磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤

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磁珠纯化dna步骤

磁珠纯化dna步骤

磁珠纯化dna步骤
磁珠纯化DNA是一种常见的DNA提取和纯化方法。

以下是通用的磁珠纯化DNA的步骤:
1. 样品准备:将DNA样品稀释到合适的浓度,通常用Tris-EDTA缓冲液(TE缓冲液)稀释。

2. 磁珠制备:将磁珠固定在磁板上,并加入磁珠结合缓冲液,使磁珠悬浮在缓冲液中。

3. 靶标捕获:将DNA样品加入磁珠结合缓冲液中,使DNA 与磁珠结合。

4. 磁珠分离:将磁板放在磁力板上,吸附磁珠到磁板上,使用磁力将磁珠分离至磁力板内壁,将上清液丢弃。

5. 洗涤:将洗涤缓冲液加入到分离后的磁珠上,重复磁珠分离步骤,以去除杂质。

6. DNA洗脱:将洗脱缓冲液加入到磁珠上,使磁珠中的DNA 与洗脱缓冲液中的物质交换,并离开磁板。

7. 验证DNA纯化:使用DNA定量方法(如紫外吸收光谱或荧光定量)检查纯化后的DNA浓度和质量。

注意:具体步骤可能会因不同厂商提供的试剂盒和设备而有所不同。

请根据所使用的具体试剂盒和设备的说明进行操作。

磁珠法全血基因组DNA 提取详细步骤及方法

磁珠法全血基因组DNA 提取详细步骤及方法

磁珠法全血基因组DNA 提取详细步骤及方法注意事项样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量也下降;◆需要自备材料:无菌水、异丙醇、磁铁或磁架、1.5 ml离心管(最好低吸附的离心管);需要去除RNA自备RNase A,在蛋白酶K消化这一步加入4 μl RNase A (100 mg/ml);PBS。

◆已加入抗凝剂的血液样品可在2-8℃储存不超过3天(推荐使用EDTA作为抗凝剂),长期贮存请置于-70℃;◆整个过程请勿离心,以免磁珠不可逆聚集而影响提取效果。

实验准备◆冻存血液应在室温或37℃缓慢解冻,不可高温加热,以免血凝成块;将冻存的血液置于37℃摇床150-200 rpm融化,效果最佳;也可提前一天放在4℃解冻;◆磁珠用前一定要充分混匀;◆56℃加热源◆使用前需在Buffer BGW I中加入相应体积的无水乙醇。

操作步骤1. 裂解:(1)当全血样品量低于200 μl时,在全血中加入200 μl Buffer BGL、20 μl Proteinase K,56℃ 10min;(2)当全血样品量高于200 μl时,12000 rpm离心1分钟,弃上清,加入200 μl PBS缓冲液,再加入200 μl Buffer BGL、20 μl Proteinase K,56℃ 10min;2. 结合:在上述裂解液中加入400 μl 异丙醇和磁珠悬浮液(MB) 30 μl(使用前充分重悬),吹打分散磁珠;将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

3.漂洗: (1) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer BGW 0,涡旋振荡5s,充分重悬磁珠,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体,重复该步骤一次。

(2) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer BGW I,涡旋振荡5s,充分重悬磁珠,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

从石蜡组织中提取DNA

从石蜡组织中提取DNA

石蜡包埋组织DNA提取方法
一脱蜡:
1、切取石蜡组织5-10片(5um—7um)放入1.5ml的离心管中;
2、加入1ml二甲苯,55°10min,离心轻弃上清,重复两到三次(因组织而定);
3、加入1ml无水乙醇,室温三分钟,重复二次,离心弃上清,并干燥待酒精挥发。

二消化:
例:设置250ul体系,加入2x裂解液125ul、10%SDS 5ul、蛋白酶k25ul(1mg /ml)、纯水95ul(以上根据裂解液、SDS、蛋白酶K的配置浓度不同和组织量多少而需重新设置),55°消化过夜(按组织的消化情况而定,若没消化完全可适量加入蛋白酶k),直至组织完全液化。

三抽提:
1、加纯水至500ul,加入Tris饱和酚250ul,颠倒混匀,静置5min,再加入250ul 氯仿,颠倒混匀静置5min ,瞬时离心,
2、取出上清液至1.5ml离心管中,加入500ul氯仿,轻混匀,室温静置5min瞬时离心;取上清400ul(吸取液体量可比总体积小,避免吸到蛋白)
四沉淀DNA :
1、加入3M醋酸钠40ul(醋酸钠的量是吸取上清体积的十分之一),轻混匀,加入880ul无水乙醇(两倍体积)混匀,-20°过夜。

五收集DNA
1、13000rpm 15min,离心轻弃上清
2、加入75% 1ml酒精轻洗,即刻13000rpm 5min 轻弃上清,空气干燥(可用55℃),待干燥为止。

六加入50-100ul纯水溶解,30分-1小时。

石蜡包埋组织的DNA提取

石蜡包埋组织的DNA提取

石蜡包埋组织的DNA提取近10年来,现代分子生物学技术越来越广泛地被用于人类疾病研究的诸领域,为了解病理状态下基因组DNA的变化积累了新资料。

目前认为,人类基因组并非人们想像的那样稳定,诸如基因重排、扩增、缺失,突瘘和DNA甲基化类型改变等时有发生,这些改变对于基因表过和调控,以及疾病过程的发展与转归等方面均具有重要意义。

