5例亲子鉴定常染色体STR突变基因座PI的计算与分析
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计 算 亲权 指数 (paternity index,PI)、累积 亲 权 指 数 (cumulative paternity index,CPI)。根 据 司 法 部 《亲 权鉴 定技 术 规 范 》(SF/ZJD0105001—2010)和 《法庭 科 学 DNA 亲 子 鉴 定 规 范 》(GA/T965—2011) 判断是 否 存在 亲缘 关 系 。 2 结 果
遗传 分 析 仪 进 行 毛 细 管 电 泳 ,通 过 Gene Mapper ID.V3.2软 件进 行结 果分 析 。 1.2.3 父权 指 数计 算方 法 :在 亲 子鉴 定 中 ,父 权 指 数 是判 断亲 子关 系所 需 的 两个 概率 的似 然 比,即 具 有 假设 父遗 传 表 型 的男 子 是 孩 子 生 物 学 父 亲 的 概 率 (X )与 随机 男子 是孩 子 生 物学 父 亲 的概 率 (Y )
的 比值 。亲权 指数 (paternity index,PI)PI=== V 一
筹 ,x(具有假设父遗传表型的男子是孩子生
物 学父 亲 的概率 )一 f(生母 提 供生 母基 因概 率 )×C (假 设 父提 供生 父 基 因概 率 )。Y (随机 男 子 是 孩 子 生 物学 父 亲 的概率 )一 f(生母 提供 生母 基 因概 率 ) ×g(随机 男 子 提供 生 父 基 因 概 率 )。 由于 STR 基 因突变 一 步 约 占 90 以上 ,Brenner假 设 :50 9/6的 一 步 向 上 突 变 或 5O 的 一 步 向 下 突 变 ;5V0的 二 步 向上 突 变 或 5 的 二 步 向 下 突 变 ,以 此 类 推 。 Pr
DOI:10.3969/j.issn.0253—9926.2018.04.039 作 者 单 位 :030001太 原 ,山 西 医科 大 学 法 医 学 院 (牛 蕾 蕾 );广 东 省 汕 头 市公 安 局 刑 事 技 术 中心 (窦 定 所 (康 永 红 )
· 法 医 论 坛 ·
山 西 医 药 杂 志 2018年 2月 第 47卷 第 4期 Shanxi Med J,February 2018,Vo1.47,No.4
5例 亲 子 鉴 定 常 染 色 体 STR 突 变基 因座 PI的计 算 与分 析
牛 蕾蕾 窦雪丽 康 永红
短 串联重 复 序 列 (short tandem repeats,sTR) 作为 人类 遗传 学 中一 类重 要 的遗 传 标 记 ,因其 多态 性 高 ,个 体识别 能 力强 ,扩 增 片段 长 度 短 ,广 泛地 应 用 于 法 医学亲 子鉴 定 、个体 识 别 及遗 传 病 连 锁分 析 等方 面_】]。STR 核心 序 列 的 变 异可 能 导致 对 结 果 分析 的偏 差甚 至误 判 ,因此 引起 法 医分 子 生 物学 和 遗 传 学工 作者 的重 视 _2],STR基 因座 在遗 传过 程 中 发生 变异 的机 会相 对 较 低 ,其 突变 率 约 在 0.1 ~ 0.7 ,平 均约 为 0.2 [3],明显高 于蛋 白遗 传 标记 。 本 实验 采 用 Brenner CH 经 验 递 减 模 型 [4 对 STR 突变 基 因座 父 权 指 数 (paternity index,PI)值 进 行 计 算 ,协 助鉴 定 人 员 更 好 地 应 用 突 变基 因 座 PI值 计 算公 式 。我 们 在 近 期 受 理 的 273例 标 准 三 联 体 亲子 鉴定 案件 中观察 到有 5例 发生 遗 传 突 变 ,现报 告 如 下 。 1 对 象 与 方 法 1.1 研究 对 象
