拟南芥Trihelix转录因子基因家族研究
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周 宏， 钱 娇 ， 李 荣芳 ，陈丹丹 ，方荣俊 ， 赵卫国
（ 江 苏 科 技 大学 生 物技 术 学 院 ， 镇江 ２ １ ２ ０ １ ８ ）
摘
要： Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转录 因子家族在植 物生长发育与响应逆境胁迫等 方面发挥 着重要作用 ， 但 目前基 于拟南 芥全基 因组水平
Ａ ｂｓ ｔ ｒ ａ ｃ ｔ：Ｔｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ ｔ ｒ ａ ｎｓ ｃ ｉｐ ｒ ｔ ｉ ｏ ｎ ｆ ａ ｃ ｔ ｏ ｒ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ ｐ ｌ ａ ｙ ｓ ａ ｎ ｅ ｓ ｓ ｅ ｎ ｔ ｉ ａ ｌ ｒ ｏ ｌ ｅ ｉ ｎ ｐ ｌ ａ ｎｔ ｇ ｒ ｏ ｗｔ ｈ，ｄ ｅ ｖ ｅ ｌ ｏ ｐ ｍｅ ｎ ｔ ａ ｎ ｄ ｓ ｔ ｒ ｅ ｓ ｓ ｒ ｅ ・
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（ Ｃ ｏ ｌ ｌ ｅ ｇ ｅ ｏ ｆ Ｂ ｉ ｏ ｔ ｅ ｃ ｈ ｎ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ ，Ｊ ｉ ａ ｎ ｇ ｓ ｕ Ｕ ｎ ｉ ｖ ｅ ｒ ｓ ｉ ｔ ｙ ｏ ｆ Ｓ ｃ ｉ ｅ ｎ ｃ ｅ ａ ｎ ｄ Ｔ ｅ ｃ ｈ ｎ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ ， Ｚ ｈ ｅ ｎ ｊ ｉ ａ ｎ ｇ ２ １ ２ ０ １ ８ ，Ｃ ｈ ｉ ｎ ａ ）
鉴定和分析该基 因家族 的研究 尚未 见相 关报道． 利用 生物 信息学方法在拟南芥基因组数据库 中鉴定 到 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 家族成员 ３ ４ 个． 通过序列 聚类和功能结构域分析发现 ， 该 家族均含有高度 保守 的 、 特 征性 的 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ结构域 ； 根 据亲缘 关系远 近和结 构 域特 点 ， 将拟南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子 家族 分为 ５ 个 亚家族 ， 基 于 ＭＥ ＭＥ程序分 析的保守基 序与 聚类分析结 果具有较 高 的一
第３ ｌ 卷第 ２ 期
２ ０ １ ７年 ４月
江苏科技大学学报（ 自然科学版）
Ｊ ｏ ｕ ｒ ｎ ａ ｌ ｏ ｆ Ｊ ｉ ａ ｎ ｇ ｓ ｕ Ｕ ｎ ｉ ｖ ｅ ｒ ｓ ｉ ｔ ｙ ｏ ｆ Ｓ ｃ ｉ ｅ ｎ ｃ ｅ ａ ｎ ｄ Ｔ ｅ ｃ ｈ ｎ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ（ Ｎ ａ ｔ ｕ ｒ ａ ｌ Ｓ ｃ ｉ ｅ ｎ ｃ ｅ Ｅ ｄ ｉ ｔ ｉ ｏ ｎ ）
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Ｖ 。 １ ． ３ １ Ｎ 。 ． ２
Ａ ｐ ｒ ・ ２ ０ １ ７
ｄ ｏ ｉ ： １ ０ ． ３ ９ ６ ９ ／ ｊ ． ｉ ｓ ｓ ｎ ． １ ６ ７ ３— ４ ８ ０ ７ ． ２ ０ １ ７ ． ０ ２ ． ０ ２ ０
拟 南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ转 录 因 子 基 因 家 族 研 究
ｓ ｐ ｏ ｎ ｓ ｅ；Ｈｏ ｗｅ ｖ ｅ ｒ ，ｆ ｅ ｗ ｓ ｔ ｕ ｄ ｉ ｅ ｓ ａ ｂ ｏ ｕ ｔ ｉ ｄ ｅ ｎ ｔ ｉ ｉ ｆ ｃ ａ ｔ ｉ ｏ ｎ ａ ｎ ｄ ａ ｎ ａ ｌ ｙ ｓ ｉ ｓ ｏ ｆ ｔ ｈ ｉ ｓ ｇ ｅ ｎ ｅ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ ｉ ｎ Ａ ｒ ａ ｂ ｉ ｄ ｏ ｐ ｓ ｉ ｓ ｏ ｎ ｔ ｈ ｅ ｇ ｅ ｎ ｏ ｍｅ — ｗｉ ｄ ｅ ｌ ｅ ｖ ｅ ｌ ｈ ａ ｖ ｂ ｅ ｅ ｎ ｒ ｅ ｐ ｏ ｔｅ ｒ ｄ ．Ｉ ｎ ｔ ｈ ｉ ｓ ｓ ｔ ｕ ｄ ｙ，３ ４ ｍｅ ｍｂ ｅ ｒ ｓ ｏ ｆ Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ，ｗ ｈ ｉ ｃ ｈ ｃ ｏ ｎ ｔ ａ ｉ ｎ ｈ ｉ ｇ ｈ ｌ ｙ ｃ ｏ ｎ ｓ ｅ ｒ ｖ ｅ ｄ ａ ｎ ｄ
