禾谷镰孢复合种毒素化学型及遗传多样性分析
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关键 词:禾谷镰孢复合种;毒素化学型;遗传 多样性;ISSR;玉米穗腐病
Analysis of Toxigenic Chem otype and Genetic Diversity of the
严r一பைடு நூலகம்Sar『■ m ram ,0门ea m ,、 pec ̄0 es Om pI- eX
1期
马 红 霞 等 :禾 谷 镰 孢 复 合 种 毒 素 化 学 型 及 遗 传 多样 性 分 析
83
Abstract: [Objective]The objective of this study is to clarify the toxigenic chemotype and genetic diversity of Fusarium graminearum species complex(FGSC)causing maize ear rot from diferent provinces(autonomous region).[Method]The toxigenic chemotypes of 92 FGSC isolates collected from l1 provinces(autonomous region)were analyzed by using the specif ic primer
M A HongXia,SUN Hua,GUO Ning,ZHANG HaiJian,SHI Jie,CHANG JiaYing
(Plant Protection Institute,Hebei Academy ofAgricultural andForestry Sciences ̄Key Laborator y oflPM on Crops in Northern Region ofNorth China,MinistryofAgriculture/IPM Centre ofHebeiProvince,Baoding071000,Hebei)
摘要 : 【目的】明确不 同省 (自治区 ) J起 玉米穗腐病 的禾谷镰 孢复合种 (FusarJum graminearum SpecieS complex,FGSC)的毒 素化 学型和 它们之 间的遗传差异 以及 亲缘 关系。 【方法 】选用根据基 因 和 序列 设计的特异性 引物分析来 自 11个省 (自治 区 )的 92株 禾谷 镰孢复合种菌株 的毒素化学型;从 1 OO条哥伦 比亚大 学 (UBC)开发的通用 5I物 中筛选 出 1 3条扩增 条带丰富、重复性 好、信 号强、背景清晰 的引物 ,利用筛选 出的 5】 物对供 试菌株进行 ISSR—PCR扩增 ,使用 Popgen32软件 计算多态性位 点百分 率、Shannon’S多样性指数 、群体 间的 遗传距离和遗传相似性;依 据 Nei’S遗传距 离,利用 NTsys2.i 0e软件 进行 UPGMA聚类分 析,并构建供试菌株 的聚 类 图。【结果 】供试 的 92株 禾谷镰孢复合种菌株的产 毒素化学型有 4种:DON、15-ADON、DON+I5-ADON和 NIV+I 5-ADON。 其 中产生 DON和 15-ADON的菌株分别 为 1株和 2 0株 ;同时产 生 15-ADON和 NIV的有 1株 ;同时产 生 1 5-ADON和 DON的有 55株。筛选 出的 1 3条 5】物对所有供试 菌株进行 PCR扩增 ,共获得 1 02条带,其 中多态性条 带 1 01条 , 多态性 比率为 99.02%,平均每条 5I物产 生条 带为 7.8 5条。在群体 平均水平上,基 因多样性指数 (H)为 0.3129, Shannon’s的信 息指数 (I)为 0.4774,表 明禾谷镰孢复合种存在较高 的遗传多样性水平;不同地理种群间 ,各群 体 的遗传多样性水平具有 一定差 异,河北、 山西、黑龙江和吉林种群遗传多样性最 高,安徽和 河南种群 最低 。地 理种群 间的基 因分化系数 (Gst)为 0.2722,说明不 同地理种群 间存在一定 的遗传 变异,但大部分遗传变异 (72.78%) 发生在 种群 内。