绿色荧光蛋白在蛋白质研究中的应用

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— — — — — — — — — — — 收稿日期 : 2006- 10- 19 国 家 自 然 科 学 基 金 资 助 项 目(No. 30470049) 作 者 简 介 : 段 青 (1985—) , 女 , 本 科 , E - mail: duan-
qing36@yahoo.com.cn ; 王 倩 (1983 — ), 女 , 博 士 生 ; 祁 庆 生 (1966—), 男, 教授, 联系作者, E- mail: qiqingsheng@sdu.edu.cn
Baird等[4] 发现, 虽然 GFP 有紧密的桶状结构 和形成发光基团所必需的复杂的翻译后修饰, 当 对 GFP 的 N 端和 C 端部分交换重排并以一段间隔 重 新 连 接 时 , GFP 仍 然 具 有 荧 光 。并 且 , GFP 的 某些位点可以耐受整段蛋白质的插入, 在结合金 属 离 子 的 黄 色 荧 光 蛋 白(yellow fluorescent protein, YFP)(GFP 的突变体)的 145 位插入锌指结构能够使 荧光强度多倍提高。Hu 等[5] 提出了双分子荧光互 补 实 验 (bimolecular fluorescence complementation , BiFC)的概念, 用互补的荧光片段标记不同蛋白质 来研究 bZIP 和 Rel 转录因子家族的相互作用, 确 定了相互作用位置和信号传递对作用位点的调节 等, 证明了双分子荧光互补实验在蛋白质相互作
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●小综述
《生命的化学》2007 年 27 卷 1 期 CHEMISTRY OF LIFE 2007, 27(1)
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图 1 绿色荧光蛋白的结构及发光基团
荧 光 定 量 测 定 的 方 法 [2]。 2. GFP 在蛋白质相互作用和构象变化研究中的应 用
蛋白质相互作用是生物学研究很重要的一个 方面, 采用如免疫共沉淀、化学交联、片段层析 等技术, 已经了解了许多蛋白质的相互作用以及 结构基础。但这些生化技术离体研究不能反映活 细胞内蛋白质相互作用的情况以及动力学问题。 一种活细胞内蛋白质相互作用的研究方法是蛋白 质 片 段 互 补 测 定 法 (protein- fragment complementa- tion assay, PCA)[3]。将 标 记 蛋 白 在 某 个 位 点 打 开 , 用片段分别与两个靶蛋白融合。如果靶蛋白相互 作用, 则标记蛋白片段靠近并重新折叠恢复活性。
参考文献
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摘 要 : 绿 色 荧 光 蛋 白(green fluorescent protein, GFP)自 发 现 以 来 , 由 于 具 有 自 发 荧 光 等 特 性 , 在 分 子 生 物 学 和 细 胞 生 物 学 领 域 得 到 广 泛 应 用 。 GFP 作 为 一 种 报 道 分 子 , 在 研 究 蛋 白 质 相 互 作 用 和 构 象 变 化 、 检 测 蛋 白 质 表 达、蛋白质和细胞荧光示踪中, 起到了重要的作用。该文通过对绿色荧光蛋白特性的分析, 介绍其作为荧光标 记在蛋白质研究中的应用, 并展望进一步的研究前景。 关键词: 绿色荧光蛋白; 荧光标记; 基因标记物; 蛋白质研究 中 图 分 类 号 : Q291, Q503
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《生命的化学》2007 年 27 卷 1 期 CHEMISTRY OF LIFE 2007, 27(1)
●Mini Re vie ws
绿色荧光蛋白在蛋白质研究中的应用
段 青 王 倩 祁庆生
( 山 东 大 学 微 生 物 技 术 国 家 重 点 实 验 室 , 济 南 250100 )
[ 5 ] Jahn M et al. Chem Commun(Camb), 2004, (3): 274- 275 [ 6 ] Honda Y et al. J Biol Chem, 2006, 281(3): 1426- 1431 [ 7 ] Vaughan MD et al. J Am Chem Soc, 2006, 128(19): 6300- 6301 [ 8 ] Sugimura M et al. Biosci Biotechnol Biochem, 2006, 70 (5):
用研究中的可行性。 荧光互补不仅在蛋白质相互作用中有所应用,
Jeong 等[6] 以 与 底 物 结 合 时 会 有 典 型 构 象 变 化 的 麦芽 糖 结 合 蛋 白 (maltose binding protein, MBP)为 模 型, 将 MBP C 端和 N 端分别与 GFP 片段融合。 结果证明加入底物的一组显示出比对照组更强的 荧 光 , 由 此 提 出 split- GFP 在 观 察 蛋 白 质 构 象 变 化中的应用。
243- 251 [14] Feng HY et al. J Biol Chem, 2005, 280(44): 37088- 37097 [15] Dion M et al. Glycoconj J, 2001, 18(3): 215- 223 [16] Dion M et al. Glycoconj J, 2001, 18(6): 457- 464 [17] Kim YW et al. J Biol Chem, 2004, 279(41): 42787- 42793 [18] Jorgensen F et al. Appl Microbiol Biotechnol, 2001, 57: 647- 652 [19] Goyal K et al. Arch Biochem Biophys, 2002, 407(1): 125- 134 [20] Mullegger J et al. Angew Chem Int Ed Engl, 2006, 45 (16):
