遗传学课件12第十二章(遗传工程)

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两种DNA连接酶都不能催化单链DNA之间的连 接反应,被连接的DNA链必须是双链DNA分子 的一部分。
T4 DNA连接酶还可以催化二个具有平齐末端 的双链DNA片段之间的连接反应,而大肠杆菌 连接酶一般不具有这种活性。
(三)反转录酶
• 反转录酶(reverse transcriptase)是 一类以RNA为模板来指导DNA合成的DNA聚 合酶,所以又称为依赖于RNA的DNA聚合 酶。
图12-6 重组质粒的蓝白斑筛选
2、病毒载体
λ噬菌体载体
可以接受 15~23kb的外 源DNA片段
图12-10 利用噬菌体为载体克隆外 源DNA的策略
3、克隆大片段DNA的载体
黏粒载体、细菌人工染色体和酵 母人工染色体载体 。
黏粒载体(cosmid)柯斯 质粒
可以接受15~45kb的外源 DNA
重组DNA的步骤
(1)从细胞或组织获得DNA并纯化; (2)用限制酶切割DNA;
(3)将获得的限制片段连接到载体上。 (4)重组DNA导入宿主细胞,在宿主细胞内
重组DNA分子复制,产生大量相同拷贝的 重组DNA分子,称为克隆; (5)克隆的DNA分子可以从宿主细胞中回收, 纯化; (6)克隆的DNA可以转录和翻译,其产品可 以被分离出来用于研究或商业开发。
变性温度:93-94 ℃, 30-60秒
退火温度:36-60 ℃, 30-60秒
延伸温度:72 ℃,
1.5-2分
循环30-40次;
最后72 ℃补齐10分钟。
表12-2 PCR循环数与PCR产物的拷贝数之间的关系
循环数 1 5 10 15 20 25 30
PCR产物拷贝数
21
2
25
32
210
1024
产生纯合后代
克隆T-DNA两侧的植物DNA(Plasmid rescue; IPCR; Tail PCR) 利用侧翼DNA序列作探针从该植物的cDNA文库中钓取基因 基因功能的验证
(三)PCR扩增基因
(四)人工合成基因
第三节 外源基因的导入
一、重组DNA导入原核生物
1.CaCl2处理转化:
将细菌细胞用冰上预冷的CaCl2处理,然后 转移到42℃的条件下处理90秒。CaCl2处 理转化的机制尚不清楚,可能是CaCl2处 理破坏了细菌的细胞壁,使游离的DNA分 子被摄入受体细胞。转化频率大概是千分 之一。
甲基化
胞嘧啶
5—甲基胞嘧啶
三种限制性内切酶
Ⅰ型限制性内切酶: 酶切部位没有特异性,随机切割双链DNA分子。 EcoB和EcoK
Ⅱ型限制性内切酶: 酶切部位有特异性,能识别DNA分子上特 定的DNA序列。
Ⅲ型限制性内切核酸酶(Ⅲ型酶) 具有特异的识别位点,这种识别位点是非对称的。
Ⅱ型酶有几个基本特性
冠瘿碱代谢 酶编码பைடு நூலகம்因
Ti 质粒 复制起 始点
各种不同类型的Ti质粒都具有T-DNA区、毒性 区、质粒复制起点、质粒结合转移位点和冠瘿 碱分解位点(图12-13)。其中以T-DNA区和毒性 区在植物转化中最为重要。
T-D N A 区 细 胞 分 裂 素 合 成 基 因
生长素合成基因
冠瘿碱合成基因
左边界
α受体片段:酶的C端片段,一般存在于宿 主细胞。
α供体片段:酶的N端片段,一般存在于 质粒载体。
α供体片段+α受体片段
有活性
质粒载体含有 LacZ基因的N端编码序列, 在编码区含有多克隆位点,不影响酶的 活性,选择含有β-半乳糖苷酶C端片段 的宿主细胞。
在含有X-gal(5-溴-4-氢-3-吲哚- β –D-半乳糖苷)的培养基中形成兰色菌落, 但如果外源DNA插入到多克隆位点,将绝 对地产生不具有α互补功能的N端片段产 生,菌斑为白色。
(4) 分子量小,多拷贝,易于操作。
1、质粒载体
质粒:细菌细胞内 独立于细菌染色 体而自然存在的、 能自我复制、易 分离和导入的环 状双链DNA分子。
外源DNA片段小于10kb
图12-8 质粒PUC18的结构及多 克隆位点
α互补:
α互补是指大肠杆菌β-半乳糖苷酶的两 个无活性片段组合成为功能完整的酶的过 程。
反转录酶在遗传工程中的主要用途是 以mRNA为模板合成cDNA 。