医院病理科档案中积存的大量石蜡包埋组织,是一个可靠的分子生物学研究的材料来源。

在石蜡切片上进行原位杂交或原位PCR分析的分子生物学方法,是免疫细胞化学技术的重要延伸。

通过对DNA或mRNA分析亦可直接证实或补充免疫细胞化学的发现。

这些对开矿学延伸。

通过对DNA或mRNA 分析亦可直接证实或补充免疫细胞化学的发现。

这些对形态学家较为熟悉的原位分子生物学技术,本节不再赘述。

Goelz(1985)和Dubeau等(1986 )成功地从蜡块中提取出高质量的DNA,完全可以满足某些肿瘤分子生物学研究的需要,结束了DNA研究依赖于新鲜或冰冻的探针,诊断与鉴别诊断研究和患者预后评估等方面均具有重要价值。

本节重点讨论石蜡包埋组织DNA提取的方法学及其潜在的应用前景。

一、石蜡包埋组织DNA提取的基本方法从石蜡包埋组织中提取DNA的基本步骤,是在常规DNA提取方法的基础上改良和演变而业。

Goelz等(1985)最先提出的石蜡包埋组织DNA提取技术,是用机械的方法破碎组织,切除多余的石蜡,进入含SDS和高浓度蛋白酶K(1mg/ml)的提取缓冲液加温孵育,然后进行苯酚和氯仿抽提。

所得DNA虽不完整,但可被限制性内切酶切割,因而适于点杂交,印迹杂交等多种分了生物学实验。

Dubeau等(1986)在上述方法上作了改进。

首先通过组织切片和二甲苯和脱蜡,保证了组织的完全破碎,使细胞与消化液充分接触,使DNA释放和蛋白去除更加完全;其次通过两步消化的方法,将不适于做分子杂交的降解的DNA 小段去除,仅保留那些可螺旋化的完整的DNA分子,从而提DNA质量,适于做Sorthern印迹杂交分析。

磁珠法(新鲜组织冰冻组织)基因组DNA 提取详细步骤及方法

磁珠法(新鲜组织冰冻组织)基因组DNA 提取详细步骤及方法

磁珠法(新鲜组织/冰冻组织)基因组DNA 提取详细步骤及方法注意事项样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量也下降;◆需要自备材料:异丙醇、磁铁或磁架、1.5mL离心管(最好低吸附的离心管);◆整个过程请勿离心,以免磁珠不可逆聚集而影响提取效果。

实验前准备磁珠用前一定要充分混匀;◆56℃加热源;◆使用前需在Buffer TGW I 中加入相应体积的无水乙醇。

1. 组织预处理:取动物组织10-50mg,于液氮中研磨破碎,然后将研磨后的组织转移到含有500 μl Buffer TGP 的离心管中,涡旋振荡混匀(若有匀浆机,组织液氮研磨后,在500 μl Buffer TGP中用匀浆机将组织彻底磨碎,效果更佳),12000rpm离心1min,弃上清,沉淀备用。

2. 裂解:在上述组织沉淀中加入500 μl Buffer TGL,移液器吹散沉淀,涡旋振荡数秒,室温放置5-10 min(期间不时颠倒混匀);3. 结合:加入500 μL 异丙醇,再加入磁珠悬浮液(MB) 30 μL(使用前充分重悬),颠倒混匀5分钟;将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

4. 漂洗: (1) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer TGW 0,涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体,重复该步骤一次。

(2) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer TGW I,涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

重复该步骤一次,待磁珠完全吸附后吸弃液体(液体一定要弃尽,不然残留会影响下游实验),晾干2min。

5. 洗脱:将离心管从磁力架上取下加入50-100 μl Buffer EB ,涡旋振荡结合移液器吹打磁珠,使磁珠完全分散在液体中(一定要完全重悬磁珠,若未充分重悬会影响DNA得率),56℃ 放置5min(每隔2min振荡混匀重悬磁珠),置于磁力架上,将上清DNA转移至一新的离心管中,放入-20 ℃ 保存备用,保质期为2 年。

dna提取磁珠法

dna提取磁珠法

dna提取磁珠法
DNA提取磁珠法是一种高效、快速、简便的DNA提取方法。

该方法
利用磁珠表面的亲和性分子与DNA的亲和性结合,将DNA分离出来。

该方法具有操作简单、提取效率高、纯度高等优点,被广泛应用于生
物学、医学、农业等领域。

DNA提取磁珠法的原理是利用磁珠表面的亲和性分子与DNA的亲和
性结合,将DNA分离出来。

首先,将样品加入到含有磁珠的混悬液中,磁珠表面的亲和性分子与DNA结合,形成磁珠-DNA复合物。

然后,利用磁力将磁珠-DNA复合物沉淀到底部,将上清液倒掉。

最后,用
缓冲液洗涤磁珠-DNA复合物,将DNA从磁珠上解离出来。

DNA提取磁珠法具有以下优点:
1. 操作简单:该方法只需要几个简单的步骤,不需要复杂的设备和技术,因此操作简单。

2. 提取效率高:该方法可以高效地提取DNA,提取率可以达到90%
以上。

3. 纯度高:该方法可以提取高质量的DNA,纯度可以达到1.8以上。

4. 适用范围广:该方法适用于多种样品类型,包括血液、组织、细胞等。

DNA提取磁珠法在生物学、医学、农业等领域有广泛的应用。

在生物学领域,该方法可以用于基因克隆、基因测序、基因表达分析等。

在医学领域,该方法可以用于疾病诊断、药物研发等。

在农业领域,该方法可以用于植物基因组学研究、动物育种等。

总之,DNA提取磁珠法是一种高效、快速、简便的DNA提取方法,具有操作简单、提取效率高、纯度高等优点,被广泛应用于生物学、医学、农业等领域。

组织基因组DNA提取试剂盒磁珠法

组织基因组DNA提取试剂盒磁珠法

组织基因组DNA提取试剂盒(磁珠法)使用说明书(Cat#Yu-TD02-1)【产品介绍】组织基因组DNA提取试剂采用国内领先的专利技术合成的纳米磁珠颗粒和多次实验优化的缓冲液体系,能从样品中分离纯化高质量DNA。

