农作物特种遗传资源共享平台的建立

　南京农业大学学报　2011,34(6):7-12　Journal of Nanjing Agricultural University http :==================================================================================================================================================================// 收稿日期:2010-12-10

基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金(KYZ200919);教育部科技基础条件平台项目(505005)

作者简介:叶锡君,副教授,研究方向为农业信息系统㊁生物信息学和网络安全,E⁃mail :yexj@ ㊂*通讯作者㊂

叶锡君,孙敬,张天真.农作物特种遗传资源共享平台的建立[J ].南京农业大学学报,2011,34(6):7-12

农作物特种遗传资源共享平台的建立

叶锡君1*,孙敬2,张天真2

(1.南京农业大学信息科技学院,2.南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095)

摘要:农作物特种遗传资源共享平台(CGRSP )采用了国家种质资源描述规范和数据标准,整合教育部所属高校农作物特种遗传资源,对其中水稻㊁大豆等十几种主要作物的创新种质㊁遗传材料㊁代表性地方品种等特种遗传资源进行数字化㊁标准化整理㊂平台基础是采用 框架和C#构建的具有高校特色的农作物特种遗传资源数据库,收集保存了12万份共性品种资源,具有动态创建遗传资源个性表的功能,同时实现了基于Internet 的用户角色分配㊁多种检索㊁种质图片管理㊁数据交换和分析统计等功能,使之成为作物育种㊁生物技术研究以及农业生产所依托的基础平台㊂

关键词:遗传资源;种质;共享平台;农作物;

中图分类号:S126;TP319 文献标志码:A 文章编号:1000-2030(2011)06-0007-06

Genetic resources sharing platform construction of crops

YE Xi⁃jun 1*,SUN Jing 2,ZHANG Tian⁃zhen 2

(1.College of Information Science and Technology ,2.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement ,Nanjing Agricultural University ,Nanjing 210095,China )Abstract :Several main crops (such as soybean ,paddy rice ,and so on.)genetic resources including innovation germplasm ,heredity materials and representative local varieties ,etc.were reorganized digitally and standardized using crop genetic resources sharing platform (CGRSP )which adopted the national germplasm resources description standard ,data standard and integrated crop genetic re⁃sources of the universities subordinated to Ministry of framework and C#were mainly adopted to construct university characteristic database of CGRSP which preserved 120thousand general character resources and could create dynamic

databases of germplasm individuality.Based on the Internet sharing platform ,multifunction such as user role assignment ,resource retrieval ,pictures process ,data exchange and analysis statistics could be executed ,along with serving as foundation platform for plant breeding ,biological technology research and agricultural production.Key words :genetic resources ;germplasm ;sharing platform ;crop ; 农作物特种遗传资源是指可用于遗传育种研究的各种作物具特异性状的材料(品种㊁系)㊁突变体㊁近等基因系(NIL )㊁重组近交家系群体(RIL )㊁回交自交系群体㊁双单倍体(DH )群体㊁同核异质系㊁野生种质渐渗系㊁基因聚合系㊁染色体变异体(染色体结构变异体,如易位㊁缺失㊁倒位和重复等;染色体数量变异体,如单体㊁缺体㊁三体㊁四体㊁端体㊁附加系㊁代换系等)等㊂它是长期以来在遗传研究㊁分子生物学研究中由科研人员人工创造㊁人为诱变或自然突变而获得的创新种质,这些材料对于品种选育㊁基因定位㊁基因分离克隆和开展人工定向育种㊁多目标性状同步改良㊁育种目标多样化等具有重要作用㊂

各国政府都十分重视遗传资源的收集㊁保存㊁评价和利用工作,把遗传资源作为国家公共资源,向全社会开放㊂同时为了提高资源的利用效率,采用现代信息技术㊁网络技术,建立综合或专业数据库,实现了所有种质资源的网络信息共享㊂美国较早利用计算机对种质资源进行管理,建立了国家植物种质资源系统(National Plant Germplasm System ),作为农作物种质资源收集㊁保存㊁评价㊁鉴定和分发的平台㊂为其配套的种质资源信息网络系统(Germplasm Resources Information Network ,GRIN ),目前已有2237个属,13619个种,共542526份种质资源的网络信息化共享,并且每天在不断增加,是世界上最大的农作物种质资源信息系统之一[1]㊂2008年美国农业研究局(Agricultural Research Service )和国际生物多样性中心(Biodiversity International )及全球农作物多样性信托基金(Global Crop Diversity Trust )共同启动了 全球种质资源信息网络(GRIN⁃Global )”项目,旨在建立一个全球性的以GRIN 为原型㊁采用统一标准㊁基于互联