一例心脏缺陷胎儿染色体lp36.3微缺失的产前诊断重点

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an

karyotype of 46,XY,t(1;14)(t)36.3;p12),and that the SNP—
or
abnormal chromosome 1 derived from the paternaI translocation。Conclusion FISH
can
Array combined with GTG banding and
2.1
结果
针,200万个拷贝数探针,探针平均间隔约1 kb)。提 取胎儿羊水和父母全血基因组DNA(Qiangen试剂 盒),取500 ng完整基因组DNA按实验手册进行实 验。采用Affymetrix 7G扫描仪扫描,扫描信号图经 Affymetrix的Chas软件分析、计算产生每一个位点的 基因型或信号相对强度,包括拷贝数变异(copy

analyze the fetus and his parents.Results
in
6.9
Mb microdeletion
at
1 p36.33 p36.23
the fetus.Chromosomal and FISH
analyses indicated that the father of the fetus had fetus has inherited
常规的G显带核型分析只能检测到5~10 Mb以上的 染色体片段异常,对于微小的染色体结构的异常不能 检测。染色体末端通常涉及的片段较小,而且大部分 是G显带浅染区,肉眼难以辨认,发生染色体重排时 一般难以通过传统细胞遗传学核型分析检测。在诊断 染色体末端重排时除了需要G显带核型分析技术,更 需要借助FISH和基因芯片技术。 1p36缺失是最常见的染色体亚端粒区域微缺失, 其表现出来的临床症状称为1p36缺失综合征,在人群 中的发病率为1/5000~1/10 000。lp36缺失综合征 患者的症状包括中度到重度智力低下、宫内发育迟缓、 生长发育迟缓、心脏畸形、听力障碍、视力障碍、肌张力 低、癫痫、肥胖、泌尿生殖器缺陷、甲状腺机能减退症、 骨骼异常、大脑异常、喂食困难、异常颅面特征(小头畸 形、短头畸形、大前囟门、面中部发育不良、直眉毛、深 陷的眼睛、内眦赘皮、鼻梁平坦、平鼻子、尖下巴、低位 耳)等[3‘5]。1p36缺失综合征患者涉及4种染色体重 排:单纯性末端缺失(占67%)、衍生染色体(占16%)、 中间缺失(占10%)和复杂重排(占7%)[63。由于 1p36缺失综合征患者缺失的片段大小和位置不同,导 致缺失不同的剂量敏感基因而产生不同的单倍剂量不 足效应,或发生不同的基因印记效应,或暴露某些隐性 突变的等位基因,从而表现出多样化表型。1p36缺失 综合征患者中50%患有癫痫;71%患有先天性心脏缺 陷,主要缺陷为室间隔缺损、动脉导管未闭、瓣膜异常 和心肌病;47%有行为异常,包括30%咬手、22%乱发 脾气、13%食欲过盛,与Prader—Willi综合征(Prader— Willi syndrome,PWS)典型表型重叠【7]。 lp36上含有多个基因,有学者研究了其中的部分 基因与疾病的关系,取得很大进展。位于1p36.33的 GABRD基因和位于1p36.31的KCNAB2基因是癫 痫的候选基因,这些基因的缺失会导致基因表达的单 倍剂量不足,从而出现癫痫症状¨’8]。位于1p36.33的 SKI基因是一种促进细胞生成的原癌基因,该基因的 单倍剂量不足可能会引起肌张力减退、运动发育迟缓、 智力低下、面裂等症状[9]。位于1p36.33的MMP23 基因在调节囟门关闭上起重要作用,当基因缺失,基因 表达单倍剂量不足时会导致前囟门关闭延迟;当基因 重复,基因过度表达时会导致颅缝早闭[1…。距离1p 末端10 Mb以内的区域有很多基因与葡萄糖和脂类 代谢相关,这些基因表达的改变或者疾病易感基因的 影响程度不同,可能会导致lp36缺失综合征中肥胖的 发展。DAngelo等[1妇发现1p36缺失综合征有类似 PWS综合征表型的患者有2.5 Mb的末端缺失,提出 1p36.33一p36.32是肥胖和食欲过盛表型的关键区域。
number variation,CNV)和SNP。
1.3
SNP—array检测结果
胎儿高密度SNP—array
023 411—
芯片结果为arr[h919]1p36.33p36.23(1
7 881
780)×1,在lp36.33p36.23存在约6.9 Mb的 G显带核型分析结果 羊水G显带核型分析结
于发现染色体末端隐匿性易位、微缺失或微重复,提高诊断准确率,对复发风险的评估有重要价值。
【关键词】染色体末端; 位杂交 隐匿性易位; 核型分析; 单核苷酸多态微阵列芯片技术分析; 荧光原
Prenatal diagnosis of 1p36.3 I.in
microdeletion in

