RNA干扰技术
RNA干扰与基因沉默
RNA干扰与基因沉默RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一种通过特定RNA分子介导的基因沉默机制,被广泛应用于生物学研究、基因治疗等领域。
本文将深入探讨RNA干扰的原理、应用及未来发展方向。
一、RNA干扰的原理RNA干扰是一种高度保守且广泛存在于真核生物中的生物学过程。
它主要通过三种类型的RNA分子实现基因沉默:microRNA (miRNA)、small interfering RNA(siRNA)和Piwi-interacting RNA (piRNA)。
其中,siRNA是最为常见和被广泛应用的一种。
在RNA干扰中,siRNA与RNA诱导酶复合物结合形成RNA诱导沉默复合物(RISC),RISC会通过碱基互补的方式与靶向RNA结合,并介导靶向RNA的降解,从而达到沉默该基因的效果。
这一过程使得基因的转录和翻译被有效地抑制,实现基因的沉默。
二、RNA干扰的应用1. 基因功能研究:RNA干扰技术被广泛应用于基因功能的研究中。
通过设计特定的siRNA,可以实现对目标基因的沉默,从而观察基因沉默对生物体的生理和生化过程产生的影响,揭示基因在细胞和生物体中的作用机制。
2. 疾病治疗:RNA干扰技术在基因治疗领域具有巨大潜力。
通过设计特异性的siRNA,可以实现对致病基因的沉默,从而治疗遗传性疾病、肿瘤和病毒感染等多种疾病。
此外,RNA干扰还可以用于研发新型药物和治疗手段。
3. 植物保护:在植物领域,RNA干扰技术也被广泛应用于植物保护。
通过设计特定的siRNA,可以实现对害虫和病原菌基因的沉默,从而提高作物的抗病虫性,减少对农药的依赖,实现绿色农业的发展。
三、RNA干扰的未来发展方向随着RNA干扰技术的不断发展,未来有望在以下几个方面取得重要进展:1. 靶向性增强:未来的RNA干扰技术将更加注重提高siRNA的靶向性,减少对非靶向基因的影响,从而提高沉黙效率和生物安全性。
2. 交叉学科应用:RNA干扰技术将与生物信息学、纳米技术等学科相结合,开拓全新的应用领域,如基因组编辑、精准医学等。
rna干扰
RNA干扰什么是RNA干扰?RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是一种通过特定的RNA分子干扰基因表达的现象。
这种现象最早被发现于植物和线虫中,后来发现在动物中也普遍存在。
RNA干扰通过介导mRNA的降解或抑制转录来实现靶向基因的沉默。
RNA干扰的机制主要是通过一种特殊的小RNA分子,称为干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)或小干扰RNA (short interfering RNA,shRNA)。
这些siRNA或shRNA是由外源性或内源性的长双链RNA在细胞内被核酶Dicer切割而成的20-30个碱基的双链RNA分子。
RNA干扰的过程RNA干扰的过程可以分为三个主要步骤:siRNA的产生、siRNA的引物和RNA诱导沉默复合物(RISC)的形成、RISC 介导的mRNA降解或转录抑制。
首先,外源性或内源性的长双链RNA被核酶Dicer切割成20-30个碱基的siRNA。
siRNA由RNA诱导沉默复合物(RISC)捕获,其中的一个链被释放,留下一个导引链和一个剪切链在RISC中。
接下来,导引链将与靶标mRNA互补结合。
RISC将靶标mRNA切割成小片段,导致mRNA的降解或转录抑制。
这种RNA干扰过程可以非常特异地沉默特定的基因表达。
RNA干扰在基因研究中的应用RNA干扰已经成为基础科学研究和功能基因组学研究中广泛应用的工具。
通过沉默特定基因的表达,研究人员可以揭示该基因在生物学过程中的功能,以及该基因对疾病发展的影响。
在细胞水平上,RNA干扰可以用于验证候选基因是否在特定生物途径中起关键作用,或者用于筛选新药物靶点。
研究人员可以通过转染siRNA或shRNA来干扰目标基因,评估其对细胞功能的影响。
在动物模型中,RNA干扰可以用于研究特定基因的作用。
通过通过siRNA或shRNA直接注射进入动物体内,可以沉默目标基因的表达,并观察动物表型的变化。
新型药物——RNA干扰技术
新型药物——RNA干扰技术RNA干扰技术,是指利用RNA分子抑制靶标基因表达的技术,也被称为RNAi技术。
这种技术被认为是一种有效的基因靶向药物发展方法,近年来已经越来越受到关注。
本文将从基本原理、发展历程、现状和前景四个方面探讨RNA干扰技术的应用前景。
一、基本原理RNA干扰技术的基本原理是:在细胞内,RNA分子通过匹配比较与它们相互作用的靶标RNA来抑制特定的基因表达。
RNA干扰的反应主要是通过引入一种小RNA分子来实现的。
这种小RNA分子有两种类型:微小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)和microRNA(miRNA)。
siRNA主要是为了阻断目标mRNA而设计的,可以被细胞内RNA酶制备出来,并且可以通过介导RNA介导的开放式染色质(RNA-induced open chromatin,RIOC)途径来导致靶mRNA的降解。
而miRNA则是通过结合不完美匹配的靶mRNA抑制其翻译。
二、RNA干扰技术的发展历程RNA干扰技术的发展历程始于1998年,当时发现C.elegans(秀丽隐杆线虫)中一群基因缺失后,引起其表型发生了特异性变化。
其中,在RNAi技术被广泛应用之前,关键的突破是首次发现siRNA。
通过缩短dsRNA(double-stranded RNA,双链RNA)来制作siRNA,能够高度特异性地抑制基因表达。
这一发现引起了科学家们的极大兴趣,RNAi技术逐渐成为一个热点领域。
在RNAi技术的发展过程中,广泛的研究证实RNAi具有广泛的应用范围,包括在基因学、细胞学、发育生物学和生物医学中的应用,以及在农业生产和生物医药领域中的应用。
三、现状在目前的生物医学领域中,RNAi技术已成为一种广泛使用的工具,被广泛应用于基因功能研究、病原体基因组学、基因治疗以及药物研发等方面。
现在RNAi技术已经成为基因治疗领域研究的重点。
目前,RNA干扰技术在临床中的应用主要集中在抗癌领域。
RNA干扰技术
RNAi技术的实验方法
siRNA的设计原则 序列大小 19-21nt ,最好以A或G开始 从mRNA的AUG开始,寻找AA二连序列,作 为潜在的RNAi靶位点 不要针对5‘和3’端非编码区(untranslated regions,UTRs)
设计2~4个序列, BLAST 比对基因序列以确 保序列设计的特异性 优先选择 GC 含量30-50%的序列 设计适当的阴性对照序列
RNA干扰技术
什么是RNA干扰
RNA干扰(RNA interference,RNAi),又称
转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing,PTGS),是指将特异性 同源双链RNA(dsRNA)导入到细胞内,使 目的基因的不表达或表达水平下降.
