动物生理生态学
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贻贝取样在BB和SH河蚌由调查决定海拔高度如下: BB-mid (1.44 ± 0.59 m), BB-high(1.68 ± 0.69 m)； SH-low (1.00 ±0.42 m), SH-mid(1.75 ± 0.72 m) and SH-high (2.07 ± 0.85 m)
2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温的估计）
在低温或低营养环境中,有机体可能缺乏有足够能量储备的细胞，这些 有机体在防御其他恶劣环境时,更易受伤害。贻贝类也如此，它们受复 合效应的影响,若贻贝类栖息环境接近他们的热生理极限，它们的生产 率低。
这些结果可能为未来预测气候变化下，种群的生物地理学尺度提供依 据，在截然不同的海洋区域，通过生理耐受性分析，预测其范围限制。
关键词：生物地理学分布，DNA微阵列，生态基因组学，环境压力，基因表达， 贻贝，空间变化
通俗的名字是基因芯片（gene chip）。是一块带 有DNA微阵列（micorarray）涂层的特殊玻璃片， 在数平方厘米之面积上安装数千或数万个核酸探 针，经由一次测验，即可提供大量基因序列相关 资讯。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究 人员应用基因芯片就可以在同一时间定量的分析 大量(成千上万个)的基因表达的水平，具有快速、 精确、低成本之生物分析检验能力
但是，在BB-mid每日max更高,每天max记录常高 于20℃，而SH-mid每天max记录很少达到20℃。
Results
从季节性来看,贻贝 mid潮汐带，BB和SH 两地的日最大体温相 似； 这表明，位于这两个 海岬的贻贝，生理反 应对体温变化的影响， 不太可能源于简单的 对环境热适应的差异。
Key-words
Key-words: biogeographical distribution, DNA microarray, ecological genomics, environmental stress, gene expression, mussels, spatial variation
Results
4.INTER-SITE COMPARISONS OF VARIATION IN GENE EXPRESSION （基因
表达变化的点间比较）
压 力 反 应
贻贝沿着海岸居住在不同垂直 高度，在代谢过程表现出很大 基因水平的变化。
代谢\细胞增殖
圆-low，三角形-mid，正方形- high
Materials and methods
1. TIDAL HEIGHT MEASUREMENTS (潮汐高度测量)
确定在垂直立面的低、中、高潮汐区使用的测量方法，用当地潮汐基准面，以 确保贻贝类似年度浸没时间。对应于海拔0 m北太平洋东部海岸,有机体淹没 90%的时间。
2.MUSSEL BODY TEMPERATURE ESTIMATES (贻贝体温估计)
Conclusions
复杂的生理反应与环境变化之间的联系，了解全球气候变化对物种的 影响，是科学研究的重大挑战。 我们的研究结果强调潜在的温度和食物供应的共同影响,指出生物和非 生物机制之间可能会共同作用，影响生理限制和地理边界。例如,压力 反应的感应，可能增加其他生物功能的压力；在基因表达方面,可能在 躯体的健壮程度与增长率之间的权衡方面。
样本收集→贻贝温度记录器的嵌入（安全插入每个贻贝）→每隔10分钟记录一次
3.CHLOROPHYLL-A MEASUREMENTS (叶绿素a测量)
量化浮游植物（贻贝主要的食物）的丰富度
Materials and methods
4.SAMPLE COLLECTION (样品收集)
贻贝样品：中午低潮时，同一地点，水平横断面的3个垂直高度上，每个高度 取10个贻贝 测量叶绿素a的样品：量化浮游植物的丰度，不透明塑料250毫升瓶，在垂直高 度取，每隔10分钟测（在研究期间—4月至9月）
也就是说，这两地的环境温度是 不同的，但从图中看出，它们的 体温却相似，说明除Байду номын сангаас环境温度 外，还有别的因素，作用于它们 的生理反应（调节体温的这一生 理反应）
Results
3.CHLOROPHYLL-A MEASUREMENTS （叶绿素a测量） 与BB相比，从SH岸边采 集的样本（在同样的垂 直高度点上）显示的 Chl-a明显更高。 8月,Chl-a浓度在SH是 在BB的至少两倍； 在SH，8月Chl-a浓度比 6月中旬增加到近20倍。
