表观遗传学简介资料

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·转录抑制复合物干扰基因转录。 甲基化DNA结合蛋白与启动子区内的甲基化CpG岛结合,再与其
他一些蛋白共同形成转录抑制复合物(TRC),阻止转录因子与启动子 区靶序列的结合,从而影响基因的转录。
·通过改变染色质结构而抑制基因表达。 染色质构型变化伴随着组氨酸的乙酰化和去乙酰化,许多乙酰化
和去乙酰化本身就分别是转录增强子和转录阻遏物蛋白。
DNA本身的序列、成分和次级结构; RNA根据序列同源性可能靶定的区域; 特定染色质蛋白、组蛋白修饰或相当有序的染色质结构。
·表观遗传学研究内容
甲基化状态保持的方式
·表观遗传学研究内容
-组蛋白修饰(histone modification)
·组蛋白(histone)
组蛋白是存在于染色体内上与DNA结合的碱性蛋白质, 赖氨酸和精氨酸含量丰富;
每个部分都有其特定的优势期,直至所有的部分出现从而形 成一个功能整体。”
1990,Robin Holliday;将表观遗传学定义为“在复杂有机体 的发育过程中,基因活性在时间和空间中调控机制的研究。” 1993,Li E et,al;引进“表观遗传模板”这个术语。 1996,Arthur Riggs et,al;一项关于能引起可遗传的基因功 能改变的有丝分裂和/或减数分裂的研究,而这些变化是DNA 序列的改变无法解释的。
在在人类基因组内,存在有近3万个CpG岛;在大多数染色体上,平 均每100万碱基含有5~15个CpG岛,其中有1.8万多个CpG岛的GC含量 为60%~70%;
正常细胞的CpG岛由于被保护而处于非甲基化状态; 全基因组低甲 基化,维持甲基化模式酶的调节失控和正常非甲基化 CpG岛的高甲基化 是人类肿瘤中普遍存在的现象;
-表观遗传学
研究不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传变化 的,或者说是研究从基因演绎为表型的过程和机制的一门新兴 的遗传学分支。
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·表观遗传学概述
-词源及定义
概 念 模 型 定 义 深 化 概 念 共 识
1942,C. H. Waddington;作为一个后生论和遗传学的合词 而提出。
1968,Erik Erikson;在他的著作里提到“后生论”,“任 何生长的事物都有一个平面图,在这个图之外各个部分出现,
·组蛋白中被修饰氨基酸的种类、位置和修饰类型被称为组蛋白 密码(histone code),遗传密码的表观遗传学延伸,决定了基因表 达调控的状态,并且可遗传。
研究证明启动子区的高甲基化导致抑癌基因失活是人类肿瘤所具有 的共同特征之一,而且这种高甲基化是导致抑癌基因失活的又一个机制。
·表观遗传学研究内容
-DNA甲基化的转录抑制机制
·直接干扰特异转录因子与各自启动子结合的识别位置。 DNA的大沟是许多蛋白因子与DNA结合的部位,胞嘧啶的甲基化
干扰转录因子与DNA的结合。
·表观遗传学研究内容
-DNA甲基化(DNA methylation)
主要是基因组 DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基间的共价结 合,胞嘧啶由此被修饰为5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5-mC), 是目前研究得最清楚、 也是最重要的表观遗传修饰形式。
甲基化转移酶 DNMT1
胞嘧啶 C
Biblioteka Baidu
SAM S-腺苷甲硫氨酸
胞嘧啶甲基化反应
5-甲基胞嘧啶 5-mC
·表观遗传学研究内容
-DNA甲基化的遗传与保持
·DNA复制后,新合成链在DNMT1的作用下,以旧链为模板进行 甲基化;
·甲基化并非基因沉默的原因而是基因沉默的结果,其以某种机 制识别沉默基因,后进行甲基化;
·DNA全新甲基化。引发因素可能包括:
-组蛋白修饰 ·组蛋白修饰是表观遗传研究的重要内容。
·组蛋白的 N端是不稳定的、无一定组织的亚单位, 其延伸至核
小体以外,会受到不同的化学修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素 化等),这种修饰往往与基因的表达调控密切相关。
·被组蛋白覆盖的基因如果要表达,首先要改变组蛋白的修饰状
态,使其与DNA的结合由紧变松,这样靶基因才能与转录复合物相互 作用。因此,组蛋白是重要的染色体结构维持单元和基因表达的负控 制因子。
基因转录后的调控
RNA干扰(RNAi) 基因组中非编码RNA 微小RNA(miRNA) 核糖开关等
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·表观遗传学研究内容
·表观遗传学研究内容
·CpG岛(CpG island)
许多基因,尤其是管家基因的启动子区,基因的末端通常存在一些 富含双核苷酸“CG”的区域;
CpG表示核苷酸对,其中G在DNA链中紧随C后,长度通常在几百到 几千核苷酸的长度内变化;
2007,Adrian Bird;将表观遗传学定义为染色体的构造适应 ,以便启始、发出信号或保持变构的活性状态。
2008,冷泉港会议;达成了关于表观遗传学的共识,即“染色 体的改变所引起的稳定的可遗传的表现型,而非DNA序列的 改变。”
5
·表观遗传学概述
表观遗传机制
·表观遗传学概述
-表观遗传学的主要特点
·可遗传的,即这类改变通过有丝分裂或减数分裂,能在细胞或个 体世代间遗传; ·可逆性的基因表达调节,也有较少的学者描述为基因活性或功能 的改变; ·没有DNA序列的改变或不能用DNA序列变化来解释。
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·表观遗传学研究内容
基因选择性转录表达 的调控
DNA甲基化 组蛋白修饰 染色质重塑 基因印记等
表观遗传学简介
Jomi
20131121
·表观遗传学简介
基因突变??
·表观遗传学简介
·表观遗传学概述 ·表观遗传学研究内容 ·表观遗传学研究意义
·表观遗传学概述
-表观遗传(Epigenetics)
所谓表观遗传就是不基于DNA差异的核酸遗传。即细胞 分裂过程中,DNA 序列不变的前提下,全基因组的基因表达 调控所决定的表型遗传,涉及染色质重编程、整体的基因表 达调控(如隔离子,增强子,弱化子,DNA甲基化,组蛋白 修饰等功能 ), 及基因型对表型的决定作用。
染色质中的组蛋白与DNA的含量之比为1:1; 几乎所有真核细胞染色体的组蛋白均可分成5种主要的组 分:H1,H2A,H2B,H3,H4;核小体组成的核心蛋白; 是脱氧核糖核酸(DNA)折叠时所依赖的线轴; 组蛋白的基因非常保守,亲缘关系较远的种属中,四种 组蛋白(除H1外)氨基酸序列都非常相似;
·表观遗传学研究内容
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