目前应用的基因干扰技术
细胞中内源性dsRNA的形成
基因组中DNA 反向重复序列的转录产物 同时转录反义和正义RNA 病毒RNA 复制中间体 以单链RNA 为模板由细胞或病毒的RNA 依 赖RNA 聚合酶(RdRp) 催化合成dsRNA
Dicer酶
RNAase III超家族成员。结构中包括一个 螺旋酶结构域,两个RNA酶Ⅲ结构域,一 个双链RNA结合位点 对单链RNA没有活性 对200~500nt的dsRNA作用效果最好,能 降解成25nt左右的siRNA 广泛存在
体外转录法制备siRNA
优点:简单 成本低 速度快 毒性小 稳定性 好 缺点:反应规模和量始终有一定的限制 用途:筛选siRNAs,特别是需要制备多种 siRNAs
消化法( “ siRNAs 鸡尾酒 ”)
rna干扰的名词解释
rna干扰的名词解释RNA干扰:探索基因调控的新领域近年来,一个名词在生物学领域频繁出现,它就是“RNA干扰”。
作为一种重要的基因调控机制,RNA干扰在生物学研究中扮演着重要的角色。
本文将带您深入了解RNA干扰的概念、机制和应用。
一、RNA干扰的概念RNA干扰,全称为RNA interference,是一种通过RNA分子调控基因表达的过程。
简而言之,它是一种通过降解或抑制特定基因产物的方式,来调节这些基因表达和功能的现象。
二、RNA干扰的机制1. 小干扰RNA(siRNA)的产生RNA干扰的开始是由于产生小干扰RNA(siRNA)。
当外源的双链RNA (dsRNA)或内源性的转录产物具备一定的结构特征,即能够被核酸内切酶识别并切割,从而形成长度约为20-24核苷酸的小干扰RNA。
2. siRNA的导入产生的siRNA会与RNA诱导复合物(RISC)结合,这个复合体能够识别和结合与siRNA序列互补的mRNA分子。
导入过程确保siRNA与目标mRNA结合,从而催化这些mRNA的降解或抑制翻译。
3. mRNA降解或抑制翻译一旦siRNA与特定mRNA结合,RISC会切割这些mRNA分子,导致它们在细胞内降解。
如果切割发生在编码区,会导致部分或完全的mRNA降解;如果切割发生在非编码区,会引起mRNA的转译抑制,从而阻止蛋白质的合成。
三、RNA干扰的应用1. 基因沉默研究RNA干扰为研究基因功能提供了强有力的工具。
通过选择性地抑制或沉默特定基因,在细胞和生物体中观察这些变化,可以揭示基因在发育、分化、疾病等方面的重要作用。
2. 药物研发RNA干扰技术为药物研发提供了新途径。
通过利用siRNA特异地靶向基因表达,可以高效地减少特定蛋白质的产生,从而对许多疾病进行治疗。
例如,肝癌、糖尿病和病毒感染等疾病的治疗已经取得了一定的成功。
3. 农业和食品安全RNA干扰不仅在医学领域应用广泛,也在农业和食品安全领域有着巨大潜力。
RNA干扰技术
RNAi的分子作用机制
1、siRNA引起的基因沉默
miRNA诱导的基因沉默
miRNA是一种广泛存在于真核生物中内源性的、高度保守 的、非编码小的RNA。 miRNA主要是通过抑制翻译来实现基因的沉默,成熟的双 链miRNA会很快被整合到miRNA介导的沉默复合体(miRISC) 中。 成熟miRNA结合到与其序列互补的mRNA位点,通过2种依 赖于序列互补机制负性调控靶基因的表达。如果miRNA与靶 位点序列完全互补,miRNA的结合会引起mRNA的降解;如 果miRNA与mRNA不完全互补,则能抑制mRNA的翻译过程。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
第三步(倍增阶段)在 RISC 复合物中,以 siRNA 的单链 为引物,以 mRNA 为模板,在 RNA 指导的 RNA 聚合酶作 用下,合成 mRNA 的互补链,即形成 dsRNA 。 dsRNA 再 被Dicer酶裂解成新的siRNA(次级siRNA)。 因此,细胞内的siRNA数量大大增加,显著增强了对基因 表达的抑制作用。 siRNA 也可转运出细胞,使 RNAi 扩散 到整个机体。
获得siRNA产物方法
目前主要有5种方法用于siRNA的制备
(1)化学合成法;(2)体外转录法;
(3)长链dsRNA的RNaseIll体外消化法;
(4)siRNA表达载体法;(5)siRNA表达框架法。
前3种是在体外制备然后导入到细胞中;后两种则
是基于具有合适启动子的载体或转录元件在哺乳动
物或细胞中转录生成siRNA。
RNA干扰技术
张风娇
简介
RNA干扰(RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双
链RNA(dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解,
RNAi技术
RNAi技术1. 引言RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)技术是一种基因沉默技术,通过利用小分子RNA分子调节基因的表达,从而实现对目标基因沉默的目的。
RNAi技术的出现,彻底改变了分子生物学的研究方法,为研究基因功能以及治疗基因疾病提供了新的手段和途径。
2. RNAi技术的原理RNAi技术基于RNA干扰生物过程中产生的一种自我保护机制,即小分子RNA分子干扰RNA的翻译过程。