遗传分化系数估算 的基 因流值 Nm=1.3372(>1),表 明不 同地理种群 间存在 一定 的基因流 动;遗传 关系结果表 明河北、 山西、黑龙江、吉林 、辽宁、 内蒙古和甘肃菌株群体 间亲缘关系较近 ,山东、江苏、河 南和安 徽菌株 间亲缘关系较近 ,安徽和 内蒙古菌株 间的亲缘关系最远。聚类分析显示所有菌株相似系数为 0.43—0.95。在 相似系数为 0.43时,所有菌株分成 2大类群,Group 1包括 4株北方春播 区菌株 (吉林 、山西和河北张家 口),不 产生 NIV和 DON;Group 2由余下的 88株 菌株构成,产生的毒素类型主要为 DON和 i5-ADON,其来源于北方春播 区(山 西、黑龙江 、吉林 、辽宁、甘肃和河北张家 口、唐 山)和黄淮海夏播 区 (河北石家庄 、河南、山东、江苏和安徽 ), 在相似 系数为 0.664时,各类群分成不 同的亚群 ,亚群 的结果与菌株来源有一定的相关性。聚类分析结果和毒素化 学型分 析显示,同一地理种群 的菌株 多数聚在一起,个别菌株分散到不同的分支上。 【结论 】北方春播 区和黄淮海 夏播 区的禾谷镰孢复合种主要的毒素化学型为 DON和 15-ADON。引起玉米穗腐病的禾谷镰孢复合种菌株群体 内存在丰 富的遗传 变异 ,不同地理种群 间存在一定的基 因交流,遗传多样性与地理来源有 关。
收 稿 日期 :2017.06—21;接 受 日期 :2017-09—05 基 金项 目:国 家现代 农业 产业 技术 体系 (CARS一02) 联 系方 式 :马红 霞 ,E-mail:mahongxia0792@163.cor n。通 信作 者 石洁 ,E-mail:shij99@ 163. ̄om
中 国农 业 科 学 2018,51(1):82—95 Scientia Agricultura Sinica
doi:10.38648.issn.0578—1752.2018.01.008
禾谷镰 孢复合种毒素化学型及遗传 多样性分析
马红 霞,孙华 ,郭宁,张海剑,石 洁,常佳迎
(河 北省农 林 科学 院植 物保护 研 究所/农业 部华 北北 部作 物有 害生 物综合 治 理重 点实 验室/河北 省农 业有 害生 物综 合防 治工程 技 术研 究 中心 河北 保定 071000)
Analysis of Toxigenic Chem otype and Genetic Diversity of the
严r一பைடு நூலகம்Sar『■ m ram ,0门ea m ,、 pec ̄0 es Om pI- eX
1期
马 红 霞 等 :禾 谷 镰 孢 复 合 种 毒 素 化 学 型 及 遗 传 多样 性 分 析
83
Abstract: [Objective]The objective of this study is to clarify the toxigenic chemotype and genetic diversity of Fusarium graminearum species complex(FGSC)causing maize ear rot from diferent provinces(autonomous region).[Method]The toxigenic chemotypes of 92 FGSC isolates collected from l1 provinces(autonomous region)were analyzed by using the specif ic primer
M A HongXia,SUN Hua,GUO Ning,ZHANG HaiJian,SHI Jie,CHANG JiaYing
(Plant Protection Institute,Hebei Academy ofAgricultural andForestry Sciences ̄Key Laborator y oflPM on Crops in Northern Region ofNorth China,MinistryofAgriculture/IPM Centre ofHebeiProvince,Baoding071000,Hebei)
