生物医学文献主题标引基础

3、医学主题词选词范围 （1）器官、组织、细胞 A （2）疾病病理学 C （3）药物、化学物质、内源性物质和其他物质 D （4）操作技术，含诊断、治疗、外科、麻醉、分析 E （5）行为医学、心理学及精神病学 F （6）有机体：微生物、动植物 B （7）生理、生物学 G （8）公共卫生保健科学及事业 N （9）与医学相关的自然科学H、社会科学I、人文科学 K、情报科学等L、工业农业J （10）地理区域 Z
（3）Biosynthesis 生物合成 （ＢＩ） 用于生物体的活细胞或亚细胞成分的化学物质的形成 例４、痛风时肝内的氨基酸合成 氨基酸类/生物合成 肝/代谢 痛风/代谢
（4）Blood 血液(BL)（/Urine尿/Cerebrospinal Fluid脑 脊髓液） 用于正常或疾病状态血液中的内含物及其分析、 检查或变化。不包括血清诊断和血清学，前者用/诊断， 后者用/免疫学 例５、妊娠期中血青霉素G的含量 妊娠/血液 青霉素G/血液 （5）Chemical synthesis 化学合成 （ＣＳ） 用于体外分子的化学制备。在生物、细胞或亚细 胞领域内形成化学物质时用/生物合成 例６、青霉素的制备 青霉素类/化学合成
5、医学主题词表（MeSH)的局限
（1）有关中医中药的主题词极少； （2）有些概念不能找到合适的主题词来表达 如：药物治疗的量、原发与继发（肿瘤除外）、经 常与罕见 （3）对某些综合征没有适当的主题词表达，有关反 映新技术、新概念的词汇出现仍嫌较晚 如 SARS
（4）地理主题词：美国的地理名词较详，美国以外 的国家只有国家名及部分大城市名
免疫和生物因子 （树状结构表） 生物因子 生长物质 白细胞介素类 白细胞介素1 白细胞介素2 白细胞介素3 白细胞介素4 白细胞介素5 白细胞介素6 白细胞介素7 白细胞介素8 白细胞介素9 白细胞介素10 白细胞介素11 白细胞介素12 白细胞介素13 白细胞介素14 白细胞介素15 白细胞介素16 白细胞介素17 白细胞介素18
简言之，标引就是对文献主题分析的结果赋予检索标识的过程。而检索标 识，是一种代表文献主题的标记符号。如分类号、主题词、关键词等。
2. 文献检索标识：
外部特征：著者、文献号 内容特征：分类号标识 主题词标识：关键词（自然标识） 单元词、标题词及叙词（人为标识）
3. 主题标引的几个基本概念 （1）主题词（Subject Headings）：
标引依据：《MeSH》、《中医药学主题词表》 2、医学主题词表（Medical subject Headings, MeSH）
NLM编制，21,000个主题词，83个副主题词（Subheadings) 严 规范化
字顺表，树状结构表（辅表） 用途：标引和检索（确保主题标引者和主题检索者在用语上的一致） MeSH对文献作者、读者所使用的自然语言进行规范，主要体 现单一性、动态性两个特点
（6）Chemical induced 化学诱导 （ＣＩ） 用于人或动物由于化学化合物引起的疾病，综合征、 先天性异常或体征。注意用在药物或化学物质名称之 后加/副作用、/中毒、/毒性的副主题词作配伍 例７、与氯喹有关的眼疾病 眼疾病/化学诱导 氯喹/副作用 （7）Complications 并发症（ＣＯ） 用于疾病同时或随后发生的状态，即同时存在的 疾病，并发症或后遗症。注意与/病因学的区别 例８、眼弓形体病并发的青光眼
（3） 《中国图书馆分类法》
（4） 《杜威十进分类法》（DC） （5） 《美国国会图书馆图书分类法》（LC） （6） 《美国国立医学图书馆图书分类法》（NLMC）
二、主题标引（Subject Indexing）
1、中国生物医学文献标引系统 中国医学科学院、中国中医研究院联合设计
以 NLM MEDLARS及《汉语主题词表》为依托
Biological Factors Intercellular Signaling Peptides and Proteins Cytokines Interleukins Interleukin-1 Interleukin-1alpha Interleukin-1beta Interleukin-10 Interleukin-11 Interleukin-12 Interleukin-12 Subunit p35 Interleukin-12 Subunit p40 Interleukin-13 Interleukin-15 Interleukin-16 Interleukin-17 Interleukin-18 Interleukin-2 Interleukin-23 Interleukin-12 Subunit p40 Interleukin-23 Subunit p19 Interleukin-3 Interleukin-4 Interleukin-5 Interleukin-6 Interleukin-7 Interleukin-8 Interleukin-9
Penicilins/AE 或 Penicilins/Adverse effects
（2）Analysis 分析
（ＡＮ）
用于一种物质Baidu Nhomakorabea其成分或其代谢产物的鉴定或定量测 定，注意与/化学、/血液、/尿、/脑脊髓液、/分离与提纯 、代谢、/药代动力学等区别
例３、肝脏的青霉素浓度 青霉素类/分析 肝/ 代谢
7、常用副主题词简介
（1）Adverse effects 副作用（ＡＥ） 用于诊断、治疗、预防或麻醉的药物，化学物质、生 物和物理作用物，以及制造的产品在正常用量时引起 的不良反应（包括：过敏或特异性反应），也用于诊 断、治疗、预防、麻醉、外科手术及其他措施时的副 作用或并发症，但不包括禁忌症。 例１、冷冻疗法的并发症 冷冻疗法(CRYOTHERAPY)/副作用 例２、青霉素引起过敏（Penicilins）
⑥动态性（Dynamic)：指主题词表中的词的更新变化。
