IVD统计定性试剂
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IVDStatistics (芸豆荚IVD 统计程序)定性试剂
一、统计方法
计算方法均来源于经典的文献或统计学软件,结果和SPSS ,SAS 、MedCalc 等软件相同,主要计算方法如下:
a) 基础计算:
按表1的代号:
阳性符合率=A/(A+C)×100% 阴性符合率=D/(A+B) ×100% 阳性预期值=D/(B+D) ×100% 阴性预期值=D/(C+D) ×100%
总符合率=A+D/(A+B+C+D) ×100%
率的95%可信区间采用Modified Wald 方法计算,公式如下:
95%可信区间:
式中:,a 为数值比分子,n 为数值比分母,Z 1-α/2=1.96。
二项分布法计算(同MedCalc 程序),公式如下:()k
n k
LB n
a k p p k n LB
--⎪⎪⎭
⎫ ⎝⎛=∑=12/α,
()k
n k UB a
k p p k n UB
--⎪⎪⎭
⎫ ⎝⎛=∑=12/0α,式中a 为数值比分子,n 为数值比分母。
Wald 方法计算,公式如下: 95%可信区间:
n q p Z p
-a//ˆˆˆ21±,式中: p =a/n ,q p n ˆˆ=1- p ,a 为数值比分子,n 为数值比分母,
Z 1-α/2=1.96。
Score (Wilson)方法计算,公式如下:
95%可信区间:
式中:a 为数值比分子,n 为数值比分母,Z 1-α/2=1.96。
Score with Continuity Correction 方法计算,公式如下:
⎥ ⎥ ⎦ ⎤ ⎢ ⎢ ⎣ ⎡ + - + + + = - - - - 2 2 2 / 1 3 2 / 1 2 2 / 1 2 2 / 1 4 ) ( 2 n Z n a n a Z n Z n a Z n n
p UB α α α α ⎥ ⎥ ⎦ ⎤ ⎢ ⎢ ⎣ ⎡ + - - + + = - - - - 2 2 2 / 1 3 2 / 1 2 2 / 1 2 2 / 1 4 ) ( 2 n Z n a n a Z n Z n a Z n n
p LB α α α α
95%可信区间:P LB =
)
Z (n )q (n p /n)(Z Z )Z p
n (-a/-a/-a/-a/2
2
22121212121ˆˆ4121ˆ2++++---+
P UB =
)Z (n )-q (n p /n)-(Z )+Z Z p
n (-a/-a/-a/-a/2
2
2
2121212121ˆˆ4121ˆ2+++++
式中:a 为数值比分子,n 为数值比分母,Z 1-α/2=1.96。
b) 卡方检验
依据参考文献[1,2],精确概率法检验(同SPSS 程序)计算方法:X 2=×2,自由度v=1。
普通卡方检验(同SAS 程序)计算方法:X
2= ,自由度v=1
校正卡方检验(b+c>25时,同MedCalc 程序)计算方法:X 2=
,
自由度v=1 ,
再根据卡方X 2值和卡方分布函数计算出概率值P 。
c) Kappa 一致性检验(结果同SAS ,MedCalc 等程序)
依据参考文献3,对于行为i=2,列为j=2排列的数据:计算公式如下:
一致性系数Kappa=式中
;
用于估计95%可信限的标准误计算公式如下:Se(k)=,式中:
Kappa 值的95%可信区间=Kappa+/-1.96Se(k)。
Kappa 值非0检验,即检验Kappa 值是否来自为0的总体,即Kappa 值的差异是否由抽样误差造成的,计算公式如下:Z=Kappa/Se0 (k),式中
Se0(k)=
,再根据Z 值和标准正态分布函
数,计算出概率值P 。
二、和OpenEpi 、MedCalc 、SPSS 计算结果对比(结果一致)
以输入以下数据为例:
1) 基础计算
本程序:(95%CI采用二项分布法)
MedCalc:、
2) 率的95%可信区间:
同项目和OPenEPi完全一致(MedCalc只有一种算法):
OPenEPi:
3)配对卡方检验
精确概率法
本程序:
SPSS:
校正卡方(另一组数据,b=16,c=19) 本程序:
MedCalc:
4) Kappa一致性检验
本程序:
SPSS:
MedCalc(结果无非0的检验)
参考文献
1、颜红主编. 医学统计学(第2版),人民卫生出版社. 2010
2、刘一斑秀,刘钧. 配对四格表资料差别检验的精确概率方法,南京大学学报. 1998, 34(5):627-631
3、Joseph L. Fleiss. Statistical Methods For Rates And Proportions - 3Ed, 2003,598-607
4、。