文中说：由于部分数据丢失，所以只做了如下数据， 但同样能反应探讨的问题。
Results
2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温估计）
5天中，与SH-mid相比,BB-mid贻贝显示更大的温 度差异；每日最低温度都是两个点,在11至14℃ 之间不等；
贻贝中的高潮间带呈现出更多的类似， 每日最大的体温差异的垂直位置是在 岸边。
谢谢！
这里我们利用转录组分析，在不同空间尺度上了解贻贝的生理反应机制。我 们使用居住在不同的垂直位置的贻贝，在 BB（ Boiler Bay）SH( Strawberry Hill )的基因表达的变化。 结果显示两个截然不同的基因表达特征，代谢活动的循环和细胞内稳态扰动， 在空间尺度上相距0.65公里的海域间显示出较大差异，主要来自食物和环境 压力的影响。 环境控制基因的表达，这些新见解可以理解重要的生理内部驱动器，这种见 解可以跨群体。
PARISON OF GENE EXPRESSION PROFILES （基因表达 谱的比较） 6.NORMALIZATION AND STATISTICAL ANALYSIS OF
MICROARRAY DATA （归一化和微阵列数据的统计分析）
Results
1.TIDAL HEIGHT SURVEYS （潮汐高度调查）
The title
讲解人： 程 红
contents
1
Summary Key-words Materials and methods Results Conclusions
2
3 4 5
Summary
海洋潮间带的特点是温度的大幅度变化、pH值、溶解氧气、营养和食物供应 在时间尺度上的变化。这些主要通过生理机制，来驱动生态过程（竞争等）。
Introduction
沿着俄勒冈海岸贻贝的基因表达模式以及生理反应可能有多个相 互作用的复杂的非生物因素。 温度（特别是体温）和食物已经被证明是最重要的影响生存、生 长和繁殖的两个因素。理解底层机制（体温和食物供应）驱动有机反 应和生理性能越来越必要。像气候变化改变生境温度，先前的研究关 于有机体和生态之间的联系及其细胞反应很大程度上是观察，范围有 限，少量的非生物和生物因素,如热休克蛋白或相对基本的生理状态的 代理,如增长率,体型,生殖输出和死亡率。 现在，全基因组分析的框架内进行生态环境允许我们检查多个驱 动和有机反应的相互作用。
2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温的估计）
在低温或低营养环境中,有机体可能缺乏有足够能量储备的细胞，这些 有机体在防御其他恶劣环境时,更易受伤害。贻贝类也如此，它们受复 合效应的影响,若贻贝类栖息环境接近他们的热生理极限，它们的生产 率低。
这些结果可能为未来预测气候变化下，种群的生物地理学尺度提供依 据，在截然不同的海洋区域，通过生理耐受性分析，预测其范围限制。
关键词：生物地理学分布，DNA微阵列，生态基因组学，环境压力，基因表达， 贻贝，空间变化
通俗的名字是基因芯片（gene chip）。是一块带 有DNA微阵列（micorarray）涂层的特殊玻璃片， 在数平方厘米之面积上安装数千或数万个核酸探 针，经由一次测验，即可提供大量基因序列相关 资讯。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究 人员应用基因芯片就可以在同一时间定量的分析 大量(成千上万个)的基因表达的水平，具有快速、 精确、低成本之生物分析检验能力
但是，在BB-mid每日max更高,每天max记录常高 于20℃，而SH-mid每天max记录很少达到20℃。
Results
从季节性来看,贻贝 mid潮汐带，BB和SH 两地的日最大体温相 似； 这表明，位于这两个 海岬的贻贝，生理反 应对体温变化的影响， 不太可能源于简单的 对环境热适应的差异。
Key-words
Key-words: biogeographical distribution, DNA microarray, ecological genomics, environmental stress, gene expression, mussels, spatial variation
Results
4.INTER-SITE COMPARISONS OF VARIATION IN GENE EXPRESSION （基因
表达变化的点间比较）
