SPM操作步骤
SPM中文教程 汇总(已整理)

一、SPM的安装与启动先安装matlab,然后将SPM复制到matlab下的一个文件夹(SPM2需要matlab6.0或以上版本)。
启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入SPM即可启动,然后选择fMRI,也可以直接输入SPM fMRI二、SPM数据处理概要先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。
三、SPM8数据处理的一般步骤为方便后续的数据处理,如果数据分散处理后整合,建议所有处理数据路径保持一致,要统一路径。
处理前首先要采用数据转换软件将dicom数据转换成SPM解析格式,然后进行数据预处理,预处理结束后到matlab安装目录中备份spm*.ps文件,其中包含了空间校正和标准化的信息,然后进行建模分析。
运行命令:spm fmri,打开spm8的操作界面我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。
在spm8和spm5中,每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板,如果一个分支项左面有“+”号,你可以双击显示子分支项,如果一个分支项右面有“<-X”号,你必须为之指定选项(否则不能运行该tree),分支项的选项在其右侧面板指定,而帮助信息则在下面的面板中显示。
如果我们处理数据没有特殊需求,我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可,其余均可采用默认设置。
另外注意在Tree Building Window的顶部菜单,新增了一个菜单项“TASKS”,在使用批处理分析时非常重要。
以下内容,还可以参考E:\《汇总》中“静息态fMRI的数据预处理流程”这部分的讲述。
磁共振实验数据SPM8处理流程

磁共振实验数据SPM8处理流程磁共振实验数据的处理流程主要包括原始数据预处理、功能图像处理和统计分析三个步骤。
其中,SPM8是一款常用的功能磁共振成像软件,可以用于实现磁共振实验数据的处理与分析。
以下是磁共振实验数据SPM8处理流程的详细步骤:1.原始数据预处理:(1)数据导入:将原始数据导入SPM8软件,通常数据的格式为DICOM 或NIfTI格式。
(2)切片时间校正:根据数据采集过程中的切片顺序和时间信息,对数据进行切片时间校正,以获得各个时间点上的切片数据。
(3)运动校正:校正数据中由于受试者运动引起的图像运动,通常使用刚体变换或流形形变方法进行运动校正,以消除不同时间点之间的运动偏移。
(4)标准空间转换:将运动校正后的数据转换到参考空间中,通常使用统一分割方法,将每个受试者的数据映射到一个标准的空间模板上。
(5)降噪处理:对数据进行降噪处理,一般使用高斯平滑方法,平滑数据以减小噪声干扰。
2.功能图像处理:(1)激活检测:通过对原始数据进行激活检测,识别可能激活区域。
常用的方法包括广义线性模型(GLM)和独立成分分析(ICA)等。
(2) 功能图像标准化:将激活检测得到的功能图像进行标准化处理,以便进行后续的统计分析。
常用的方法包括z-score标准化和百分位标准化等。
(4)时间序列提取:从功能图像中提取感兴趣脑区的时间序列数据,以便进行统计分析。
3.统计分析:(1)组间比较:使用统计学方法对不同组别的数据进行比较,常用的方法包括单样本t检验、双样本t检验和方差分析等,可以得到激活区域和激活程度的差异信息。
(2) 相关性分析:分析不同脑区之间的功能连接关系,通常使用Pearson相关系数或互信息等方法进行分析。
(3)多变量分析:使用多变量模式识别方法(如支持向量机、随机森林等)对脑图像数据进行分类或预测,以探索脑区之间的潜在模式。
以上是磁共振实验数据SPM8处理流程的主要步骤,这些步骤将原始数据进行预处理,提取功能图像,以及进行统计分析,从而得出与研究目的相关的结论。
SPM操作中文简介

SPM操作中文简介SPM使用简介一、Spm的安装与启动:先安装matlab,然后将spm复制到matlab下的一个文件夹(Spm2需要和matlab6.0或以上版本配合使用)。
启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入spm即可启动,然后选择fmri,也可以直接输入spm fmri二、Spm数据处理概要先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。
三、Spm数据处理一般步骤1、转换数据dicom格式转换为img文件,将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。
2、Slice timing校正系列成像中层与层获得时间的不同,使一个TR中的各层获得时间一致(如都在一个TR的开始),相当于afni中tshift所做的工作。
3、Realign(相当于afni中的registration)分两步:1)coregister,将每个session的第一个scan与第一个session 的第一个scan进行比较,然后将每个sessioni 中的其他scan与本session中的第一个scan进行比较,得到每个filename.img文件的转换参数,生成filename.mat文件,同时为每个session生成一个对齐参数(realignment parameters),文件名为realignment_params_*.txt2)reslice,用filename.mat文件对filename.img 重新切片,生成rfilename.img文件。
并可依选择生成一个平均象,名为meanfilename.img。
4、Normailze选用realign步骤中得到的平均象与模板进行比较,获得进行标准化的参数,参数文件命名为filename_sn3d.mat,然后依据此参数文件对每个img文件进行标准化,生成文件nfilename.img.5、Smooth推荐为象素大小的两至三倍。
SPM5数据分析简明教程