在一定条件下,磁珠表面修饰的基团高效吸附目的DNA,而当条件改变时,磁珠释放吸附的DNA,达到快速分离纯化DNA的目的。

整个过程安全、无毒、便利,提取的DNA质量稳定、纯度高。

纯化后的DNA适用于多种后续实验。

本试剂盒可以从少量动物组织中分离纯化出高质量、高浓度的DNA。

【产品特点】1. 效率高:DNA提取得率高,操作简便。

2. 安全、无毒害:整个操作过程无需使用苯酚、氯仿等有毒物质,提取环境更加安全。

3. 高纯度:OD260/230在1.5左右,OD260/280在2.0左右。

可直接用于各种分子生物学实验。

【试剂盒组成】【规格】50T/盒【自备试剂】无水乙醇,异丙醇【贮藏与有效期】裂解吸附液和Buffer AW1必须室温(15-25℃)避光保存;磁珠室温保存;其他所有试剂室温保存,有效期为1年。

【注意事项】1、Buffer AW1使用前,加入18mL无水乙醇,混匀,使乙醇含量为60%。

★2、Buffer AW2使用前,加入21mL无水乙醇,混匀,使乙醇含量为70%。

★3、磁珠使用前必须充分混匀。

★4、组织最好置于组织核酸(DNA/RNA)保存液(Cat#Yu-TP01)或液氮中保存。

【操作步骤】1、样本的处理1.1、液氮中保存的组织将组织在液氮中磨成粉末后,使液氮充分挥发。

再以50-100mg组织中加入1mL裂解吸附液,充分研磨。

以下进入步骤2。

1.2、组织保存液中保存的样本取出在组织保存液中保存的组织,加入1mL无水乙醇洗涤组织两次。

再以50-100mg组织中加入1mL裂解吸附液,充分研磨。

以下进入步骤2。

2、吸取400µL研磨后的裂解吸附液转入1.5mL的EP管中,加入5µL蛋白酶K,60℃1500rpm10分钟。

石蜡组织DNA提取SOP

石蜡组织DNA提取SOP

提取石蜡包埋组织基因组DNA标准操作规程1. 目的:由石蜡包埋组织中提取出基因组DNA,以保证后续检测的正常进行。

2. 操作者:病理科负责取材的技术员、病理医师以及分子病理技术员。

3. 准备工作:3.1 56℃和90℃水浴锅3.2二甲苯或无毒脱蜡液(Deparaffinization Buffer)3.3无水乙醇3.4蛋白酶K溶液:每管干粉状的蛋白酶K中加入1.1ml蛋白酶K溶解液,颠倒让蛋白酶K充分溶解,分装保存于-20℃。

3.5洗涤液GW1使用前,须加入17ml无水乙醇进行稀释。

3.6洗涤液GW2使用前,须加入80ml无水乙醇进行稀释。

4. 步骤:4.1标本接收:分子病理技术员负责核对送样登记表所记录的病理号与标本编号是否一致,要求10um肿瘤组织病理石蜡切片不少于4张,可以是已经切好并放在载玻片上的切片;所有切片均应是未经染色的白片。

4.2脱蜡(可按以下方案A或方案B去除石蜡):方案A:二甲苯去除石蜡(经典方案)A1:石蜡蜡卷A1-1:将石蜡切片置于1.5ml离心管中,加入1ml二甲苯,盖紧涡旋振荡10s,13000r/min 离心2min,吸去上清,保留沉淀;如脱蜡不完全,可重复该步骤一次。

A1-2:向离心管中加入1ml无水乙醇,涡旋振荡混匀,13000r/min离心2min,吸弃上清,用移液器吸头小心将组织摊开粘附于管壁,置于恒温加热器(预先设置为37℃)10min晾干,直到乙醇完全挥发,之后按4.3步骤进行操作。

A2:石蜡切片A2-1:将组织切片置于二甲苯浸泡10分钟,两次;A2-2:无水乙醇浸泡5分钟,一次;A2-3:蒸馏水中浸泡,刮取肿瘤区域到1.5ml离心管中,之后按4.3步骤进行操作。

方案B:无毒脱蜡液(Deparaffinization Buffer)去除石蜡B1-1:加入0.5ml Deparaffinization Buffer至样品中,剧烈涡旋10s。

B1-2:短暂离心让样品浸泡到脱蜡液中,56℃水浴3~5min,剧烈涡旋20s。

磁珠法提取dna步骤

磁珠法提取dna步骤

磁珠法提取dna步骤
磁珠法提取DNA,是一种常用的 DNA 提取方法。

它可以通过磁性珠子的吸附作用,高效地将 DNA 分离出来。

以下是该方法的详细步骤:
1. 细胞裂解
将待提取 DNA 的样品加入细胞裂解液中,均匀混合后在温度为 50-60℃ 的水浴中孵育 30 分钟,使细胞裂解,释放出细胞质和细胞核内的 DNA。

