06个体遗传评定

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1 (n 1)rp P
n
A
rA
1
nh (n 1)rp
1 (n 1)rp P A
n
A P
rA
nh2 1 (n 1)rp
证毕
上式意味着估计育种值的准确度取决于被估个体与提供信息个体的亲缘 关系(rA)、性状的遗传力(h2)、重复力(rP)和可利用的信息量(n)。
第三节 单性状育种值估计方法
信息来源:本身、祖先、同胞和后裔
对于常染色体上的基因来说,由于后代的遗传基础是由 父母亲共同决定的,因一个个体只有一半的基因遗传给下一代, 所以将传递力的2倍规定为育种值。
EBV 2ETA

ETA EBV 2
3、相对育种值(relativebreedingvalue,RBV):
个体育种值占群体均值的百分数称相对育种值(relative breeding value,RBV):
(非近交,两亲本平均值)
全同胞后裔
0.5h2
0.5kh2/[1+(k-1)re]
0.5nh2/[1+0.5(n-1)h2]
半同胞后裔
0.25h2
0.5kh2/[1+(k-1)re]
0.5nh2/[1+0.5(n-1)h2]
全同胞兄妹
0.5h2
0.5kh2/[1+(k-1)]re]
0.5nh2/[1+0.5(n-1)h2]
1 (116 1)0.25 0.2
② 同理,根据半同胞子女的遗传信息可以得到:
Aˆx 2h(2hs) (P0 P) P
根据半同胞子女(后裔)信息计算半同胞加权遗传力:
hH2 S
1
0.25nh2 (n 1)0.25h2
0.2515 0.2 1 (15 1)0.25 0.2
0.4412
9-781根据半同胞子女(后裔)信息的估计育种值为:
Additive Genetic Value = Breeding Value.
Notice that the Breeding Value of an animal is the sum of its genes Additive Effects.
(2)特殊育种值:(Special Breeding value) 由于显性基因和上位基因引起基因加性效应的离差。
个变量之间的回归关系,可以从一个变量估计另一个变量。
回归公式 : yˆ byx (x x ) y
式中: x: 自变量 y: 应变量 byx:依变量y对自变量x的回归系数
根据上述回归原理,以 P(* 表型值)为自变量,A(育 种值)为依变量代替回归公式中的相应值,就可通过下列
回归方程由P估计A。
该式中的bAP对不同来源的信息表型值而不同,由表 6-1给出。
表6-1 不同信息估计个体育种值的(bAP)如下表
信息资料类型 本身
一个个体单次度量值
bAP
h2
亲本
0.5h2
一个个体k次度量均值
bAP
kh2/[1+(k-1)re]
0.5kh2/[1+(k-1)re]
N个同类个体单次度量均值
----____ h2(这时n=2)
(6 5)
证明:
由公式(2-14)
2 P*
1 (n 1)rp n
2 P
n :个体本身度量次数或同类亲属个体数
2 P
:性状的表形方差
rp :多个表型值之间的相关(同一个体多次度量时为重复 率)且有如下关系:
rp rA* h2
用通经系数法证明该式
由通经分析的原理可知 rp rA* hh rA*h2
(6 15)
五、育种值估计举例
例:表6-2给出了4头种公羊及其有关亲属的剪毛量(Kg),假 设它们都来自同一群体,该群体的均值为 P 5.0 ,剪毛量的遗传力近 似为 h2 0.2。
试利用各种不同的信息估计该性状种公羊育种值。这里仅以9- 781号种公羊在两种情况下的育种值估计加以说明。
表6-1 4头种公羊及其有关亲属的剪毛量(Kg)记录,试计算各个公羊的育种值。
h2 p(n)
0.5nh2 1 (n 1)re
(2)同时有父、母双亲的记录时:
AˆA 0.5hs2(n) (Ps(n) P) 0.5hd2(n) (Pd(n) P) P
(6 10)
bAP*
h2 s(n)
0.5nh2
1 (n 1)re
bAP*
h2 d (n)
0.5nh2 1 (n 1)re
由于育种值只能根据个体表型值估计得到,所以称估计 育种值(estimated breeding value,EBV)。
Estimated Breeding Value (EBV): An estimation of a breeding Value.
个体育种值也可表示为:Aˆx (即:X个体的育种值)
半同胞兄妹
0.25h2
0.25nh2/[1+0.25(k-1)re]
0.25nh2/[1+0.25(n-1)h2]
二、估计育种值准确度度量
上式所得到的育种值是估计育种值,其准确度可用估计 育种值与真实育种值的相关系数来度量,计算公式如下:
rAAˆ
rAP
bAP
P* A
rA
nh2 1 (n 1)rp
rA* :为同类个体间的亲缘系数;
(∵
Cov(
A,
P*
)
Cov(
A,
A* )
rA
2 A