SPM5数据分析简明教程SPM(Statistical Parametric Mapping)是一种常用的功能磁共振成像(fMRI)数据分析工具,用于研究大脑的活动与功能的关联。
本文将为您介绍SPM5的基本操作和流程,帮助您入门数据分析。
SPM5是SPM软件的一个版本,它提供了一个友好的用户界面,便于用户进行数据处理和结果展示。
在使用SPM5之前,我们需要准备一些基本的数据,包括脑功能成像数据和结构成像数据。
这些数据可以从实验室或大脑成像数据库中获取。
首先,我们需要使用SPM5将原始的fMRI数据进行预处理。
预处理的目的是将原始数据进行校正、对齐和标准化,以便后续的统计分析。
在SPM5中,可以使用"Preprocessing"工具箱来完成这一步骤。
打开工具箱后,我们需要选择需要处理的fMRI数据,然后按照提示进行参数设定,包括对齐和标准化参数。
完成设定后,点击运行按钮即可开始预处理过程。
预处理完成后,会生成一个预处理后的fMRI数据,我们将这个数据用于后续的统计分析。
接下来,我们需要进行统计分析。
在SPM5中,可以使用"General linear model"(GLM)工具箱进行统计分析。
打开工具箱后,需要选择预处理后的fMRI数据、实验设计以及一个用于模型估计的对照矩阵。
然后,设置统计参数,包括显著性阈值、簇大小等。
完成参数设定后,点击运行按钮即可开始统计分析。
分析完成后,SPM5会生成一个统计结果的图像,包括激活区域的位置、大小和程度等信息。
最后,我们可以使用SPM5进行结果展示。
在SPM5中,可以使用"Results"工具箱来查看和展示统计结果。
打开工具箱后,选择统计结果的图像文件,并设置显示参数,如显示阈值和颜色编码等。
然后,点击运行按钮即可展示结果。
结果展示主要包括激活区域的三维和二维可视化,以及区域的统计信息和图表等。
除了以上的基本操作,SPM5还具有一些高级功能,如多个组间比较和多个变量的线性回归分析等。
SPM的操作步骤

SPM的操作步骤
1、MFM的操作
(1)、打开计算机,打开监视器,打开控制器。
(2)、取下激光头,换磁力探针,调激光光束。
(a)、调激光头的x钮,使得激光斑点挡住一点。
再调激光头的y轴,使得激光斑
点挡住一点。
最终是的激光斑点模糊。
(b)、打开PL---800电源,出现黄色光斑。
(c)、基座开关在AFM&LFM调节光电感应器的x、y钮,使得VERT=0,HORZ=0
将基座开关切换到TM AFM处,调VERT=0,此时SUM有读数。
(3)双击屏幕上Nanoscope5.12b48,打开软件。
双击显微镜状图标,出现十个小图标和六个面板,七个菜单。
选择菜单microscope的profile,点击MFM load.在microscope 点scanner 6105(E)eV OK。
Scanner JVH
Feedback controls
点击auto tune ,点击zero phase
(5)、下针开始扫描,根据扫描情况调节相关参数,得到清晰的图像后抓图。
(6)、抬针最少两次。
把目镜抬起,将开关搬到up,直到用肉眼可以看到针与样品之间有了间距。
(7)、把激光头、扫描器和基座一同取下。
用屏蔽罩罩好。
扫描探针显微镜(SPM)原理简介及操作(修正版)

