中国南方汉族人群D13S631等四个STR基因座遗传多态性

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中国南方汉族人群D13S631等四个STR基因座遗传多态性童大跃;伍新尧;高飞;陈维红;高俊峰;徐剑锋;张云飞
【摘要】短串联重复序列(STR)作为遗传标记在法医学个体识别和亲权鉴定中应用十分广泛。

实际工作中由于某些案例的需要,往往要增加基因座。

新基因座的使用必然要研究其遗传学多态性,并对他们进行评价。

本实验对本室在鉴定工作中经常使用的4个STR基因座(D8S384、D13S631、D18S535和D19S253)多态性进行研究,得到其群体遗传学资料。

现予以报道。

【期刊名称】《法医学杂志》
【年(卷),期】2008(024)001
【总页数】2页(P47-48)
【关键词】法医生物学;遗传多态性;STR;中国南方汉族人群
【作者】童大跃;伍新尧;高飞;陈维红;高俊峰;徐剑锋;张云飞
【作者单位】中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080;中山大学,中山医学院法医物证教研室,广东,广州,510080【正文语种】中文
【中图分类】DF795.2
短串联重复序列(STR)作为遗传标记在法医学个体识别和亲权鉴定中应用十分广泛。

实际工作中由于某些案例的需要,往往要增加基因座。

新基因座的使用必然要研究其遗传学多态性,并对他们进行评价。

本实验对本室在鉴定工作中经常使用的4个STR基因座(D8S384、D13S631、D18S535和D19S253)多态性进行研究,得到其群体遗传学资料。

现予以报道。

取无关个体血液样品,柠檬酸三钠抗凝。

无关个体祖籍分布如下:广东56.2%,
广西6.1%,湖南8.9%,川渝8.2%,江西6.6%,安徽5.3%,湖北3.9%,其他
地区4.8%。

采用5%Chelex-100提取DNA,对D8S384、D13S631、D18S535和D19S253用银染的方法进行基因分型,各基因座分析样品数分别为217例、468例、822例和858例。

PCR扩增引物由上海博亚公司合成
扩增条件:总体积20μL,50~200ng DNA模板,1×Buffer(10 mmol/L Tris-HCl pH8.3,50 mmol/L KCl,Mg2+20mmol/L,ABI,USA),0.2mmol/L dNTP,1U DNA聚合酶(鼎国生物技术公司,北京,中国)。

循环参数:95℃,
5min,95℃30s,60℃,30s,72℃,30s,30个循环,72℃,5 min,4℃保温。

扩增产物用30%(29∶1)聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显色,用自制Ladder进行基因分型[1]。

统计分析用PowerStats V12.xls分析软件进行基因遗传学资料分析,得到法医学
相关参数。

2.1 等位基因分型结果
中国南方汉族人群4个STR等位基因分型结果见图1~4,图中L代表Ladder,F 代表父亲,M代表母亲,C代表孩子。

2.2 等位基因频率
中国南方汉族人群4个STR基因座等位基因结果频率分布如表1。

等位基因频率
分布符合正态分布规律,经过Hardy-Weinberg平衡检验,分布平衡。

2.3 法医学相关参数
利用软件Powerstate V12.xls对中国南方汉族人群4个STR基因座的常用法医学参数分析结果见表2。

STR基因座的多态性高,操作简便,现在已经成为法医学个体认定和亲权鉴定的
最常用和最主要工具。

如果由于群体资料的不够全面和缺乏,则会对实际工作带来影响。

本研究对中国南方汉族200例以上无关个体4个STR基因座进行研究和分析,得到了中国南方汉族人群这4个STR基因座的群体遗传学资料。

从分析结果看,4个STR基因座H、DP、PE、PIC等指标完全适合亲权鉴定和个体识别应用。

按照Shriver等提出的标准评价[2],4个基因座的DP均大于0.80,PE值除
D8S384外,均大于0.50,PIC均大于0.50。

与CODIS系统中的基因座相比,中
国南方汉族人群中这4个基因座的法医学参数的均值都十分接近。

与已报道的中
国延安、四川和广东汉族群体15个STR基因座资料对比没有发现显著差异[3-5]。

等位基因频率分布符合正态分布规律,经过Hardy-Weinberg平衡检验分布平衡。

等位基因频率最低0.001,最高0.424(D8S384的等位基因11)。

分析得到4
个STR基因座个体识别率最低的0.859较CODIS系统基因座TPOX和TH01(0.778和0.853)还高。

PE、PIC、H几个指标也较TPOX基因座(0.282,
0.540,0.592)高。

总之,中国南方汉族群体D13S631等4个基因座在法医学
亲权鉴定和个体识别中有重要应用价值。

【相关文献】
[1]孙宏钰,郭景元.STR基因座等位基因阶梯制备方法尝试[J].中国法医学杂志,2000,(S0):
33-34.
[2]Shriver MD,Jin L,Boerwinkle E,et al.A novel measure of genetic distance for highly polymorphic tandem repeat loci[J].Mol Biol Evol,1995,12(5):914-920.
[3]杨玉玲,王冬花,陈玲,等.安徽汉族人群15个STR基因座遗传多态性[J].法医学杂志,2007,23(1):36-38.
[4]李英碧,吴谨,侯一平,等.成都汉族人群15个短串联重复序列基因座遗传多态性[J].中华医学
遗传学, 2005,22(2):169-173.
[5]李海燕,台运春,陆惠玲等.中国汉族人群15个STR基因座的等位基因频率调查[J].中国法医学杂志,2004,19 (6):330-333.。

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