转座子在基因工程中的应用
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3. 转座机制
(1) 复制型转座
特点: 转座以后原来位置上的转座子保持不变 在新的位置上的转座子的两侧出现正向重复序列 转座过程出现共联体。 以细菌的转座子Tn3为例: 切开:转座酶识别受体质粒上的 靶序列,并在该序列两侧各一条 单链上造成一个切口,切口之间 的距离决定了转座后两侧正向重 复序列的长度。
2. 转座子类型
转座子是染色体DNA上可复制和移动的DNA序列。一段DNA顺序可以从原 位上单独复制或断裂下来,环化后插入另一位点,并对其后的基因起调控 作用,此过程称转座。这段序列称跳跃基因或转座子,可分插入序列 ( insertion sequence, IS)、转座子( transposon,Tn)、Mu 噬菌体 ( Mu phage)。按转座方式分复制性和非复制性转座子。
它是以两种方式转座。在感染宿主细胞时,Mu 不经复制便整合进宿主基因 组;在溶菌周期中,拷贝数通过复制转座而扩增。两种方式的转座在转座子 和靶位点间有相同反应机制,但反应结果不同
2.2 真核生物中的转座因子
(1)酵母菌基因组中的转座子
目前在酵母中研究得较清楚的转座子是Ty( transposon yeast,Ty)系列, 它们的一般长度约为5 900 bp,两端含有两个称为δ的同向长末端重复序列 ( LTR) ,长度约340 bp。δ 因子大约由70%的AT组成,每一个δ 因子都 含有一个启动子和一段被转座酶识别的序列
Mu是DNA噬菌体,含有38kb线状DNA,两端各带一小段大肠杆菌的DNA, 这与该噬菌体插入大肠杆菌染色体上有关。
M u的转座频率比一般的转座子要高。Mu的复制能力和它的转座能力是密切 相关的,M u的生存依靠转座,复制转座是其正常生活史中的一种方式。在 转座过程中,它摆脱两端原有的细菌DNA 而转座到新的某个位点上。
2.1 原核生物中的转座因子 (1) 插入序列IS
IS是最简单的转座因子,不含 任何宿主基因的可转位的DNA 序列称为插入序列。它们是细 菌染色体或质粒DNA 的正常组 成部分。
IS本身没有任何表型效应,只 携带和它转座作用有关的基因, 称为转座酶基因。
除IS1以外,所有已知IS序列都只有一个开放阅读框( open reading frame,ORF) ,翻译起始位点紧接第一个反向重复区,终止点位于第 二个反向重复区或重复区附近。IS1含有两个分开的读码框,只有移码 通读才能产生功能型转座酶。一般情况下,每个IS转座频率是10- 4 ~ 10- 3/世代,恢复频率则低得多,为10- 7 ~ 10- 6/世代。
不含IS的Tn称为简单转座子( simple transposon) ,如Tn3等
无论是IS或Tn的两端都有反向重复序列,两端反向重复序列的存在与它 们的转座功能密切相关。如Tn3的两个IR中任一个顺式作用元件缺失都会 阻止转座。
TnA转座子家族
(3)转座噬菌体
1963年发现了一种特殊的噬菌体,称为Mu( mutator phage),它是大肠 杆菌的一种温和噬菌体,M u几乎可插入宿主染色体任何一个位置上。它 的两端没有黏性末端,插入某基因中就引起该基因突变。其整合方式不同 于λ 噬菌体,而类似于转座因子的作用。
酵母接合型相互转换是属于复制型转座。
(2)其他真核生物转座子
果蝇中的转座子除了P因子外还有copia、FB 等。 它们的结构虽有所不同,但两端都有反向重复 序列。 玉米中Ac-Ds转座系统,非复制性转座。Spm dSpm系统等 已知重复序列占了人类基因组50%以上,其 中转座子占重复序列的45% 。所有的转座 子都是多拷贝的
Ty1因子只编码一条长5.7kb的mRNA, 转录的启动子位于Ty1因子左端的 LTR之中。mRNA编码两种蛋白质。 在某些酵母品系中,Ty1因子可多达 35个拷贝,但拷贝数因品系不同而有 差别。
Ty1因子转座是通过一种RNA 中间产 物进行的,其过程类似反转录病毒的 复制与整合,所以Ty1因子也称作反 转录转座子。一般认为Ty1因子转座 时,首先以其DNA 为模板合成一个拷 贝的RNA,然后再通过反转录合成一 条新的Ty1因子,最后这条新的Ty1转 座子再插入到新的位点上
(2) 转座子Tn
Tn是一类较大的转座子,除了含有与转座作用有关基因外,还带有
抗药基因以及其他基因,如乳糖发酵基因,因此Tn的转座能使宿主菌 获得有关基因的特性。Tn分子大小一般在2 ~ 25kb,两端有相同序 列,如IR。
某些Tn的IR便是已知的IS,带有IS的Tn也称为复合转座子
( composite transposon) 。Tn5、Tn10和Tn903都属于复合转座子.
酿酒酵母中有控制a与α 两种接合型的两个基因a与α 。这两个基因都能 转座。
当a 基因从它的位置HMR转座到MAT位置后便能表达,细胞就成为a接
合型;
当α 基因从它的位置HM L转座到MAT后,原来在M AT上的a基因消失,
α 基因得以表达,细胞便能转换成α 接合型。这两个转座子具有明显的 生理功能,它们与其他转座子不同之处是只能转座到M AT这一个位置 上,而其他的转座子几乎可以转座到该基因组中任何位置上。
1956年再次阐述跳跃基因学说与相关的机制 1970年代末期,分子生物学有进一步的发展后,她的
理论才渐渐受到重视与认同,于1983年,获得诺贝尔 生理医学奖 Ac-Ds转座系统 Ac(Activator) :自主性转座子,自己能编码转位酶,能自由地在基因组中转 座. Ds(Dissociation):非自主性转座子,本身不能编码转位酶,必须依靠Ac转座 子产生的转位酶才能产生转座.(玉米色素基因C附近有Ds) SAc: Stable Ac ,去掉Ac中转座酶识别序列
1.美国遗传学家B.McClintock的转座学说 2. 转座子类型 3. 转座机制 4. 转座子在基因工程中的应用
源自文库
1.美国遗传学家B.McClintock的转座学说
1951年,提出其六年的研究成果-跳跃基因学说。此
学说指出:玉米的染色体中含有跳跃基因,可于染色 体上依状况进行移动,而此基因可控制或影响某些构 造基因的表达。