生物无机化学研究进展

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晶体场理论的应用
• 1、生物配合物的热力学稳定性。第一过渡金属离子(Ⅱ)八面 、生物配合物的热力学稳定性。第一过渡金属离子( 体弱场配合物的稳定性次序符合埃文-威廉斯 威廉斯( 体弱场配合物的稳定性次序符合埃文 威廉斯( Irving-Williams) ) 规律,这些离子在生物体内分别与含氧、含氮、 规律,这些离子在生物体内分别与含氧、含氮、硫配体形成配 合物的稳定性为: 合物的稳定性为: MnL<FeL<CoL<NiL<CuL>ZnL < < < < > • 2、配合物的氧化还原稳定性。生物体内参与氧化还原的过渡元 、配合物的氧化还原稳定性。 素主要由铁、铜和钴钼等, 素主要由铁、铜和钴钼等,在生物体内催化活性与金属离子的 氧化态变化有关。过渡金属具有若干稳定的氧化态, 氧化态变化有关。过渡金属具有若干稳定的氧化态,这是过渡 金属的特性。许多金属蛋白质体系常常涉及电子传递链, 金属的特性。许多金属蛋白质体系常常涉及电子传递链,一般 是按照它们的氧化还原电位值顺序排列。 是按照它们的氧化还原电位值顺序排列。在金属酶体系中各种 过渡金属电对的氧化还原电位数值, 过渡金属电对的氧化还原电位数值,将决定它在电子传递过程 中的作用,可以用晶体场理论对配合物的氧化还原的方向 晶体场理论对配合物的氧化还原的方向作出 中的作用,可以用晶体场理论对配合物的氧化还原的方向作出 解释。 解释。 活性配合物。 • 3、配位体取代反应动力学。惰性配合物 活性配合物。 、配位体取代反应动力学。惰性配合物/活性配合物
生物无机化学基本原理和理论
• • • • 配位化学原理(晶体场理论及其应用) 配位化学原理(晶体场理论及其应用) 氧化还原反应电子转移机理 生物分子的性质及空间构型 底物结合与活化的非氧化还原机理
有机分子间的弱化学 作用力以及立体效应 (如:氢键、立体位阻等)
底物与活性中 心的相互作用 (如:协同效应等)
生物无机化学研究热点及未来方向
金属离子、微量元素等生物无机化学 成分在生命科学中占有十分重要的地 位,它们不仅是生物体的重要组分,参 与酶和蛋白质的合成、构象、分泌、 转运、磷酸化和细胞调节,而且在基因 的转录、表达、调控和分子识别中也 具有重要意义。
晶体场理论的要点
• 1、晶体场理论认为配合物中的过渡金属离子与配位体之 、 间的化学键都是静电引力 金属离子带正电荷, 静电引力。 间的化学键都是静电引力。金属离子带正电荷,配体带负 电荷。 电荷。 • 2、在配位体电场的作用下,5个简并的 轨道发生能级分 个简并的d轨道发生能级分 、在配位体电场的作用下, 个简并的 分裂方式决定于金属离子周围配位体的排列方式, 裂,分裂方式决定于金属离子周围配位体的排列方式,即 配位体场的对称性。 配位体场的对称性。 • 3、每个 轨道可容纳 个电子,电子按轨道能级自低往高 轨道可容纳2个电子 、每个d轨道可容纳 个电子, 排列,使体系能量最低。 电子在 电子在t-g和 轨道中的分布取 排列,使体系能量最低。d电子在 和eg轨道中的分布取 决于分裂能∆和成对能 和成对能P。 决于分裂能 和成对能 。成对能是指为了克服两个电子 成对地进入同一轨道所消耗的能量。 成对地进入同一轨道所消耗的能量。当∆>P时为强场情 > 时为强场情 况,电子尽量分配到t-g轨道,它们采取低自旋排布。当∆ 电子尽量分配到 轨道,它们采取低自旋排布。 轨道 时为弱场情况, 轨道, <P时为弱场情况,电子尽量分占 和e-g轨道,它们采 时为弱场情况 电子尽量分占t-g和 轨道 取高自旋排布。 取高自旋排布。 • 4、在配位体的作用下金属离子 轨道发生分裂,电子优先 轨道发生分裂, 、在配位体的作用下金属离子d轨道发生分裂 填充在较低能量的轨道上, 填充在较低能量的轨道上,电子填入分裂轨道比处于未分 裂轨道的总能量要低,这种能量下降称为晶体场稳定化能 裂轨道的总能量要低,这种能量下降称为晶体场稳定化能 (CFSE)。 )。
生物无机化学发展及现状
