猪流行性腹泻病毒河南株2014年～2015年分子特征和遗传进化分析

猪流行性腹泻病毒河南株2014年～2015年分子特征和遗传
进化分析
赵丽;张鸿鑫;李存法;韩昊莹;卢婷婷;陈红英;雷连成
【期刊名称】《中国预防兽医学报》
【年(卷),期】2017(039)012
【摘要】200 PED suspected samples were detected by RT-PCR from different swine breeding farms in Henan province from January,2014 to 2015,In order to research molecular characterization and phylogenetic difference between 15 PEDV positive isolates and PEDV reference strains,S and ORF3 genes of the 15 PEDV isolates were cloned,sequenced and analyzed.The results of genetic difference of S and ORF3 genes showed that 15 PEDV isolates and reference strains all could be divided into 2 groups.The phylogenetic analysis of S genes indicated that 15 PEDV Henan isolates clustered into one subfamily,and all of them had far genetic evolutionary relationship with reference strains.The phylogenetic analysis of ORF3 genes indicated 15 PEDV Henan strains had close relationship with China strains,America strains and Korea strains,and 15 PEDV Henan strains had far relationship with classic strains (CV777) and vaccine strains in China.These results showed that the PEDV Henan strains had the trend of variation and evolution.This study could lay the foundation for better control of the outbreaks for PEDV in Henan province.%为分析河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)分子和遗传进化特征,本研究对2014年1月～2015年12月收
集自河南省不同地区的200份PEDV疑似病料进行RT-PCR检测,并对15份阳性样品进行S和ORF3基因的克隆及序列分析,结果显示15株河南流行株PEDV的S基因和ORF3基因的部分核苷酸和氨基酸序列与参考株相比均发生了变异.S和ORF3基因遗传进化树显示,PEDV均可分为两个群,基于S基因的进化树显示15株河南株独立成群,与其它参考株亲缘关系较远;基于ORF3基因的进化树显示,15株河南株与国内分离株、美国株及韩国株均有较近的亲缘关系.从S和ORF3基因的进化关系中还显示,15株河南株与经典株CV777及国内所使用的疫苗株,亲缘关系较远.表明PEDV河南株有变异和进化的趋势.本研究为更好地控制本病在河南地区的发生奠定基础.
【总页数】4页(P1026-1029)
【作者】赵丽;张鸿鑫;李存法;韩昊莹;卢婷婷;陈红英;雷连成
【作者单位】吉林大学动物医学学院,吉林长春130062;河南农业大学,河南郑州450002;河南农业大学,河南郑州450002;郑州市猪重大疫病防控重点实验室,河南郑州450002;河南牧业经济学院,河南郑州45001l;河南农业大学,河南郑州450002;郑州市猪重大疫病防控重点实验室,河南郑州450002;河南牧业经济学院,河南郑州45001l;河南农业大学,河南郑州450002;郑州市猪重大疫病防控重点实验室,河南郑州450002;吉林大学动物医学学院,吉林长春130062
【正文语种】中文
【中图分类】S852.65
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