扫描探针显微镜(SPM)原理简介庞文辉 2012.2.22一、SPM定义扫描探针显微镜(Scanning Probe Microscope,SPM)是扫描隧道显微镜及在扫描隧道显微镜的基础上发展起来的各种新型探针显微镜(原子力显微镜AFM,激光力显微镜LFM,磁力显微镜MFM等等)的统称,包括多种成像模式,他们的共同特点是探针在样品表面扫描,同时针尖与样品间的相互作用力被记录。
SPM的两种基本形式:1、扫描隧道显微镜(Scanning Probe Microscope,STM)2、原子力显微镜(Atomic Force Microscope,AFM)AFM有两种主要模式:●接触模式(contact mode)●轻敲模式(tapping mode)SPM的其他形式:●侧向摩擦力显微术(Lateral Force Microscopy)●磁场力显微镜(Magnetic Force Microscope)●静电力显微镜(Electric Force Microscope)●表面电势显微镜(Surface Potential Microscope)●导电原子力显微镜(Conductive Atomic Force Microscope)●自动成像模式(ScanAsyst)●相位成像模式(Phase Imaging)●扭转共振模式(Torisonal Resonance Mode)●压电响应模式(Piezo Respnance Mode)●……二、STM原理及应用基于量子力学中的隧穿效应,用一个半径很小的针尖探测被测样品表面,以金属针尖为一电极,被测固体表面为另一电极,当他们之间的距离小到1nm左右时,形成隧道结,电子可从一个电极通过量子隧穿效应穿过势垒到底另一个电极,形成隧穿电流。
在极间加很小偏压,即有净隧穿电流出现。
隧穿电流与两极的距离成指数关系,反馈原理是采用横流模式,当两极间距不同(电流不同),系统会调整Z轴的位置从而成高度像。
SPM操作步骤

第一步Realign,选estimate&reslice,结果生成mean文件。
第二步Coregister,先选择Coregister estimate ,reference选择mean文件,source image 选择解剖像文件,然后选Coreg reslice,Image Defining Space和Image to reslice都选解剖像文件,run第三步是Normalise, A:选estimate&Write ,source文件选择解剖像文件,image to write选择还是解剖像文件,Estimation里 template选择SPM自带的标准解剖像(template T1)文件,Write options里体素大小改为1 1 1,运行。
B:然后功能像也要再做一遍,这次选择write,parameter选择sn.mat文件(解剖像里),image to wright选择功能像文件(rb文件),Write options里体素大小改为3 3 3,再运行。
第四步,smooth平滑(wr文件)。
半宽全高改为 6 6 6,再运行数据分析:选择Specify 1st-level选择路径,,unit选择scan,输入TR时间,然后scans选择功能像文件(swr文件),然后condition里name命名,onsets 1:20:120,duration输入10,其他都可以用默认值。
然后run,再estimate(SPM.mat)。
结束后点result,左下角define new contrast,选t test, contrast输入1,done。
最后在xjview里调用SPMT文件。
如果加解剖像,选择other里找解剖像文件。
SPM使用简介

SPM使用简介一、Spm的安装与启动:先安装matlab,然后将spm复制到matlab下的一个文件夹(Spm2需要和matlab6.0或以上版本配合使用)。
启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入spm即可启动,然后选择fmri,也可以直接输入spm fmri二、Spm数据处理概要先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。
三、Spm数据处理一般步骤1、转换数据dicom格式转换为img文件,将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。
2、Slice timing校正系列成像中层与层获得时间的不同,使一个TR中的各层获得时间一致(如都在一个TR的开始),相当于afni中tshift所做的工作。
3、Realign(相当于afni中的registration)分两步:1)coregister,将每个session的第一个scan与第一个session的第一个scan进行比较,然后将每个sessioni中的其他scan与本session中的第一个scan进行比较,得到每个filename.img 文件的转换参数,生成filename.mat文件,同时为每个session生成一个对齐参数(realignment parameters),文件名为realignment_params_*.txt2)reslice,用filename.mat文件对filename.img重新切片,生成rfilename.img文件。
并可依选择生成一个平均象,名为meanfilename.img。
4、Normailze选用realign步骤中得到的平均象与模板进行比较,获得进行标准化的参数,参数文件命名为filename_sn3d.mat,然后依据此参数文件对每个img文件进行标准化,生成文件nfilename.img.5、Smooth推荐为象素大小的两至三倍。
SPM(原子力显微镜)设备安全操作规程

