从CCLE中查找细胞系中基因表达量
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• （9.点击row profile plot，即能够做出表达 量的图。
从CCLE中查找基因表达量
• （2.进入CCLE,选择browse-cell line，之后 选择Hist subtype1。选择所要查找的细胞 系。（AML）
从CCLE中查找基因表达量
• （3.选择download selected annotations 这个下载好的cell line annotation.csv 文件将在后面使用到。
从CCLE中查找基因表达量
• （4.在搜索栏填写所要查找的基因名 如 meis1
从CCLE中查找基因表达量
• （5.点击meis1，进入detail page。
从CCLE中查件后缀名是.gct.
从CCLE中查找基因表达量
• （6.用GENE-E打开下载好的基因表达量的 文件，里面有所有细胞系的meis1表达量的 比对值。（表达量的值来自于芯片）
细胞系海拉细胞系细胞系和细胞株有限细胞系细胞株细胞系神经细胞系hela细胞系细胞系鉴定乳腺癌细胞系肝癌细胞系
• 从CCLE中查找AML细胞系的基因表达量
从CCLE中查找基因表达量
• （1.到broadinstitute的一个子页去下载安装 GENE-E. /cancer/softw are/GENE-E/download.html 由于该软件是java编写的，需要java的一个 预安装环境。
从CCLE中查找基因表达量
• （7.点击file-annotate columns，选择第一 次下载的cell line annotation.csv,出现注解。
从CCLE中查找基因表达量
• （8.双击hist subtype1，就能够对筛选的细 胞系进行由左到右的从高到低的表达量的 排列。
从CCLE中查找基因表达量
从CCLE中查找基因表达量
• （2.进入CCLE,选择browse-cell line，之后 选择Hist subtype1。选择所要查找的细胞 系。（AML）
从CCLE中查找基因表达量
• （3.选择download selected annotations 这个下载好的cell line annotation.csv 文件将在后面使用到。
从CCLE中查找基因表达量
• （4.在搜索栏填写所要查找的基因名 如 meis1
从CCLE中查找基因表达量
• （5.点击meis1，进入detail page。
从CCLE中查件后缀名是.gct.
从CCLE中查找基因表达量
• （6.用GENE-E打开下载好的基因表达量的 文件，里面有所有细胞系的meis1表达量的 比对值。（表达量的值来自于芯片）
细胞系海拉细胞系细胞系和细胞株有限细胞系细胞株细胞系神经细胞系hela细胞系细胞系鉴定乳腺癌细胞系肝癌细胞系
• 从CCLE中查找AML细胞系的基因表达量
从CCLE中查找基因表达量
• （1.到broadinstitute的一个子页去下载安装 GENE-E. /cancer/softw are/GENE-E/download.html 由于该软件是java编写的，需要java的一个 预安装环境。
从CCLE中查找基因表达量
• （7.点击file-annotate columns，选择第一 次下载的cell line annotation.csv,出现注解。
从CCLE中查找基因表达量
• （8.双击hist subtype1，就能够对筛选的细 胞系进行由左到右的从高到低的表达量的 排列。
从CCLE中查找基因表达量