将公式(2-14)带入 公式(6-4)得:
bAP*
Cov( A, P*)
2 P*
rA
2 A
1 (n 1)rp
n
2 P
nrA
2 A
1 (n 1)rp
2 P
nrAh2 1 (n 1)rp
(6 6)
再将(6-6)带入(6-5)得:
因此:Cov(
A,
P*
)
Cov(
A,
A*
)
2 A
bAP*
Cov(A, P*)
2 P*
2 A
2 P*
h2
书p147设

Cov( A,
A* )
Cov( A, A*)
A A*
2 A
rA
2 A

A
A*=
2时
A
通过(6-4)可得育种值计算的通式:
Aˆ bAP (P P) P h2(P P) P
a1、a2、……、an, 相应的经济加权值(ecomomic weight)为:
w1、w2、……、wn, 因此综合育种值(H)可定义如下:
n
H wiai wa i 1
(6 2)
这里,w [w1 w2 wn ] a [a1 a2 an ]
第二节 育种值估计原理
一、建立育种值估计回归公式 从表型值估计育种值,是运用回归原理进行的。利用两
bAP*
Cov(A, P*)
2 P*
(6 4)
式中:
Cov(A, P*) :被估计个体育种值与信息表型值的协方差;
2 P*
:信息表型值方差;

P* A* R*
Cov(A, P*) Cov[A, (A* R*)] Cov[(A, A*) (A, R*)]
一般情况下 Cov( A, R*) 0
从育种学角度出发,重要的是能够真实遗传的育种值 这一部分,而D和I带有一定的随机性,可将它们归并到环 境效应偏差值中,统称为剩余值,记为R
P=G+E =A+D+I+E =A+D+I+EP+ET =A+R
上式中A为育种值
1、育种值(breeding value,EBV):
(1)一般育种值:(Breeding value)
0.8593
9-781根据半同胞兄妹信息的估计育种值为:
Aˆ9781 (PHS P)hH2S P (5.73 5)0.8593 5 5.6273
其估计育种值的准确度为:
rAP rA
nh2 1 (n 1)rp
rA
nh2 1 (n 1)rHS h2
0.25
116 0.2
0.4635
公羊号
本身
父亲
母亲
祖父
半同胞兄妹 半同胞子女 祖母 外祖父 外祖母
N 均值 N 均值
9-781 8.2 13.6 5.6 10.4 7.6 10.8 4.3 116 5.73 15 6.08
9-794 7.7 13.6 7.2 10.4 7.6 14.5 5.5 116 5.73 25 5.75
9-770 8.5 11.7 4.6 14.5 6.5 10.2 5.0 64 5.32 17 5.42
rAAˆ
rAP
bAP*
P* A
nrAh2 P* 1 (n 1)rp A
又因
2 P*
1 (n 1)rp n
2 P

