生物统计学(第3版)杜荣骞 课后习题答案 第十二章 实验设计
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第十二章实验设计
12.1一项关于在干旱地区生长的一种杨树(Populus euphratica),在土壤中的水分逐渐丧失后,其基因表达、蛋白谱、生态生理学及生长性能等方面产生可逆性改变的研究。作者在本实验的5个时间点上(H5为对照),用qPCR方法度量了该杨树叶子中的三个基因的转录丰度比[83],表中给出的为阵列数据:
GenBank ID 基因H1H2H3H4H5
AJ 780 423 半胱氨酸蛋白酶0.7 1.0 2.3 13.1 1.9
AJ 780 698 环核苷酸和钙调节的离子通道 1.5 1.2 3.0 4.3 1.5
AJ 777 362 核糖体蛋白 1.1 1.1 1.0 0.9 1.2
借用上述数据,以三个基因作为三个区组,计算在5个时间点上转录丰度比差异是否显著?
答:随机化完全区组实验设计方差分析的程序,类似于两因素交叉分组实验设计。以下是本题的程序和结果:
options linesize=76 nodate;
data poplar;
do block=1 to 3;
do time=1 to 5;
input trans @@;
output;
end;
end;
cards;
0.7 1.0 2.3 13.1 1.9
1.5 1.2 3.0 4.3 1.5
1.1 1.1 1.0 0.9 1.2
;
proc anova;
class block time;
model trans=block time;
run;
The SAS System
The ANOVA Procedure
Class Level Information
Class Levels Values
block 3 1 2 3
time 5 1 2 3 4 5
Number of observations 15
The SAS System
The ANOVA Procedure
Dependent Variable: trans
Sum of
Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 6 72.5560000 12.0926667 1.53 0.2809
Error 8 63.1013333 7.8876667
Corrected Total 14 135.6573333
R-Square Coeff Var Root MSE trans Mean
0.534848 117.6745 2.808499 2.386667
Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F block 2 18.82533333 9.41266667 1.19 0.3519 time 4 53.73066667 13.43266667 1.70 0.2416
从上表中的结果可以看出,如果按随机化完全区组设计进行分析,不同时间点之间的差异不显著。
归纳成一般格式的方差分析表如下:
变差来源平方和自由度均方 F P
区组18.825 333 33 2 9.412 666 67 1.19 0.351 9
时间点53.730 666 67 4 13.432 666 67 1.70 0.241 6
误差63.101 333 33 8 7.887 666 7
总和135.657 333 3 14
12.2测定了新疆维吾尔、哈萨克、柯尔克孜族乡村不同年龄的男生(n =100),50米跑的平均成绩(s),结果如下[10]:
年龄/a 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 维吾尔10.54 10.16 9.58 9.41 9.11 8.83 8.65 8.24 7.89 7.85 7.70 7.41 哈萨克10.27 9.70 9.38 9.21 8.84 8.74 8.32 7.92 7.69 7.48 7.40 7.40 柯尔克孜11.19 10.66 10.12 9.84 9.48 9.24 8.94 8.50 8.27 7.91 7.76 7.63 该试验的目的,是为了推断不同民族间,男生50米跑的平均成绩差异是否显著。首先判断该试验属于一种什么设计,然后再计算。
答:该试验为随机化完全区组设计,年龄为区组。程序不再给出,下面只给出结果。
The SAS System
The ANOVA Procedure
Class Level Information
Class Levels Values
block 12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
people 3 1 2 3
Number of observations 36
The SAS System
The ANOVA Procedure
Dependent Variable: second
Sum of
Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F Model 13 38.51329167 2.96256090 193.30 <.0001 Error 22 0.33718333 0.01532652
Corrected Total 35 38.85047500
R-Square Coeff Var Root MSE second Mean
0.991321 1.404826 0.123800 8.812500
Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > F block 11 36.34027500 3.30366136 215.55 <.0001 people 2 2.17301667 1.08650833 70.89 <.0001
从方差分析可知,不同民族间,男生50米跑的平均成绩差异极显著。
归纳成一般格式的方差分析表如下:
变差来源平方和自由度均方 F P
区组36.340 275 00 11 3.303 661 36 215.5
5
<0.000 1
民族间2.173 016 67 2 1.086 508 33 70.8
9
<0.000 1
误差0.337 183 33 22 0.015 326 52
总和38.850 475 00 35
12.3测试了新疆维吾尔、哈萨克、柯尔克孜族乡村不同年龄男生(n =100)立位体前屈的平均次数,结果如下[10]:
年龄/a 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 维吾尔 6.65 7.28 7.65 7.63 7.72 7.79 9.12 9.27 12.87 12.83 14.91 16.30 哈萨克 6.94 7.31 6.03 6.50 7.23 6.36 7.52 7.47 10.31 11.91 12.89 13.08 柯尔克
孜
5.15 5.56 5.83
6.38 6.80
7.12
8.16 10.77 12.03 15.74 16.89 17.65 与上题类似,请推断三个不同民族间,男生立位体前屈平均次数差异是否显著?
答:与上题类似,以下只给出结果。
The SAS System
The ANOVA Procedure
Class Level Information
Class Levels Values
block 12 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
people 3 1 2 3
Number of observations 36
The SAS System
The ANOVA Procedure
Dependent Variable: number
Sum of
Source DF Squares Mean Square F Value Pr > F
Model 13 418.8897361 32.2222874 22.21 <.0001
Error 22 31.9233611 1.4510619
Corrected Total 35 450.8130972
R-Square Coeff Var Root MSE number Mean