在这个过程中,RNAi分子通过与RNA互补配对,形成RNA-RNA复合物,这种复合物在RNA酶的作用下被剪切成更小的RNA分子。
这些小RNA分子可以继续识别新的RNA,并在细胞中导致基因沉默(图1)。
图1 RNAi技术的原理示意图3. RNAi技术的应用3.1 RNAi技术在基因功能研究中的应用RNAi技术被广泛应用于分子生物学和细胞生物学的研究中。
通过设计和构建与目标RNA互补的RNAi分子,可以实现对该基因的瞬时或持续沉默。
这种方法可以用来研究基因在生物学过程中的功能以及相互作用,同时也可以用来筛选或验证药物靶标。
3.2 RNAi技术在疾病治疗中的应用由于RNAi技术可以实现对单一基因的沉默,因此它成为治疗基因疾病的一种有效手段。
通过将RNAi分子直接引入到体内,可以实现对特定疾病相关基因的沉默,从而治疗疾病(图2)。
图2 RNAi技术在疾病治疗中的应用示意图4. RNAi技术的优缺点4.1 优点(1)靶向性好:RNAi技术可以实现对特定基因的沉默,从而精确地调控基因表达。
(2)效率高:RNAi技术可以快速地实现基因沉默,因此在基因研究和药物研发中得到了广泛应用。
(3)安全性高:RNAi技术只对特定基因的表达产生影响,不会对细胞或机体整体产生不利影响。
4.2 缺点(1)技术复杂:RNAi技术需要专业知识和技术,因此需要专业技术人员操作。
(2)RNAi分子稳定性低:RNAi分子容易被降解,因此在RNAi技术的应用中需要结合载体和转染技术来增加RNAi分子的稳定性和转染效率。
调控基因表达的RNA干扰技术
调控基因表达的RNA干扰技术RNA干扰技术是一种能够调控基因表达的方法,通过促进或抑制某些基因的表达,可以达到一系列的目的。
在这篇文章中,我们将探讨RNA干扰技术的原理、应用以及未来发展方向。
一、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术是通过靶向基因转录产物(mRNA)来抑制或阻断其转录形成的特定蛋白质。
RNA干扰技术基于RNA的双链结构,使用小分子RNA或RNA类似物来靶向特定的mRNA,在细胞中调控该基因的表达。
RNA干扰技术由三部分组成:小分子RNA、蛋白质和RNA诱导的沉默复合物(RISC)。
在这个过程中,小分子RNA结合到RISC中,进而靶向特定mRNA的3'非翻译区域(也叫3'UTR) 。
绑定后,RISC可以通过水解的方式,将mRNA切断并阻止其翻译成蛋白质。
这个机制可以有效地调控特定的基因表达。
二、RNA干扰技术的应用RNA干扰技术作为一个新兴的基因调控技术,广泛应用于许多领域。
1、基因功能研究RNA干扰技术被广泛用于基因功能研究。
通过敲低或敲除某些基因,可以研究这些基因的作用,从而揭示新的细胞信号通路或生物学过程。
用RNA干扰技术进行基因敲除,可以避免扰乱复杂的基因调节网络,并且是一种经济高效的方法研究基因功能。
2、药物筛选RNA干扰技术能够高度选择性地抑制特定的基因,在药物筛选中也有广泛应用。
通过设计小分子RNA来抑制与某种疾病有关的基因表达,进而测试新药的功效。
这个过程也可以帮助我们发现新药物目标。
3、基因治疗RNA干扰技术在基因治疗中也有应用。
一个例子是使用RNA 干扰技术抑制患病基因的表达,治疗患有遗传疾病的患者。
通过敲低或敲除患病造成的基因表达,可能可以降低或缓解某些疾病的症状。
三、RNA干扰技术的未来发展RNA干扰技术作为一种新兴的基因调控技术,有着很多未来的发展方向。
1、靶向性RNA干扰技术的靶向性是非常重要的,因为小分子RNA对不同的基因具有不同的靶向性。
生物工程知识:RNA干扰技术——分子生物学领域最前沿的新兴技术
生物工程知识:RNA干扰技术——分子生物学领域最前沿的新兴技术RNA干扰技术是一种基因沉默的技术,即通过稳定地、特异性地、可控地抑制靶基因的表达,从而实现对细胞生理学、病理学等多种生物过程的研究。
RNA干扰技术在过去十年中突飞猛进,尤其是在分子生物学领域得到广泛的应用。
本文将从RNA干扰技术的原理、应用及优缺点等方面进行探讨,并分析这一技术在生物医学和农业等领域的发展前景。
一、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术是由细胞自身启动的基因调控机制演化而来,其基本原理是利用RNA分子对与其互补的mRNA分子交互作用,导致靶基因mRNA被降解或转录被沉默,从而降低其蛋白表达水平。
RNA干扰技术基本上是以dsRNA(double-stranded RNA)为媒介,形成RNAi(RNA interference,RNA干扰)复合物并将其导入到目标细胞中,从而介导靶基因的降解。
dsRNA通过酶切剪切产生长度为21-25个核苷酸的siRNA(small interfering RNA),siRNA与蛋白质组装成RISC (RNA-induced silencing complex),并绑定到靶mRNA上,引起mRNA降解或转录后阻遏,从而达到抑制特定基因表达的目的。
二、RNA干扰技术的应用RNA干扰技术在许多生物医学领域,如药物筛选、疾病诊断、基因治疗等方面得到了广泛的应用。
这种技术可以抑制癌症、病毒、细菌等对人体的威胁,不仅在化疗药物研发中具有潜在的应用价值,还可以用于开发新型的生物药物。
