四.核酸和核苷酸

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2. 双螺旋结构模型的基本特征
a. 围绕同一中心轴缠绕的反平
行双链右手螺旋
b. 外侧是两条由脱氧核糖-磷
酸构成的亲水主链(骨架), 内部是配对的疏水碱基。
c. 双螺旋内部的碱基按规则配 对:腺嘌呤(A)必须和胸腺 嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G) 必须和胞嘧啶(C)配对(碱 基配对原则)。 d. 双螺旋表面形成两种凹槽, 螺旋直径2nm,螺旋结构每隔 10个碱基对(base pair, bp) 重复一次,间隔为3.4nm 。 e. 双螺旋的两条链是互补关系。
H
O
H O
A (G)
H OH
O P OH
O
cAMP(cGMP)
3’,5’-环式单磷酸腺苷(鸟苷)
几种稀有核苷酸
H3C H 5
CH3
H
CH3
假尿苷()
二氢尿嘧啶(DHU)
Am
m26G
核苷酸的生物学功能:
1)携能核苷酸:核苷三磷酸被作为能源用于驱动一系列 不同的化学反应,ATP使用最为广泛,UTP,GTP,CTP 也被用于专门的生化反应中。其中焦磷酸键水解能释 放出30kJ/mol的能量。 2)作为酶的辅因子结构成分:如腺嘌呤核苷,并不直接 参与催化反应,具有增加酶和底物初始复合物的稳定 结合能力。 3)信号转导:细胞内第二信使常常是核苷酸,较为普遍 的是3’,5’-环式单磷酸腺苷(cAMP)。除了植物界, cAMP在所有细胞中都有调节功能。 4)核苷三磷酸是DNA和RNA合成的活性前体。
第七节 核蛋白
第一节 核酸的种类和分布
1869 年, Miescher 从脓细胞的细胞核中分离出了
一种含磷酸的酸性化合物,称为核素(nuclein)即核
蛋白。1889年,R. Altman从酵母及其它动物细胞中分 离得到不含蛋白质的核酸(nucleic acid),核酸当时 指从细胞核中分离出来的酸性物质。
第四章 核苷酸和核酸
第四章 核苷酸和核酸
重点:核酸的分类和化学组成,DNA 和 RNA的结
构特征及其与功能的关系;核酸的主要理化性质和 核酸研究的一般方法。
核苷酸和核酸
第一节 核酸的种类分布与功能 第二节 核酸的化学组成 第三节 DNA的分子结构
第四节 RNA的种类与结构
第五节 核酸的理化性质
第六节 核酸酶和DNA限制性内切酶
β-D-2-脱氧核糖
β-D-核糖
2.3 磷酸
2.4 核苷与核苷酸
核苷是碱基以C-N糖苷键共价连接到戊糖的1’碳原子上 而成的糖苷。糖苷中的戊糖碳原子编号用1’,2’,3’等 表示;C1’与嘌呤碱的N9连接,与嘧啶碱的N1连接。
核 苷
NH2 N N HOCH2 H H OH O H H OH 腺嘌呤核苷 N N N OH N N NH2 N OH
多聚嘌呤
多聚嘧啶
DNA分子内的 三链结构
3.3 DNA的三级结构
指DNA双螺旋进一步扭曲形成的更高层次的
空间结构,包括线状DNA形成的扭结、超螺 旋和多重螺旋以及环状DNA形成的结、超螺 旋和连环等多种类型,主要指双螺旋进一步 扭曲形成的超螺旋。
环状DNA分子的超螺旋结构 (麻花状)
线装DNA分子的超螺旋结构 (螺旋的螺旋)
1)DNA链弯曲:如连续出现4个以上腺嘌呤;在一些蛋白 质和DNA 的结合中起重要作用。 2)回文顺序:双链DNA中的一段倒置重复序列,碱基顺序 在正负链上颠倒重复,该序列链内互补,双链DNA能形成 十字架结构,单链DNA或RNA中能形成发卡结构 。 --TTAGCAC----GTGCTAA---AATCGTG----CACGATT—
1. 核酸的种类:
核酸按其所含戊糖种类不同分为两大类: a).所含戊糖为脱氧核糖,称为脱氧核糖核酸 (deoxyribonucleic acid, DNA);
b).所含戊糖为核糖,称为核糖核酸(ribonucleic acid, RNA). RNA按其功能不同主要分为三类: 转移RNA(transfer RNA, tRNA, 15%), 信使RNA(messenger RNA, mRNA, 5%), 核糖体RNA(ribosomal RNA, rRNA, 80%).