2. 质粒去除
对于需要提取质粒 DNA 的样品(如原核生物),需要使用碱性 SDS 溶液帮助去除细胞壁和膜,然后用酯酶进行消化。

3. 去除蛋白质和碎片
将混合后的样品加入 RNase A 或 Proteinase K 消化液中,在室温下孵育 10 分钟至1 小时,去除 RNA 或蛋白质。

接着加入 EDTA,使磷酸酶失活,避免 DNA 被降解。

4. DNA 磁珠处理
将 MagBeads DNA Purification Beads(磁珠)加入样品中,磁场作用下,磁珠将 DNA 吸附到表面上,其它杂质被去除。

然后用洗涤液对磁珠进行洗涤,去除表面上的杂质。

5. DNA 回收
将磁场去除,使磁珠失去磁性,离心处理样品,使磁珠沉到离心管的底部。

然后去掉上清液,加入去离子水进行洗涤,离心 3-5 分钟。

最后用去离子水或 ELution Buffer 将DNA 从磁珠上溶解出来,用比色计或紫外光谱仪检测 DNA 的浓度和纯度。

将提取出的 DNA 存储在 -20℃ 等低温下,以保证其质量。

总之,磁珠法提取 DNA 使用简便,操作方便,且具有较高的纯度和产量,因此在分
子生物学实验中被广泛使用。

亲子鉴定DNA提取标准操作规程

亲子鉴定DNA提取标准操作规程

DNA提取标准操作规程1. 目的:规范不同检材的DNA提取操作程序,确保DNA质量,保证STR分型结果准确性。

2. 原理:Chelex-100 是一种由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成的化学螯合树脂,含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,可螯合多价离子,特别是对高价金属离子有很高的亲和力和螯合作用。

在低离子强度、碱性及煮沸的条件下,可以使细胞膜破裂,并使蛋白质变性,通过离心除去Chelex颗粒,使其结合的物质与DNA 分离。

磁珠法提取核酸是通过细胞裂解液裂解细胞,从细胞中游离出来的核酸分子被特异的吸附到磁性颗粒表面,而蛋白质等杂质不被吸附而留在溶液中。

反应一定时间之后,再在磁场作用下,使磁性颗粒与液体分开,回收颗粒(即磁珠-DNA 混合物),再用洗脱液洗脱即可以得到纯净的DNA。

3. 操作者:具有法医物证检验资格的广西区妇幼司法鉴定所技术人员。

4. 标本:5%EDTA抗凝全血、8-10ml胎儿羊水、5%EDTA抗凝脐血、FTA纸血斑、口腔拭子、5-10根带毛囊的毛发、绒毛细胞。

5 试剂:5.1 试剂的厂家及规格:5.1.1 DNA抽提试剂 Chelex-100 伯乐公司(Bio-Rad Laboratories, Inc. CA U.S.A)。