fetus with
help
assess
to
detect cryptic translocation,microdeletion
recurrence
百度文库
microduplicatlon of chromosomes and is valuable
to
the
risk for the affected family.
Karyotyping; Single
Yat—sen University,Guangzhou,Guangdong 510080.China (?orrPspo玎di拧g author:Wu Jianzhu,Email:w“歹;廿":矗“3140(雪1 26.COrn
[Abstract]
recurrence
Objective
To
analyze
2016,V01.33,No.3
隔缺损,均未行进一步检查。 1.2全基因组基因芯片检测 应用美国Affymetrix
哚复染剂于杂交区域位置,盖上盖玻片,暗处放置10 min后,在荧光显微镜下观察。

公司提供的CytoHD-SNP—Array微阵列,使用
Affymetrix CytoScan
HD探针(含约75万个SNPs探
FISH检测
胎儿父亲中期分裂相FISH分析,
选用定位于Monosomy lp36微缺失综合征关键区内 的SKI探针(红色信号是SKI探针,绿色信号是lq44 探针,Cytocell公司)。滴片风干后50℃烤3 h,放人 37℃预温的2×SSC溶液浸泡10 min,在室温的PBS 溶液中漂洗3 min,用浓度分别为70%、85%、100%的 乙醇脱水各2 min。干燥后在暗室中加对应探针,盖 上盖玻片后封胶,杂交仪73℃变性3 min,42℃杂交16 h,然后洗片,干燥后滴加8“I。4’,6一二脒基一2一苯基吲
中华医学遗传学杂志2016年6月第33卷第3期Chin J Med Genet,June 2016,V01.33,No.3
・353・
・临床遗传学论著・
一例心脏缺陷胎儿染色体lp36.3
微缺失的产前诊断
吴坚柱 何志明 林少宾
谢英俊
陈宝江
陈筠虹
510080广州,中山大学附属第一医院妇产科胎儿医学中心
通信作者:吴坚柱,Email:wujianzhu3140@126.corn DOI:10.3760/cma.j.issn.1003—9406.2016.03.017
1p36.33p36.23不存在缺失
胎儿羊水G显带核型分析图lp36.3被一段未知来源的随体柄和随体所代替
胎儿父亲G显带核型分
1p末端和14p末端平衡易位图5胎儿父亲中期分裂相SKI探针FISH分析结果1条lp末端缺少SKI探针信号,易位到其他染色体末
万方数据
中华医学遗传学杂志2016年6月第33卷第3期Chin J Med Genet,June 2016,V01.33,No.3
(fluorescence in situ
hybridization,FISH)验证胎儿染色体1p36.3微缺失的来源。结果
高密度SNP—
array芯片检测显示胎儿在lp36.33p36.23存在6.9 Mb的微缺失,G显带核型分析和FISH检测提示其父 亲核型为46,XY,t(1;14)(p36.3;p12),胎儿携带一条由父亲lP末端和14p末端平衡易位形成的l号衍生 染色体,核型为46,XY,der(1)t(1;14)(p36.3;p12)pat。结论 SNP—array结合G显带和FISH技术有助
缺失(图1),其父母检测结果正常(图2)。
2.2
果显示胎儿1P末端的lp36.3被一段未知来源的随体 柄和随体所代替,核型为46,XY,add(1)(p36.3)(图 3)。胎儿母亲G显带核型分析结果正常,胎儿父亲G 显带核型分析结果显示1P末端和14p末端平衡易位, 核型为46,XY,t(1;14)(p36.3;p12)(图4)。
complex heart defect
Wu Jianzhu,He Zhiming,
Shaobin,Xie Yingjun,Chen Buojiang,Chen Junhong
Fetal
Medicine
Center,Department of Gynecology and Obstetrics,The First Affiliated Hospital of Sun
术能检测出染色体末端的微缺失和微重复,有利于染 色体末端隐匿性易位的检出。本研究中,我们应用 SNP—Array、G显带核型分析和荧光原位杂交
(fluorescence in situ
hybridization,FISH)技术检出1
例心脏缺陷胎儿携带来源于父亲1P末端和14p末端
万方数据
中华医学遗传学杂志2016年6月第33卷第3期Chin J Med Genet,June
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图3
小Y④
左上角红色粗横杠示在Ip36.33p36.23存在6.9 Mb的缺失
图2 胎儿父亲SNP array芯片检测结果 图4
胎儿SNP—array芯片检测结果

