耳聋基因诊断
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耳聋基因诊断 ——揭示耳聋背后的秘密
哈尔滨医科大学附属第四医院检验科
梁红艳
1
2 3
背
景
耳聋的遗传模式
常见的致聋基因及位点
4
5
耳聋基因诊断的方法
常用SNP检测方法
1
背
景
耳聋
传音、感音及其听觉传导通路中的听神经和各级中枢发 生病变,引起听功能障碍,产生不同程度的听力减退 。 根据听力减退的程度不同,又称之为听力障碍、听 力减退、听力下降等。
11q22-24
3
常见的致聋基因及位点
GJB2
GJB3
常见致聋 基因
SLC26A4
12rRNA
3
常见的致聋基因及位点
GJB2 基因突变是非综合征型常染色体隐性遗传性语前聋 的主要原因
GJB2
种族差异明显,在欧美地区,35delG为主;在东亚,包括 中国、日本和韩国, 235delC 是常见的GJB2 突变 据报道,中国非综合征型耳聋人群中, 235delC占 16.3%。但我们的研究表明,在黑龙江地区,约占30% 左右。
临床上应用较为广泛,这些药物的过量或长期应用可以导 致耳鸣、听力下降,但也有一些患者仅应用一次这些药物 就出现耳鸣,甚至严重的听力下降,这些患者往往就与线 粒体基因突变有关,也有些患者并不表现为氨基糖甙类药 物的耳毒性,即使不用药,也会像其它基因突变一样出现 耳聋。
3
常见的致聋基因及位点
GJB3
GJB3纯合突变容易导致孩子后天感音神经性耳聋
DFNA2
DFNA3 DFNA5
GJB3, KCNQ4
GJB2, GJB6 DFNA5
1p34
13q12 7p15
DFNA6
DFNA8 DFNA9 DFNA11 DFNA12 DFNA15
常染色体隐性遗传 NSHI类型 基因 临床表现 定位
常染色体隐性遗传:双耳学语前非进行性重-深度感音神经性聋
DFNB1 GJB2 临床表型不衡定,可为先天性聋或1~10岁 期间进行性听力下降,受损程度可从轻~ 重度聋 听力下降在500~8 000 Hz大于90 dB 13q12
常用SNP检测方法
5
常用SNP检测方法 PCR-RFLP分型技术
5
常用SNP检测方法
TaqMan探针分型技术
5
常用SNP检测方法
Multiplex SNaPshot分型技术
5
常用SNP检测方法 电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分型技术
5
常用SNP检测方法
HRM技术
5
常用SNP检测方法
一般比较少见,X连锁遗传多是由母亲传给儿子ห้องสมุดไป่ตู้女儿一 般不发病,或者病情较轻,Y连锁遗传是男性相传,更为 少见
线粒体母系遗传
母亲将基因传给儿子或女儿,有些线粒体基因突变患儿可 以出现氨基糖甙类药物耳毒性,这种患儿即使使用正常剂 量的药物,有时一针即可致聋
常染色体显性遗传
NSHI类型 基因
DFNA,迄今已定位27型(DFNA1~DFNA31)
3
常见的致聋基因及位点 也称PDS基因 ,这种基因突变可以造成两种临床表现,一 是Pendred综合征,表现为甲状腺肿大和耳聋;另外一些患 儿仅表现为耳聋,CT检查可以发现前庭导水管扩大 SLC26A4
这些孩子在出生后有些听力是正常的,通常在一次轻微的外 伤后(特别是头部外伤)出现听力下降,经过一段时间后听 力可以部分恢复,但是经过多次发作,听力逐渐下降,最终 需要植入人工耳蜗来帮助这些患儿恢复听力。
+
听力正常父亲 听力正常母亲
听力
普通人中,大约有5~6%的人也会携带隐性状态的耳聋基因突变 。如 果夫妻双方都携带相同的耳聋基因,就算听力正常,也有高达25%的 几率生育出聋儿 。
例如:父——听力正常 SLC26A4 2168位点杂合突变 母——听力正常 SLC26A4 IVS-7 位点杂合突变 孩子——先天性耳聋 SLC26A4 2168和IVS-7 位点杂合突变
DFNB2 DFNB3 DFNB4
Myosin7A Myosin15 PDS(SLC26A4)
11q12.321
17q11.2
50%合并有前庭导水管扩大
学语后进行性听力减退,但比常染色体显 性遗传发病年龄早,听力下降速度快
7q31
DFNB8 DFNB9
DFNB21
OTOF
α -tectorin
2p22-23
等位基因特异PCR技术
临床表现
定位
常染色体显性遗传:学语后进行性感音神经性聋,语言发育正常 DFNA1 HAID1 低频听力受损 在1 000 Hz以上频率每年下降1~5 dB;1 000 Hz以下每年 下降0.2~0.5 dB。逐渐发展为全频率中-重度聋 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 低频听力受损 α-tectorin COCH Myosin7A α-tectorin POU4F3 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 11q22-24 14q12-13 11q12.3-21 11q22-24 5q31 5q31
