睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
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睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
睡莲是一种古老的、美丽的花卉,其广泛分布于世界各地的淡水湖泊、沼泽和河流中。
睡莲种质资源的遗传多样性是睡莲保持种群适应性、生存和发展的重要基础。
因此,我们
对睡莲种质资源的遗传多样性进行分析和评价,有助于更好地保护和利用睡莲资源。
本文
旨在对睡莲种质资源的遗传多样性进行分析并构建DNA指纹图谱。
1. 材料与方法
本研究共选取了来自四川、云南、广东、浙江等省份的61份睡莲种质资源样品。
1.2 样品DNA提取
采用改良CTAB法提取睡莲叶片DNA样品。
DNA纯度和质量通过比色法和凝胶电泳检测。
1.3 SSR扩增和分析
利用已知的7个SSR引物对睡莲种质资源样品进行扩增,PCR产物通过凝胶电泳检测。
得到的数据进行多样性分析、遗传距离计算和构建遗传相似度树。
1.4 探针标记和印刷
将扩增产物中的四个显著性MS位点设计为探针,并用这些探针标记用于印刷。
1.5 DNA指纹图谱构建
将标记后的扩增产物通过PAGE凝胶电泳分离,然后用银染法进行印刷。
在银盐照相显色后,将银染带扫描,并在软件中进行分析。
2. 结果
共扩增得到116个SSR位点,其中109个多态性位点,多态信息含量(PIC)平均为
0.604。
遗传距离范围为0.098到0.578。
构建的遗传相似度树将所有61份睡莲种质资源样品分为六个主要分支和两个独立的单个样品。
在银染图谱中,共检测到160张带,其中154张为多态带,多态率为96.25%。
构建的DNA指纹图谱显示出了睡莲种质资源样品之间的遗传关系。
3. 讨论
本研究对睡莲种质资源的遗传多样性进行了分析,并构建了DNA指纹图谱。
结果表明,睡莲种质资源在遗传上具有较高的多样性,且可以根据遗传相似性进行分类。
DNA指纹图
谱能够为睡莲种质资源的鉴定、品种鉴定和遗传演化研究提供依据。
由于该研究只选取了少量的睡莲种质资源样品,因此,有必要对更多的睡莲种质资源进行遗传分析和DNA指纹图谱构建,以便更全面地评估其遗传多样性和遗传关系。