蛋白互作研究方法PPT课件

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1)GAL4体系的缺点
2) MbSUS 体系
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mbSUS 原理
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In vivo cloning into mbSUS vectors
GATEWAY cloning method
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P = Prey Protein, M = MagneG最S新T.课P件article.
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5 免疫共沉淀Co-IP
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6 Far-western analysis
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7 双分子荧光互补技术 BiFC
双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC) 分析技术,利用绿色荧光 蛋白(green fluorescent protein,GFP) 及其突变体 (YFP,CFP,BFP)的特性作为报告基因,将荧光蛋白分割 成两个不具有荧光活性的分子片段,再分别与目标蛋 白连接. 如果两个目标蛋白因为有相互作用而靠近, 就使得荧光蛋白的两个分子片段在空间上相互靠近, 重新形成活性的荧光基团而发出荧光. 在荧光显微镜 下,就能直接观察到两目标蛋白是否具有相互作用, 并且在最接近活细胞生理状态的条件下观察到其相互 作用发生的时间、位置、强弱、所形成蛋白质复合体 的稳定性,以及细胞信号分子对其相互作用的影响等, 这些信息对研究蛋白质相最互新课作件 用有一定意义。 38
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GFP及其各种突变体的片段互补特性
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Visualization of protein interactions in living plant cells using bimolecular fluorescence complementation
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Detection of protein–protein interactions in plants using bimolecular fluorescence complementation
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GFP 的一些定点突变能明显地改变其波长性质. 产生 的突变体,具有产生多色光的特性,如:GFP66 位的 酪氨酸突变为色氨酸后成为青色荧光蛋白(cyan fluorescence protein,CFP),203 位的苏氨酸突 变为酪氨酸后成黄色荧光蛋白(yellow fluorescence protein,YFP),145 位酪氨酸突变为苯丙氨酸后成 蓝色荧光蛋白(blue fluorescence protein, BFP) [3]. 2002 年Hu 等[1] 最先报道了用BiFC技术在活细 胞中观察bZIP 和Rel 家族蛋白的相互作用,利用的 就是YFP 作标记,在荧光显微镜下用525 nm 波长 直接检测黄色荧光.
Principle of the BiFC assay
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GFP的特性
绿色荧光蛋白(GFP) 来源于水母(Aequorea victoria),分子质量约为27 kda,能在各种细胞中表 达. 受到激发时,不需要任何辅助因子,就能在活体 中发出绿色荧光. 1992 年,Prasher 等[2]克隆了GFP 基因. 随后,GFP 作为一种研究基因表达和蛋白质定 位的活体可遗传标记,在各种类型细胞的研究中得到 了广泛的应用.
用而表现出来的,这种相互作用存在于机体每
个细胞的生命活动过程中,相互交叉形成网络,
构成细胞中一系列重要生理活动的基础。因此,
对于蛋白质相互作用interactome的研究就
成为蛋白质组学中最主要研究内容之一。
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2 蛋白质相互作用常用研究方法
1 酵母双杂交(Yeast two-hybrid,Y2H)
2 pull-down
3 免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation,Co-IP)
4 双分子荧光互补技术(Biomolecular fluorescence complementation,BiFC or Split YFP)
5 Far-western analysis
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3 酵母双杂交技术 3.1 原理
Yeast cells that are mating. A zygote typically has three-lobed
shape, the lobes representing the two haploid(parental) cells and
the budding diploid cells.
Department of Plant Sciences, Tel Aviv University, Tel Aviv 69978, Israel
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Confocal images of bimolecular fluorescence complementation
(BiFC) studies
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4 pull down 1) 原理
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2)试剂盒
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The MagneGST. Pull-Down System
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Figure 1. Overview of the MagneGST. Pull-Down System protocol.
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Constructing AD fusion libraries by recombinationmediated cloning in yeast.
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cDNA library of oilseed rape line RS-1 constructed in
yeast
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Library screening by mating
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IPG735+PG736
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IPG735+PG736 47
Ppn20-735+PG736
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Ppn20-735+PG736, 蛋白互作可能导致internalization
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多色荧光 互补技术
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蛋白质相互作用
研究方法
王心宇
College of Life Sciences
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1 研究蛋白质相互作用的意义
随着生命现象的研究逐渐由获取基因序列
信息转向研究基因功能,一门新的学科———
蛋白质组学proteomics应运而生。蛋白质组
是一个在空间和时间上动态变化的整体,其功
能往往是通过蛋白质之间或与核酸之间相互作
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Positive clones confirmed on SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-a-Gal
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检测特定两个蛋白是否互作
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pGADT7 Vector Information
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3.3 膜蛋白互作研究方法
---基于泛素的酵母双杂交 体系(mating-based Split ubiquitin system "mbSUS“)
DNA-binding and activating functions in a transcription
factor may comprise independent domains of the protein.
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The two hybrid technique tests the ability of two proteins to interact by incorporating them into hybrid proteins where one has a DNA-binding domain and the other has a transcriptionactivating domain.
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诱饵蛋白载体构建
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最课件
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pGADT7-Rec Vector Informat最新课件
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