此外,RNA干扰技术已经应用于诊断临床病理生理状态,例如在癌症细胞中检测靶基因表达水平,可以提高癌细胞的灵敏性并使得早期癌症的诊断和治疗更加准确和有效。
RNA干扰技术也被应用于农业和畜牧业领域,其中一个应用是用于生物质能源生产中的生物致能催化剂生产。
三、RNA干扰技术的优缺点RNA干扰技术具有许多优点,例如技术简便、高效、具有多靶向的优势、易于定量化等。
rna干扰
rna干扰RNA干扰技术是一种利用RNA分子干扰靶标基因表达的方法,该技术的研究与应用已经广泛扩展到生物学、医学以及生物技术领域。
本文将介绍RNA干扰技术的原理、应用和未来发展前景。
RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是由RNA介导的靶向基因沉默的一种机制。
它最早在植物中被发现,后来也被发现在动物细胞中广泛存在。
RNA干扰通过靶向性介导的方法,降低或抑制特定基因的表达,从而实现对基因功能的研究和调控。
RNA干扰的基本原理是双链RNA(dsRNA)通过酶切分解为20-25个碱基对长的小干扰RNA(small interfering RNA,简称siRNA)。
siRNA与RNA诱导静默复合体(RNA-induced silencing complex,简称RISC)结合,将其中一条链引导到靶标mRNA上,并通过与该mRNA互补配对,发挥沉默作用。
引导链与靶标mRNA形成稳定的双链结构,进而被RISC酶降解,从而阻断了该mRNA的翻译过程或引起其降解。
通过RNA干扰技术,可以特异性地沉默特定基因的表达。
RNA干扰技术的应用非常广泛。
首先,它被广泛应用于基因功能研究。
通过对单个基因进行沉默,可以直接观察到其对细胞及生物体的影响,从而揭示其在生物过程中的作用。
其次,RNA干扰技术也可以用于治疗疾病。
对于一些基因异常表达导致疾病的情况,通过RNA干扰技术恢复正常的基因表达,可以有望治疗相关疾病。
此外,RNA干扰技术还可以用于抗病毒研究、农业作物改良等领域。
在临床应用方面,RNA干扰技术已取得了一些重要的突破。
例如,目前已经有一些RNA干扰基因药物进入了临床试验阶段。
这些基因药物通过RNA干扰技术沉默与疾病相关的靶标基因,为患者治疗提供了新的选择。
此外,RNA干扰技术还可以用于个体化医学,根据患者基因的特点制定个体化的治疗方案,提高治疗的效果。
然而,RNA干扰技术仍然面临一些挑战和限制。
RNA干扰技术
4、每个细胞仅需要少量siRNA分子就可对大量mRNA发挥 作用,提示存在某些放大和/或催化活性的因素在起作用
例如: 依赖RNA的RNA聚合酶 (RdRP)的发现 线虫中的随机降解性PCR模型
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RdRP ----- 依赖RNA的RNA聚合酶
1、多种遗传学实验证实了RdRP在基因沉默中的重要作用, 其活性是基因沉默机制中不可缺少的组分。 (首先在线虫和果蝇中获证)
RNA 干 扰 技 术
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RNA 干扰(RNA interference, RNAi)
RNA干扰:一些小的双链RNA(siRNA)可以通过促使特定基因的mRNA 降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺 失的表型。
RNA 干扰的发展简史:
近几年来RNAi研究取得了突破性进展,被《Science 》杂志评为2001年的十大科学进展之一,并名列 2002年十大科学进展之首。由于使用RNAi技术可以 特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以该技术已 被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤 的基因治疗领域。
96年前后,研究发现 注入反义RNA及正义链RNA都能 抑制线虫par-1 基因的表达;三年后,首次将双链RNA注入 到线虫中,结果表现出比单独注射正义链或者反义链都要强 得多的基因沉默效果,这种技术的成熟使得大规模筛选线 虫RNAi诱导的功能缺失突变体成为可能,并引发后继的大 量针对这种模式生物基因敲除的研究 。
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2006年的诺贝尔生理学奖获得者:
Andrew Z. Fire Craig C. Mello
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Glossary (术语)
RNAi----- RNA interference (RNA干扰) siRNAs-----Small interfering RNAs (小干扰性RNA)
RNA干扰原理与技术
!!! ds mixture causes potent and specific interference !!!! !!! ds RNA substancially more effective than antisence !!! !!! effect were evident in both the injected animals and their progeny !!!
