组织芯片
组织芯片的概念及原理
组织芯片的概念及原理关键词：细胞株肿瘤细胞菌种保藏中心 ATCC 中国微生物菌种网北京标准物质网组织芯片(tissue chip)，也称组织微阵列(tissuemmroarray)，该技术是将数十个甚至上千个不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一载体上，进行同一指标的原位组织学研究，是一种高通量、大样本以及快速的分子水平分析工具。
组织芯片的制作原理与单个切片相同，只是样本数量增加。
组织芯片的种类包括人的常规石蜡包埋样本的组织芯片、各种实验动物的组织芯片、细胞株及一些病原微生物的芯片等。
在已有的石蜡包埋组织芯片的基础上，Feizo等创建了冷冻组织微阵列技术。
近年来出现了一种新技术，称为下一代组织芯片技术(next-generation tissue。
microarray，ngTMA)，该技术将组织学专业知识与数字化病理技术及自动化组织芯片技术相结合，能精准定位所需要的组织区域或细胞类型，避免无效组织的出现，有助于肿瘤微环境中的病理学研究。
组织芯片主要用于各种原位组织技术实验中，包括常规形态学观察、各种特殊染色、免疫组织化学染色、核酸原位杂交、原位PCR、荧光原位杂交、原位RT-PCR和寡核苷酸启动的DNA合成(PRINS)等；其次用于临床和基础的研究，如分子诊断、预后指标筛选、治疗靶点定位、抗体和药物筛选、基因和表达分析等。
组织芯片的设计应考虑组织的种类及芯片上每一样本组织片的大小。
此外，组织片的大小对某一器官或组织所存在病变的代表程度如何也是考量因素。
一般而言，芯片上组织样本数量越大，组织的面积越小，细胞数量也越少。
在直径约为2mm的组织芯片上有约100000个细胞，而在直径为0．6mm的组织片上只有约30 000个细胞，故在组织芯片的设计中并不是组织片的数量越多越好，最常用的组织芯片的样本含量仍以60～100个为主，组织片的直径可为2mm，这样既可提供较大面积的组织进行形态学观察，又可定位和半定量观察免疫组化或原位杂交等的检测信号(图9-7-1)。
组织芯片
组织芯片初步学习13临七卓医 韦卢鑫 1330705103组织芯片是将数十至上千个小组织整齐地排放在一张载玻片上而制成的组织切片。
它分为多组织片,组织阵列和组织微阵列。
组织芯片的特点是:体积小, 信息含量大, 一次性实验即可获大量结果。
组织芯片可用于组织中的DNA 、RNA 和蛋白质的定位分析和检测。
像普通组织切片一样, 可做HE染色、特殊染色、免疫组织化学染色、DNA 和RNA 原位杂交、荧光原位杂交。
组织芯片蜡块可做100 ～ 200 张连续切片。
这样用同一套组织芯片即可迅速的对上百种生物分子标记(如抗原, DNA 和RNA)进行分析、检测。
因此组织芯片技术是建立疾病, 特别是肿瘤的生物分子文库的强有力的工具。
图1 组织阵列由41 例淋巴瘤组织组成, 组织的直径是2.0 mm图2 组织微阵列由200 多不同发展时期的膀胱癌组织组成,组织的直径是0.6 mm组织芯片的基本制作方法:通过组织芯片制作机细针打孔的方法, 从众多的组织蜡块中采集到数十至上千的圆柱形小组织, 并将其整齐排放到另一个空白蜡块中而制成组织芯片蜡块。
然后, 对组织芯片蜡块进行切片, 再将切片转移到载玻片上而制成组织芯片。
组织芯片的应用有：（1）寻找疾病基因：:组织芯片与基因芯片配合使用在寻找疾病基因中有很好的互补作用。
具有强大的检测基因的功能利用这些新技术,但是, 这些技术不能将原发改变的基因和继发改变的基因区分开来。
换句话说, 在这些改变的基因H ＆E 染色部分从乙醇固定多肿瘤阵列（A ）四个数组元素：肾癌（B ），鳞状细胞癌肺（C ）中，小叶浸润性乳腺癌（D ）和结肠癌（E ）。
B-E ，x400。
中哪些是真正的肿瘤基因, 哪些是次要的和无关的基因, 基因芯片技术不能解决这些问题。
因此, 基因芯片筛选出的候补肿瘤基因必需放到大量的实际病例中去检验, 并且还需大量体外功能实验和体内实验的验证。
将基因芯片筛选出的基因作成探针, 再将探针与组织芯片中众多的肿瘤组织进行荧光原位杂交, 然后找出哪些基因与肿瘤有关。
组织芯片制作
SOP一、总纲1.简介1. 1 原理组织芯片（tissue chip），又称组织微阵列（tissue microarray ，TMA），是生物芯片（组织芯片、基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片）技术的一个重要分支，是将许多不同个体组织标本以规则阵列方式排布于同一载体（使用载玻片最多）上，利用免疫组化、原位杂交等技术分析目的基因的表达差异，进行同一指标的原位组织学研究。
1.2 组织芯片的发展及其应用组织芯片的雏形是Barrifora 等（1986）最早建立的；Wan 等（1987）创造了带有一个管中空隙中心的石蜡嵌入来决定单克隆抗体的染色模式，经过10 年发展，Kononen 等（1998）首先提出组织芯片（tissue chip ，TC），并首次成功运用组织芯片技术对乳腺癌组织中6 种基因的表达情况进行了研究，证实了该技术的实用价值并宣告组织芯片概念的诞生。