扫描探针显微镜/SPM(原子力显微镜)设备安全操作规程前言扫描探针显微镜(Scanning Probe Microscopy, SPM)是一种能够在原子、分子尺度上进行检测和表征的分析仪器。
此类显微镜利用扫描探针在样品表面上扫描,通过所获得的信号进一步得到样品表面的拓扑、结构和力学性质等信息。
因其高分辨率和单原子敏感性,尤其在纳米结构材料的表征上有着广泛的应用,而且已经成为了纳米科学与技术中不可或缺的工具之一。
然而,SPM技术操作需要注意许多安全事项,不当操作会引入样品污染、设备故障、人身安全等问题。
因此,本文将总结一些应该注意的安全操作规程,以提高SPM技术人员的意识和实验操作品质。
总则1.所有使用SPM的人员,应该经过专业培训并具有相应的操作证书。
2.只有在清洁、无异议的实验室内进行SPM操作,不得在人流、高分贝、高湿、高温等环境下进行。
3.严格按照使用手册和SPM设备厂商的安全规范进行操作。
4.禁止将SPM设备移动离开实验室。
5.禁止人为添乱或者胡乱修改设备参数。
操作规程1.仪器开启前,检查样品盒是否正确安装,确认样品及其密封是否符合IP67标准,检查SPM控制器是否处于正确运行状态。
2.操作人员应该穿戴适当的防护手套、口罩和实验服装,避免样品误触和发尘,注意个人卫生。
3.开机前,根据已运行实验数据的导向,设定扫描范围和参数,避免一次性盲目调整。
4.仪器工作期间,严禁同时使用或连接其它电子设备,以免与SPM的信号产生干扰。
5.操作人员应降低操作声音、保持微风不扰设备和样品,避免防尘屏幕上产生氧化物颗粒物。
6.对样品进行工作前的准备操作过程中,需要保留稳定的温度和一定的卧室气体环境,注意尽量避免冷带电流短时间过小或者样品污染。
7.实验完成后,必须先将压载台缓慢降低,保证样品表面与探针离开,再关闭样品盒和实验台,推出样品盒进行清洗。
操作误区1.停电后,不要直接关机或重新插拔SPM控制器电源连接线(DC12V/24V)和其他数据线,以免直接接触硬盘。
SPM中文教程汇总已修订版

S P M中文教程汇总已 Document number:PBGCG-0857-BTDO-0089-PTT1998一、SPM的安装与启动先安装matlab,然后将SPM复制到matlab下的一个文件夹(SPM2需要或以上版本)。
启动matlab,首先set path,然后在matlab命令窗口中输入SPM即可启动,然后选择fMRI,也可以直接输入SPM fMRI二、SPM数据处理概要先将所得数据进行空间预处理(对齐,平滑,标准化等),然后进行模型估计(将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积,所得结果与全脑象素信号进行相关分析),最后察看结果。
三、SPM8数据处理的一般步骤为方便后续的数据处理,如果数据分散处理后整合,建议所有处理数据路径保持一致,要统一路径。
处理前首先要采用数据转换软件将dicom数据转换成SPM解析格式,然后进行数据预处理,预处理结束后到matlab安装目录中备份spm*.ps文件,其中包含了空间校正和标准化的信息,然后进行建模分析。
运行命令:spm fmri,打开spm8的操作界面我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button window),左下侧的窗口为输入窗口(input window),右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics window)。
在spm8和spm5中,每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板,如果一个分支项左面有“+”号,你可以双击显示子分支项,如果一个分支项右面有“<-X”号,你必须为之指定选项(否则不能运行该tree),分支项的选项在其右侧面板指定,而帮助信息则在下面的面板中显示。
如果我们处理数据没有特殊需求,我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可,其余均可采用默认设置。
另外注意在Tree Building Window的顶部菜单,新增了一个菜单项“TASKS”,在使用批处理分析时非常重要。
岛津SPM原子力显微镜原理及操作流程