摘要 : 【目的】明确不 同省 (自治区 ) J起 玉米穗腐病 的禾谷镰 孢复合种 (FusarJum graminearum SpecieS complex,FGSC)的毒 素化 学型和 它们之 间的遗传差异 以及 亲缘 关系。 【方法 】选用根据基 因 和 序列 设计的特异性 引物分析来 自 11个省 (自治 区 )的 92株 禾谷 镰孢复合种菌株 的毒素化学型;从 1 OO条哥伦 比亚大 学 (UBC)开发的通用 5I物 中筛选 出 1 3条扩增 条带丰富、重复性 好、信 号强、背景清晰 的引物 ,利用筛选 出的 5】 物对供 试菌株进行 ISSR—PCR扩增 ,使用 Popgen32软件 计算多态性位 点百分 率、Shannon’S多样性指数 、群体 间的 遗传距离和遗传相似性;依 据 Nei’S遗传距 离,利用 NTsys2.i 0e软件 进行 UPGMA聚类分 析,并构建供试菌株 的聚 类 图。【结果 】供试 的 92株 禾谷镰孢复合种菌株的产 毒素化学型有 4种:DON、15-ADON、DON+I5-ADON和 NIV+I 5-ADON。 其 中产生 DON和 15-ADON的菌株分别 为 1株和 2 0株 ;同时产 生 15-ADON和 NIV的有 1株 ;同时产 生 1 5-ADON和 DON的有 55株。筛选 出的 1 3条 5】物对所有供试 菌株进行 PCR扩增 ,共获得 1 02条带,其 中多态性条 带 1 01条 , 多态性 比率为 99.02%,平均每条 5I物产 生条 带为 7.8 5条。在群体 平均水平上,基 因多样性指数 (H)为 0.3129, Shannon’s的信 息指数 (I)为 0.4774,表 明禾谷镰孢复合种存在较高 的遗传多样性水平;不同地理种群间 ,各群 体 的遗传多样性水平具有 一定差 异,河北、 山西、黑龙江和吉林种群遗传多样性最 高,安徽和 河南种群 最低 。地 理种群 间的基 因分化系数 (Gst)为 0.2722,说明不 同地理种群 间存在一定 的遗传 变异,但大部分遗传变异 (72.78%) 发生在 种群 内。遗传分化系数估算 的基 因流值 Nm=1.3372(>1),表 明不 同地理种群 间存在 一定 的基因流 动;遗传 关系结果表 明河北、 山西、黑龙江、吉林 、辽宁、 内蒙古和甘肃菌株群体 间亲缘关系较近 ,山东、江苏、河 南和安 徽菌株 间亲缘关系较近 ,安徽和 内蒙古菌株 间的亲缘关系最远。聚类分析显示所有菌株相似系数为 0.43—0.95。在 相似系数为 0.43时,所有菌株分成 2大类群,Group 1包括 4株北方春播 区菌株 (吉林 、山西和河北张家 口),不 产生 NIV和 DON;Group 2由余下的 88株 菌株构成,产生的毒素类型主要为 DON和 i5-ADON,其来源于北方春播 区(山 西、黑龙江 、吉林 、辽宁、甘肃和河北张家 口、唐 山)和黄淮海夏播 区 (河北石家庄 、河南、山东、江苏和安徽 ), 在相似 系数为 0.664时,各类群分成不 同的亚群 ,亚群 的结果与菌株来源有一定的相关性。聚类分析结果和毒素化 学型分 析显示,同一地理种群 的菌株 多数聚在一起,个别菌株分散到不同的分支上。 【结论 】北方春播 区和黄淮海 夏播 区的禾谷镰孢复合种主要的毒素化学型为 DON和 15-ADON。引起玉米穗腐病的禾谷镰孢复合种菌株群体 内存在丰 富的遗传 变异 ,不同地理种群 间存在一定的基 因交流,遗传多样性与地理来源有 关。
收 稿 日期 :2017.06—21;接 受 日期 :2017-09—05 基 金项 目:国 家现代 农业 产业 技术 体系 (CARS一02) 联 系方 式 :马红 霞 ,E-mail:mahongxia0792@163.cor n。通 信作 者 石洁 ,E-mail:shij99@ 163. ̄om
中 国农 业 科 学 2018,51(1):82—95 Scientia Agricultura Sinica
doi:10.38648.issn.0578—1752.2018.01.008
禾谷镰 孢复合种毒素化学型及遗传 多样性分析
马红 霞,孙华 ,郭宁,张海剑,石 洁,常佳迎
(河 北省农 林 科学 院植 物保护 研 究所/农业 部华 北北 部作 物有 害生 物综合 治 理重 点实 验室/河北 省农 业有 害生 物综 合防 治工程 技 术研 究 中心 河北 保定 071000)