扩增dsRNA或siRNA
在RdRP的作用下,进入细胞内的双链RNA通过类似于 PCR的反应过程,呈指数级的数量扩增。但是目前认为 这个现象并不存在于哺乳动物细胞中。
RNAi的发生机制
2 Nucleotides 3’ overhang
21-25 nt
DICER
- RNAse III, ds spec. endonuclease - Dimer, 2 catal. domains, helicase and PAZ motif - produce 2-3nt 3´overhangs - ATP-dependent ribonuclease
•这个方法的不足是实 验的规模受到限制。
•体外转录得到的 siRNAs只要较低的浓 度就可以达到化学合 成siRNAs较高浓度的 效果(如右图:0.5-20 nM vs. 50-100 nM per transfection)
HeLa cells
RNase III降解
dsRNA Digestion of long dsRNA by an RNase III family enzyme
RNA干扰的基础和应用
RNA干扰的基础和应用RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是一种通过介导mRNA分解的生物学现象。
RNAi从20世纪90年代开始被发现,而cosuppression和PTGS则是在植物和线虫中最早被发现的RNAi现象。
RNA干扰在细胞、动物和植物中普遍存在,广泛参与多种生物学过程,如基因表达调控、病毒防御等。
本文将系统阐述RNA干扰的基础、调控机制和应用。
一、RNA干扰基础RNA干扰主要是指由RNA介导的一种基因静默机制。
RNA干扰基本流程如下图所示:[图1]首先,在RNA干扰反应中,一类小RNA分子命名为siRNA(小干扰RNA)或miRNA(microRNA,微小RNA)是RNA干扰的关键介质。
小RNA是短链非编码RNA,在细胞内广泛存在。
他们通过一组复杂的蛋白质复合体,与同源mRNA发生序列互补匹配(完全互补或部分互补)并降解它们。
siRNA和miRNA的分子大小分别为21-22 nt和18-24 nt,且都能通过相同的介导机制阻断RNA表达或降解mRNA分子。
siRNA和miRNA的产生及介导机制有所不同。
siRNA是由异源RNA引发的RNA分子,通过切割二级RNA产生。
miRNA是由内含子和非编码RNA带产生的RNA分子。
预miRNA的长链RNA在细胞核内转录生成,由核内蛋白质Drosha切割生成50-70条的前体miRNA。
后续,前體miRNA分子被外泌小体进一步分裂成miRNA/diG或miRNA/miRd,它们可以通过Dicer蛋白复合物及ARGONAUTE含有RNA识别结构域的产物降解mRNA分子。
二、RNAi的调控机制RNA干扰的过程包括siRNA的产生、siRNA的运输以及siRNA对mRNA的介导。
RNA干扰是由许多与RNAi直接参与的蛋白质组成的,包括Drosha、DGCR8、Dicer等。
这些蛋白质的确切表达和活性调整RNA干扰的效率。
例如,在核糖核酸核酸1和DNA甲基转移酶1中,它们通过与miRNA蛋白复合物合作调整RNAi底层机制。
RNA干扰技术
RNA干扰技术RNA干扰技术是一种基因沉默技术,通过特异性地抑制基因的表达,成为生命科学研究领域中一项重要的实验工具。
本文将介绍RNA干扰技术的原理、应用以及未来发展前景。
一、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术是指通过利用某些特定的RNA分子介导的过程来抑制基因表达。
它分为两种类型:siRNA(短干扰RNA)和miRNA(微干扰RNA)。
这两种RNA分子通过与靶基因的mRNA序列配对,从而导致靶基因的降解或抑制其翻译过程。
在siRNA干扰中,外源性合成的siRNA经由RISC(RNA诱导的靶向核酸酶复合物)的引导,与目标mRNA施加互补配对。
这一互补配对通常是通过siRNA中的21-23个碱基与目标mRNA中相应的区域形成稳定的双链结构。
这个双链结构被RISC中的核酸酶(Argonaute等)识别并降解,从而抑制靶基因的表达。
miRNA干扰是一种内源性的调控机制。
miRNA是一类长度约为21-25个碱基的内源性小RNA,在细胞中通过与mRNA的部分或完全互补配对,可以沉默靶基因的表达。
与siRNA不同,miRNA通常通过与mRNA的3'非翻译区(UTR)序列配对,从而发挥抑制作用。
二、RNA干扰技术的应用1. 功能基因研究RNA干扰技术被广泛应用于基因功能研究。
通过沉默特定基因的表达,人们可以揭示该基因在生物学过程中的功能和作用机制。
例如,科研人员可以利用RNA干扰技术研究某个候选基因在肿瘤形成中的作用,或者在干细胞分化中的功能。
2. 疾病治疗RNA干扰技术在疾病治疗方面具有巨大潜力。
通过沉默与疾病相关的基因,可以达到治疗疾病的目的。
例如,利用RNA干扰技术,科学家已经研发出多种治疗疾病的新药,如针对肝癌的siRNA药物和针对视网膜退化的miRNA药物。
3. 抗病毒研究在抗病毒研究中,RNA干扰技术也发挥着重要作用。
人们可以设计合成特定的siRNA或miRNA,以抑制病毒基因的表达,从而阻断病毒复制和传播。
RNA干扰名词解释
RNA干扰名词解释RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一种在基因表达调控过程中起关键作用的现象,也是一种常用的实验技术。
RNA干扰是指通过引入外源双链RNA(dsRNA),使其与特定的目标RNA序列产生互补配对,从而导致目标RNA降解或抑制其翻译的过程。
RNA干扰分为内源性RNA干扰和外源性RNA干扰。
内源性RNA干扰是生物体自身具备的一种防御机制,通过特定的酶(Dicer和Argonaute等)将dsRNA切割成长度约为21-25个核苷酸的小分子siRNA(小干扰RNA),然后与Argonaute蛋白结合形成RNA-诱导沉默复合物(RISC),通过互补配对特异性地降解目标mRNA或抑制其翻译。
外源性RNA干扰则是通过外源方法将dsRNA或人工合成的siRNA导入细胞内,引发类似的干扰效应。
RNA干扰在生物学研究中广泛应用。
通过选择合适的dsRNA序列,可以针对特定基因进行干扰,研究该基因的功能和调控机制。
通过抑制目标基因的表达,可以研究其对生物体或细胞的功能影响,验证其在生命过程中的重要性。
此外,RNA干扰还可以用于筛选基因库,寻找参与特定生理过程的新基因,或在疾病治疗中靶向抑制特定基因的表达。
RNA干扰技术的应用还包括在植物和动物遗传改良中。