4
耳聋基因诊断的方法
芯片法
荧光探针法
ARMS-PCR法
测序法
芯片法 有批号的厂 商 检测位点 博奥 GJB2 35del G GJB2 176 del 17bp GJB2 235del C GJB2 299-300delAT GJB3 538 C>T SLC26A4 2168 A>G SLC26A4 IVS-7 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G 基因位点多
2
耳聋的遗传模式
常染色体显性遗传
常染色体隐性遗传
按遗传模式分类
X和Y染色体伴性遗传
线粒体母系遗传
常染色体显性遗传
在一个大家系中可以有很多耳聋病人,耳聋就像一个 幽灵一样在这个家系中游荡
常染色体隐性遗传
比例最高,由于这种患儿需要父母各携带一个致病 等位基因,因此通常表现为散发病例
X和Y染色体伴性遗传
优点
快速,成本低,无须特 殊设备;可避免实验室 污染 位点少,需要后续检测
成本低
可发现其他基因 突变,是金标准 需要特殊设备; 成本高
缺点
需要基因芯片检测的系 列设备 成本高
操作繁琐,耗时长; 易造成实验室污染 位点少,需要后续检 测
易造成实验室污染
适用大批量检测
适用大批量检测
技术含量高
5
测序技术
对于这些孩子进行SLC26A4基因诊断,可以早期发现,提 醒家长注意尽量避免孩子受到外伤,延缓听力下降的时间, 可以为孩子争取宝贵的语言发育时间。
3
常见的致聋基因及位点
线粒体基因突变与氨基糖类药物的耳毒性有关
常用氨基糖类药物有庆大霉素、链霉素、小诺霉素、卡 那霉素、丁胺卡那霉素、新霉素等等
12rRNA
荧光PCR法 济南英盛 智海生物 济南英盛: GJB2 235del C 智海生物 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G
ARMS-PCR法 中生北控 GJB2 35del G SLC26A4 IVS-7 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G
测序法
根据需要检测
治疗方法:人工耳蜗植入
3
常见的致聋基因及位点
GJB2 常见的突变位点
1、35delG:在欧美多见,亚洲少。
GJB2
2、79G-A突变:目前认为是基因多态性
3、109A-G突变:目前认为是基因多态性
4、176del 17bp
5、235delC:在中国最常见
6、299-300delAT
7、341A-G突变
哈尔滨医科大学附属第四医院检验科
梁红艳
1
2 3
背
景
耳聋的遗传模式
常见的致聋基因及位点
4
5
耳聋基因诊断的方法
常用SNP检测方法
1
背
景
耳聋
传音、感音及其听觉传导通路中的听神经和各级中枢发 生病变,引起听功能障碍,产生不同程度的听力减退 。 根据听力减退的程度不同,又称之为听力障碍、听 力减退、听力下降等。
11q22-24
3
常见的致聋基因及位点
GJB2
GJB3
常见致聋 基因
SLC26A4
12rRNA
3
常见的致聋基因及位点
GJB2 基因突变是非综合征型常染色体隐性遗传性语前聋 的主要原因
GJB2
种族差异明显,在欧美地区,35delG为主;在东亚,包括 中国、日本和韩国, 235delC 是常见的GJB2 突变 据报道,中国非综合征型耳聋人群中, 235delC占 16.3%。但我们的研究表明,在黑龙江地区,约占30% 左右。
临床上应用较为广泛,这些药物的过量或长期应用可以导 致耳鸣、听力下降,但也有一些患者仅应用一次这些药物 就出现耳鸣,甚至严重的听力下降,这些患者往往就与线 粒体基因突变有关,也有些患者并不表现为氨基糖甙类药 物的耳毒性,即使不用药,也会像其它基因突变一样出现 耳聋。
3
常见的致聋基因及位点
GJB3
GJB3纯合突变容易导致孩子后天感音神经性耳聋
DFNA2
DFNA3 DFNA5
GJB3, KCNQ4
GJB2, GJB6 DFNA5
1p34
13q12 7p15
DFNA6
DFNA8 DFNA9 DFNA11 DFNA12 DFNA15
常染色体隐性遗传 NSHI类型 基因 临床表现 定位
常染色体隐性遗传:双耳学语前非进行性重-深度感音神经性聋
DFNB1 GJB2 临床表型不衡定,可为先天性聋或1~10岁 期间进行性听力下降,受损程度可从轻~ 重度聋 听力下降在500~8 000 Hz大于90 dB 13q12
常用SNP检测方法
5
常用SNP检测方法 PCR-RFLP分型技术
5
常用SNP检测方法
TaqMan探针分型技术
5
常用SNP检测方法
Multiplex SNaPshot分型技术
5
常用SNP检测方法 电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)分型技术
5
常用SNP检测方法
HRM技术
5
常用SNP检测方法
一般比较少见,X连锁遗传多是由母亲传给儿子ห้องสมุดไป่ตู้女儿一 般不发病,或者病情较轻,Y连锁遗传是男性相传,更为 少见