b. 嘧啶碱
嘧啶
Cytosine (Cyt)
Uracil (Ura)尿嘧啶
Thymine (Thy) 胸线嘧啶 (5-甲基-2,4-二氧嘧啶)
包嘧啶 (2-氧-4氨基嘧啶)(2,4-二氧嘧啶)
2.2 戊糖
核酸所含戊糖为两大类核糖: DNA: D-2-脱氧核糖 RNA: D-核糖 并以环状β-呋喃糖形式存在 直链型D-核糖
3.1 DNA 的一级结构
概念:DNA分子中各脱氧核苷酸
之间的连接方式(3 ´-5 ´磷酸二酯键 )和排列顺序叫做 DNA 的一级结构, 简称为碱基序列。 一级结构的走向规定为 5´ →3 ´。不同的 DNA 分子具有不同的 核苷酸排列顺序,因此携带有不同 的遗传信息。
5 ´

1. 脱氧核苷酸之间的连接键:
第四节 RNA的分子结构
结构特征: 1. 由4种主要的核糖核苷酸组成 (AMP,GMP,CMP,UMP) 2. 3’,5’-磷酸二酯键连接,分子小, 几十到几千个核苷酸 3. 绝大多数RNA是单链 4. 可通过单链自身折叠按A与U,C 与G配对的原则形成茎环结构 (二级结构)

OH

OH
OH
RNA的类别
含氮碱基 戊糖 (A、T、G、C、U) (脱氧核糖或核糖)
核酸的基本化学组成
组成
碱基 嘌呤碱 嘧啶碱
DNA
腺嘌呤A,鸟嘌呤G 胞嘧啶C,胸腺嘧啶T
RNA
腺嘌呤A,鸟嘌呤G 胞嘧啶C,尿嘧啶U
戊糖
磷酸
D-2-脱氧核搪
磷酸
D-核搪
磷酸
2.1 基本碱基结构和命名
a. 嘌呤碱
嘌呤
腺嘌呤(6-氨基嘌呤)
鸟嘌呤(2-氨基-6-氧嘌呤)
H2N N N HO N HO N HOCH2 HOCH2 HOCH 2 O O O H H H H H H H H H H H H OH OH OH OH OH OH 鸟嘌呤核苷 胞嘧啶核苷 尿嘧啶核苷
DNA中的脱氧核苷2’位是H而不是OH。
RNA 中的4种主要的核糖核苷(核苷): 腺苷(A) 鸟苷(G) 胞苷(C) 尿苷(U) DNA中的4种主要的脱氧核糖核苷(脱氧核苷): 脱氧腺苷(dA) 脱氧鸟苷(dG) 脱氧胞苷(dC) 脱氧胸苷(dT)
2. 核酸的分布
1)脱氧核糖核酸(DNA):遗传信息的贮存和携带者,生 物的主要遗传物质。在真核细胞中,DNA主要集中在细 胞核内,线粒体和叶绿体中均有各自的DNA。原核细胞 没有明显的细胞核结构,DNA存在于核质区。 2)核糖核酸( RNA):主要参与遗传信息的传递和表达 过程。真核细胞的RNA主要存在于细胞质中,少量存在 于线粒体,叶绿体,细胞核中。
DNA双螺旋结构提出的意义
第一次提出了遗传信息的贮存方式
以及DNA的复制机理,以准确的语言回 答了DNA是怎样可能成为遗传物质的, 大大推动了分子生物学和分子遗传学的 发展,因此获得1962年诺贝尔生理学或 医学奖。 DNA双螺旋结构模型的建立 ,标志着人类在揭示生命遗传奥秘方面 迈出了具有里程碑意义的一步。
3. 维持DNA双螺旋结构的作用力
氢键
:A=T,G=C
碱基堆积力 :双螺
旋中垂直方向的作用力,与 碱基π电子云间的吸引力、 范德华力、碱基疏水作用等 因素有关,是维持双螺旋结 构稳定性的主要因素。
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4. DNA双螺旋的不同构象
A-DNA B-DNA Z-DNA
DNA双螺旋构象的类型
5.与DNA碱基顺序相关的特殊结构
5´-NDP
5´-NTP N=A、G、C、U 5´-dNMP 5´-dNDP 5´-dNTP N=A、G、C、T
monophosphate
AMP Adenosine
Adenosine diphosphate Adenosine triphosphate
ADP
ATP
腺苷酸及其多磷酸化合物
O
CH2 H
3. 核酸的生物学功能
DNA:染色体的主要成分,是只要的遗传物质。染色体中
脱氧核苷酸顺序是遗传信息的贮存形式,每种蛋白质的 氨基酸顺序和RNA的核苷酸顺序都是由细胞中DNA的核 苷酸顺序决定的。遗传的最小功能单位基因就是DNA分 子的一个区段。DNA通过复制把全套遗传信息传递给子 代,通过转录把某些遗传信息传递给RNA。
尿嘧啶核苷酸 (UMP)