通过选择性地抑制目标基因的表达,可以引起特定性状的变化,例如提高作物产量、增强抗病性等。
此外,RNA干扰还可以用于治疗疾病,例如通过沉默特定基因来治疗癌症、病毒感染等。
虽然RNA干扰技术有着广泛的应用前景,但也存在一些限制。
首先,由于dsRNA的特异性是通过互补配对实现的,因此如果引入的dsRNA序列与其他靶标RNA序列存在部分相似性,也可能对其产生干扰,导致误识别和副作用。
其次,外源性RNA干扰技术在某些细胞类型和生物体中的效率较低,对于特定的细胞类型和生物体,可能需要进行优化和改进。
综上所述,RNA干扰是一种重要的基因表达调控机制,并且具有广泛的应用潜力。
rna干扰技术原理
rna干扰技术原理RNA干扰技术原理。
RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一种通过特异性降解靶基因mRNA的技术,从而抑制靶基因表达的方法。
它是一种非常有效的生物学技术,被广泛应用于基因功能研究、药物研发和治疗等领域。
RNA干扰技术的原理是基于细胞内的一种天然生理现象,即RNA干扰通过介导RNA的降解来抑制基因表达。
RNA干扰技术的原理主要包括三个步骤,siRNA合成、RISC复合物形成和mRNA降解。
首先,siRNA(small interfering RNA)由外源引入细胞内,或者通过内源的方式产生。
siRNA是由20-25个核苷酸组成的双链RNA,其中包含有与靶基因mRNA互补的序列。
siRNA与靶基因mRNA形成双链结构后,被一种酶类切割成较短的小分子,即miRNA(microRNA)。
接着,miRNA与RISC(RNA-induced silencing complex)复合物结合,形成活性RISC复合物。
RISC复合物中的miRNA将靶基因mRNA识别并结合,导致靶基因mRNA的降解或者翻译抑制,从而抑制靶基因的表达。
RNA干扰技术的原理是基于细胞内的天然生理过程,因此具有较高的特异性和效率。
与传统的基因敲除技术相比,RNA干扰技术不需要对靶基因进行永久性的改变,而且可以实现快速、可逆的基因沉默。
此外,RNA干扰技术还可以用于多个靶基因的同时沉默,从而实现对复杂生物学过程的研究。
因此,RNA干扰技术在基因功能研究、药物研发和治疗等领域具有广阔的应用前景。
总之,RNA干扰技术通过介导RNA的降解来抑制靶基因表达,其原理包括siRNA合成、RISC复合物形成和mRNA降解。
这一技术具有特异性高、效率高、快速可逆等优点,被广泛应用于基因功能研究、药物研发和治疗等领域。
随着对RNA干扰技术原理的深入研究和技术的不断改进,相信这一技术将为生命科学领域带来更多的突破和进展。
rna干扰的原理
rna干扰的原理
RNA干扰是一种通过RNA分子介导的基因沉默机制。
其主要
原理是利用双链RNA(dsRNA)或小干扰RNA(siRNA)与
特定的目标mRNA序列相互作用,从而诱导靶基因的降解或
抑制其翻译,从而实现对该基因的表达的抑制。
具体来说,RNA干扰的原理可以分为两个步骤:
1. 引发RNA干扰:在细胞内,特定基因的DNA序列首先被
转录成对应的mRNA。
这些mRNA序列会进一步被RNA干
扰诱导产生的dsRNA或siRNA识别,并结合形成RNA诱导
沉默复合物(RISC)。
在RISC的引导下,dsRNA或siRNA
经过加工成为小干扰RNA(siRNA),其中一个链担任“引导链”的作用。
2. 靶向RNA降解或抑制翻译:通过启动RISC复合物,
siRNA的"引导链"与目标mRNA中的互补区域结合。
这种互
补配对后,RISC复合物会通过核酸内切酶活性引起目标mRNA的降解。
另外一种情况是siRNA与目标mRNA结合后,可以抑制其翻译,使其无法转化为蛋白质。
总之,RNA干扰原理的关键是通过siRNA与目标mRNA的互
补配对,从而靶向性地介导mRNA的降解或抑制翻译,进而
实现对特定基因的沉默或抑制。
这一机制不仅在研究中被广泛应用,还具有潜在的临床应用前景,如基因治疗、药物研发等领域。
生物医药中的RNA干扰技术
生物医药中的RNA干扰技术RNA干扰技术是一种在生物医药领域中被广泛使用的技术,其能够准确地靶向基因,从而控制细胞生物过程,达到治疗疾病的目的。
这项技术的突破,对医学界的发展和人类健康的保障具有重要意义。
RNA干扰技术的原理是通过转录RNA分子来剪切目标基因的mRNA,从而抑制该基因的表达。
RNA干扰技术有两种类型:小干扰RNA和长干扰RNA。
小干扰RNA通常包含21-23个碱基对,而长干扰RNA则通常由20-30个碱基对组成。
在医学上,RNA干扰技术被用于治疗许多疾病,如癌症、心脏病、糖尿病等。
举例来说,有的研究人员通过RNA干扰技术成功地抑制了乳腺癌细胞的生长,从而达到了治疗乳腺癌的目的。
此外,RNA干扰技术还可以用于病毒治疗。
一项研究表明,通过RNA干扰技术,可以控制艾滋病病毒的复制和感染,从而达到治疗艾滋病的目的。
RNA干扰技术还可以通过抑制基因表达,来引发细胞自杀。
这项技术被广泛应用于肝癌等恶性疾病的治疗中,其效果显著。
研究人员发现,借助RNA干扰技术,可以使癌症患者的生存期明显延长。
在药物开发方面,RNA干扰技术也被运用到了一些新的药物中。
例如,一种基于RNA干扰技术的新型药物已被研制出来,该药物可以有效地治疗一些眼疾,比如黄斑变性等。
总的来说,RNA干扰技术在生物医药领域中有着广泛的应用,是一项具有良好治疗效果和发展前景的技术。
但是相比于传统药物治疗,RNA干扰技术还存在一些问题,比如运输和稳定性等方面的问题,这些问题需要在未来的研究中得到解决。
虽然RNA干扰技术在现在的医疗领域中已经取得了很大的进展和成就,但是其研究也需要不断地推进和完善。
未来的研究应该继续探索该技术的不同应用场景和更加完善的技术工具,为医学界的发展和人类健康的保障做出更大的贡献。
RNA干扰技术
RNA干扰技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA (double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。
它是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通过RNA调控基因表达的机制。
最早的RNA干扰研究是从植物和线虫开始,2001年Tuchl等首次应用长度约为19~23个碱基对的双链小分子干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)在哺乳动物细胞中诱发基因沉默现象,证实这些细胞也普遍存在RNA干扰的机制,从而在世界范围内掀起了研究和应用RNA干扰技术的热潮。
