2株猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及ORF3基因的克隆与序列分析

2株猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及ORF3基因的克隆与序
列分析
张小峰;涂玉蓉
【期刊名称】《养猪》
【年(卷),期】2014(000)003
【摘要】For the study,prevention and control of Guangdong area of porcine epidemic diarrhea,this experiment first by determining the presence of porcine epidemic diarrhea virus in swine fecal samples of RT-PCR method, followed by the use of Vero cells were blind transfer,the nucleic acid identification of virus,RT-PCR,TCID50 de-termination,gene sequencing and sequence analysis method,to confirm separation 2 strains of porcine epidemic diarrhea virus strains,named as PEDV GDKP-2013 and PEDV GDKP2-2013,through ORF3 gene nucleotide se-quence analysis,consistency of the amino acid sequence of GDKP-2013 strain and GDKP2-2013 strain and clas-sic reference strain JX261936-CHGD-
01,98.2%,98%; JQ039903-CH-GD-2011,98.6%,98.4%;AF353511-
CV777,95.4%,95.1%;KC344845-STPED0810,95.1%,94.8%;EU054929-
DR13,95.5%,95.2%;KF272920-USA-Colorado-2013,95.1%,94.8%,showed that the 2 strains of virus,and domestic isolates of amino acid homology, with South Korea,Thailand and American isolates of amino acid homology is lower,and amino acids,homologous vaccine reference strains is relatively low;analysis of gene system evolution,GDKP-2013 strain and GDKP2-2013
strain were mainly in the branches and attenuated vaccine strain (b branch) between genetic evolution relation-ship is far.%为研究、防控广东地区猪流行性腹泻，首先通过RT-PCR法确定某猪场粪便样品中存在猪流行性腹泻病毒，随
后利用Vero细胞进行盲传，最后经核酸类型鉴定、RT-PCR、病毒TCID50的测定、目的基因测序和序列分析等方法，确认分离到2株猪流行性腹泻病毒毒株，
命名为PEDV GDKP-2013和PEDV GDKP2-2013，通过ORF3全基因核苷酸序
列分析可知，GDKP-2013株与GDKP2-2013株与经典参考毒株的氨基酸序列一
致性为 JX261936-CHGD-01，98.2%，98%；JQ039903-CH-GD-2011，
98.6%，98.4%；AF353511-CV777，95.4%，95.1%；KC344845-STPED0810，95.1%，94.8%；EU054929-DR13，95.5%，95.2%；KF272920-USA-Colorado-2013，95.1%，94.8%，表明此2毒株与国内分离株的氨基酸同源性高，与韩国、泰国和美国分离株的氨基酸同源性要低一些，同时，与疫苗参考株的氨基酸同源性也相对较低；基因系统进化分析可知，GDKP-2013株与GDKP2-2013株主要处在Ⅰa分支，均与弱毒疫苗株（Ⅰb分支）相互之间遗传进化关系
较远。

【总页数】4页(P98-100,101)
【作者】张小峰;涂玉蓉
【作者单位】广东开平广三保畜牧有限公司，广东开平 529300;广州华农大实验
兽药有限公司，广州 510642
【正文语种】中文
【中图分类】S852.65
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