16S鉴定细菌的种属 PPT

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守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类 生物亲缘关系的研究。 bp=base pair
图 16S rDNA基因组成(灰色为保守区,绿色为可变区)
16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反 映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细 菌的系统发育密切相关。
码该亚基的基因。 原核生物的rRNA含有3种类型:23S、16S、5S rRNA,它们分别
含有2900、1540和120个核苷酸。
2.用16S rDNA进行细菌鉴定的原因 16S rDNA在原核生物中普遍存在。 16 S rDNA的相对分子量大小适中,约1500 bp,便于序列分析。 在16S rRNA分子中, 既含有高度保守的序列区域,又有中度保
检测:核酸蛋白仪/琼脂糖凝胶电泳
1525R 5' AAG GAG GTG WTC CAR CC 3'
试剂使用量( 20μL体系)
PCR 反应条件
模板DNA (10ng~100ng) Taq 酶(5U/μL) 10×Taq Buffer(Mg2+) dNTPs(2.5mM) 引物F(10 μM) 引物R(10 μM) ddH2O
2μL 0.2 μL 2 μL 1 μL 0.5 μL 0.5 μL 13.8 μL
1min30s
判断16Sr DNA序列扩增是否成功:经琼脂糖凝胶电泳在1500 bp附近 出现条带,说明16s rDNA已经扩增成功。
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精选pptdna的提取挑取单菌落然后置于装有100lprepmanultra的离心管中涡旋震荡混匀30s左右然后100水浴10min后以离心机最大转速离心3min取10l上清液与490lddh2o即稀释50倍混匀作为下步pcr的模板dna
利用16S rDNA鉴定细菌 的种属
1.什么是 16S rDNA? 16SrRNA为原核生物核糖体RNA的一个亚基,16SrDNA就是编
DNA的提取
挑取单菌落,然后置于装有100 μLPrepManபைடு நூலகம்Ultra的离心管中, 涡旋震荡混匀30s左右,然后100℃水浴10min 后,以离心机 最大转速离心3min,取10μL上清液与490μL ddH2O(即稀 释50 倍),混匀作为下步PCR 的模板DNA 。提取的DNA 于-20℃保存。
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