另 外 , 重 要 的 荧 光 成 像 技 术— ——荧 光 共 振 能 量 转 移 [ 7] (fluorescence resonance energy transfer, FRET), 利 用 GFP 及 其 突 变 体 , 实 现 了 定 时 、 定 量、定位、无损伤地在活细胞内检测大分子构象 变 化 和 蛋 白 质 相 互 作 用 。 最 近 , Pedelacq 等[8] 经 过突变得到一种 GFP 超折叠体。这种 GFP 超折叠 体不论是在单独表达还是融合表达时都不容易产 生荧光的减弱, 将有望用于 FRET 技术的改进。 3. GFP 在蛋白质表达中的应用 3.1 GFP 与 蛋 白 质 可 溶 性 表 达 利 用 大 肠 杆 菌 进行蛋白质大量表达时, 常常会造成蛋白质错误 折叠和聚集沉淀。已有的增加蛋白质可溶性表达 的方法包括: 靶蛋白与溶解性好的蛋白质融合表 达、靶蛋白与促折叠剂及伴侣蛋白共表达、低温 表达、改善培养条件等。但这些方法并不适用于 所有情况, 因为没有从本质上改变控制蛋白质折 叠和可溶性的因 素 。Waldo 等[9] 利 用 GFP 只 有 在 自身折叠正确的情况下才产生荧光的特性和能在 基因水平操作的优点, 将随机突变后的目的蛋白 以 C 端 同 GFP 融 合 , 在 大 肠 杆 菌 中 构 建 表 达 文 库。荧光筛选和 SDS 验证表明, GFP 的 折 叠 和 发 光基团的形成与上游蛋白质的正确折叠及可溶性 直 接 相 关 。此 后 , Pedelacq 等[10] 进 一 步 利 用 GFP 指 示 筛 选 到 可 溶 性 提 高 的 甲 基 转 移 酶 、 NDP 激 酶 , 并 通 过 X 光 衍 射 实 验 得 到 了 进 化 的 NDP 激 酶 的 结 构 。van den Berg 等[11] 利 用 这 种 方 法 , 通 过 易 错 PCR(error- prone PCR)增 加 了 TEV 蛋 白 酶 在 大 肠 杆 菌 中 的 可 溶 性 表 达 。 Kawasaki 等 [12] 将 T- PCR(tagged random primer PCR)扩 增 与 GFP 标 记 筛 选 方 法 相 结 合 , 从 小 鼠 Vav 蛋 白 中 克 隆 到 4 个可溶结构域。
针对 GFP 折叠报告系统存在的问题, 比如在 蛋白质定向进化中, 蛋白质可能从内部隐蔽核糖 体结合位点错误起始翻Baidu Nhomakorabea而形成截短的蛋白质, 以及这种报告系统不适用于由于缓慢聚集而形成 的 不 溶 性 蛋 白 质 , Cabantous 等[13] 在 GFP 折 叠 报
经过环化、氧化后形成的咪唑环, 在钙离子激发 下 产 生 绿 色 荧 光 [1]。
通 常 , GFP 在 完 整 并 形 成 正 确 构 象 时 能 够 产 生荧光, 这个性质使得它在蛋白质研究中具有极 其重要 的 作 用 。GFP 被 广 泛 地 用 作 指 示 分 子 , 通 过与靶蛋白的基因融合, 来研究蛋白质相互作 用、构象变化, 蛋白质折叠效率与可溶性, 蛋白 质 的 表 达 以 及 细 胞 定 位 等 。 作 为 报 道 分 子 , GFP 具有很多优点, 如实现了活细胞内基因表达和定 位、荧光为蛋白质的内在属性、荧光发射无种属 依赖性、检测时不需要附加辅助因子、具有高度 稳 定 性 等 。 另 外 , 细 胞 内 GFP 的 检 测 也 比 较 简 单, 如利用紫外灯、荧光显微镜、荧光激活细胞 分选仪等, 现有报道利用实时定量 PCR 进行 GFP
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能 将 很 快 被 实 现 。最 近 , 糖 苷 酶 的 突 变 酶— ——糖 苷合成酶被应用于合成糖蛋白和 鞘 糖 脂 , [7,20] 不 仅 成功地解决了长期以来糖蛋白和鞘糖脂难以合成 或合成产量低、难以大量获得的难题, 同时也扩 大了糖苷酶的应用范围。随着分子生物学技术在 糖苷酶领域的进一步应用, 糖苷酶的作用将会继 续延伸, 更多的新酶将会不断涌现, 极大地丰富 其合成的糖类及药物分子的种类, 推动糖生物学 和制药业的迅速发展。
1210- 1217 [ 9 ] Kim YW et al. J Am Chem Soc, 2006, 128(7): 2202- 2203 [10] Hinz SW et al. Biotechnol Bioeng, 2006, 93(1): 122- 131 [11] Hansson T et al. Biotechnol Bioeng, 2001, 73(3): 203- 210 [12] Rivera MH et al. Protein Eng, 2003, 16(7): 505- 514 [13] Aronson NN Jr et al. Biosci Biotechnol Biochem, 2006, 70(1):
1. 绿色荧光蛋白 绿 色 荧 光 蛋 白(green fluorescent protein, GFP)
是 荧 光 蛋 白(fluorescent protein, FP)家 族 中 常 用 的 一 种 , 最 初 从 水 母 Aequorea victoria 中 分 离 得 到 。 它能够在单独或者与其他蛋白质融合时产生荧 光, 最显著的特点是除了氧气之外, 不需要其他 辅 酶 。GFP 由 11 个 β片 层 组 成 桶 状 构 成 疏 水 中 心, 由 α螺 旋 包 含 着 的 发 光 基 团 位 于 其 中(图 1)。 这 个 发 光 基 团 是 由 3 个 氨 基 酸(Ser65、Tyr66、Gly67)
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