Fejzo 等（2001）成功的研制出冰冻组织芯片并利用它进行了非放射性RNA 原位杂交，荧光原位杂交（FISH）和免疫组化等试验。
目前组织芯片技术已广泛应用于人类基因组学研究、疾病相关基因验证、新药的开发与筛选、治疗过程的追踪和预后等方面的研究。
由于组织芯片技术能在细胞水平定位和蛋白质水平检测，实现基因及其表达产物与组织形态学研究相结合，所以在肿瘤病理学研究中价值极大，目前结合免疫组织化学和原位杂交技术在组织芯片上对各种不同肿瘤的研究相对成熟，国内外研究报道已囊括各种消化道肿瘤、泌尿系肿瘤、妇科肿瘤、呼吸道肿瘤及各种软组织瘤等。
不仅要建立规模化的各类型肿瘤的组织库，还要建立正常组织的组织库，使组织芯片的构建形成系统化，为人类攻克癌症提供试验材料。
该技术自1998 年问世以来，以其大规模、高通量、标准化等优点得到大范围的推广应用。
其最大优势在于，芯片上的组织样本实验条件完全一致，有极好的质量控制。
节省时间、节省试剂更是显而易见的。
将数十至上千个小组织整齐地排列在一张载玻片上而制成的组织切片，主要用于研究同一种基因或蛋白质分子在不同细胞或组织中表达的情况。
组织芯片制作流程及注意事项
组织芯片制作流程及注意事项一、组织芯片（OrganonChip，简称OoC）技术作为生物医学工程领域的创新之一，旨在模拟人体器官的微环境，为药物测试和疾病研究提供高度精确的实验平台。
本文将详细探讨组织芯片的制作流程及在实验过程中需要注意的关键事项。
二、组织芯片制作流程1. 设计与布局制作组织芯片需要一个精确的设计。
设计师必须考虑到模拟器官的结构、功能需求以及与外部环境的交互。
在这一阶段，CAD（计算机辅助设计）软件和仿真工具被广泛用于模拟和优化设计。
2. 材料选择与预处理选择合适的材料对于组织芯片的成功制作至关重要。
常用的材料包括聚合物、玻璃和硅等。
在使用前，这些材料通常需要经过表面处理或功能化，以增强其生物相容性和化学稳定性。
3. 制造芯片基板制造芯片基板可以通过微纳米加工技术实现，例如光刻、蚀刻和沉积。
这些技术能够精确地控制微米级的结构和通道，以满足组织芯片对于结构复杂性和流体动力学特性的要求。
4. 组织细胞培养一旦芯片基板制备完成，就可以开始进行细胞培养。
选择适当的细胞类型并将其培养在芯片内部的指定区域。
这需要严格控制细胞密度、培养介质和培养条件，以确保细胞的健康和功能活性。
5. 模拟生理环境组织芯片的核心是模拟器官的生理环境。
通过微流控技术控制介质的流动和化学梯度，模拟体内器官的微环境。
这不仅包括细胞的供养和排泄，还涉及到机械性刺激和生物化学信号的模拟。
6. 数据采集与分析在进行实验过程中，必须实时采集和分析数据。
传感器和成像设备用于监测细胞的生长状态、药物反应和疾病模型的进展。
数据分析则需要利用统计学和计算模型来解释实验结果并提取关键信息。
三、注意事项1. 生物安全性组织芯片设计和制作过程中必须严格遵循生物安全性标准。
使用的材料和培养条件必须能够保证细胞的健康和稳定性，避免对实验人员和环境造成潜在风险。
2. 实验重复性为了确保实验结果的可靠性和可重复性，必须严格控制每一批次组织芯片的制作工艺和细胞培养条件。
现成组织芯片进行免疫组化的方法学
现成组织芯片进行免疫组化的方法学免疫组化技术是生物学和医学领域中一种重要的实验方法，它通过特异性抗原与抗体的结合反应，实现对细胞或组织中特定蛋白质的定位和定性分析。
组织芯片（Tissue microarray, TMA）作为高通量分析工具，可以同时对大量样本进行免疫组化研究。
本文将详细介绍使用现成组织芯片进行免疫组化实验的方法学。
一、实验材料与试剂1.现成组织芯片：包含多种不同类型的组织样本。
2.抗体：一抗、二抗及HRP标记的三抗。
3.DAB显色剂：3,3"-二氨基联苯胺（Diaminobenzidine）。
4.封闭血清：与一抗来源相同的物种血清。
5.0.01M PBS缓冲液（pH 7.4）。
6.0.01M柠檬酸钠抗原修复液（pH 6.0）。
7.脱水剂、透明剂、封片剂。
二、实验步骤1.组织芯片预处理：将组织芯片放入柠檬酸钠抗原修复液中，微波炉加热至沸腾，持续10-15分钟，自然冷却至室温。
2.封闭：使用封闭血清对组织芯片进行封闭，37℃孵育30分钟。
3.一抗孵育：甩掉封闭血清，滴加一抗，37℃孵育1-2小时或4℃过夜。
4.二抗孵育：甩掉一抗，滴加二抗，37℃孵育30分钟。
5.三抗孵育：甩掉二抗，滴加HRP标记的三抗，37℃孵育30分钟。
6.显色：甩掉三抗，滴加DAB显色剂，室温显色3-10分钟，自来水冲洗终止显色。
7.复染：使用苏木素-伊红（H&E）复染，脱水、透明、封片。
三、结果观察与分析1.显微镜下观察组织芯片各样本的免疫组化染色情况。
2.分析阳性细胞、阳性信号强度以及阴性对照等，判断抗体与抗原的结合情况。