Power Plex 21系统 在 认 定 该 5例 亲 子 关 系 的 案 件 中 ,发 现 STR 基 因 座 FGA、D3S1358、 D2S1338、D7S820、D18S51均 发 生 一 步 突 变 ,其 余 基 因座 分 型结 果符 合遗 传 规律 。
山 西 医 药 杂 志 2O1 8年 2月 第 ,1 7卷 第 4期 Shanxi Med J.Fv1)rI㈨ry 20l8.Vo1.4 7.No.1
(D3S1358,D 1S1656,D6S1043,D 13S317,Penta E , D 16S539,D 18S51,D 2SI338,CSF1PO ,Penta D , TH01,vW A ,D21S11,D7S820,D5S818,TP0X,
D8S1l79,D12S391,Dl9S433,FGA),用 ABI 313O
(Q,R假 设 父 遗 传 Q)一 Pr(Q 被 遗 传 )× ×百1×
( ) ,假设 父 为 纯 合 子 ,Pr(Q 被 遗 传 )一 1;假 设
父 为杂 合 子 ,Pr(Q 被 遗 传 )一1/2。 值 为 0.2 , 表 示基 因座 总 的 突 变 率 ,S为 变 的 步 数 ]。如 果 突变来 自母 亲 ,则 女 性 发 生 突变 的 概率 为 男 性 的 1/3.5 E 。 1.3 统计 学处 理
涉及 标 准三 联 体 5个 案 例 ,由被 检 父 、生 母 及 其孩 子 自行 委托 进 行 亲 子 鉴 定 。 每 位 受 检 者 采 集 指血 1O I ,置 于装 有 1 mL高 压 灭 菌 去 离 子 水 的 EP管 中 ,4℃冰箱 保存 。 1.2 方 法 1.2.1 DNA 提取 :采 用 Chelex一100法 获 得血 样本 基 因 组 DNA。 1.2.2 聚合 酶链 反 应 (PCR)扩 增 、电泳 及结 果 :用 Power Plex 21系 统 荧 光 标 记 试 剂 盒 复 合 扩 增 Amelogenin 基 因 座 和 2O 个 STR 基 因 座
遗传 分 析 仪 进 行 毛 细 管 电 泳 ,通 过 Gene Mapper ID.V3.2软 件进 行结 果分 析 。 1.2.3 父权 指 数计 算方 法 :在 亲 子鉴 定 中 ,父 权 指 数 是判 断亲 子关 系所 需 的 两个 概率 的似 然 比,即 具 有 假设 父遗 传 表 型 的男 子 是 孩 子 生 物 学 父 亲 的 概 率 (X )与 随机 男子 是孩 子 生 物学 父 亲 的概 率 (Y )
的 比值 。亲权 指数 (paternity index,PI)PI=== V 一
筹 ,x(具有假设父遗传表型的男子是孩子生
物 学父 亲 的概率 )一 f(生母 提 供生 母基 因概 率 )×C (假 设 父提 供生 父 基 因概 率 )。Y (随机 男 子 是 孩 子 生 物学 父 亲 的概率 )一 f(生母 提供 生母 基 因概 率 ) ×g(随机 男 子 提供 生 父 基 因 概 率 )。 由于 STR 基 因突变 一 步 约 占 90 以上 ,Brenner假 设 :50 9/6的 一 步 向 上 突 变 或 5O 的 一 步 向 下 突 变 ;5V0的 二 步 向上 突 变 或 5 的 二 步 向 下 突 变 ,以 此 类 推 。 Pr
DOI:10.3969/j.issn.0253—9926.2018.04.039 作 者 单 位 :030001太 原 ,山 西 医科 大 学 法 医 学 院 (牛 蕾 蕾 );广 东 省 汕 头 市公 安 局 刑 事 技 术 中心 (窦 定 所 (康 永 红 )