• 在过去的 年中,生物无机化学学科发展越来越受重视,研 在过去的10 年中,生物无机化学学科发展越来越受重视, 究队伍不断壮大,取得了令人瞩目的成就和发展, 究队伍不断壮大,取得了令人瞩目的成就和发展,正在成为 化学和生物学交叉领域中一个非常活跃的部分, 化学和生物学交叉领域中一个非常活跃的部分,并紧密结合 了实际问题。 了实际问题。 • 我国生物无机化学从 世纪 年代开始起步,当时落后于 我国生物无机化学从20 世纪80 年代开始起步, 国际上10 年左右。但是在过去20 年里,经过我国老一辈生物 国际上 年左右。但是在过去 年里 经过我国老一辈生物 无机化学家的不懈努力,在内源性含金属生物功能分子的结构 无机化学家的不懈努力 在内源性含金属生物功能分子的结构 与作用机理、金属物种与生物大分子(蛋白质 核酸、多糖、 蛋白质、 与作用机理、金属物种与生物大分子 蛋白质、核酸、多糖、 类脂等) 和分子功能聚集体的相互作用、细胞无机化学、 类脂等 和分子功能聚集体的相互作用、细胞无机化学、医药 学中的无机物、生物矿化等领域取得了突出成绩。总体上, 学中的无机物、生物矿化等领域取得了突出成绩。总体上, 三个台阶: 大致跃升了三个台阶 从生物小分子配体上升到生物大分子; 大致跃升了三个台阶:从生物小分子配体上升到生物大分子; 又从生物大分子到研究生物体系; 又从生物大分子到研究生物体系;近年来又开始了对细胞层 次的无机化学研究。 次的无机化学研究。
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生物无机化学发展及现状
自20 世纪70 年代以来,生物无机化学的发展主要由以下 方面 世纪 年代以来 生物无机化学的发展主要由以下3 生物无机化学的发展主要由以下 所推动: 所推动 蛋白质和其他生物分子高分辨结构的迅速测定。 • (1) 蛋白质和其他生物分子高分辨结构的迅速测定。生物氧 化还原反应过程一直是生物无机化学研究的主题中心 一直是生物无机化学研究的主题中心, 化还原反应过程一直是生物无机化学研究的主题中心 目前 最引人注目的是广泛使用有效的方法检测蛋白质工程化合 物的结构,而这些在 年代仅仅存在于人们的梦想中。 而这些在70 物的结构 而这些在 年代仅仅存在于人们的梦想中。 • (2) 用于结构及动力学测定的高效光谱仪器的应用。人们不 用于结构及动力学测定的高效光谱仪器的应用。 仅知道许多呼吸酶的结构,人们还知道很多关于它们的反应 仅知道许多呼吸酶的结构 人们还知道很多关于它们的反应 机理,这些都归功于研究反应动力学的方法的发展 这些都归功于研究反应动力学的方法的发展,包括光引 机理 这些都归功于研究反应动力学的方法的发展 包括光引 发和检测技术都使我们能够直接观测到反应的最初阶段。 发和检测技术都使我们能够直接观测到反应的最初阶段。 • (3) 生物工程在创造新的生物相关结构中的广泛应用 如基 生物工程在创造新的生物相关结构中的广泛应用,如基 因定点突变技术等。今天,很多的分子能够被随意地操作 很多的分子能够被随意地操作,其 因定点突变技术等。今天 很多的分子能够被随意地操作 其 结果是特定的蛋白质和核酸已经变成说明生物功能的基本 模型。 模型。
生物无机化学
金属生物分子 蛋白质 金属酶 金 属 激 属 活 酶 白 酶 蛋 酶 白 体 运 蛋 金 载 储 体 白 子 属 载 蛋 电 金 子 节 料 金属蛋白 命 小 分 调 材 体 构 原 结 还 化 生 氧 非蛋白质 光
生物无机化学发展及现状