四、注意事项1.组织芯片在实验过程中需保持湿润，避免干燥。
2.抗体稀释比例、孵育时间及温度需根据实验条件进行优化。
3.显色时间需严格控制，避免过度显色影响观察。
4.实验过程中应设立阴性对照和阳性对照，以保证实验结果的可靠性。
总结：使用现成组织芯片进行免疫组化实验，可以在短时间内对大量样本进行研究，提高实验效率。
组织芯片技术原理及应用
组织芯片技术原理及应用一、组织芯片技术基本原理组织芯片技术又称为组织微阵列技术，是近年来基因芯片技术的发展和延伸，属于一种特殊芯片技术，具有体积小、信息含量高、可根据不同的需要进行组合和设计的特点，一次性实验即可获大量结果。
将数百个乃至数千个不同来源的组织粘贴到同一张固相载体如玻璃片或硅片上，形成组织微阵列。
组织芯片技术可以迅速测试临床标本组织，和其他技术联合应用能够迅速筛选新的基因分子并评估其生物学作用，进一步在大批量样本中证实这种作用，有助于建立与诊断、治疗和预后相关的各种参数，从而构成完整的基因检测体系。
这对人类基因组学的研究与发展，尤其对基因和蛋白质与疾病关系的研究、疾病相关基因的验证、新药开发与筛选、疾病的分子诊断、治疗过程的追踪和预后等方面具有实际意义和广阔的应用前景；在形态学教学工作中亦具有十分重要的实用价值。
二、组织芯片在医学领域中的应用（一）组织芯片在肿瘤研究的应用1.组织芯片在肿瘤诊断中的应用目前大多数肿瘤诊断是依靠形态学的改变来确定的。
但是，肿瘤可能还未发生形态学的改变或其改变不具有特征性，如何早期发现肿瘤并进行诊断，是医学研究的重点。
在寻找肿瘤诊断标志物时，可将肿瘤和正常组织放在同一芯片上进行比较。
2.组织芯片在肿瘤分类中的应用不同分类的肿瘤由于其组织学类型和肿瘤细胞功能状态及其特异性受体的不同，治疗方案、疗效及预后均不同。
这种以组织芯片技术和免疫组织化学表达谱为基础的分子生物学分类系统为肿瘤分类开辟一个新的途径。
3.组织芯片在肿瘤的浸润转移研究中的应用肿瘤浸润转移是一个多步骤、多基因调控的复杂过程，其具体分子机制不清。
肿瘤的浸润转移与肿瘤的治疗及预后密切相关。
应用组织芯片技术可研究特异性蛋白质在肿瘤浸润转移部位的不同表达水平，从而揭示肿瘤浸润转移与相关蛋白质标志物的关系。
4.组织芯片在肿瘤临床治疗研究中的指导作用应用组织芯片技术对肿瘤治疗中的各种蛋白质表达差异进行检测可提示治疗效果。
基因芯片组织芯片蛋白质芯片
基因芯片组织芯片蛋白质芯片
基因芯片、组织芯片和蛋白质芯片都是生物芯片的分类，它们在应用领域和功能上有所不同。
1. 基因芯片：
基因芯片是将cDNA或寡核苷酸固定在微型载体上形成微阵列，用于高通量快速检测DNA、RNA等生物分子。
它通常应用于基因表达谱分析、基因突变检测、基因组测序等。
2. 组织芯片：
组织芯片是将组织样本以微阵列的形式固定在芯片上，用于检测组织中特定基因的表达水平或寻找与疾病相关的基因。
组织芯片可以用于研究肿瘤、神经退行性疾病等疾病的病理生理过程。
3. 蛋白质芯片：
蛋白质芯片是将蛋白质或抗原等非核酸生物物质固定在微型载体上形成微阵列，用于高通量快速检测蛋白质的表达水平、蛋白质-蛋白质相互作用等。
蛋白质芯片可以用于研究免疫应答、信号转导通路等。
总之，基因芯片、组织芯片和蛋白质芯片都是生物芯片技术中的重要类别，它们在生物医学研究、药物研发和临床诊断等领域具有广泛的应用前景。
组织芯片制作流程及注意事项
组织芯片制作流程及注意事项
以下是 7 条关于组织芯片制作流程及注意事项的内容：
1. 嘿，先说说取材这一步吧！就像大厨挑选最鲜美的食材一样，咱得精心选好组织样本哟！你想啊，要是挑了不好的，那后面还能做出好的芯片吗？例子：比如在做病理组织芯片时，一定得挑那些典型病变的区域，可不能马虎呀！
2. 切片这环节可重要啦！那得切得薄厚均匀呀，就跟切肉片似的，不能厚一块薄一块的。
要是没切好，那后面观察都困难嘞！例子：瞧瞧医院里那些厉害的技术员，人家切出来的片子多漂亮！
3. 点样的时候可得细心再细心，一个点一个点得放好咯，这就好比摆棋子，要整整齐齐的嘞！不然后续分析都不好搞啦。
例子：就像拼图一样，得把每个小块都放对地方才完美呀！
4. 融合这步也不简单哟！得让那些样本紧密结合在一起，就好像把一群小伙伴团结起来一样。
没弄好的话，芯片质量可就不行咯！例子：想想盖房子，砖和砖之间得牢牢固固的，芯片融合也得这样呀！
5. 切片处理也不能马虎呀！该烤的得烤好，该固定的得固定牢，就像给汽车保养一样，每个步骤都得做到位嘞！例子：要是没处理好切片，后面出问题了，那不就白忙活啦！
6. 染色可得讲究技巧啦！要染得均匀又漂亮，这跟给画上色似的，得掌握好火候。
不然怎么看得清楚嘞！例子：像画家精心给作品上色一样，咱染色也得用心呀！
7. 最后封装，可得保护好芯片哟！就像给宝贝找个安全的盒子装起来一样。
不好好封装，那之前的努力不都白费啦！例子：你想想，好不容易做好的芯片，可不得好好保护呀！总之，组织芯片制作真不是个简单事儿，每一步都得用心去做，才能做出高质量的芯片呀！。
