materialstudio教程PPT课件

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1. 生成Projects
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生成Projects
(1).运行Material studio (2).生成Project
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2.打开并且观察3D 文档
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打开并且观察3D 文档
(1)调整显示风格 在 3D 结构上单击右键 并选择Display Style
对话框中的各选项的意义如下 Atom栏 Line：线状模型 Stick：棍状模型 Ball and stick：球棍模型 CPK：球堆砌模型 Polyhedron：多面体堆积模型（晶体） Lattice 栏: Display:显示单个晶胞或者元胞 Range：显示在X、Y、Z 方向上晶胞的数量 Lattice:显示晶胞边界的风格
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Байду номын сангаас
4.观察并且处理研究表格文档
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观察并且处理研究表格文档
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3.绘制苯甲酰胺分子
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绘制苯甲酰胺分子
下面是要建造的苯甲酰胺结构：
(1).生成3D 文档
➢ 在菜单上选择 New，并且选择3D Atomistic Document 后单 击OK此时文件名称出现。
➢ 在左侧的Project Explorer 中，名称为3D Atomistic Document.xsd，在其上单击鼠标右键，选择ReName 进行改 名并进行保存。
单击原子将键连接到该原子上，然后移动鼠标并在合适 位置单击设置另一个原子。
要结束绘制，请在最后一个原子上双击鼠标左健或者按
下键盘上的 Esc 键。
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绘制苯甲酰胺分子
(3).将分子改变为球棍模型
在 Display Style 对话框 中进行详细操作
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绘制苯甲酰胺分子
(4).绘制氧原子
在 Sketch Atom 的选项箭头下选择氧原子，以相同的 方法绘制氧原子。
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绘制苯甲酰胺分子
(7).调整氢原子并进行整理
✓ 可以通过程序自动加氢而不需要单独的为每个原子加上 合适的氢原子。
✓ 在 Sketch 工具栏上，单击Auto Hydrogen 按钮为结构 加入合适的氢原子。
✓ 按下Clean按钮修正结构的几何，这样结构中的键、键角 和扭转角都会变得具有化学合理性。
下拉菜单中选择Resonant 或者Kekule，会将其转换为另 一种对应结构。
同样的选项可以在Atom and Bond 工具栏的Bond 按钮下 找到。
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绘制苯甲酰胺分子
(9).监控并且调整距离 ➢ 可以在 Material Studio 的Measure/Change 中监控并 调整原子间距离、角度和扭转角。 ➢ 在 Measure/Change 下，选择Distance。选择两个原子， 则这两个原子之间的距离会显示出来。 ➢ 对于成键原子（或者完全不相关原子），可以通过在窗 口中按住鼠标左键进行拖动来。 ➢ 改变相互之间距离（第一个选中的原子将会被固定）。
Materials Studio 入门教程
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Materials Studio 入门教程
你将学到：
1.生成Projects 2.打开并且观察3D 文档 3.绘制苯甲酰胺分子 4.观察并且处理研究表格文档 5.处理分子晶体：尿素 6.建造Alpha 石英晶体 7.建造多甲基异丁烯酸盐 8.保存Project 并结束
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打开并且观察3D 文档
(2)改变3D 结构的视图
1. Rotate:旋转结构视图。 2. Zoom:向上或者右侧拖动可以增大所选结构的视图；
向下或者向左侧拖动会缩小所选结构的视图。 3. Translation:将结构沿着不同的方向平移。 4. Fit to View:根据窗口的尺寸，为3D 结构选择合
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绘制苯甲酰胺分子
(9).监控并且调整距离 ➢ 角度和扭转角的操作同上。 ➢ 完成后就可以使用 View | Explorers | Properties Explore 来查看所构造分子的信息了。 ➢ Properties Explore 可以自动显示所选对象的性质，包 括原子、键、分子以及距离、角度和扭转角等。 ➢ 可以在相应条目上双击鼠标左键进行改动，改变后的变 化会出现在结构上。
适的大小。 5. Recenter:将结构放置到窗口中心，结构大小不变。 6. Reset View:将结构放置到窗口中原来的位置，并
恢复原有大小
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打开并且观察3D 文档
(3).选择对象的各种类型 ➢ 在 3D View 工具栏上选择3D Viewer Selection Mode。 ➢ 通过单击原子、键来选择相应的对象该对象变为黄色表 示已经被选中。 ➢ 通过鼠标的托拽操作可以选择一定区域内的所有对象， 包括原子和键。 ➢ 在结构中的某个原子或键上双击鼠标可以选择整个结构。
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绘制苯甲酰胺分子
(2).绘制分子环和原子链
在 Sketch 菜单上选择Sketch Ring 工具，并移动到文 档中绘制环（环的右侧会显示环的尺寸，可以在键盘上 按下数字键3-8 来改变环的大小）。
现在选择 Sketch Atom 工具，移动到环上，当原子变为 绿色后表示可以进行绘制操作。
(5).编辑原子类型
选中某个原子后，在Modify 菜单下的Modify Element 中选择Oxygen 来改变原子类型。
或者可以在Sketch 工具栏中选择Modify Element 按
钮来直接改变原子类型。
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绘制苯甲酰胺分子
(6).编辑键的类型 首先选择两个原子之间的键，然后在 Sketch 工具 栏上的Modify Bond Type 按钮来改变。 键的类型，同样的选项也可以在Modify 菜单下的 Modify Bond Type 中找到。 如果要选择多个原子或键，请按下 Shift 后再进 行选择。 如要取消选择，请在结构外单击鼠标左键。
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绘制苯甲酰胺分子
(8).将共轭结构转化为凯库勒式
Material Studio可以很轻松的在共轭结构和凯库勒式间 进行转化。
从 Build 菜单中选择Bond，此选项将进行Bond 计算工 作。
在 Bonding Scheme 栏中的选项部分，确定Convert representation to 被选中，并在右侧的。