RNA干扰之所以能引起生物医学界几乎所有研究领域的广泛性趣,是因为siRNA具有强大的抑制基因表达的效应和高度的序列特异性。
与抑制基因表达的传统工具,如反义寡核苷酸和核酶等比较,siRNA沉默基因的效率高达数十到数千倍,是逆基因工具的革命性改进。
此外与目标基因信使RNA相差一个碱基序列的siRNA的基因沉默效应大大受到削弱,从而保证了抑制目标基因的高度特异性。
因此,siRNA的发现具有划时代的意义,它不仅深入揭示了细胞内基因沉默的机制,而且它还是基因功能分析的有力工具,极大地促进了人类揭示生命奥秘密的进程。
siRNA本身还是一种极具前景的基因靶向药物,可广泛地用于诸如癌症等疾病的治疗。
鉴于siRNA技术的巨大意义与广阔应用前景,siRNA技术连续多年被美国《Science》杂志评选的“全球年度十大科学突破”。
由于使用RNAi技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达,所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的基因治疗等领域。
第一节RNA干扰的研究历程虽然RNA干扰是一种古老的机制,但是第一篇报道这种现象的论文是在1990年发表的。
1990年,Napoli和V an der Krol等在研究矮牵牛花查尔酮基因时发现了基因共抑制现象(cosuppression)。
rna干扰技术方法
rna干扰技术方法RNA干扰技术方法RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种通过靶向降低特定基因表达的技术。
它可以通过引入外源双链RNA(dsRNA)或小干扰RNA(siRNA)来靶向特定基因的mRNA,从而抑制该基因的表达。
RNA干扰技术已经被广泛应用于基因功能研究、药物研发、疾病治疗等领域。
RNA干扰技术的方法主要包括合成siRNA、合成shRNA、合成miRNA以及转染siRNA等。
下面将详细介绍这些方法。
1. 合成siRNAsiRNA是由两股RNA链组成的双链RNA分子,每股链长为21-23个核苷酸。
合成siRNA的方法主要有化学合成和转录合成两种。
化学合成是通过合成核苷酸单元,然后通过化学方法将这些单元逐个连接在一起,最终合成完整的siRNA分子。
这种方法可以合成大量的siRNA,适用于大规模研究和应用。
转录合成是利用体外转录系统,通过DNA模板的转录来合成siRNA。
这种方法可以合成定制的siRNA,并且可以在合成过程中加入化学修饰物,增强siRNA的稳定性和特异性。
2. 合成shRNAshRNA是一种基于RNA干扰的工具,与siRNA类似,可以通过靶向特定基因的mRNA来抑制其表达。
合成shRNA的方法主要是将shRNA序列插入质粒中,然后通过质粒转染到细胞中。
在细胞内,shRNA会被Dicer酶切割成小片段,形成siRNA,从而实现基因的沉默。
3. 合成miRNAmiRNA是一类内源性的短RNA分子,与siRNA类似,可以通过靶向特定基因的mRNA来抑制其表达。
合成miRNA的方法主要是合成miRNA前体序列,然后通过转染到细胞中,经过一系列的加工和修饰,最终形成成熟的miRNA。
4. 转染siRNA转染siRNA是将合成好的siRNA引入到细胞中,通过细胞内的RNA干扰机制来抑制目标基因的表达。
转染siRNA的方法主要有化学转染、电穿孔转染和病毒载体转染等。
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哺乳动物中RNAi
虽然在大鼠胚胎中证明RNAi技术是可行的,但是 在其它体细胞中却发现dsRNA的导入造成了细胞中的 非特异性基因沉默。非特异性沉默的原因,可能是长 的双链的RNA通过某种途径激活了两种酶:一种是 dsRNA依赖的蛋白激酶(PKR),它能够使转录起始 因子eIF2a发生磷酸化,而造成对基因表达的非特异性 抑制;另一种是2’,5’寡腺甘酸合成酶,其催化合成的 2’,5’寡腺甘酸能够活化RNaseL,RNaseL可以非特异 性水解mRNA。
RNAi的几个重要成员:
siRNA
导入生物体的dsRNA 在ATP 供能下被Dicer 复合物切割, 生成约22 个核苷酸( nu2cleotide , nt ) 的小干扰RNA ( small interfering RNA ,siRNA)。 siRNA的结构特征是: 双链,长度21-23nt; 具有5’末端磷酸基团和3’末端羟基;
RISC
siRNA必须与RNA诱导沉默复合物 (RNA-induced silencing complex, RISC ) 结合才能具有切割靶mRNA的功能,siRNA 是RISC的组成部分。RISC对靶mRNA的切 割是以内切的方式进行的,而且切割仅发生 在与siRNA同源的部分。
RNAi作用的简单模型:
DNA: homologous recombination (yeast, mice) chromosome gene chromosome
ห้องสมุดไป่ตู้
marker
chromosome
marker
chromosome
protein: eliminate its functionality with an antibody
RNAi的可扩 散性
Fire等观察到 将dsRNA注射于线 虫体内,这些 dsRNA可以从注射 处的细胞扩散到体 内其它细胞,引起 其它细胞的基因沉 默。
RNAi的可遗传性
初期的试验观察到,细胞增殖50-100倍仍 可保持RNAi效应。这说明RNAi有放大的效应, 或者有高效的催化机制。然而虽然RNAi的效应 是长效的,甚至在注射的华丽线虫的子一代的 整个生活周期里都能持续,但是由于它不能产 生DNA的修饰,随着细胞的不断分裂,dsRNA 被逐渐稀释,最终不能持续的遗传下去。
Quelling
类似的现象还发生在真菌中,当把合成类胡萝 卜素的基因转入红色面包霉中时,导致大约30% 转染细胞本身基因的失活,这种现象称为“压制” (quelling)。
研究发现在植物、真菌、锥虫、涡虫、囊虫、 线虫、果蝇、斑马鱼、老鼠早期胚胎等不同种属 的生物体中都存在这一现象。
RNAi的机制
RNAi的高效性
siRNA的反义链结合到目的mRNA后,不仅诱导 RISC对该基因进行降解,同时还激活RdRp介导的单 链RNA的合成,产生大量dsRNA,这些dsRNA再次被 RISC切割成许多siRNA,进入下一个RNAi循环。这 种不断放大的瀑布式作用形成大量的新的siRNA,使 RNAi的在短时间内达到迅速并有效地抑制mRNA翻 译形成蛋白质或多肽,从而有效地抑制了靶向基因蛋 白质或多肽地合成。每个细胞只需少量的dsRNA即能 完全关闭相应基因地表达,可见,RNAi过程具有生 物催化反应的基本特性。