组织芯片安全操作及保养规程
组织芯片安全操作及保养规程随着信息技术的不断发展，电子产品的应用越来越广泛，其核心的组成部分之一就是芯片。
在生产制造、研发设计、安全加密等领域，芯片都扮演着重要的角色。
然而，芯片的安全性异常重要，因为它们储存着极其重要的信息，尤其是商业机密和政府机密等重要信息。
因此，芯片在使用和保养过程中必须采取一系列安全措施以保证信息安全。
本文就围绕组织芯片的安全操作及保养规程进行详细阐述。
1. 组织芯片安全操作规程1.1 芯片的场所安全首先，组织芯片的场所必须安全可靠。
芯片制造使用的干净室要求非常高，其灰尘、空气流动、温度、湿度和风险控制等方面都有精密的控制要求。
芯片应在一个低尘、洁净、温湿度适宜的工作环境中操作。
场所内不得存放其它杂物及物品，清洁度不得低于万级。
场所应于每次操作结束后，保持卫生整洁，便于日后的操作。
1.2 芯片的存储为确保芯片的可靠和长期使用，芯片在存储过程中也需要严密把控。
芯片的存储应在无尘、无静电、防潮、防火、防腐蚀的情况下进行。
所有芯片在存放时须有标识，并登记在册，定期检查是否正常。
芯片不宜长期堆放，应当隔一段时间检查芯片是否能正常使用。
1.3 芯片的操作在操作芯片时，需要采取一些必要的措施：1.3.1 确认操作权限在操作芯片之前，首先要确认自己是否拥有该芯片的操作权限。
芯片的操作权限是限制芯片信息泄露的一个关键措施。
由于芯片很容易被拷贝，如果没有操作权限管理，芯片的商业价值将大打折扣。
1.3.2 防止静电静电是导致芯片失效的一个非常重要的原因。
在操作过程中，要采取一系列防静电措施，如在工作平台的表面、手套和工具等地放置带电绝缘介质。
确保不带静电有成功的操作芯片。
1.3.3 防止磁场干扰磁场也是导致芯片失效的另一个重要原因。
因此，在操作芯片之前应该防止磁场的干扰。
例如，如果在操作过程中附近有强磁场的源头，就可能导致芯片出现失效现象。
1.3.4 确认芯片的方向芯片有正反面之分，在操作时一定要把握芯片的方向。
《病理学》组织芯片的制备及应用
❖ 组织芯片（tissue chip）,又称组织微阵列 （tissue microarray）,1998年由Kononen 等在cDNA微阵列的基础上发明的一种特殊 的生物芯片，是继基因芯片和蛋白芯片之 后生物芯片家族的又一个新成员。
❖ 简言之，组织芯片是将数十个乃至数百个 小的组织片整齐的排列在某一载体上（通 常在载玻片上）制成的缩微组织切片。
局限性：
（1）芯片的组织片大小对某一病变是否具有代表 性，尤其是对有明显异质性的肿瘤。
（2）是否能得到大量样本(病例) ,是否能做出高密 度的组织芯片,所做出的组织芯片是否合乎实验的 严格要求。
即在组织芯片制作过程中可能会出现以下问题： a. 无效组织；b.制片过程中组织片的移位或脱落； c.假阴性或假阳性反应，在组织芯片上进行染色时, 常在靠近载玻片长轴两端的部分组织片呈假阴性反 应或假阳性反应(即边缘效应)。d.对目标(供者)石 蜡块的破坏。
（1）组织芯片同时将大量(多个) 组织(探针) 固定于 支持物上,可一次性对多个样品大量的序列进行检 测和分析（高通量、多样本) 。大大提高了检测率。
（2）组织芯片通过设计不同组织阵列,可使用不同 的技术方法对不同的组织或病变进行分析,扩展 FISH 和免疫组化的应用范围,提高研究效率。
（3）此外，组织芯片还可以对原始存档病 理资料进行大样本的回顾性研究,且试剂用 量少(仅为常规方法所用试剂的1/20) ,从而 降低了研究费用，而且可以单次实验同时 观察大量不同组织样本，控制了实验条件， 消除了不同批次实验间的误差，具有更可 靠的可比性。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
组织芯片的制备
❖ TMA制作流程简图： 病检石蜡标本的收集↘
空白蜡块的制备 ↗
病理学中组织芯片使用
病理学中组织芯片使用病理学是研究疾病的基础学科，主要研究疾病的形态学、病理生理学和病理化学等问题。
随着科学技术的不断进步，病理学研究手段也在不断更新。
近年来，组织芯片在病理学研究中得到了广泛应用，本文将对组织芯片在病理学中的应用进行详细介绍。
1. 组织芯片的原理和基本构成组织芯片是一种高通量的技术，可以在一张玻片上持续评估数千个组织样本。
组织芯片通常由一个小直径的针头（通常为0.6-1.5毫米）穿透标本的不同部位，将样本从剖面上采集，并将其插入预先制作好的基质中。
这个基质有可能是蜡块，硅胶，聚合物等。
组织芯片的目的是在一张玻片上收集大量病理学数据，而不是单独评估每个单独的组织标本。
组织芯片通常是由标本、针头、预先制作好的基质、切片机和玻片等组成。
动物实验可以使用小鼠或其他动物模型进行，但是组织芯片的制作通常使用的是人体组织。
2. 组织芯片在病理工作中的应用组织芯片在病理学中的应用十分广泛，主要涵盖了以下几个方面：2.1 诊断疾病组织芯片在诊断疾病方面起到了非常重要的作用。