压 力 反 应
贻贝沿着海岸居住在不同垂直 高度，在代谢过程表现出很大 基因水平的变化。
代谢\细胞增殖
圆-low，三角形-mid，正方形- high
Materials and methods
1. TIDAL HEIGHT MEASUREMENTS (潮汐高度测量)
确定在垂直立面的低、中、高潮汐区使用的测量方法，用当地潮汐基准面，以 确保贻贝类似年度浸没时间。对应于海拔0 m北太平洋东部海岸,有机体淹没 90%的时间。
2.MUSSEL BODY TEMPERATURE ESTIMATES (贻贝体温估计)
Conclusions
复杂的生理反应与环境变化之间的联系，了解全球气候变化对物种的 影响，是科学研究的重大挑战。 我们的研究结果强调潜在的温度和食物供应的共同影响,指出生物和非 生物机制之间可能会共同作用，影响生理限制和地理边界。例如,压力 反应的感应，可能增加其他生物功能的压力；在基因表达方面,可能在 躯体的健壮程度与增长率之间的权衡方面。
样本收集→贻贝温度记录器的嵌入（安全插入每个贻贝）→每隔10分钟记录一次
3.CHLOROPHYLL-A MEASUREMENTS (叶绿素a测量)
量化浮游植物（贻贝主要的食物）的丰富度
Materials and methods
4.SAMPLE COLLECTION (样品收集)
贻贝样品：中午低潮时，同一地点，水平横断面的3个垂直高度上，每个高度 取10个贻贝 测量叶绿素a的样品：量化浮游植物的丰度，不透明塑料250毫升瓶，在垂直高 度取，每隔10分钟测（在研究期间—4月至9月）
也就是说，这两地的环境温度是 不同的，但从图中看出，它们的 体温却相似，说明除Байду номын сангаас环境温度 外，还有别的因素，作用于它们 的生理反应（调节体温的这一生 理反应）
Results
3.CHLOROPHYLL-A MEASUREMENTS （叶绿素a测量） 与BB相比，从SH岸边采 集的样本（在同样的垂 直高度点上）显示的 Chl-a明显更高。 8月,Chl-a浓度在SH是 在BB的至少两倍； 在SH，8月Chl-a浓度比 6月中旬增加到近20倍。
文中说：由于部分数据丢失，所以只做了如下数据， 但同样能反应探讨的问题。
Results
2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温估计）
5天中，与SH-mid相比,BB-mid贻贝显示更大的温 度差异；每日最低温度都是两个点,在11至14℃ 之间不等；
贻贝中的高潮间带呈现出更多的类似， 每日最大的体温差异的垂直位置是在 岸边。
谢谢！
这里我们利用转录组分析，在不同空间尺度上了解贻贝的生理反应机制。我 们使用居住在不同的垂直位置的贻贝，在 BB（ Boiler Bay）SH( Strawberry Hill )的基因表达的变化。 结果显示两个截然不同的基因表达特征，代谢活动的循环和细胞内稳态扰动， 在空间尺度上相距0.65公里的海域间显示出较大差异，主要来自食物和环境 压力的影响。 环境控制基因的表达，这些新见解可以理解重要的生理内部驱动器，这种见 解可以跨群体。
PARISON OF GENE EXPRESSION PROFILES （基因表达 谱的比较） 6.NORMALIZATION AND STATISTICAL ANALYSIS OF
MICROARRAY DATA （归一化和微阵列数据的统计分析）
Results
1.TIDAL HEIGHT SURVEYS （潮汐高度调查）
The title
讲解人： 程 红
contents
1
Summary Key-words Materials and methods Results Conclusions
2
3 4 5
Summary
海洋潮间带的特点是温度的大幅度变化、pH值、溶解氧气、营养和食物供应 在时间尺度上的变化。这些主要通过生理机制，来驱动生态过程（竞争等）。
Introduction
沿着俄勒冈海岸贻贝的基因表达模式以及生理反应可能有多个相 互作用的复杂的非生物因素。 温度（特别是体温）和食物已经被证明是最重要的影响生存、生 长和繁殖的两个因素。理解底层机制（体温和食物供应）驱动有机反 应和生理性能越来越必要。像气候变化改变生境温度，先前的研究关 于有机体和生态之间的联系及其细胞反应很大程度上是观察，范围有 限，少量的非生物和生物因素,如热休克蛋白或相对基本的生理状态的 代理,如增长率,体型,生殖输出和死亡率。 现在，全基因组分析的框架内进行生态环境允许我们检查多个驱 动和有机反应的相互作用。