P*
1
(n 1)rp n
2 P
带入上式得:
rAAˆ
nrAh2 P* 1 (n 1)rp A
rA
1
nh2 (n 1)rp
1
(n 1)rp n
2 P
1
A
rA
1
nh h (n 1)rp
一性状的基因组合的加性效应值,即加性基因所决定的效 应值。
Breeding Value: The part of an individual genotypic value that is due to additive effect and therefore transmittable. (Breed true)
第六章 个体遗传评定 ——选择指数法
本章要求:
1、掌握遗传评定的主要方法育种值的概念; 2、掌握个体育种值的计算方法; 3、掌握多性状遗传评定-综合选择指数方法;
第一节 育种值的概念
根据数量性状的微效多基因假说,可将将数量性 状表型值(P)线性剖分为基因型值(G)和环境效应值(E) 两个部分,即:
EBV Aˆ bAP (P* P) P
(6 3)
EBV( Aˆ ): 为估计育种值;
bAP :育种值A对表型值P的回归系数,即h2; P* :表示用于评定育种值的信息表型值; P :表示与该信息来源处于相同条件下的所有个体的平均值;
上式中,关键是回归系数bAP,而bAP在不同资料的情况 下为不同加权的遗传力。归纳如(表6-1)。
用公式表示为:
RBV
1
Aˆ P
100%
(6 1)
4、综合育种值(total breeding value):
对多性状选择时,综合考虑各个性状的遗传特征,各性状 间的遗传相关和经济重要性,制定一个综合选择指数,称该选 择指数为综合育种值(total breeding value)。
假设,需要选择提高的目标性状总共有 n 个, 每一个性状的育种值为:
hF2H
1
rFH nh2 (n 1)rFH
h2
rFH
d 1 4d
四、后裔信息:
(1)当与配母畜是群体的一个随机样本,且后裔间为半同胞时:
Aˆx 2h(2hs) (P0 P) P
(6 14)
h02 hH2S
(2)当与配母畜非随机时,估计育种值需作校正, 清除由于选择母畜所造成的偏差:
Aˆx 2[(P0 P) 0.5(PD P)h2]h(20) P
9-752 7.4 14.5 7.3 6.0 6.8 8.7
4.6 75 5.61 15 5.54
① 根据半同胞兄妹信息计算估计育种值公式为:
AˆX (PHS P)hH2S P
根据半同胞兄妹信息计算半同胞加权遗传力:
hH2 S
1
0.25nh2 (n 1)0.25h
2
0.25116 0.2 1 (116 1)0.25 0.2
2、估计传递力(estimated transmitting ability,ETA):
一个个体将其遗传性状传递给后代的能力称为传递力(ETA)。
Relative genetic worth is expressed as Estimated Transmitting Ability (ETA) which is an estimate of a livestock's potential genetic ability.
Aˆ9781 2h(2hs) (P0 P) P 20.4412(6.08 5.0) 5 5.953
其估计育种值的准确度为:
rAP 2rA
nh2 1 (n 1)rp
2rA
nh2 1 (n 1)rHS h2
2 0.25
15 0.2
பைடு நூலகம்.6642
1 (15 1)0.25 0.2
六、不同资料来源估计育种值(自学)
一、个体本身的信息: (1)只有一次记录:
Aˆx h2(Px P) P
(2)本身多次记录:
Aˆx
h2 (n)
(P(n)
P) P
bAP*
h2 (n)
nh2
1 (n 1)re
(6 7)
(6 8)
二、系谱信息:
(1)只有一个亲本的记录:
Aˆx
h2 p(n)
(Pp(n)
P)
P
(6 9)
bAP*
1、多种亲属信息育种值估计原理
三、同胞信息:
(1)全同胞: AˆX (PFS P)hF2S P (2)半同胞: AˆX (PHS P)hH2S P
(6 11) (6 12)
(3)全半同胞混合家系:
AˆX (PFH P)hF2H P
(6 13)
hF2S
0.5nh2 1 (n 1)0.5h2
hH2 S
0.25nh2 1 (n 1)0.25h2
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