线粒体母系遗传
母亲将基因传给儿子或女儿,有些线粒体基因突变患儿可 以出现氨基糖甙类药物耳毒性,这种患儿即使使用正常剂 量的药物,有时一针即可致聋
常染色体显性遗传
NSHI类型 基因
DFNA,迄今已定位27型(DFNA1~DFNA31)
3
常见的致聋基因及位点 也称PDS基因 ,这种基因突变可以造成两种临床表现,一 是Pendred综合征,表现为甲状腺肿大和耳聋;另外一些患 儿仅表现为耳聋,CT检查可以发现前庭导水管扩大 SLC26A4
这些孩子在出生后有些听力是正常的,通常在一次轻微的外 伤后(特别是头部外伤)出现听力下降,经过一段时间后听 力可以部分恢复,但是经过多次发作,听力逐渐下降,最终 需要植入人工耳蜗来帮助这些患儿恢复听力。
+
听力正常父亲 听力正常母亲
听力
普通人中,大约有5~6%的人也会携带隐性状态的耳聋基因突变 。如 果夫妻双方都携带相同的耳聋基因,就算听力正常,也有高达25%的 几率生育出聋儿 。
例如:父——听力正常 SLC26A4 2168位点杂合突变 母——听力正常 SLC26A4 IVS-7 位点杂合突变 孩子——先天性耳聋 SLC26A4 2168和IVS-7 位点杂合突变
DFNB2 DFNB3 DFNB4
Myosin7A Myosin15 PDS(SLC26A4)
11q12.321
17q11.2
50%合并有前庭导水管扩大
学语后进行性听力减退,但比常染色体显 性遗传发病年龄早,听力下降速度快
7q31
DFNB8 DFNB9
DFNB21
OTOF
α -tectorin
2p22-23
等位基因特异PCR技术
临床表现
定位
常染色体显性遗传:学语后进行性感音神经性聋,语言发育正常 DFNA1 HAID1 低频听力受损 在1 000 Hz以上频率每年下降1~5 dB;1 000 Hz以下每年 下降0.2~0.5 dB。逐渐发展为全频率中-重度聋 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 低频听力受损 α-tectorin COCH Myosin7A α-tectorin POU4F3 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 学语前中-重度感音神经性聋,听力常保持稳定或仅呈轻微 进行性下降 听力减退与年龄和频率有关,多为高频神经性聋 11q22-24 14q12-13 11q12.3-21 11q22-24 5q31 5q31
4
耳聋基因诊断的方法
芯片法
荧光探针法
ARMS-PCR法
测序法
芯片法 有批号的厂 商 检测位点 博奥 GJB2 35del G GJB2 176 del 17bp GJB2 235del C GJB2 299-300delAT GJB3 538 C>T SLC26A4 2168 A>G SLC26A4 IVS-7 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G 基因位点多
2
耳聋的遗传模式
常染色体显性遗传
常染色体隐性遗传
按遗传模式分类
X和Y染色体伴性遗传
线粒体母系遗传
常染色体显性遗传
在一个大家系中可以有很多耳聋病人,耳聋就像一个 幽灵一样在这个家系中游荡
常染色体隐性遗传
比例最高,由于这种患儿需要父母各携带一个致病 等位基因,因此通常表现为散发病例
X和Y染色体伴性遗传
优点
快速,成本低,无须特 殊设备;可避免实验室 污染 位点少,需要后续检测
成本低
可发现其他基因 突变,是金标准 需要特殊设备; 成本高
缺点
需要基因芯片检测的系 列设备 成本高
操作繁琐,耗时长; 易造成实验室污染 位点少,需要后续检 测
易造成实验室污染
适用大批量检测
适用大批量检测
技术含量高
5
测序技术
对于这些孩子进行SLC26A4基因诊断,可以早期发现,提 醒家长注意尽量避免孩子受到外伤,延缓听力下降的时间, 可以为孩子争取宝贵的语言发育时间。
3
常见的致聋基因及位点
线粒体基因突变与氨基糖类药物的耳毒性有关
常用氨基糖类药物有庆大霉素、链霉素、小诺霉素、卡 那霉素、丁胺卡那霉素、新霉素等等
12rRNA
荧光PCR法 济南英盛 智海生物 济南英盛: GJB2 235del C 智海生物 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G
ARMS-PCR法 中生北控 GJB2 35del G SLC26A4 IVS-7 12sRNA 1494 C>T 12sRNA 1555 A>G
测序法
根据需要检测
治疗方法:人工耳蜗植入
3
常见的致聋基因及位点
GJB2 常见的突变位点
1、35delG:在欧美多见,亚洲少。
GJB2
2、79G-A突变:目前认为是基因多态性
3、109A-G突变:目前认为是基因多态性
4、176del 17bp
5、235delC:在中国最常见
6、299-300delAT
7、341A-G突变