5.1.2 DNA抽提试剂 Promega PP18或PP21 DNA System抽提试剂盒。

5.1.3 DNA抽提试剂口腔棉签制备基因组DNA试剂盒(G&T,U.S.A)5.1.4 无水乙醇分析纯5.1.5 异丙醇分析纯5.1.6 无菌的超纯水由实验室技术人员制备。

5.2 试剂的配制:5.2.1 5%Chelex-100的配制:称取5克粉状Chelex-100于试剂瓶中,加入灭过菌的超纯水至100ml。

5.2.2 灭菌超纯水的制备:用干净的试剂瓶装超纯水1升左右,经121℃灭菌30分。

6 仪器及设备:6.1 生物安全柜。

6.2 高速离心机。

6.3 超速冷冻离心机。

基因组dna提取流程 -回复

基因组dna提取流程 -回复

基因组dna提取流程-回复提取基因组DNA是生物学研究和分子生物学实验中的常见步骤之一。

DNA提取过程的主要目标是从细胞中分离纯净的DNA,这样可以进一步进行PCR扩增、测序、限制酶切等实验。

DNA提取的过程需要使用特定的试剂和仪器,并遵循一系列的步骤来确保高质量的DNA样品。

下面将分步介绍DNA提取的流程。

步骤一:准备样品在开始DNA提取之前,需要准备样品。

样品可以是从动植物组织、细菌或真菌中获得的样本。

根据样本的类型,准备的方法可能会有所不同。

对于动植物组织样品,通常需要将样品切碎或磨粉。

这可以通过使用刀具、搅拌器、研钵等实现。

对于一些特殊的组织或植物种类,可能需要优化样品的处理方法。

对于细菌样品,可以利用细菌培养物进行提取,或者直接收集细菌进行提取。

对于培养物,需要将其以高速离心的方式收集下来,并洗涤去除附着在细胞表面的其他物质。

步骤二:细胞破碎细胞破碎是提取DNA的关键步骤之一。

它的目的是破坏细胞膜和核膜,释放DNA。

有许多方法可以破碎细胞,常见的有以下几种:1. 物理破碎:通过高速离心或超声波处理来破坏细胞。

高速离心将沉淀细胞,超声波处理则通过施加强大的震荡来破坏细胞结构。

2. 化学破碎:使用洗涤剂来破坏脂膜和脂蛋白,使细胞破裂。

洗涤剂会溶解脂质双层,使DNA被释放到溶液中。

3. 酶解破碎:使用特定的酶来消化细胞壁或细胞膜,从而释放DNA。

例如,对于真菌样品,可以使用纤维素酶和壁脲酶来消化细胞壁。

步骤三:DNA纯化在细胞破碎后,需要将DNA与其他细胞组分分离。

这样可以去除蛋白质、RNA和其他污染物,使DNA样品更为纯净。

1. 蛋白质消化:可以使用蛋白酶来消化蛋白质。

蛋白酶会降解蛋白质,使其释放出来。

随后,可以使用盐溶液和有机溶剂提取DNA。

2. RNA消化:利用核酸酶消化RNA。

核酸酶将特异性地降解RNA,而不会对DNA产生影响。

消化后,可以使用盐溶液和有机溶剂进行DNA的提取。

3. DNA沉淀:通过向DNA溶液中添加盐和酒精,可以使DNA凝聚成可见的颗粒。

磁珠法提取dna的原理及注意事项

磁珠法提取dna的原理及注意事项

磁珠法提取dna的原理及注意事项以磁珠法提取DNA的原理及注意事项一、引言DNA提取是分子生物学和遗传学研究的基础步骤之一,它是从生物样本中分离纯净的DNA分子。

目前,有多种DNA提取方法可供选择,其中磁珠法是一种常用且高效的方法。

本文将介绍磁珠法提取DNA的原理及注意事项。

二、原理磁珠法提取DNA的原理基于磁性颗粒与DNA的亲和性。

一般情况下,磁珠表面会经过修饰,使其具有特定的亲和性,可以与DNA 分子结合。

DNA提取的主要步骤包括细胞破碎、DNA与磁珠结合、洗涤和DNA的洗脱。

1. 细胞破碎需要将待提取DNA的细胞样本进行破碎。

破碎方法可以是物理方法(如超声波破碎)或化学方法(如蛋白酶消化)。

破碎后,细胞内的DNA被释放到溶液中。

2. DNA与磁珠结合接下来,将磁珠加入到含有DNA的溶液中。

磁性颗粒的表面修饰使其能够与DNA结合。

通过搅拌或磁力的作用,磁珠与DNA结合形成复合物。

此时,DNA会被吸附在磁珠表面。

3. 洗涤为了去除杂质和污染物,需要进行洗涤步骤。

洗涤液的选择和洗涤次数会影响DNA纯度和提取效果。

一般来说,洗涤液中会含有特定浓度的盐和洗涤缓冲液。

4. DNA的洗脱最后一步是将DNA从磁珠上洗脱下来。

这一步通常通过改变溶液的条件来实现,如改变pH值或加入特定的洗脱缓冲液。

洗脱后,可以得到纯净的DNA溶液,可以用于后续的实验或分析。

三、注意事项在进行磁珠法提取DNA时,需要注意以下几个方面:1. 样本的选择和处理样本的选择对提取DNA的效果有重要影响。

首先,应选择新鲜的样本,并尽量避免冷冻和解冻过程。

其次,不同样本的DNA含量和质量也会有所差异,因此在提取之前,需要根据实际情况调整提取试剂盒中的试剂用量。

2. 避免污染在DNA提取过程中,污染是一个常见的问题。

为了避免污染,应使用无酶、无RNase和无DNA的试剂和工具。

此外,实验操作中要注意佩戴手套、使用滤芯和避免气溶胶污染。

3. 操作条件的控制磁珠法对操作条件的控制较为严格,包括温度、离心速度和洗涤缓冲液的配制等。

浅析DNA提取步骤及注意事项

浅析DNA提取步骤及注意事项

浅析DNA提取步骤及注意事项DNA提取是分子生物学中的一个核心步骤,它涉及从生物样本中分离出DNA。

这个过程通常包括细胞裂解和核酸纯化两个主要阶段。

细胞裂解旨在破坏细胞膜和核膜,释放出DNA,而核酸纯化则是通过物理化学方法将DNA与其他细胞组分分离。

常用的DNA提取方法包括有机溶剂提取法、硅胶柱提取法和磁珠法。

在实际工作中,需要根据不同的样本类型和实验需求,选择不同的提取方法。

一、常见的DNA提取步骤(详细实验操作根据方法不同有所差异)1.细胞破碎:使用物理或化学方法破坏细胞膜和细胞壁,释放细胞内的DNA。

物理方法包括研磨、冻融循环等,化学方法包括使用去污剂(如SDS-十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K。

2.去除蛋白质和其他杂质:常用的方法包括酚氯仿抽提法、盐析法和使用硅胶柱层析法。

这些方法可以去除蛋白质、RNA和其他细胞组分,从而净化DNA。

3.DNA纯化:通过乙醇沉淀或使用硅胶柱等方法进一步纯化DNA,去除残留的杂质。

4.DNA浓缩:使用乙醇沉淀法或离心浓缩等方法将提取的DNA 浓缩到适宜的体积和浓度。

5.质量检测:通过紫外光谱吸收值(OD260/OD280比值)、凝胶电泳和qPCR等方法评估DNA的纯度和浓度。

二、特殊样本的提取方法对于特定类型的样本,如植物组织和血液,可能需要特别设计的提取方法。

例如,植物DNA提取中常用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵,Hexadecyl trimethyl ammonium Bromide)法,该方法利用CTAB与核酸形成复合物,在低盐溶液中沉淀,而在高盐溶液中解离,从而分离DNA和多糖。