· 法 医 论 坛 ·
山 西 医 药 杂 志 2018年 2月 第 47卷 第 4期 Shanxi Med J,February 2018,Vo1.47,No.4
5例 亲 子 鉴 定 常 染 色 体 STR 突 变基 因座 PI的计 算 与分 析
牛 蕾蕾 窦雪丽 康 永红
短 串联重 复 序 列 (short tandem repeats,sTR) 作为 人类 遗传 学 中一 类重 要 的遗 传 标 记 ,因其 多态 性 高 ,个 体识别 能 力强 ,扩 增 片段 长 度 短 ,广 泛地 应 用 于 法 医学亲 子鉴 定 、个体 识 别 及遗 传 病 连 锁分 析 等方 面_】]。STR 核心 序 列 的 变 异可 能 导致 对 结 果 分析 的偏 差甚 至误 判 ,因此 引起 法 医分 子 生 物学 和 遗 传 学工 作者 的重 视 _2],STR基 因座 在遗 传过 程 中 发生 变异 的机 会相 对 较 低 ,其 突变 率 约 在 0.1 ~ 0.7 ,平 均约 为 0.2 [3],明显高 于蛋 白遗 传 标记 。 本 实验 采 用 Brenner CH 经 验 递 减 模 型 [4 对 STR 突变 基 因座 父 权 指 数 (paternity index,PI)值 进 行 计 算 ,协 助鉴 定 人 员 更 好 地 应 用 突 变基 因 座 PI值 计 算公 式 。我 们 在 近 期 受 理 的 273例 标 准 三 联 体 亲子 鉴定 案件 中观察 到有 5例 发生 遗 传 突 变 ,现报 告 如 下 。 1 对 象 与 方 法 1.1 研究 对 象
Power Plex 21系统 在 认 定 该 5例 亲 子 关 系 的 案 件 中 ,发 现 STR 基 因 座 FGA、D3S1358、 D2S1338、D7S820、D18S51均 发 生 一 步 突 变 ,其 余 基 因座 分 型结 果符 合遗 传 规律 。
山 西 医 药 杂 志 2O1 8年 2月 第 ,1 7卷 第 4期 Shanxi Med J.Fv1)rI㈨ry 20l8.Vo1.4 7.No.1
(D3S1358,D 1S1656,D6S1043,D 13S317,Penta E , D 16S539,D 18S51,D 2SI338,CSF1PO ,Penta D , TH01,vW A ,D21S11,D7S820,D5S818,TP0X,
D8S1l79,D12S391,Dl9S433,FGA),用 ABI 313O
(Q,R假 设 父 遗 传 Q)一 Pr(Q 被 遗 传 )× ×百1×
( ) ,假设 父 为 纯 合 子 ,Pr(Q 被 遗 传 )一 1;假 设
父 为杂 合 子 ,Pr(Q 被 遗 传 )一1/2。 值 为 0.2 , 表 示基 因座 总 的 突 变 率 ,S为 变 的 步 数 ]。如 果 突变来 自母 亲 ,则 女 性 发 生 突变 的 概率 为 男 性 的 1/3.5 E 。 1.3 统计 学处 理
涉及 标 准三 联 体 5个 案 例 ,由被 检 父 、生 母 及 其孩 子 自行 委托 进 行 亲 子 鉴 定 。 每 位 受 检 者 采 集 指血 1O I ,置 于装 有 1 mL高 压 灭 菌 去 离 子 水 的 EP管 中 ,4℃冰箱 保存 。 1.2 方 法 1.2.1 DNA 提取 :采 用 Chelex一100法 获 得血 样本 基 因 组 DNA。 1.2.2 聚合 酶链 反 应 (PCR)扩 增 、电泳 及结 果 :用 Power Plex 21系 统 荧 光 标 记 试 剂 盒 复 合 扩 增 Amelogenin 基 因 座 和 2O 个 STR 基 因 座