组织芯片可以帮助病理学家确定病变的类型和程度，并提供大量有关疾病细胞结构和形态方面信息，这对于疾病的准确诊断和治疗有重要的意义。
2.2 提高病理诊断的准确性组织芯片可以提高病理诊断的准确性，尤其是在复杂的肿瘤诊断中。
肿瘤往往呈现出异质性和非均匀性，组织芯片可以在一张玻片上收集数千个样本，并对这些样本进行定量分析和比较。
这种方法可以消除病理学家在大量组织标本上进行分析时可能存在的随机误差，并减少观察结果的误差。
2.3 研究疾病机制组织芯片在研究疾病机制和病理生理学方面也有重要的应用。
通过使用组织芯片采集患者和健康人的组织标本，可以比较分析患者和健康人之间的差异，进而确定引起疾病的相关因素。
组织芯片可以用于研究单个细胞和分子水平上的变化，并能够跟踪模型动物中人类疾病的进展。
2.4 研究药物疗效病理学家可以使用组织芯片来评估药物疗效。
组织芯片 cdna芯片
组织芯片 cdna芯片组织芯片（cDNA芯片）是一种用于研究基因表达的技术工具。
cDNA（亦称为复制DNA）是由反转录过程中合成的DNA分子，其序列和信使RNA（mRNA）相对应。
cDNA芯片则是将这些cDNA分子固定在基质上，用于检测和量化不同基因在特定条件下的表达水平。
cDNA芯片的制备过程包括样品处理、RNA提取、反转录和标记、芯片制备、杂交和信号检测等步骤。
首先，需要提取待研究的组织或细胞中的总RNA。
然后，通过反转录酶将RNA转录成cDNA，其中可以选择使用特定的引物来合成cDNA，以检测特定基因的表达。
接下来，通过标记技术，将反转录合成的cDNA标记上荧光染料，以便在芯片上进行检测。
随后，将标记后的cDNA分子均匀地固定在芯片上，形成cDNA芯片。
最后，将待测样品和芯片进行杂交，通过检测芯片上荧光信号的强度和位置来确定基因的表达水平。
cDNA芯片的主要应用领域是基因表达谱研究。
通过比较不同组织、不同生理状态或不同疾病条件下的基因表达谱，可以揭示基因在生物体内的功能和调控机制。
同时，cDNA芯片也可以用于筛选和鉴定新的基因，并研究基因在发育、分化和疾病中的作用。
此外，cDNA芯片还可用于药物研发和个体化医学等领域。
cDNA芯片相比于传统的杂交技术具有许多优势。
首先，cDNA芯片可以同时检测和量化成千上万个基因的表达水平，大大提高了研究效率。
其次，cDNA芯片具有较高的灵敏度和特异性，可以检测到低丰度的基因表达变化。
此外，cDNA芯片还具有高通量、高重复性和可靠性的特点，可以进行大规模的高通量筛选和分析。
最后，cDNA芯片的数据分析方法和数据库资源也相对成熟，有助于研究人员进行数据解读和功能注释。
然而，cDNA芯片也存在一些局限性。
首先，由于基因组复杂性和多样性，cDNA芯片上不能覆盖所有基因的表达情况。
其次，由于芯片制备过程中的技术限制和设计限制，cDNA芯片的信号动态范围相对较窄。
此外，cDNA芯片的结果需要经过严格的数据分析和验证，才能得出可靠的结论。
组织芯片做免疫组化
组织芯片做免疫组化一、什么是组织芯片组织芯片是一种先进的生物芯片技术，它将多种组织样本集中在一个微小的芯片上。
这种技术可以用于研究组织的结构和功能，并有助于诊断疾病和指导治疗。
组织芯片可以用于免疫组化，来检测和定量分析特定蛋白质在组织中的表达和定位。
二、免疫组化的原理免疫组化是利用特异性抗体与组织或细胞中的靶分子结合，通过染色反应展示靶分子的位置和表达水平。
免疫组化的主要原理包括以下几个步骤：1. 抗原修复组织标本通常需要经过抗原修复处理，以恢复组织中的抗原表达能力。
抗原修复可以通过热处理、酶解或化学方法来实现。
2. 抗体和标记物选择与目标蛋白质特异性结合的抗体，可根据需要使用初级抗体和次级抗体。
标记物可以是酶、荧光染料等，用于检测和可视化目标蛋白质。
3. 反应和检测通过将抗体和标记物与组织样本接触，形成免疫复合物。
根据不同的标记物，可以选择相应的检测方法，如酶标法、免疫荧光等。
4. 图像分析通过显微镜观察免疫染色结果，并进行图像分析，可以定量和定位目标蛋白质。
三、组织芯片在免疫组化中的应用组织芯片在免疫组化中具有许多优势和应用价值。
1. 高通量组织芯片可以同时分析数百个组织样本，可以高效地筛查大规模的样本集合，并加快研究进展。
2. 节省样本和试剂由于组织芯片可以将多个组织样本集中在一个芯片上，可以节省大量的样本和试剂，降低研究成本。
3. 多参数分析组织芯片上可以同时检测多个蛋白质的表达和定位，有助于研究不同蛋白质之间的相互作用以及组织的复杂生物学过程。
4. 数据共享和比较组织芯片的数据可以进行共享和比较，有助于不同实验室之间的合作和研究结果的验证。
四、组织芯片免疫组化实验步骤1. 芯片制备将组织样本处理成可以固定在芯片上的形式。
可以通过冻切或石蜡切片制备组织芯片。
2. 去蜡和抗原修复将组织芯片进行去蜡和抗原修复处理，以恢复抗原的表达能力。
3. 抗体处理将组织芯片与目标抗体进行孵育，使抗体与抗原结合形成免疫复合物。
组织芯片 免疫组化
