生物样本库岗前培训-信息化管理体系

样品及样品源所有相关详细 信息，用户自己都可以通过 自定义字段实现所有功能， 比如链接样品图片、样品信 息文档、样品信息视频等。
2、技术员执行操作流程（SOP）
3、用户检索和使用库存样本
即时查询
智能搜索
报告模板
提纲
• 生物样本用于医学转化研究的流程 • 信息化体系中涉及的实体、数据和联系 • 信息化体系的核心目标和实现手段 • 信息化实践中遇到的矛盾和问题
Leabharlann Baidu18
如何规划信息化管理体系
• 保存那些信息？ • 在何时、何地、何节点，由何人保存？ • 保存为何种形式？保存于何种介质？ • 信息是否对应于某个实体？是否唯一对应？ • 信息是否会更新？何人有更新权限？更新过程如何记录？ • 信息如何备份？如何校验？ • 是否由更原始的数据加工产生？加工标准为何？会否变动？ • 信息的呈现形式是否合乎常理？会否导致误解？
患者
姓名、性别、年龄、民族、联系方式 临床诊断、发病日期、发病部位、家 族史、症状、体征、实验室检查、内 窥镜检查、影像学检查、治疗情况
大体形态、肿瘤最大径、切 缘情况、浸润范围、转移部 位、检出淋巴结个数、阳性 淋巴结个数、TNM分期
临床科室 研究中心 研究人员
生物分子
核酸提取仪 组织研磨仪 分光光度计 其他设备
www.biobank.org.cn
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提纲
• 生物样本用于医学转化研究的流程 • 信息化体系中涉及的实体、数据和联系 • 信息化体系的核心目标和实现手段 • 信息化实践中遇到的矛盾和问题
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生物样本库≈生物信息库
生物样本 （潜在信息）
患者信息
基因突变、 蛋白表达、 表观修饰、
等等
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Lifecycle 运转流程
液氮罐 超低温冰箱 条码打印机 扫描仪
存放位置、冻存时间、重量 或大小、处理方法、保存条 件、条码编号、分管信息
样本 样本 管理 储存
新鲜组织
配套 病案 设备 随访
随访状态 随访结局 末次随访时间 复发转移情况
冻存组织
样本库 随访人员
样本库 技术员
低温维持、冻融情况
手术器械 冰冻切片机 等病理设备
病理科 病理医生
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信息化体系的核心要求
• 最终目的：低成本高效率地获取数据，验证临床医学问题 和科学假设。
• 核心要求：
安全可靠 （时间跨度长，涉及人员多，记录信息多，信息类型杂） 标准统一 （将样本用于实验分析，数据用于统计分析的基本要求） 灵活创新 （临床转化研究的进展，新的关注点不断涌现）
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提纲
• 生物样本用于医学转化研究的流程 • 信息化体系中涉及的实体、数据和联系 • 信息化体系的核心目标和实现手段 • 信息化实践中遇到的矛盾和问题
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涉及的实体、数据和联系
• 以信息化的形式呈现样本库中的实体，实体关联的数据， 实体与实体之间的联系，数据和数据之间的联系。
• 为用户（临床研究工作者）提供合用的生物样本和数据， 验证临床问题和科学假设。
患者
保障系统
生物分子
样本 样本 管理 储存
配套 病案 设备 随访
新鲜组织
冻存组织
样本库 技术员
低温维持、冻融情况
温控探头 短信发射器 主控服务器
低温 监控
8
信样息本库流 数据
管理员
备份
临床科室 临床医生
FTP服务器
数据库服务器
来源样本、浓度、质量 检测和研究结果（如基因突 变、蛋白表达、表达谱等｝
新鲜组织
随访状态 随访结局 末次随访时间 复发转移情况
低温维持、冻融情况
6
人员流
临床科室 临床医生
患者
临床科室 研究中心 研究人员
生物分子
样本 样本 管理 储存
配套 病案 设备 随访
新鲜组织
冻存组织
样本库 技术员
样本库 随访人员
病理科 病理医生
7
信样息本库流 数据
管理员
备份
FTP服务器
数据库服务器
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信息化规划的简单流程
• 以保存一份血清和相关信息为例
1、系统管理员规划待保存的信息
虚拟冰箱/液氮罐
设置冰箱
通过自定义层，架，列，样品盒 等的空间位置，可完全模拟任何 品牌冰箱/冰柜/液氮罐的真实储存 空间。
自定义样品盒类型
样品及样品源信息管理
自定义字段功能
字段类型
样品源字段管理
样品字段管理 自定义样品信息
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管理员视角
样本库管理员 样本库规划者
样本库
交互界面 管理系统 操作系统 底层硬件
样本查询录 入客户端
条码打印客 户端
温度监控客 户端
样本管理系 统
样本管理/条 码打印系统
温度监控系 统
样品盒 定位架
操作系统
操作系统
操作系统
冰箱
服务器配置
条码打印机
服务器、信 号接收器、 短信发射器
房间（电气、 网络、温度、 湿度、承重）
生物分子
存放位置、冻存时间、重量 或大小、处理方法、保存条 件、条码编号、分管信息
姓名、性别、年龄、民族、联系方式 临床诊断、发病日期、发病部位、家 族史、症状、体征、实验室检查、内 窥镜检查、影像学检查、治疗情况
患者
样本 样本 管理 储存 配套 病案 设备 随访
冻存组织
大体形态、肿瘤最大径、切 缘情况、浸润范围、转移部 位、检出淋巴结个数、阳性 淋巴结个数、TNM分期
Content 操作对象
患者
信息
开发
样本
软件
硬件
人员
取样
利用
储存
Infrastructure 基础架构
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样本流
患者
核酸提取仪 组织研磨仪 分光光度计 其他设备
生物分子
液氮罐 超低温冰箱 条码打印机 扫描仪
样本 储存 配套 设备
冻存组织
新鲜组织
手术器械 冰冻切片机 等病理设备
5
信息流
来源样本、浓度、质量 检测和研究结果（如基因突 变、蛋白表达、表达谱等｝
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信息化体系中的实体和数据
• 标本 • 患者（标本来源） • 操作者 • 储存空间 • 仪器/设备 • 检测/研究结果 • ……
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数据的储存形式
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实体和数据之间的对应关系
• 标签 • 唯一号
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数据之间的逻辑关系
以肿瘤患者为例 1. 出生日期 2. 确诊日期 3. 手术前放化疗日期 4. 手术治疗日期 5. 手术后放化疗日期 6. 进展日期（复发，转移） 7. 死亡日期 8. 末次随访日期
温控探头 短信发射器 主控服务器
低温 监控
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用户视角
临床科室 研究中心 研究人员
样本 • 组织 实物 • 血清
样本 • 病理资料 信息 • 随访资料 查询 • 检索系统 手段 • 条码标签
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技术员视角
样本库技术员
样本库 随访人员
冰箱、液氮罐 样品盒
条码打印机、扫描仪 患者和样品信息录入
冰箱温度 随访信息更新