血液样本中的DNA提取则可能采用非离子变性剂NP40和蛋白酶K的组合来裂解细胞和去除蛋白质。

注意事项:在进行DNA提取时,应注意避免核酸酶污染,确保样品新鲜并妥善保存,避免反复冻融,以保证DNA完整性,以及严格按照协议操作以保证结果的一致性和可重复性。

优化提取条件、样本预处理、温度控制和充分混匀或使用专用试剂盒等策略可以提高提取的效率和质量。

大量提dna的方法

大量提dna的方法

大量提dna的方法提取DNA是生物学和遗传学研究中的一项重要技术。

DNA提取的目的是将细胞中的DNA分离出来,方便进行后续的分析和研究。

下面将介绍几种常用的DNA提取方法。

一、酚/氯仿法酚/氯仿法是一种常用的DNA提取方法。

它利用酚和氯仿的不同密度来分离DNA和其他细胞组分。

首先,将细胞裂解,释放出DNA。

然后,加入酚和氯仿混合液,使DNA在两相溶液中选择性地分配。

最后,通过离心将DNA沉淀到底部,进一步清洗和纯化DNA。

二、石蜡包埋法石蜡包埋法主要用于从组织样本中提取DNA。

首先,将组织样本固定在甲醛中。

然后,经过脱水和浸渍处理,将组织样本置于石蜡中进行包埋。

接下来,用切片机切割出组织块,然后用蛋白酶和蛋白酶K进行消化,释放出DNA。

最后,通过离心等步骤分离和纯化DNA。

三、盐酸法盐酸法是一种简单快速的DNA提取方法,适用于从口腔黏膜等样本中提取DNA。

首先,将样本中的细胞裂解,释放出DNA。

然后,加入盐酸和乙醇,使DNA沉淀。

最后,通过离心将DNA沉淀到底部,进一步清洗和纯化DNA。

四、硅胶柱法硅胶柱法是一种高效的DNA提取方法。

它利用硅胶柱上的硅胶颗粒与DNA的亲和力,将DNA从其他细胞组分中分离出来。

首先,将细胞裂解,使DNA释放。

然后,将样品加载到硅胶柱上,通过洗涤和离心去除杂质。

最后,用低盐缓冲液洗脱DNA,获得纯净的DNA溶液。

五、磁珠法磁珠法是一种新兴的DNA提取方法。

它利用磁性珠子上的特殊配体与DNA的亲和力,将DNA从其他细胞组分中分离出来。

首先,将细胞裂解,使DNA释放。

然后,将磁性珠子加入到样品中,通过磁场将珠子与DNA结合,然后用洗涤缓冲液去除杂质。

最后,用低盐缓冲液洗脱DNA,获得纯净的DNA溶液。

DNA提取是生物学和遗传学研究中的重要步骤,不同的实验目的和样本类型适用于不同的DNA提取方法。

研究人员可以根据实际需求选择适合的DNA提取方法,以获得高质量的DNA样本,为后续的实验和研究提供可靠的基础。

磁珠法提取dna步骤

磁珠法提取dna步骤

磁珠法提取dna步骤磁珠法提取DNA是一种常用的DNA提取方法,它利用磁珠表面修饰的DNA结合试剂将DNA与磁珠结合,然后利用外加磁场将DNA与其他杂质分离,最终得到纯净的DNA样品。