RNAi的定义
RNA干扰( RNA interference, RNAi)是由双 链RNA分子(dsRNA)在mRNA水平关闭相应序列基 因的表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同 类型细胞的靶向基因的表达,用特异的抗体几乎 检测不到靶向基因表达的蛋白质。因此RNAi技术 又被形象的称为基因敲低(knock-down)。RNAi 是一种典型的转录后基因调控方法,又称转录后 基因沉默( posttranscriptional gene silencing PTGS)。
双链两端具有两个突出的单链核甘酸。
Dicer
导入生物体的dsRNA的降解过程需要不同的酶 的参与,其中一种为dsRNA特异性核酸内切酶 (dsRNA-specific endonuclease,Dicer)。Dicer 是RNA酶Ⅲ家族中dsRNA特异性核酸内切酶,具 有解旋活性。它的作用底物是长度200-500bp左 右的dsRNA。Dicer切割dsRNA,产生21-23bp 的siRNA片断。此酶对小于30bp的dsRNA和 ssRNA均无活性。
Run on gel Purify single-stranded RNA
ss ds ss ds
Make sense RNA
Run on gel Purify single-stranded RNA
MIX
Mutant Phenotype
mex-3 in situ
No Probe
No iRNA
ss iRNA
RNA Interference is a Biological System that Recognizes dsRNA and Inactivates Corresponding mRNAs and/or Genes in Sequence Specific Manner.
DNA
CH3
dsRNA
RNAi的应用
RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设 想的更为重要。RNA干扰(RNA interference)的 发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全 新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为 研究基因功能的有力工具,因此格外引人注意。 随着对小分子RNA研究的不断深入,研究人员开 始认识到:小分子RNA的世界一点都不小。有人 推测:小分子RNA可能代表一个新层次上的基因 表达调控方式。
RNaseL eIF2
Breakthrough: Short dsRNA (~22 nt) induces RNAi
Silencing of lamin proteins in human cells by dsRNA transfection
RNAi的特点
RNAi的特异性
导入生物体的siRNA只能引起同源基因 的表达抑制,而无关基因不受影响。而且, 在siRNA序列中配对的21-23nt中如果改变 一个核甘酸,就可以使siRNA序列不对靶 mRNA起作用。
Make anti-sense RNA
Mutant Phenotype
polyA
Explanation:
Inhibit Translation
Make sense RNA
Mutant Phenotype
polyA
Explanation:
HOW?
Inhibit Translation?
Make anti-sense RNA
当dsRNA导入细胞后,被Dicer切割成21-23bp的 siRNA,这一加工过程需要ATP提供能量。被切割成 21-23bp的siRNA再与RISC结合并激活,siRNA在 ATP提供的能量下解链,以它的反义链为模板识别靶 mRNA,引导RISC对其进行降解,最终抑制目的基因 的表达。 siRNA的反义链结合到目的mRNA后,不仅诱导 RISC对该基因进行降解,同时还激活RdRp介导的单 链RNA的合成,产生大量dsRNA,这些dsRNA再次被 RISC切割成许多siRNA,进入下一个RNAi循环。
dsRNA
siRNA
RdRp
RNAi需要的另一种酶为RNA依赖性的 RNA多聚酶( RNA dependent RNA polymerase, RdRp)。此酶的作用是以siRNA为一种特殊 的引物,以靶mRNA为模板,将mRNA通过聚 合酶链式反应转变成为dsRNA,为Dicer提供 底物。。
"Dice" into Small Pieces
21
CH3
Methylation of DNA Sequences
Dicer
Small Inhibiting RNA (siRNAs)
Repression of Transcription
Assemble into RISC Complex
Perfect Base-pairing to mRNA
基因功能研究方法之一----
RNAi:
mechanisms and applications
RNAi scoops medical Nobel
Two US geneticists who discovered one of the fundamental mechanisms by which gene expression is controlled have received a Nobel prize for their achievement. Andrew Fire and Craig Mello, who revealed the process of RNA interference (RNAi) in 1998, will share the US$1.4-million award.
m7Gppp
AAAAAA mRNA Cleavage and Destruction
RNA Interference: The Bottom Line
dsRNA
In Sequence Specific Manner
• mRNA Destruction • Repression of mRNA Translation • DNA Modification (Methylation, Deletion)
ds iRNA
Effects of mex-3 RNA interference on levels of the endogenous mRNA.
Analysis of RNA-interference effects in individual cells.