• 地球表壳的生命起源是在无机环境中进化的 血液中含有铁,在很多生 地球表壳的生命起源是在无机环境中进化的,血液中含有铁 在很多生 血液中含有铁 理反应中涉及铜和锌,它们作为生命必要元素的发现被称为是 它们作为生命必要元素的发现被称为是生物无机 理反应中涉及铜和锌 它们作为生命必要元素的发现被称为是生物无机 化学的初期阶段。 化学的初期阶段。 • 20 世纪 年代末期到 年代早期 著名的化学家 世纪50 年代末期到60 年代早期, 著名的化学家Kendrew 和Perutz 分别解答了肌红蛋白和血红蛋白 肌红蛋白和血红蛋白的 射线结构的问题。 分别解答了肌红蛋白和血红蛋白的X 射线结构的问题。 • 20 世纪 年代 很多无机化学家也加入到这个领域中来 大量相关的出 世纪70 年代,很多无机化学家也加入到这个领域中来 很多无机化学家也加入到这个领域中来,大量相关的出 版物发行。 版物发行。 • 1976 年6 月,数百名科学家齐聚哥伦比亚大学 讨论了当时在无机化学 数百名科学家齐聚哥伦比亚大学, 数百名科学家齐聚哥伦比亚大学 稳步发展起来 和生物学交叉地带的发展,生物无机化学从此稳步发展起来。 和生物学交叉地带的发展,生物无机化学从此稳步发展起来。 • 1983 年,召开了第一届国际生物无机化学会议 此后每隔两年举行一 召开了第一届国际生物无机化学会议 国际生物无机化学会议,此后每隔两年举行一 我国已申请主办2009年第 届国际生物无机化学会议。 年第14 次。我国已申请主办 年第 届国际生物无机化学会议。 • 除了基础理论方面召开的国际生物无机化学会议以外 国际应用生物无 除了基础理论方面召开的国际生物无机化学会议以外,国际应用生物无 机化学会议由我国北京大学王夔教授和澳大利亚 由我国北京大学王夔教授和澳大利亚J 教授发起, 机化学会议由我国北京大学王夔教授和澳大利亚 . Webb 教授发起 也是每两年召开一次。 也是每两年召开一次。这些学术活动大大促进了国内外生物无机化学 学科的发展。 学科的发展。
配位化学原理: 配位化学原理:
生物体系中某些金属与配体
金属 Mn Fe Fe Co Zn Zn Pb Ni Cu 配体 咪唑 卟啉, 卟啉,咪唑 含硫配体 咕啉环 -NH2,咪唑 (-RS) (- )2 -SH 半胱氨酸 咪唑、 咪唑、酰胺 生物体系 丙酮酸脱羧酶 血红素、氧化酶、 血红素、氧化酶、过氧化氢酶 铁氧化还原蛋白 B12 胰岛素、 胰岛素、碳酸酐酶 醇脱氢酶 δ-氨基乙酰丙酮脱水酶 - 脲酶 白蛋白
生物无机化学研究进展
主要内容: 主要内容:
• • • • 生物无机化学概念及研究对象 生物无机化学历史发展及现状 生物无机化学基本原理和理论 生物无机化学热点及未来方向
生物无机化学
• 生命体的无机化学,又称无机生物化学或生物配位化学。20 生命体的无机化学,又称无机生物化学或生物配位化学。 世纪60年代以来逐步形成 年代以来逐步形成, 无机化学、生物化学、医学等 世纪 年代以来逐步形成,是无机化学、生物化学、医学等 多种学科的交叉领域。 多种学科的交叉领域。 • 研究对象:生物体内的金属(和少数非金属)元素及其化合 研究对象:生物体内的金属(和少数非金属)元素及其化合 金属 及其 特别是痕量金属元素和生物大分子配体 痕量金属元素 配体形成的生物配合 物,特别是痕量金属元素和生物大分子配体形成的生物配合 如各种金属酶 金属蛋白等 金属酶、 物,如各种金属酶、金属蛋白等。 • 生命体中的生物分子包括氨基酸、肽和蛋白质等,金属离子 生命体中的生物分子包括氨基酸 肽和蛋白质等 氨基酸、 主要有铁、 过渡金属元素。 主要有铁、锌、铜、钼、镍 等过渡金属元素 • 侧重研究:它们的“结构 性质 生物活性”间的关系以及在生 侧重研究:它们的“结构-性质 生物活性” 性质-生物活性 命环境内参与反应的机理。 命环境内参与反应的机理。 • 为便于研究,常用人工模似的方法合成具有一定生理功能的 为便于研究, 金属配位化合物。 金属配位化合物。
金属离子与有机分 子间的配合体作用
晶体场理论及其应用
生物配体、蛋白质、核酸及酶( 生物配体、蛋白质、核酸及酶(氨 基酸、多肽和蛋白质等) 基酸、多肽和蛋白质等)能和生命元素 过渡金属离子Mn Fe、 过渡金属离子Mn 、Fe、 Co 、Zn 、Mo 等形成金属配合物 金属配合物。 等形成金属配合物。生物配体与金属离 子形成配合物, 子形成配合物,必定会引起其性质及功 能的改变。晶体场理论可对配合物的性 能的改变。晶体场理论可对配合物的性 能做出比较满意的解释。 能做出比较满意的解释。
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