岛津SPM原子力显微镜原理及操作流程岛津SPM(Scanning Probe Microscope)是一种常用的原子力显微镜,用于研究材料的表面形貌和力学特性。
其原理基于利用探针与样品间的相互作用力来实现高分辨率成像,操作流程一般包括准备工作、样品处理、探针安装、参数设置、成像与分析等步骤。
一、准备工作1.将岛津SPM放置在干燥、净化的实验室环境中,确保无尘和恒定的温度。
2.准备所需的实验材料,包括样品、探针、标定样品等。
二、样品处理1.将要研究的样品放置在岛津SPM的样品台上,确保样品表面干净平整。
2.根据需要,可以通过清洗、研磨、切割等方法处理样品,以提高成像效果。
三、探针安装1.在干燥的实验室环境下打开探针包装。
2.选择合适的探针并使用探针夹装置将其固定在探针支架上。
3.将支架插入探针头座,并通过调节旋钮确保探针与探针力传感器的间隙适当。
四、参数设置1.打开岛津SPM的电源,并通过电脑连接控制软件。
2.在控制软件中进行参数设置,包括成像模式、扫描速度、扫描范围、扫描线数等。
3.对探针进行标定,根据标定样品的尺寸设定扫描参数,以确保成像结果精确可靠。
五、成像与分析1.将探针移动到待测区域,选择合适的点开始成像。
2.启动扫描仪后,控制软件会控制探针在样品表面进行扫描,并通过传感器测量样品表面的力学信号。
3.扫描过程中,软件会收集并记录原子力数据,同时即时显示成像结果。
4.根据成像结果进行分析,包括测量表面粗糙度、粒子形貌、拓扑结构等参数。
六、数据保存与处理1.成像结束后,可将得到的数据保存下来,包括扫描图像和原子力数据。
2.可以使用成像软件对数据进行处理、分析和展示,以提取更多有用的信息。
3.根据需要,可以对成像结果进行后处理,如滤波、平滑、三维重构等操作。
岛津SPM是一种强大的表面观察仪器,可以通过不同成像模式(如原子力显微镜、电子探针显微镜等)实现高分辨率的成像和精确的力学测量。
操作流程虽然略显繁琐,但只要正确掌握原理并严格操作,就能获得准确可靠的成像结果,为材料科学和纳米技术研究提供有力支持。
扫描探针显微镜(SPM)原理简介及操作(修正版)

扫描探针显微镜(SPM)原理简介庞文辉 2012.2.22一、SPM定义扫描探针显微镜(Scanning Probe Microscope,SPM)是扫描隧道显微镜及在扫描隧道显微镜的基础上发展起来的各种新型探针显微镜(原子力显微镜AFM,激光力显微镜LFM,磁力显微镜MFM等等)的统称,包括多种成像模式,他们的共同特点是探针在样品表面扫描,同时针尖与样品间的相互作用力被记录。
SPM的两种基本形式:1、扫描隧道显微镜(Scanning Probe Microscope,STM)2、原子力显微镜(Atomic Force Microscope,AFM)AFM有两种主要模式:●接触模式(contact mode)●轻敲模式(tapping mode)SPM的其他形式:●侧向摩擦力显微术(Lateral Force Microscopy)●磁场力显微镜(Magnetic Force Microscope)●静电力显微镜(Electric Force Microscope)●表面电势显微镜(Surface Potential Microscope)●导电原子力显微镜(Conductive Atomic Force Microscope)●自动成像模式(ScanAsyst)●相位成像模式(Phase Imaging)●扭转共振模式(Torisonal Resonance Mode)●压电响应模式(Piezo Respnance Mode)●……二、STM原理及应用基于量子力学中的隧穿效应,用一个半径很小的针尖探测被测样品表面,以金属针尖为一电极,被测固体表面为另一电极,当他们之间的距离小到1nm左右时,形成隧道结,电子可从一个电极通过量子隧穿效应穿过势垒到底另一个电极,形成隧穿电流。
在极间加很小偏压,即有净隧穿电流出现。
隧穿电流与两极的距离成指数关系,反馈原理是采用横流模式,当两极间距不同(电流不同),系统会调整Z轴的位置从而成高度像。
SPM(原子力显微镜)设备安全操作规定

扫描探针显微镜/SPM(原子力显微镜)设备安全操作规定本文档旨在规范扫描探针显微镜(Scanning Probe Microscope,SPM)设备的安全使用,减少工作中的安全风险,为设备操作者提供保障和指导。
设备注意事项1. 设备的电源1.1 使用交流电源110~220V,输出电压为24V。
1.2 电源插头请确保安装稳固,不得使用破损或导线暴露的电源线。
1.3 禁止使用明显损坏的电源线或插头。
1.4 请勿在操作过程中拔掉电源线,应该先关闭设备电源,再进行电源拔插操作。
2. 设备的控制面板2.1 使用者应事先了解仪器的各种操作控制按钮、选项和指示灯的作用。
2.2 禁止在功率开关关闭时对装置进行操作调试。
2.3 系统操作过程中切勿指意外操作控制面板。
2.4 操作结束后请务必关闭操作面板的所有按钮和操作控制,关闭电源后离开设备。
3. 设备的扫描针3.1 禁止对设备进行恶性敲打、碰撞和其他人为损伤行为。
3.2 请勿在完全未扫描完成的情况下停止设备,并在拔下探头前使扫描部分下降到低位。
3.3 镜头不能直接碰触被测试样的表面或其他硬物,不能使用润滑油或其它油滴在探针刻面上。
3.4 工作结束后应将探头放在安全的地方。
对于不再使用的探头应分类存放。
4. 设备的使用环境4.1 在使用设备时不得吸烟、饮食和饮料等非实验品。
4.2 禁止在潮湿、易腐蚀、易燃或其他安全隐患环境下使用设备。
4.3 禁止在没有足够安全防护措施的情况下,将设备放在震动或移动频繁的地方。
4.4 使用结束后请对设备进行清洁和消毒。
设备使用注意事项1. 上机前的准备工作1.1 操作者需要检查测试设备是否有损坏或不完整的部分,如有发现,需及时上报负责人员。
1.2 操作者必须熟悉设备使用操作手册,按照要求进行操作。
1.3 操作前应将任何杂物和药品放置在固定位置。
2. 设备测试操作2.1 操作时应控制良好工作台和设备的退出器件,确保操作者的安全。
2.2 测试样品应根据操作指引按照规定方法放置到测试位置上。
SPM的操作步骤

