宏条形码名词解释
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宏条形码名词解释
DNA宏条形码(Metabarcoding)是条形码(Barcoding)与高通量测序(High-throughput sequencing,NGS)的结合,选取条形码序列的一段(如COI的某段序列,100~200bp)作为分子标记,将混合样本(如eDNA、群落DNA)作为模板,扩增完成后进行高通量测序,获得测序结果后再进行生物信息学分析,将每条正确的测序序列与不同物种一一对应。
人类基因组计划推动了测序技术的高速发展,2000年初,第一个真正的高通量测序平台发布,再历经20多年的发展,测序成本早已不像当初那样昂贵,因此高通量测序的应用更加广泛[1]。
测序技术的发展是推动eDNA宏条形码技术成为研究热门的重要因素,同时,利用DNA条形码来鉴定物种时,只需要一小段DNA,这也正好避开了高通量测序在长片段测序方面的劣势。