下面将详细介绍磁珠法提取DNA的步骤。

1. 样品处理需要将待提取的DNA样品进行处理。

常见的样品包括血液、组织、细胞等。

对于血液样品,可以使用盐溶液进行血细胞裂解,将红细胞破裂释放DNA。

对于组织或细胞样品,可以使用裂解缓冲液将细胞或组织破碎,释放DNA。

处理后的样品需要离心,将上清液收集。

2. 磁珠结合将处理后的样品与磁珠结合试剂混合。

磁珠结合试剂通常是一种表面修饰有亲和基团的磁珠。

这些亲和基团可以与DNA结合,形成DNA-磁珠复合物。

混合后的样品需要在适当的温度和时间下进行反应,使DNA与磁珠充分结合。

3. 磁场分离将反应后的DNA-磁珠复合物置于磁场中。

由于磁珠具有磁性,它们会在磁场的作用下快速沉降至底部。

而其他杂质则会悬浮在上清液中。

因此,只需将磁珠与上清液分离,即可实现DNA的纯化。

分离过程可以通过离心或者使用磁力架来完成。

在离心过程中,可以调节离心速度和时间,以便更好地分离磁珠与上清液。

4. 洗涤分离后的DNA-磁珠复合物需要进行洗涤,以去除残留的杂质和结合试剂。

洗涤可以使用适当的洗涤缓冲液,多次重复洗涤步骤可以提高洗涤效果。

在洗涤过程中,可以使用磁力架来集中磁珠,方便上清液的去除。

洗涤后,磁珠上的纯净DNA会保留下来。

5. DNA洗脱经过洗涤后,磁珠上的DNA需要从磁珠上洗脱下来。

常见的方法是使用去离子水或低盐缓冲液进行洗脱。

洗脱过程需要在适当的温度和时间下进行,使DNA充分溶解在洗脱液中。

洗脱后的DNA溶液可以通过离心或者使用磁力架来分离磁珠,获得纯净的DNA样品。

磁珠法提取DNA的步骤主要包括样品处理、磁珠结合、磁场分离、洗涤和DNA洗脱。

这种方法简单、快速、高效,能够得到高质量的DNA样品。

在实际应用中,磁珠法已广泛用于基因组学、分子生物学、遗传学等领域的研究中。

基因组DNA抽提操作流程

基因组DNA抽提操作流程

基因组DNA抽提操作流程
1.收集样本:首先需要从待测样本中收集细胞。

这可以是任何包含细胞核的生物组织,如血液、组织样本或细菌培养物。

选择合适的样本类型根据具体的研究目的和实验要求。

2.细胞裂解:将收集到的样本进行细胞裂解,使细胞内部的DNA释放出来。

这可以通过一系列方法实现,如物理破碎、化学裂解或酶的作用。

具体使用哪种方法取决于待测细胞的特点和实验室的设备条件。

3.蛋白质去除:在细胞裂解的过程中,细胞核中的DNA会与蛋白质连接在一起形成复合物,需要进一步去除蛋白质。

可以使用蛋白酶对DNA溶液进行处理,将蛋白质降解分解,并使用盐溶液或酒精进行去除。

4.DNA沉淀:将去除蛋白质的DNA溶液中加入盐溶液或酒精,使DNA 沉淀下来。

这可以通过离心的方法加快DNA的沉淀速度。

离心操作常常需要根据DNA溶液的体积和设备的转速进行优化。

5. 溶解DNA:将沉淀下来的DNA溶于适当的缓冲液中,使其稳定并易于后续的分析和实验。

常用的溶解液包括TE缓冲液(含有Tris-HCl和EDTA)或纯化水。

6.检测DNA浓度和纯度:使用光谱分析仪或比色法等方法检测DNA的浓度和纯度。

这可以帮助确定DNA样本的适用性和是否需要进一步纯化。

需要注意的是,基因组DNA抽提的操作步骤可能会因实验目的和样本类型的不同而有所差异。

在具体操作过程中,应该根据实验室的设备和实验条件进行优化和调整。

同时,实施基因组DNA抽提操作的人员还需要注意安全规范,避免对人体和环境造成潜在的危害。

石蜡包埋组织DNA提取

石蜡包埋组织DNA提取

石蜡包埋组织DNA提取操作步骤:1.样本处理:制作石蜡切片2.将装有石蜡切片样本的1.5ml离心管中加入1ml二甲苯,震荡均匀后56度温育5min,12000r室温离心2min,用枪头将上清吸出,注意不要去除掉沉淀,重复该步骤3次。

3.向弃沉淀后的离心管内加入1ml无水乙醇,震荡均匀后12000r室温离心5min,用枪头将上清吸出,注意不要去除掉沉淀,重复该步骤2次。

4.室温放置5-10min,充分挥发乙醇,使样品呈现干燥无水状态。

5.加入200μl缓冲液GA和20μl蛋白酶K(可根据样本数量提前将GA和蛋白酶K混合分装,使充分混匀与方便加样),充分混匀后56度温育至样本完全裂解(根据具体实验室情况选择时间,必要和时间允许时可选择过夜温育)。

6.将离心管至于90度孵育1h(原则上不少于30min)。

7.在离心管中加入220μl缓冲液GB和250μl无水乙醇(可根据样本数量提前将GB和无水乙醇混合分装),充分混匀12000r室温离心2min使沉淀沉于管底。

8.准备样本数量相对应的吸附柱(标注样本名称信息等)和收集管,将上述离心管中液体移入吸附柱中(不要吸取沉淀),8000r室温离心2min,将收集管中液体重新移入吸附柱中再8000r室温离心2min,倒掉废液,吸附柱放回收集管中。

9.向吸附柱中加入500μl缓冲液GD,8000r室温离心1min,弃废液,将吸附柱放回收集管中。

10.向吸附柱中加入600μl缓冲液PW,8000r室温离心1min,弃废液,将吸附柱放回收集管中。

重复一遍。

11.将收集管12000r室温空离2min,弃收集管,将吸附柱开盖置于预先准备的1.5ml新离心管中悬空放置2-5min,以彻底晒干吸附材料中残余的漂洗液(主要为乙醇,乙醇残留会对酶反应有抑制作用)。

此时可以将TE置于65度预热。

12.向吸附膜中间部位悬空加入40μl洗脱缓冲液TE,静置3-5min,12000r离心2min。

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法 -回复

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法 -回复

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法-回复纳磁石蜡组织切片提取磁珠法是一种常用的实验方法,用于从组织切片中提取磁珠,以进一步研究细胞、蛋白质、核酸等生物学过程。