（2）主题词法（叙词法） 是直接以代表事物名称或概念的规范化的名词术语， 作为表达文献主题内容的标识符号，并依据这些标 识符号的语义和字顺，编排和组织文献检索工具的 一种方法。简言之就是利用叙词原理建立检索系统 的一种方法。 叙词法的基本特征： ① 按文献所论述的事物（即主题）集中文献； ② 用人们日常使用的名词术语经过规范化后直接表 达文献所论述的事物； ③ 用参照系统等间接显示事物概念之间（即主题之 间）的关系； ④ 用字顺序列直接提供按事物名称检索文献的途径 （即主题检索途径）。
病毒性心脏病＋心肌炎 病毒性心肌炎 （B）主题词/副主题词 限定组配 锰/中毒 锌/缺乏
4、标引与检索的关系
主题分析 文献 主题概念 转换 规范语
标引过程
词表 检索过程 课题 主题分析 主题概念 转换 标引是手段 检索是目的 标引为检索服务 检索提 问式 检索 系统 检索 结果
标引和检索关系图，即检索原理图
4、主题词的基本形式：
（1）单个词：Brain、Electrocardiography （2）词组： 直接形式：Blood Chemical Analysis, Lung Neoplasms 倒置形式： Kidney Failure （字顺表） Kidney Failure, Acute Kidney Failure, Chronic Cardiovascular Diseases （树状结构表） Vascular Diseases Hypertension Hypertension, Malignant Hypertension, Pregnancy-Induced Hypertension, Renal Hypertension, Renovascular 注：主题词采用倒置形式的主要目的，是使同属某一概念的文献能按字顺相 对集中在一起；也方便在检索过程中选词。
5、学习文献标引的意义：
（1）方便检索，提高检索效率，使查准率与 查全率保持合理的水平； （2）了解标引知识，便于专业研究
如发表文章 标识“中图类号” 标识关键词（尽量使用规范化的主题词， 提高文章被检索出来的概率，从而提高被引 用率）
6.目前常用的几种文献分类法
（1） 《中国人民大学图书馆图书分类法》 （2） 《中国科学院图书馆图书分类法》
6、副主题词（Subheadings）也称限定词（Qualifiers） 用于对某个主题词进行限定，将同一主题内容的 文献再按照不同的研究侧面作进一步的划分，提高主 题词的专指度，以便检索者准确快捷定位自己最关心 的文献所在区域；此外还可以扩大词汇量。 MeSH词表有83个副主题词，中医药学主题词表有 11个副主题词 注意：副主题词与主题词相组配使用，但并不是所有 的副主题词可以与任何一个主题词随意组配，它有一 定的组配限定，而且为适应学科发展，其限定范围及 时变更。 副主题词常常是事物的通用层面
注：主题词为实词，指事物的具体层面
②规范化（Normalize）:指对自然语言的词形和词义 进行限制，使一个词只能表达一个概念，或一个概念 只能用一个词来表达，即词和概念是一一对应的关系。 通过词表来控制。 ③优选处理（Priority):词表收词有限，不是所有的自 然语言词汇都可以作用主题词。通过词频统计确定。 ④组配（Cooperation) ⑤语义关系(semantic relation):指主题词之间的内 在联系。 主要包括等同关系、等级关系和相关关系
（4） 次要主题词（Minor MeSH Headings, Mime) 指对文章论述的次重点概念的标识 它们可能是主要标引的组配标引词，为了某 种研究目的所提供的载体、条件、方法和手 段、治疗学中提到的药物制剂、实验动物类 型、人类的性别与年龄组、文献类别、语种 等。
（5）组配（Cooperation) 按一定规则，用两个或两个以上的主题词 （或主题词与副主题词）构成逻辑关系组合 来表达一个专指概念的方法。 形式： （A）主题词＋主题词 交叉组配
单一性： （1）规定概念与主题词的单一对应，即一个主题词 只能表达一个概念，决不允许一词多义或一义多词； （2）目的是使讨论同一概念的文献不至于分散，保 证检索方便、准确和全面。 如：乙酰水杨酸 见 阿司匹林； Kidney Cancer / Kidney Tumor / Kidney Carcinomor / Neoplasms, Kidney see Kidney Neoplasms 动态性： 指词表的每年增删修订。主题词及副主题词随学科研 究的不断深化加以补充和新旧更替
也称叙词(Descriptors)，是一些以概念为基础的， 经过规范化和优选处理的，具有组配功能，并能显 示词间语义关系和动态性的词和词组。是用来揭示 文献主题内容，标引和检索文献的一种信息检索语 言词汇。 主题词主要特点： ①概念性（concept）:
事物 文献信息内容
概念
自然语言
概念
信息检索语言
Basic knowledge of biomedical literature subject indexing
生物医学文献 主题标引基础
余恩琳 汕头大学医学院图书馆 elyu@stu.edu.cn
一、基本知识
1. 标引（Indexing）的概念： 是对文献进行主题分析，从自然语言转换成规范化的检索语言 的过程。对文献给予分类号标识的过程，称为分类标引 （Classification indexing）；给予主题词标识的过程， 称为主题标引(Subject Indexing)。 -------国家标准局GB3860-83《文献主题标引规则》
（3）主要主题词（Major MeSH Headings, Mjme) 对文献核心主题概念的标识。 某种实验研究的直接目的和结果； 临床疾病的预防、诊断、治疗等主要手段、 方法和创新； 一篇文献中占篇幅较多的内容等。
在MEDLARS-MEDLINE系统中，用加权符号 “＊”表示 如： ＊Aspirin / therapeutic use 注：主要主题词对应主题检索中的加权概念