cDNA文库代表的 是某一特定细胞, 或组织,或某一发 育阶段的表达的基 因,而基因组文库 代表的是基因组中 所有的基因。
(四)聚合酶链式反应
• 聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)
• PCR反应在一种混合液中进行(PCR mixture)包括四种主要成分:两个引物 (一般为20 bp);模板DNA;热稳定的 DNA聚合酶和四种脱氧核苷酸。
① 在DNA分子上有特异识别和切割的序列部位, 使被切割的DNA分子形成单链的断裂;
② DNA分子上两个单链断裂的部位通常不是直接 相对的;
③ 断裂结果所形成的DNA片段常具有碱基互补的 单链尾巴(粘性末端),使其能够重新连接;
④ 内切酶的切割和修饰功能由两个不同的酶催 化所完成,即该类内切酶活性和甲基化作用活 性是分开的,只需要Mg2+来激活,不需要ATP辅 助因子。
Ti质粒
Ti质粒是根癌农杆菌 (Agrobacterium tumefaciens)染 色体外的遗传物 质,为双股共价 闭合的环状DNA 分子,约有 150~200kb。
T-D N A 区 细 胞 分 裂 素 合 成 基 因
生长素合成基因
冠瘿碱合成基因
左边界
右边界
致毒区
与 Ti 质 粒转 移功能 有关的遗传座位
图12-5 重组DNA技术流程
(二)载体(vector)
作为载体DNA分子,必须储备的4个条件:
(1)具有复制原点,在宿主细胞中不仅能独立地自我 复制,而且能带动携带的外源基因一起复制。
(2)具有多克隆位点,即具有多种限制性酶切位点, 且每一种酶的切点只有一个。
(3)至少具有一个选择标记基因。如抗菌素的抗性基 因或某种酶的基因。
Vir区段上的基因与T-DNA 从细菌转移到植物细胞的遗 传过程有关,区段上的基因 能够使农杆菌表现出毒性, 故称之为毒性区。
T-D N A 区 细 胞 分 裂 素 合 成 基 因
1、基因库的构建
基因组文库:全部基因组DNA酶切后与载体 连接构建而成的一个重组DNA群体 。
cDNA文库:是以mRNA为模板,在反转录酶的作用下,
合成互补DNA(cDNA),将获得的双链cDNA与适当载体 连接并转化到宿主细胞内进行扩增,而构建成的基因库。
cDNA文库与基因组文库的不同
基因组文库代表了基因组中的所有基因,而 cDNA文库仅代表某一特定细胞类型,某一 组织,或某一胚胎发育时期的表达序列。
遗传学课件12第十二章(遗传工程)
第一节 基因工程概述
生物工程(biological engineering) 是指利用工程技术的方法改造和修饰生 物体,使其产生新的性状或产品,从而 改良生物体的一种遗传学手段。
广义生物工程:细胞工程、基因工程、酶工 程、发酵工程 狭义生物工程:基因工程
基因工程
2.电激转化(electroporation) 是目前常用的一种转化方式。在电转化仪施加的
强电场的作用下,使受体细胞细胞壁具有可逆 的电穿孔,以使DNA分子进入细胞。进行电转 化操作时,细菌细胞和DNA分子放在带有电极 的小室中,通过小室(chamber)施加电脉冲, 使细胞壁穿孔,然后DNA分子进入细胞。电转 化的频率通常是10-6~10-9,因质粒的大小而异。
(2) 筛选文库
(3)阳性克隆的分析与鉴定
从文库中筛选获得目标克隆后,只有进行 测序才能进行生物信息分析和功能预 测。,确定测定的核酸序列是不是所需 要的基因,采用适当的软件预测它具有 什么功能。
(二)T-DNA标签克隆基因
T-DNA 载体构建 转化植物(T1,T-DNA杂合子)收获T2种子
筛选T2,获突变子,应为3:1分离 确定T-DNA与突变型共分离的个体
• 聚合酶是Taq酶(AmpliTaq polymerase,
在95℃甚至更高的温度下活性稳定)。
• PCR反应已经自动化,在PCR仪(thermocycler) 上进行。
• 基本过程:
通过高温,双链DNA变成单链DNA——变性;
通过降低温度,使引物和摸板配对——退火;
利用耐热DNA聚合酶,合成产物DNA——延伸。
