分布 (4) 年度分布
3.
Gopubmed与SCI信息分析功能比较
1.
(1) 历史悠久 (2) 收录范围广 (3) 质量高 (4) 检索简便 (5) 回溯检索能力强
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（二）编排结构
主题部分 2. 著者部分 3. 医学综述题录 4. 医学主题表
GoPummed
第二节 Pubmed与NCBI
四、PubMed Central：免费全文数据库
五、Entrez跨库检索
Pubmed Central
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Entrez search
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery
（一）My
1.
NCBI个性化功能
保存检索策略及E-mail发送功能 2. 保存检索结果 3. 过滤检索结果
（二）Linkout：全文链接 （三）批量引文匹配器 （四）临床试验数据库
My NCBI
LinkOUT
NCBI Batch Citation Matcher
Clinical Trail
Journal
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（七）单篇引文匹配器
输入题录信息，查找特定文献进行补缺。 刊名要准确，缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如：已知：第一著者是Challis DE，出处是Pediatric Research； 2000，47（3）：309-15，要求写出其他合著者
Institute of Health)：美国国立卫生研究
院 NLM(Natioanl Library of Medicine)：美国国立医学图 书馆 NCBI(National Center for Biotechnology Information， 美国生物技术信息中心) Entrez
第三章 外文信息资源检索-PUBMED
南京医科大学图书馆
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（一）美国医学索引概况
收录范围：世界上著名大型医学文献题录型检索期刊 2. 文献类型：论文、社论、通信、综述等 3. Index Medicus特色
（五）Pubmed高级检索
1. 检索构建器 search builder 2. 检索历史
Advanced Search
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（六）期刊数据库检索
通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。 提供电子原文的超链键。
new england journal of medicine clin exp immunol[so] 1059-1524
NCBI与Entrez
NCBI创办了生物技术和生命科学的优秀网站——Entrez— —基于多种数据库的集成检索系统，也是网上最大的免费 检索生物医学资源的网站。 通过该平台可检索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库 包含文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质 结数据库、种群研究库、表达库、完全人类基因组库、分 类信息库。 其中，Pubmed属于文献数据库。文献数据库主要收藏生 物医学方面的期刊、图书等。
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
3. 截词检索功能： 截词符：”*”作为通配符进行截词检索。 例如：bacter* （系统会找到前一部分是bacter的单词， 如： bacteria、bacterium等） 4. 短语精确检索 用双引号来强制系统进行短语检索。 例如：“oxygen free radicals” （不再自动转换匹配和 扩展 检索）
二、Medline数据库
（一）Medline数据库概况 （二）Medline的收录范围
1966年以来的70多个国家和地区，37种语言的近5600
种期刊文献
（三）Medline数据库的检索方法
第二节 Pubmed与NCBI
NIH、NLM、NCBI与Entrez
NIH(National
(1)
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（一）Pubmed收藏范围：
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Record Suppled by Publisher:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
wenku.baidu.com
第二节 Pubmed与NCBI
一、Entrez资源整合系统
NCBI，基于Web界面的综合生物信息数据库，网址为 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) Taxonomy
(1)
（二）Pubmed数据库结构（P135）
字段限定符：[ ] 例如：Stem[ti] AND neuroscience
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
1.
基本检索
Pubmed
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（九）检索结果的显示、评价、分析与管理
1. 结果显示： 2. 检索结果的保存及输出 3. 检索结果的记录显示 4. 检索结果的限定和过滤
检索结果
显示方式
保存方式
详细显示
结果限定
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
1.
(1) 字顺表 (2) 树状结构表 (3) 副主题词表 (4) 收编期刊目录
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（三）检索方法
主题途径检索 2. 著者途径检索
1.
（四）检索举例
第一节 美国医学索引与Medline
Gopubmed是一种Pubmed检索工具，是对于 Pubmed资源的另一种组合检索方式，它比 Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我 们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研 究过程、研究动态和各种信息之间的相关性
摘自上海交通大学-生命医药学科博客： http://blog.lib.sjtu.edu.cn/lam/article.asp?id=269
Single Citation Matcher
输入已知条件
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（八）临床查询
1. Clinical Study Categories 2. Systematic Review 3. Medical Genetics
Clinical Queries
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
1. 逻辑运算符: AND OR NOT 如：common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
2. 词语自动转换：自然语言转换 Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 、刊名转换表、短语 表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。 如：renal failure （肾衰竭） 转换为 "renal insufficiency"[MeSH Terms] OR ("renal"[All Fields] AND "insufficiency"[All Fields]) OR "renal insufficiency"[All Fields] OR ("renal"[All Fields] AND "failure"[All Fields]) OR "renal failure"[All Fields]
Pubmed.cn
由丁香园创建，基于Pubmed数据。
高级搜索
图库搜索
The end
See you next time!
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
其他 著者检索 姓名,姓在前,名首字母在后限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（四）Pubmed主题词检索
例：欲查肾衰竭（renal failure）饮食疗法(diet therapy) 的相关 文献？
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Subheadings
款目词
树状词表
检索
检索结果
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
（五）Gopubmed知识挖掘分析工具
Gopubmed概述 2. Gopubmed的分类统计功能
1.