一
步揭示 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子家族的系统发育 和生物学 功能奠定 了基础．
文献标志码 ： Ａ 文章编号 ： １ ６ ７ ３— ４ ８ ０ ７ （ ２ ０ １ ７ ） ０ ２— ０ ２ ３ １ — ０ ６
关键 词 ： 拟南芥 ； Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ ； 转 录因子家族 ； 进 化 中图分类 号 ： Ｑ ７ １ ； Ｑ ８ １ １ ． ４
致性 ． 采用 Ｉ ｎ ｔ Ａ ｃ ｔ 在 线数 据库分析 ， 发 现拟南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ转录因子家族各成员与其他蛋 白存 在互作 关系． 文中初步 明确 了拟
南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子家族成员的结构和功能特点 、 染 色体分布 、 核定位 信号及该家族蛋 白与其他 蛋 白质 的互作情况 ， 为进
（ 江 苏 科 技 大学 生 物技 术 学 院 ， 镇江 ２ １ ２ ０ １ ８ ）
摘
要： Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转录 因子家族在植 物生长发育与响应逆境胁迫等 方面发挥 着重要作用 ， 但 目前基 于拟南 芥全基 因组水平
Ａ ｂｓ ｔ ｒ ａ ｃ ｔ：Ｔｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ ｔ ｒ ａ ｎｓ ｃ ｉｐ ｒ ｔ ｉ ｏ ｎ ｆ ａ ｃ ｔ ｏ ｒ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ ｐ ｌ ａ ｙ ｓ ａ ｎ ｅ ｓ ｓ ｅ ｎ ｔ ｉ ａ ｌ ｒ ｏ ｌ ｅ ｉ ｎ ｐ ｌ ａ ｎｔ ｇ ｒ ｏ ｗｔ ｈ，ｄ ｅ ｖ ｅ ｌ ｏ ｐ ｍｅ ｎ ｔ ａ ｎ ｄ ｓ ｔ ｒ ｅ ｓ ｓ ｒ ｅ ・
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鉴定和分析该基 因家族 的研究 尚未 见相 关报道． 利用 生物 信息学方法在拟南芥基因组数据库 中鉴定 到 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 家族成员 ３ ４ 个． 通过序列 聚类和功能结构域分析发现 ， 该 家族均含有高度 保守 的 、 特 征性 的 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ结构域 ； 根 据亲缘 关系远 近和结 构 域特 点 ， 将拟南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子 家族 分为 ５ 个 亚家族 ， 基 于 ＭＥ ＭＥ程序分 析的保守基 序与 聚类分析结 果具有较 高 的一
第３ ｌ 卷第 ２ 期
２ ０ １ ７年 ４月
江苏科技大学学报（ 自然科学版）
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拟 南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ转 录 因 子 基 因 家 族 研 究
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步揭示 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子家族的系统发育 和生物学 功能奠定 了基础．
文献标志码 ： Ａ 文章编号 ： １ ６ ７ ３— ４ ８ ０ ７ （ ２ ０ １ ７ ） ０ ２— ０ ２ ３ １ — ０ ６
关键 词 ： 拟南芥 ； Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ ； 转 录因子家族 ； 进 化 中图分类 号 ： Ｑ ７ １ ； Ｑ ８ １ １ ． ４
致性 ． 采用 Ｉ ｎ ｔ Ａ ｃ ｔ 在 线数 据库分析 ， 发 现拟南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ转录因子家族各成员与其他蛋 白存 在互作 关系． 文中初步 明确 了拟
南芥 Ｔ ｒ ｉ ｈ ｅ ｌ ｉ ｘ 转 录因子家族成员的结构和功能特点 、 染 色体分布 、 核定位 信号及该家族蛋 白与其他 蛋 白质 的互作情况 ， 为进