组织芯片免疫组化组织芯片什么是组织芯片？组织芯片（tissue microarray，TMA）是一种高通量生物技术，它将数千个组织样本压缩到一块玻璃基板上。
这种技术可以在单个玻璃基板上同时测试多个患者的组织样本，从而提高了实验效率和减少了实验成本。
组织芯片的制备过程1. 选择合适的组织标本：选择具有代表性的标本，并且要保证标本质量良好。
2. 制作蜡块：将选择好的组织标本放入蜡块中，用刀片切割成薄片，并在玻璃基板上排列好。
3. 制作切片：将制作好的蜡块放入切片机中，制作出厚度为4-5μm的切片。
4. 制作TMA：将制作好的切片取出并放入TMA针头中，再将针头插入到玻璃基板上预先打好的小孔中。
这样就可以制作出具有多个不同患者样品的TMA。
5. 烘干和固定：将制作好的TMA进行烘干并进行固定处理，使其可以长期保存。
组织芯片的应用1. 疾病诊断：组织芯片可以同时测试多个患者的组织样本，从而可以更加准确地进行疾病诊断。
2. 药物筛选：组织芯片可以用于药物筛选，从而可以更加快速和准确地找到适合的治疗方案。
3. 分子生物学研究：组织芯片可以用于分子生物学研究，例如蛋白质表达、基因表达等方面的研究。
免疫组化什么是免疫组化？免疫组化是一种利用抗体与特定抗原结合来检测蛋白质在细胞或组织中分布和表达情况的技术。
它是一种广泛应用于生命科学领域的技术，尤其在肿瘤学、免疫学、神经科学等领域得到了广泛应用。
免疫组化的步骤1. 取样品：取需要检测的样品，例如肿瘤标本或细胞培养物等。
2. 制备切片：将取得的样品制备成切片，厚度一般为4-5μm。
3. 脱蜡和抗原修复：将制备好的切片进行脱蜡处理，并进行抗原修复，使得蛋白质更容易被抗体识别。
4. 抗体处理：将选择好的一种或多种抗体加入到样品中，让其与目标分子结合。
5. 二级抗体处理：如果需要检测的分子是小分子或者是磷酸化等修饰状态，则需要使用特异性二级抗体进行检测。
6. 显色和染色：将样品进行显色或者染色，并在显微镜下观察结果。
组织芯片的原理及应用
组织芯片的原理及应用组织芯片是一种基于微流体芯片技术的新型生物芯片，其原理是将细胞、组织和器官等生物样本固定在芯片上，以实现生理性状的研究和药物筛选等应用。
组织芯片的应用广泛，包括药物筛选、疾病模型建立、毒理学研究等，具有很大的潜力。
组织芯片的原理基于两个关键技术：微流体技术和生物样本固定技术。
微流体技术是指通过微米尺度的通道和阀门来实现生物样本的精确控制和操作。
生物样本固定技术是指将细胞、组织和器官等生物样本固定在芯片上，使其能够在芯片上进行实验和观察。
在组织芯片中，生物样本首先被引入到芯片的微流体通道中，在控制好温度、湿度和营养液等因素后，可以实现细胞、组织和器官等生物样本的长期培养和观察。
此外，通过控制微流体通道的流速和流量，可以模拟不同器官的生理环境，从而实现不同器官的功能检测和疾病模型的建立。
组织芯片在药物筛选中具有重大意义。
传统的药物筛选方法通常依赖于动物试验，但其受到时间、成本和伦理等方面的限制。
而组织芯片可以模拟人体器官的生理条件，使药物在芯片上进行筛选，从而大大减少了动物试验的需求。
此外，组织芯片还可以用于疾病模型的建立，通过将患者的细胞或组织固定在芯片上，研究人类疾病的发生、发展和治疗，提供了更为准确的预测。
另外，组织芯片还可以用于毒理学研究。
传统的毒理学研究方法主要依赖于动物试验，但其往往无法准确预测人体对化学物质的反应。
而组织芯片可以通过固定人体细胞或组织，在芯片上进行毒物暴露实验，从而更准确地评估化学物质对人体的毒性作用。
总之，组织芯片是一种基于微流体芯片技术的新型生物芯片，其原理是将生物样本固定在芯片上，以实现生理性状的研究和药物筛选等应用。
组织芯片具有广泛的应用前景，包括药物筛选、疾病模型建立、毒理学研究等。
其应用可以减少动物试验的需求，提供更准确的预测和评估，对人类健康和医学研究具有重大意义。
组织芯片
2、用于各种免疫组织化学染色、原位杂交、原位PCR、荧 光原位杂交、原位RT-PCR和寡核苷酸启动的DNA合成 （PRINS）等等。 3、用于临床和基础的研究，分子诊断、预后指标筛选、治 疗靶点定位、抗体和药物筛选、基因和表达分析等。
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组织芯片的前景
对人类基因组学的研究与发展，尤 其对基因和蛋白质与疾病关系的研究， 疾病相关基因的验证、新药物的开发与 筛选、疾病的分子诊断，治疗过程的追 踪和预后等方面具有实际意义和广阔的 市场前景。
是生物芯片技术的一个重要分 支，是将许多不同个体组织标本 以规则阵列方式排布于同一载玻 片上，进行同一指标的原位组织 学研究
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组织芯片的特点
1.体积小，信息含量大。 2.获得大量结果。 3.减少试验误差。 4.省时、省力、经济。 5.有利于原始蜡块的保存。