胞嘧啶核苷酸 (CMP)
P
P
P
P
脱氧腺嘌呤核苷酸 (dAMP)
脱氧鸟嘌呤核苷酸 (dGMP)
脱氧胸腺嘧啶核苷酸 (dTMP)
脱氧胞嘧啶核苷酸 (dCMP)
常见(脱氧)核苷酸的结构和命名
2.5 细胞内游离核苷酸及其衍生物
• 多磷酸核苷酸
• 环核苷酸
• 辅酶类核苷酸。
5´-NMP
2.6 磷酸二酯键与多核苷酸
核苷酸是核酸的基本结构单位, 一个核苷酸的3’-羟基与下一个核 苷酸5’位的磷酸基团以3’,5’-磷 酸二酯键(C’3-O-P-O-C’5)连接 形成多核苷酸链。 核酸主链由相间出现的磷酸、 核糖残基通过共价键连接构成, 各种碱基可看作为主链上的侧链 基团。
第三节 DNA的分子结构
•信使RNA(messenger RNA,mRNA):在蛋白质合成中 起模板作用; •转移RNA(transfer RNA,tRNA):在蛋白质合成时起 着携带、活化氨基酸的作用。 •核糖体RNA(ribosoal RNA,rRNA):与蛋白质结合构 成核糖体(ribosome),核糖体是蛋白质合成的场所;
1. tRNA 的结构
a. tRNA的一级结构:指tRNA分子中核苷酸的排列顺序。 结构特征: 1 )由 74-93 个核苷酸组成,大多为 76 个核苷酸的单链 ,沉降系数为4S(沉降系数:单位离心场中沉降分子下
C
T
G
OH 3´
p
p
p
p
线条式
C. 字母式
5’- ACTGCATAGCTCGA -3’
3.2 DNA的二级结构(DNA双螺旋结构)
1953年2月28日, Waston和Crick 建立了DNA双螺 旋结构,并于4 月25日,在英国 《自然》杂志发 表了文章“核酸 的分子结构—脱 氧核糖核酸的一 个结构模型”。
较长的回文结构较短的回文序列,可作为一种特别信号,如限制性核 酸内切酶的识别位点。
3)镜像重复: 颠倒重复出现在同一条链上,链内不具互补 序列。如:上海自来水来自海上。 -- TTAGCACCACGATT---AATCGTGGTGCTAA--
4)H-DNA:三链DNA, tsDNA: DNA序列具有多嘧啶-多嘌呤, 镜像重复的特点。真核细胞染 色质中,许多基因的调节区和 染色质重组的热点部位存在ts DNA结构,推测可能与基因表 达的调控、基因重组或染色体 凝聚有关。
1. 双螺旋提出的依据
a. DNA的X-射线衍射图 b. DNA的碱基组成分析 Chargaff定则:
1)不同物种间DNA碱基组成一般是不同的; 2)同一物种不同组织的DNA样品有着相同的碱 基组成; 3) 任何一种DNA样品其腺嘌呤残基的数量等于 胸腺嘧啶残基的数量,即A=T, G=C, A+G=C+T; 4)亲缘相近的生物其DNA的碱基组成相近,不对 称比率相近(A+T/G+C相近)。
3’,5’-磷酸二酯键
2. 多聚脱氧核苷酸链的连接方向
一端为5’:该末端的脱氧核苷酸5’位上的磷 酸集团不再与另一个脱氧核苷酸连接;另一端 为3’端:该末端的脱氧核苷酸3’位上是羟基,不 再连接另一个核苷酸。
3. DNA一级结构的表示法
a. 结构式
5 ´ 3´
结构式
b. 线条式
A
1´ 3´ 5´
3. 核酸的生物学功能 RNA:以DNA为模板转录合成的,在蛋白质生
物合成中起重要作用。tRNA携带和转移活化氨 基酸的作用; mRNA是蛋白质合成的模板;rRNA 与各种蛋白质结合构成核糖体,核糖体是合成 蛋白质的细胞器。
第二节 核酸的化学组成
核酸由许多核苷酸按特定的顺序连接成为核酸,核 苷酸是核酸的基本结构单位。 核苷酸水解产生核苷和磷酸,前者水解产生核糖 (或脱氧核糖),含氮碱基(嘌呤或嘧啶)。碱基、戊糖 和磷酸是核酸的基本组成成分。 核酸 核苷酸 核苷 磷酸
核苷酸:
核苷与核酸以酯键形成的核苷磷酸酯称为核苷酸。 磷酸酯化在戊糖的5’碳原子上, 核苷酸的3种成分按碱基-戊糖-磷酸的次序排列。
核酸的主要核苷酸类型:
DNA主要由dAMP、dGMP、dCMP和dTMP组成
RNA主要由AMP、GMP、CMP、UMP组成
P
P
P
P
腺嘌呤核苷酸 (AMP)
鸟嘌呤核苷酸 (GMP)
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