基于MCMC方法的随机传染病模型参数估计

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E(t+h)=[E(t)-C(t)]+B(t)
{C(t)~Bin(E(t),pC)
pC =1-exp(-ρh),其中
1 ρ
=τ
(4) (5) (6)
I(t+h)=[I(t)-D(t)]+C(t)
{D(t)~Bin(I(t),pR)
pR
=1-exp(-γh),其中
1 γ
=σ
(7) (8) (9)
R=N-S-E-I
技术应用
当汽车内的温度达标后,离合器会分离,此时压缩机会停止工 作;当车厢内的温度较高时,离合器会吸合,此时压缩机就会带 动空调系统工作。而这样的频繁启停,可能会加剧压缩机及其 离合器的磨损,甚至出现打滑等问题,使得空调制冷系统无法 正常工作。 2.2 冷凝器及蒸发器常见故障
冷凝器一般安装在发动机的主水箱前面,容易受到外界自 然因素的影响。比如树叶、泥沙、尘土等杂物很容易落到冷凝 器表面,使其通风受阻;酸雨等物质可能会腐蚀冷凝器表面,造 成制冷剂泄露等故障。蒸发器一般安装在车厢内的仪表台下 方,随着使用时间的延长,人体的汗液、毛发以及车厢内的粉尘 都会积聚在蒸发器表面上,使得其无法正常工作。 2.3 制冷剂不足或加注过量
性阶段的特定指所述的留在阶段内的概率。潜伏期和传染期的指数分布可由
几何分布近似代替,其均值分别为 1和 1。以时间 t之前的所 pC pR
有信息为条件,二项随机变量 B(t)、C(t)和 D(t)是独立的。
(下转第 168页)
166
考虑一个时间间隔(t,t+h),其中 h表示测量时间点之间
的长度,这里 h=1天。设 t时刻总人口数为 N(t),假设不考虑
人口的迁移,令 N(t)=N。令 S(t)、E(t)、I(t)和 R(t)分别为
时刻 t人群中易感个体、暴露个体、感染个体和迁移个体的数
量。B(t)表示 感 染 的 可 感 知 个 体 的 数 量,C(t)表 示 症 状 出 现
(10)
给定初始条件 S(0)=s0,E(0)=e0,I(0)=a和总体大小
N。参数
β(t)、1ρ和
1分别为时间依赖性传播率、平均潜伏期 γ
和平均感染期。β(t)=βexp(-qmax(t-t ),0)起到指数减 少的作用,t 是疫控起始点,即第一个观测到的数据的时间点。 个体从疾病的前一阶段到下一阶段的转变被视为在相应的种
" 概述 数学模型被广泛用于描述传染性疾病传播的动态机理,最
普遍应用的理论框架是将人群分解为易受感染人群、被感染人 群但不具有传染性(暴露)、具有传染性的人群、已恢复的人群, 这样的模型称为 SEIR(susceptible-exposed-infectious-recov ered)模型,它描 述 了 具 有 潜 伏 期 的 传 染 病 的 传 播 过 程。 传 染 病模型的理论是复杂的,首先是因为一个或几个模型变量可能 是不可见的(潜在的),其次数据通常在离散时间点可用,而潜 在的真实过程是连续的。再次,模型参数可能会随着时间而变 化,比如在流 行 病 期 间 引 入 控 制 疾 病 传 播 的 干 预 措 施。 文 献 [1]研究了具有随机扰动的传染病 SEIR模型,证明解是唯一 的、非负的;文献[2]研究了 SEIR传染病模型的动态分析和扰 动解,都给出了解析解的形式,但没有求出里面的参数。所有 这些研究都是基于这样一个假设:研究者可以获得所有事件时 间或其子集,但很少记录单个事件发生的时间。更常见的是, 观察的数据集是在时间间隔(如一天或一周)内发生的事件的 时间序列;文献[3]以埃博拉病毒为例,讨论了具有控制干预的 随机流行 SEIR模型的贝叶斯统计推断;文献[4]利用贝叶斯 统计推断研 究 了 一 类 流 行 病 数 学 模 型———SIR模 型 的 参 数 估 计及应用。可见,贝叶斯统计推断在求解流行病模型的精确解 方面起到了很大的推动作用。
在汽车空调制冷系统运行时,只有制冷剂的加注量刚好达 标,才能保证 空 调 系 统 正 常 运 行。 如 果 空 调 循 环 系 统 发 生 泄 漏,那么制冷剂就会不断减少,进而就会造成系统的工作压力 和制冷剂状态发生改变,轻则影响制冷效果,重则可能导致空 气被吸入空调系统,使得空调系统的重要部件损坏。在维修作 业中,有时也可能存在加注量过多的情况,而这会造成空调系 统的工作压力明显增高,加大压缩机的工作负荷,轻则会使得 制冷效果变差,重则甚至可能造成压缩机损坏。总之,制冷剂 加注过量对整个汽车空调系统的危害性是非常大的,必须加以 重视。 诊断分析方法探讨
日期前的病例数量,D(t)表示在该时间间隔内从感染类别中移
除的病例数量。τ 表示流行病灭绝的时间点。我们对随机连
续时间 SEIR模型使用离散时间近似,得到下面的模型:
{S(t+h)=S(t)-B(t) B(t)~Bin(S(t),P(t)) P(t)=1-exp(-β(t)I(t)h/N)
(1) (2) (3)
技术应用
TECHNOLOGY AND MARKET Vol.26,No.6,2019
基于 MCMC方法的随机传染病模型参数估计
张振荣
(天津农学院 基础科学学院,天津 300384)
摘 要:将经典传染病 SEIR模型离散化,用 MCMC方法动态描述传染病的传播过程,估计其中的参数,求出最终康复的 人数,为实际研究工作提供理论依据。 关键词:SEIR模型;MCMC方法;参数估计 doi:10.3969/j.issn.1006-8554.2019.06.077
群间的随机运动。假设在一个阶段内停留的时间长度为间隔
率 λ(t),它呈指数分布,则将停留时间延长一段时间 h的可能
性为 exp(-λ(t)h),因此离开的概率为 1-exp(-λ(t)h)。二
项分布(2)(5)(8)是由单个伯努利试验的总和得出的,假设一
个阶段内的所有人都是独立同分布的。由于易感、暴露和感染
本文讨论了离散时间流行病数据可用于自然史属于 SEIR 模型的传染病。Bailey(1975年)、O′Neill和 Roberts(1999年) (文献[3])基于似然推 理考虑 了 时 间 间 隔 等 于 疾 病 发 生 期 (链式二项模型)。在链式 二项模型 中,假 设生 成期,即潜 伏 期和感染期合在一 起 是 固 定 的。 在 这 里 ,我 们 放 宽 了 这 一 假 设,允许潜在周期和非传染性周期是随机的,在时间节点观测 到的数据长度不同于生成期长度。通过引入状态变量转换的 概率密度,我们建立一个概率离散时间模型,在很小的区间长 度内,该模型可以很好地逼近随机 SEIR模型生成的基础连续 时间过程。然后,在转 换 密 度 的 基 础 上,可 得 到 数 据 的 似 然 函数。 # 1*23 模型离散化
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