3.结合(conjugation)结合是原核生物细 胞与细胞接触而进行遗传物质转移的一 种自然过程。
二、植物表达载体
作为植物基因转化的载体,必须具有两种功能: (1)能作为媒介将外源基因导入到植物细胞中
去,并且整合到宿主细胞的基因组DNA上; (2)能提供被寄主细胞的复制和转录系统所识
别的DNA序列,即启动子和复制子起始位点, 以保证转化的外源基因能在植物细胞中进行复 制和表达。
定义:利用人工的方法把生物的遗传物质 在体外进行切割、拼接和重组,获得重 组DNA分子,然后导入宿主细胞或个体, 使受体的遗传特性得到修饰或改变的过 程。
基因工程的特点
1、跨越天然物种屏障,实现动物、植物、 微生物间的遗传物质交换。
2、只定向改变一个或少数几个性状,而不 改变品种的其他特性。
3、可以人为控制基因的表达。
2.从基因库中分离特定的克隆序 列(基因)
(1) DNA探针
探针是待筛选的目的基因或克隆的一段互补的核 酸序列。利用DNA探针可以从基因库中筛选特 定的克隆
通常探针用同位素标记,但也可使用荧光标记或 颜色反应标记探针。探针可以有多种来源, 如果筛选植物基因,探针可以来源于植物本 身,也可以来源于异源植物、动物中的同类 基因的保守序列。
基本技术流程: 目的基因克隆
植物表达载体的构建 转化植物细胞
筛选抗生素抗性细胞
再生抗性植株
整合——PCR, Southern杂交, 原位杂交 转录——RT-PCR, 定量PCR, Northern杂交 翻译——Western杂交
生物检测 遗传分析
第二节 基因的分离
基因克隆通常包括三个步骤:
1)目标DNA片段(基因)的分离; 2)目标基因克隆到载体上; 3)载体导入宿主细胞并在其中大量复制。
215
32768
220
1048576
225
33554432
230
1073741824
图12-6 在紫外灯下观察到的琼脂糖凝胶电泳后的 DNA条带
二、载体(vector)
(一)重组DNA技术
重组DNA(recombinant DNA)主要指利用不同生 物来源的DNA分子拼接的杂种DNA分子,是自 然界中不存在的DNA分子。
质粒的复 制原点
噬菌体DNA包装成 功噬菌体时所必需 的。
图12-11黏粒载体pJB8图谱
细菌人工染色体(BAC)
可以克隆 300kb左右 片段
酵母人工染色体(YAC)
• YAC载体可以 插入大片段的 DNA(1-2Mb)
三、基因的分离
(一)从基因文库中分离基因 基因文库:是由单一来源的特定组织或器官的DNA 或cDNA片段汇总形成的克隆群体。
表12-1 不同限 制酶的识别、 切割和修饰位 点
回纹对称序列 echo-r-one
(二)DNA连接酶
能催化DNA中相邻的 3’ –OH和5’ – 磷酸基 末端之间形成磷酸二酯 键并把两段DNA连接起 来。
在分子克隆中使用的DNA连接酶有两种。 即大肠杆菌DNA连接酶和T4 DNA连接酶。
一、工具酶
(一)限制性核酸内切酶(限制性酶) (restriction enzyme)
在识别双链DNA分子中某些特定核苷酸序列 的基础,切割DNA双链的内切酶。
限制修饰系统:
细菌细胞具有防御异源遗传物质(病毒)的进 入的能力,异源DNA分子进入后,会被限制酶 识别并降解,这个过程称为限制。
细菌(宿主)本身的DNA通过甲基化酶的作用, 使DNA得到修饰,免遭自身限制性内切酶的破 坏。
右边界
T-DNA(转移DNA): 是农杆菌侵 染植物细胞时,从Ti质粒上导 致 毒 区 入植物细胞的一段DNA。
与 Ti 质 粒转 移功能 有关的遗传座位
冠瘿碱代谢 酶编码基因
Ti 质粒 复制起 始点
T-DNA两端各有一段25bp的重复序列(分别称为左边界 序列和右边界序列)。
T-DNA携带的致瘤基因实际上就是一些与激素合成有关的 基因,称为致瘤基因,T-DNA的右端序列对T-DNA转移 到植物细胞内具有重要意义。保留T-DNA两端的末端序 列,然后用一段外源DNA插入或直接取代野生型T-DNA 的部分基因可以使植物细胞的致瘤基因除去,从而导致 转化的植物细胞不具有成瘤能力。
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