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组织芯片的制备
现在制备的多为石蜡标本组织芯片。
• 美国Clontech和Stratagene等少数生物技术公司已开展了 人及动物的组织芯片产品开发和销售，但数量少、价格高、 品种单一，满足不了医学科研和医药工业研发的需要。 2001年4月，美国LifeSpan生物科学公司建立了正常和疾 病组织基因表达数据库。美国Tissuelnformactics公司用 动物组织芯片技术进行药物毒理筛选和寻找新药物作用位 点。 • 日本、英国等国正积极筹建国家临床组织病理数据库。 • 中国在组织芯片技术方面的研究刚刚起步，但进展迅速。
组织芯片
生医0702 25号 陈莹
目录
• • • • • • 一 组织芯片的概念 二 组织芯片的特点 三 组织芯片的制备 四 组织芯片的应用 五 组织芯片的前景 六 个人关于组织芯片的一些想法
组织芯片的概念
组织芯片的原理及应用
组织芯片的原理及应用1. 引言组织芯片是一种用于管理和存储大量数据的硬件装置，它的设计理念和工作原理使得它成为了现代计算机系统中不可或缺的组成部分。
本文将介绍组织芯片的基本原理以及在计算机科学领域中的广泛应用。
2. 组织芯片的原理组织芯片的原理主要基于存储器和控制单元的组合。
下面是组织芯片的基本原理：•存储器单元：组织芯片包含大量的存储器单元，每个存储器单元可以存储一个数据元素（比如一个字节）。
这些存储器单元被组织成一个二维的矩阵结构，每个单元都有唯一的地址。
•地址线：地址线用于选择存储器单元，通过向地址线发送地址信息，可以选择要读取或写入的特定存储器单元。
•数据线：数据线用于传输数据，它将存储器单元中的数据传输到其他组件（如处理器）或从其他组件传输数据到存储器单元。
•控制信号：控制信号用于控制读取和写入操作，通过发送不同的控制信号，可以实现读取、写入和其他相关操作。
3. 组织芯片的应用组织芯片在计算机科学中有许多重要的应用。
下面列举了一些常见的应用场景：•主存储器：组织芯片作为主存储器（RAM）的核心组件，用于存储正在执行的程序和数据。
它是计算机系统中最快的存储器，可以随机访问任何存储单元。
•高速缓存：组织芯片还被用于高速缓存中。
高速缓存是位于处理器和主存储器之间的一层存储器，用于缓存处理器频繁访问的数据和指令。
组织芯片的快速访问速度和较小的容量使其成为高速缓存的理想选择。
•图形处理器：组织芯片在图形处理器（GPU）中得到广泛应用。
GPU 是用于处理图像和图形相关任务的特定处理器，它需要大量的存储器单元以支持高效并行处理。
•网络交换机：组织芯片还可以用于网络交换机中。
网络交换机用于在计算机网络中转发数据包，组织芯片可以提供高速的数据存储和快速的数据访问能力，以支持网络交换机的高性能运作。
4. 结论组织芯片作为计算机科学领域中的重要硬件装置，通过存储器单元和控制单元的组合实现了大规模数据的管理和存储。
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计制作规格与模板大小一致的各种包埋框；②倒入融化的液体石蜡，在蜡块的表面加上普通塑料包埋底盒，以便切片时固定蜡块和编号，也可直接用标签纸蜡封编号（切片时有可能使底盒与蜡块脱落，但蜡块依然很规整不影响切片）。浇注熔化石蜡后开始计时，40～50min后（具体时间可能因为室温的不同而不同）蜡块成型并且处于未完全固体化状态，剥离包埋框，开始打孔；③打孔时先将定位模板卡住受体蜡块固定，然后用对应型号的打孔针通过定位模板上的阵列孔打孔，深度为6.0mm。打孔需快速进行，否则蜡块变冷变硬时容易发裂，此时也可以放入摊片机水箱中（水温46℃）水浴加热3～5min，使蜡块受热变软而不易发裂。（2）待取位点标记及供体蜡块的制作 这是技术创新的关键。由于多数取材组织是四方形的，很少是不规则的，使我们在显微镜下阅片后很难回到蜡块上的某一点精准取材，常用方法是在玻片上画圈标记，再回到组织蜡块上目测找位点，这种方法由于取样位点象限不好确定而需要多处取样，这大大增加了我们的工作量和成本。我们的解决方法是坐标定位法准确定位：①在取材时用大头针在蜡块的左上象限1/3处打孔做标记（也可在已成形的蜡块上用小针打孔标记），作为XY轴的原点。②我们阅片时以此打孔点位为原点，分别在显微镜下测出我们要取材的位点在水平轴（X轴）和垂直轴(Y轴)上的坐标距离，再返回到蜡块上相应的坐标位点做标记，取样。从而实现点对点的精确位点取样，仅一次就可成功。(３）供体蜡块的取样①供体蜡块取样前需加热，方法有烤箱加热和水浴加热，我们认为水浴更方便，且易于控制。水温46℃～48℃，加热5～10min；②依据前面测量的坐标找到需要取材的位点，用采样针在供体蜡块欲取出部位上打孔采样，深度5.0mm（比受体蜡块孔浅1.0mm），深度先在针上用彩色塑料膜标记，采样时需缓慢用力，防止供体蜡块裂开，到达要求的深度后要旋转两周以便针芯充满。③在阵列蜡块（受体蜡块）上找到要填入的位点，用实心针芯缓缓推出，准确植入，使组织芯的平面和蜡块的基本一致。④为了更方便准确的取样，我们制作了简单的取样定位工具，制作方法：在两个内空的矩形直角边上刻上精确刻度，取样时用两个矩形相对的直角两边组成一个中空矩形，按照前面显微镜下测量的距离和方向，以打孔点为矩形的一个直角的顶点，对角顶点就是要取样的位点的精确位置。以上创新方法我们取名为二维坐标定位矩形模板取样法。（４）阵列位点信息录①在植入组织芯时在左上象限非对角线上的某一个位点要空出