(1) 主题分布 (2) 作者分布 (3) 文献来源分布 (4) 年度分布
3.
Gopubmed与SCI信息分析功能比较
1.
(1) 历史悠久 (2) 收录范围广 (3) 质量高 (4) 检索简便 (5) 回溯检索能力强
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（二）编排结构
主题部分 2. 著者部分 3. 医学综述题录 4. 医学主题表
GoPummed
第二节 Pubmed与NCBI
四、PubMed Central：免费全文数据库
五、Entrez跨库检索
Pubmed Central
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Entrez search
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery
（一）My
1.
NCBI个性化功能
保存检索策略及E-mail发送功能 2. 保存检索结果 3. 过滤检索结果
（二）Linkout：全文链接 （三）批量引文匹配器 （四）临床试验数据库
My NCBI
LinkOUT
NCBI Batch Citation Matcher
Clinical Trail
Journal
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（七）单篇引文匹配器
输入题录信息，查找特定文献进行补缺。 刊名要准确，缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如：已知：第一著者是Challis DE，出处是Pediatric Research； 2000，47（3）：309-15，要求写出其他合著者
Institute of Health)：美国国立卫生研究
院 NLM(Natioanl Library of Medicine)：美国国立医学图 书馆 NCBI(National Center for Biotechnology Information， 美国生物技术信息中心) Entrez
第三章 外文信息资源检索-PUBMED
南京医科大学图书馆
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（一）美国医学索引概况
收录范围：世界上著名大型医学文献题录型检索期刊 2. 文献类型：论文、社论、通信、综述等 3. Index Medicus特色
（五）Pubmed高级检索
1. 检索构建器 search builder 2. 检索历史
Advanced Search
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（六）期刊数据库检索
通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。 提供电子原文的超链键。
new england journal of medicine clin exp immunol[so] 1059-1524
NCBI与Entrez
NCBI创办了生物技术和生命科学的优秀网站——Entrez— —基于多种数据库的集成检索系统，也是网上最大的免费 检索生物医学资源的网站。 通过该平台可检索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库 包含文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质 结数据库、种群研究库、表达库、完全人类基因组库、分 类信息库。 其中，Pubmed属于文献数据库。文献数据库主要收藏生 物医学方面的期刊、图书等。
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
3. 截词检索功能： 截词符：”*”作为通配符进行截词检索。 例如：bacter* （系统会找到前一部分是bacter的单词， 如： bacteria、bacterium等） 4. 短语精确检索 用双引号来强制系统进行短语检索。 例如：“oxygen free radicals” （不再自动转换匹配和 扩展 检索）
二、Medline数据库
（一）Medline数据库概况 （二）Medline的收录范围
1966年以来的70多个国家和地区，37种语言的近5600
种期刊文献
（三）Medline数据库的检索方法
第二节 Pubmed与NCBI
NIH、NLM、NCBI与Entrez
NIH(National
(1)
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（一）Pubmed收藏范围：
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Record Suppled by Publisher:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
wenku.baidu.com
第二节 Pubmed与NCBI
一、Entrez资源整合系统
NCBI，基于Web界面的综合生物信息数据库，网址为 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) Taxonomy
(1)
（二）Pubmed数据库结构（P135）
字段限定符：[ ] 例如：Stem[ti] AND neuroscience
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
1.
基本检索
Pubmed
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（九）检索结果的显示、评价、分析与管理
1. 结果显示： 2. 检索结果的保存及输出 3. 检索结果的记录显示 4. 检索结果的限定和过滤
检索结果
显示方式
保存方式
详细显示
结果限定
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
1.
(1) 字顺表 (2) 树状结构表 (3) 副主题词表 (4) 收编期刊目录
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引（Index Medicus, IM）
（三）检索方法
主题途径检索 2. 著者途径检索
1.
（四）检索举例
第一节 美国医学索引与Medline
Gopubmed是一种Pubmed检索工具，是对于 Pubmed资源的另一种组合检索方式，它比 Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我 们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研 究过程、研究动态和各种信息之间的相关性
摘自上海交通大学-生命医药学科博客： http://blog.lib.sjtu.edu.cn/lam/article.asp?id=269
Single Citation Matcher
输入已知条件
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（八）临床查询
1. Clinical Study Categories 2. Systematic Review 3. Medical Genetics
Clinical Queries
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
1. 逻辑运算符: AND OR NOT 如：common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
2. 词语自动转换：自然语言转换 Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 、刊名转换表、短语 表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。 如：renal failure （肾衰竭） 转换为 "renal insufficiency"[MeSH Terms] OR ("renal"[All Fields] AND "insufficiency"[All Fields]) OR "renal insufficiency"[All Fields] OR ("renal"[All Fields] AND "failure"[All Fields]) OR "renal failure"[All Fields]
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由丁香园创建，基于Pubmed数据。
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The end
See you next time!
第二节 Pubmed与NCBI
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（三）Pubmed基本检索
2.
Pubmed的检索规则
其他 著者检索 姓名,姓在前,名首字母在后限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU]
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