这一方法结合了纳米技术和磁性材料的优势,具有高效、快速、可控的特点。

本文将详细介绍这一方法的步骤和操作流程。

第一步:制备磁珠磁珠是实施这一方法所必需的核心材料。

在实验开始前,我们需要制备磁珠。

一般来说,可选择具有一定磁性的纳米颗粒作为磁珠材料,例如氧化铁磁性纳米颗粒。

这些纳米颗粒的直径通常在10-100纳米之间。

制备磁珠的方法有很多种,最常用的是共沉淀法。

首先,将制备好的FeCl3溶液滴加入NaOH溶液中,并加热搅拌。

然后,将NH3(硝酸铵)溶液滴加到溶液中,直到溶液颜色变为深黑色。

此时,磁珠已经制备完成。

第二步:组织处理在进行纳磁石蜡组织切片提取磁珠实验之前,我们需要对研究对象的组织进行处理。

首先,收集待研究的组织样品,可以是人体组织、动物组织或植物组织等。

然后,对组织样品进行固定、脱水和浸入。

通常使用福尔马林或其他适合的固定剂来固定组织样品,随后使用酒精和二甲苯对组织样品进行脱水和浸入过程。

第三步:切片和染色处理好的组织样品需要进行切片和染色处理,以便在后续实验中更好地观察和分析。

这一步骤可以使用显微切片技术进行,一般将组织样品切成5-10微米的厚度。

接下来,用适当的染色剂,如海因氏染色法、硅胶着色法等对组织切片进行染色。

染色的目的是增强观察和分析的清晰度和对比度。

第四步:蜡片熔融经过切片和染色处理后的组织切片需要进行蜡片熔融。

这一步骤是为了将组织切片固定在玻璃载玻片上,以便后续进行磁珠提取。

将切片放在加热的蜡片中,使其融化并与组织切片紧密结合。

第五步:磁珠提取经过蜡片熔融的组织切片已经准备好进行磁珠提取了。

首先,准备好磁珠的悬浮液,将其滴加到组织切片上,并尽量使其均匀分布。

然后,借助磁力场的作用,将磁珠吸附到组织切片上。

这可通过将带有磁性的工具移至组织切片下方来实现。

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法 -回复

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法 -回复

纳磁石蜡组织切片提取磁珠法-回复纳磁石蜡组织切片提取磁珠法,是一种用于提取组织样本中的目标分子的方法。

在该方法中,使用纳磁珠的特殊性质结合组织切片的特殊处理,实现对特定分子的富集和分离。

本文将详细介绍纳磁石蜡组织切片提取磁珠法的步骤和原理。

一、实验准备1. 材料:- 目标组织样本切片- 磁性珠子(纳米级别)- 蜡块- 甲醇- 乙醇- Phosphate Buffered Saline (PBS) 缓冲液- 磁力分离器- 离心管- 温度控制水浴器2. 试剂和溶液:- Ethylenediaminetetraacetic Acid disodium salt (EDTA) 溶液- 脱水醇溶液(不同浓度的乙醇和甲醇溶液)- PBST 缓冲液(含Tween-20)- Proteinase K 溶液- 水二、步骤1. 玻片预处理首先,将切片置于温度控制水浴器中预热,温度控制在37。

然后,将切片放在一个带有蒸馏水的容器中,并在切片的表面加入一层薄薄的蜡块。

使用温度控制器将蜡块融化,使其完全覆盖切片。

然后将切片在室温下放置几分钟,直至蜡块凝固。

2. 切片脱蜡将切片及其蜡块放入甲醇中,浸泡几分钟,以去除蜡的残留物。

然后将切片置于乙醇中,重复两次以上的洗涤步骤,以逐渐提高乙醇浓度(例如50,75和100的乙醇)。

重复浸泡和洗涤步骤,直到切片完全去蜡。

3. 切片水解将EDTA 溶液加入切片中,使切片完全覆盖。

在37水浴器中,将切片在EDTA 溶液中孵育约2小时。

这样可实现切片中的细胞膜的破裂,以释放目标分子。

4. Proteinase K 消化取出切片,将Proteinase K 溶液加入切片上。

使用适当的浓度和时间,对切片进行消化,以去除细胞中的非特异性蛋白质,从而减少背景干扰。

5. 磁性珠子结合将磁性珠子悬浮在PBS 缓冲液中,使其均匀分散。

将磁性珠子加入到切片上,轻轻摇动容器,使珠子均匀地结合到目标分子上。

使用磁力分离器分离切片和珠子,在分离过程中保持珠子结合的稳定性。

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磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤
注意事项
需要自备材料:二甲苯、无水乙醇、异丙醇、磁铁或磁架、1.5mL离心管(最好低吸附的离心管);需要去除RNA自备RNase A(100mg/ml),在蛋白酶K消化这一步加入4 μl RNase A;◆整个过程请勿离心,以免磁珠不可逆聚集而影响提取效果。

实验准备
磁珠用前一定要充分混匀;◆56℃和80℃加热源;◆使用前需在Buffer FTGWI中加入相应体积的无水乙醇,使乙醇比例占80%。

操作步骤
1.脱蜡:①切下5 片厚度约为10μM(重约10mg)的组织块,尽量切去石蜡部分,置于1.5ml的离心管中。

加入1ml二甲苯,并振荡30s,然后室温放置5分钟。

20℃,14000 x g 离心3 min,用移液器移尽上清。

②加入1ml 100%乙醇振荡离心管20s,然后20℃,14000 x g 离心3 min,用移液器移去上清,室温干燥组织沉淀15min。

注意:任何残留的乙醇可能会影响蛋白酶K的消化以及减少核酸的得率
2. 消化:加300 μL Buffer FTGL,振荡至彻底悬浮,用匀浆机进行匀浆破碎(使其彻底无大块组织残留),再加入20 μL蛋白酶K(PK),于56℃温浴15min (期间不时混匀),然后置于80℃ 15min;注意:①组织大于50mg时需要增加蛋白酶K (PK)的用量。

3. 裂解结合:将离心管从80℃加热器上离开,冷却至室温,在上清液中加入600 μl Buffer FTGB和600uL 异丙醇,最后加入磁珠悬浮液(MB) 30 μL(使用
前充分重悬),颠倒混匀5分钟;将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

4. 漂洗:
(1) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer FTGW0,轻微涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体,重复该步骤一次。

(2) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer FTGW I,轻微涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

重复该步骤一次,待磁珠完全吸附后吸弃液体(液体一定要弃尽,不然残留会影响下游实验),晾干2min。

5. 洗脱:将离心管从磁力架上取下加入50-200 μl Buffer EB ,剧烈涡旋振荡,重悬磁珠(一定要完全重悬磁珠,若未充分重悬会影响DNA得率),56℃ 放置5min(每隔2min振荡混匀重悬磁珠),置于磁力架上,将上清DNA转移至一新的离心管中,放入-20 ℃ 保存备用,保质期为2 年。

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