组织芯片(tissue chip)又称组织微阵列（tissue microarray TMA）。它是将数十至上千个小组织按照设计，整齐地排放在一张载玻片上制成组织切片的技术。这一技术由美国国立癌症研究院的Kononen等[1]于1998年在Nature Medicin上首次报道。它是继基因芯片、蛋白质芯片之后出现的又一种重要的生物芯片技术。由于现有组织芯片设备昂贵且操作繁琐、取样点样本精度低等缺点，影响了组织芯片技术在病理诊断和研究中应用。我们参阅大量资料，自行设计工具，成功制作了高质量组织芯片。根据工作需要，我们选择比较乳腺癌组织芯片和普通切片中免疫组化的差别，来判断组织芯片的有效性，以期能用组织芯片技术提高工作效率。 1材料与方法 1.1供体蜡块的选择收集湖北省肿瘤医院病理科2005年12月~2006年6月诊断为乳腺癌并做过受体检测的病例160例，复查组织切片，包括苏木素-伊红(HE)和雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、cerBb2受体染色切片，一些组织蜡块太薄的病例被排除，最终有124例入选本实验，均为4%甲醛固定、石蜡包理的组织。其中浸润性导管癌101例，浸润性小叶癌14例，大汗腺癌1例，化生性癌1例，髓样癌7例。 1.2组织芯片的构建 1.2.1简易工具的制作(1） 打孔针和取样针的制作打孔针和取样针均可以用带实芯针的穿刺针自己磨制。一套针有四件，两个空心针及配套的两个实心针芯。针径可以是0.6~2.0mm，须注意打孔针径比取样针径小1号（即打孔针的外径与取样针的内径一致），以便取样组织的直径和打孔孔径一致，以防组织芯孔与受体组织连接不紧脱落。我们使用的取样针直径是1.6mm，打孔针和取样针的外周套彩色塑料膜以标记针进入蜡块的深度，打孔针打孔的深度要比取样针深1.0mm。有人报道是采用微雕开窗标记刻度技术，我们认为不可取，因为针用久不锋利时要磨，会影响刻度[2]。（2） 通量定位模板的制作根据自己的需要，可以使用不同直径的针制作不同通量的模板（最好用透明材料），孔间距可以为1.0mm到2.0mm，建议刚开始操作不熟练时间距大一点（2.0mm），四周留白距离大一点（3.0mm），以防止打孔打歪或石蜡块断裂，影响效果。模板的四周最好是三周都有挡板，模板的内径大小和受体腊块相同，以便模板卡在受体蜡块上，操作起来很轻松。我们使用的通量模板有两种：①通量阵列5×7，取样直径2.0mm，间距2.0mm；②通量阵列7×9，取样直径1.5mm， 间距1.5mm；蜡块大小统一为30.0mm×25.0mm，厚度15.0mm，便于管理。 1.2.2TMA制作方法(1） 受体蜡块的制作及打孔①可以使用熔点在60℃～62℃普通切片纯净石蜡制作，依据自己的需要设
Hale Waihona Puke ，以便识别阵列的方位。有报道采用植入脑组织来定位，我们实践后认为还是不植入方便，因为:一方面不植入组织芯的阵列，我们肉眼就可以确定方位，而植入脑组织的阵列要在显微镜才能确定；二是脑组织在摊片时有时容易散开，从而增加确定方位难度。②信息记录采用二维记录方式，精确记录每一位点的信息。水平方向从左到右每个点坐标标记为A、B、C、…，垂直方向每个点坐标标记为1、2、3…，这样每个位点都有由一个由字母和数字组成的坐标，如（A3），（B5），（G2）等等。可以在登记本上记录每个位点的信息，很方便的建立组织芯片库。(５）阵列蜡块的处理阵列制作完毕后，将阵列蜡块含有组织的一面平放在一玻璃板上，置于56℃恒温箱内，每5 min观察一次，待蜡块和玻璃板中间出现液体状的石蜡把蜡块取出，置于冰箱内冰块上冷却。有报道是在常温下冷却，我们实践和比较后认为冰箱内冷却效果更好，因为：常温下冷却蜡块必须底面（有组织芯片的面）朝上，这时液体石蜡容易流出，使蜡块的边角变钝，这样影响边角的组织芯的切片。(6）切片冰腊块好后以4μm厚切片，裱贴于经2% 3氨丙基三乙氧硅烷(APES)丙酮液处理过的载玻片上。微阵列蜡块的切片用德国徕卡一次性刀片在徕卡切片机上切片， 与常规组织切片基本相同，但是因为蜡块内的组织块多，在裱片时操作要轻，速度掌握适宜，否则容易离断或组织阵列偏移，另外，还要注意水温，过低切片展不开，过高易拉长，拉断，保持在48℃左右较合适。用一次性切片刀比用普通厚钢刀切片质量要好。共制作腊块4个，各切片3张共12张切片，每张切片留一个为定位用空白点，其余62个为有效组织位点。372例免疫组化只做了12张玻片。工作量相当于以前免疫组化的3％。