fetus
presenting
with
complex
heart
defect and
assess
the
risk.Methods
Conventional karyotyping,fluorescence in situ
tO
hybridization(FISH)and single
nucleotide polymorphism based array(SNP—array)were used SNP—Array has detected
nueleotide polymorphism-based arrays,SNP—array)技
平衡易位衍生的1号染色体。 l对象与方法 1.1对象胎儿父母为再婚夫妻,非近亲婚配。胎儿 母亲年龄33岁,G3P1A1,2005年与前夫生育一子,表 型正常。2013年怀孕3个月时因“胚胎停育”行人工 流产;再次怀孕22周,超声检查结果显示胎儿室间隔 缺损、三尖瓣发育不良、主动脉弓离断、胸腺缺如、右侧 单脐动脉。父亲年龄35岁,与前妻育有一子一女,均 为“脑瘫患儿”,超声检查发现女儿动脉导管未闭、房间
[Key words]
Chromosomal terminal;
Cryptic
translocation;
nueleotide
polymorphism—based array analysis;
Fluorescence in situ
hybridization
染色体末端的亚端粒区域富含基因,常常发生染 色体重排,重排后可能会导致智力障碍¨]。大多数染 色体末端属于G显带浅带,发生隐匿性易位时G显带 不易察觉。单核苷酸多态微阵列芯片(single
【摘要】
目的
对l例心脏缺陷胎儿进行细胞遗传学诊断,明确其病因,为再生育复发风险评估及产
应用单核苷酸多态微阵列芯片(single nucleotide polymorphism—based
arrays,
前诊断提供依据。方法
SNP—array)对胎儿及其父母行全基因组DNA扫描分析,结合G显带核型分析及荧光原位杂交
2.3
G显带核型分析
签署知情同意书后抽取30
ml。羊水进行羊水细胞培养、G显带核型分析。取胎 儿父母外周血各1 mL行淋巴细胞培养、行G显带核 型分析。选择550条带以上的核型进行分析,核型按 《2013人类细胞遗传学国际命名体制(ISCN)》描述。
1.4
FISH检测结果胎儿父亲中期分裂相SKI探
针FISH结果显示其中1条1P末端缺少SKI探针信 号,易位到其他染色体末端,验证了胎儿父亲发生 1p36.3易位(图5)。确定胎儿携带1条来源于父亲的 1P末端和14p末端平衡易位形成的衍生1号染色体, 核型为46,XY,der(1)t(1;14)(p36.3;p12)pat。 3讨论 染色体末端亚端粒区域的隐匿性重排可能会引起 畸形和智力低下。在不明原因的中度或重度智力缺陷 儿童中,约5%~7%存在隐匿性亚端粒区域重排[2]。
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