SPM的操作步骤
1、MFM的操作
(1)、打开计算机,打开监视器,打开控制器。
(2)、取下激光头,换磁力探针,调激光光束。
(a)、调激光头的x钮,使得激光斑点挡住一点。
再调激光头的y轴,使得激光斑
点挡住一点。
最终是的激光斑点模糊。
(b)、打开PL---800电源,出现黄色光斑。
(c)、基座开关在AFM&LFM调节光电感应器的x、y钮,使得VERT=0,HORZ=0
将基座开关切换到TM AFM处,调VERT=0,此时SUM有读数。
(3)双击屏幕上Nanoscope5.12b48,打开软件。
双击显微镜状图标,出现十个小图标和六个面板,七个菜单。
选择菜单microscope的profile,点击MFM load.在microscope 点scanner 6105(E)eV OK。
Scanner JVH
Feedback controls
点击auto tune ,点击zero phase
(5)、下针开始扫描,根据扫描情况调节相关参数,得到清晰的图像后抓图。
(6)、抬针最少两次。
把目镜抬起,将开关搬到up,直到用肉眼可以看到针与样品之间有了间距。
(7)、把激光头、扫描器和基座一同取下。
用屏蔽罩罩好。
SPM系统请购流程终结版

SPM系统主要分:首页、服务机构备件管理、备件中心备件管理、分公司产权备件管理、网点产权备件管理、板卡芯片备件管理、财务结算管理、基础数据管理、CSM服务工单管理、系统维护。
注:根据不同角色涉及的业务也不同,各个角色登录后看到的菜单会有所不同,即与其无关的菜单将被隐藏。
电信:网通:下面将着重介绍网点的请购操作:第一步:输入网址,进入各自的SPM系统界面:第二部:输入网点各自SPM系统用户名及密码,进入各自系统界面:首页:包括常用组,其中可以查看“我的工作台”,即所有需要“我”处理的工作内容,包括待办任务、未阅通知、已办查询;如下图第三步:我们网点自己处理过得事件都会在这里显示,我们经常用到的就是最后一项,我们以前天天看到的这个按钮,他就是和我们CSM联系在一起的个特殊按钮,我们点击他,流转成这样的一个页面:然后在回单里操作,,就是我们经常见到的CSM 工单的页面了,如下:只要点击查询就会出现派到我们各网点的单子明细了,大家并不生,那么大家看那个是需要申请材料的,各自斟酌。
在工单的最后一列上大家可以看到这个图标,那个要申请材料,那么我们就在那个的单子后面点击这个“确认”按钮,出现在眼前的就是这个一点也不陌生的画面,这时我们只要看最下面的这个图标就可以了,我们就点他就可以了,,以前他是灰色的,是不能点击的,现在系统已经生成了,点击他后,他会提醒你,是否要生成SPM系统工单,你点击“是”,就会在这张表的表头有个红色的字体提醒你,已经“申请SPM工单成功”然后关掉这张页面,点击“首页”这个选项卡,你会在待办事项里多了一个红的字体的待办事项:这就是说,你的创建需求已经有了,那么就要申请材料了,点击这行红色的字体,打开后进入SPM请购页面里了:就是这个页面,大家看,这个页面总共分为三部分,最上面那部分是从CSM系统里自动带过来的用户报修信息,中间那部分是各网点的详细资料,包括网点名称,联系人,地址,电话等基本信息,最下面的就是我们SPM从表信息,在这就是我们需要申请备件的地方,需要大家录入的地方,而因为我们在给大家派工时,还不知道串号等一系列数据,所以我们选用进行对所需物料的查找,点击它,这时系统会把所有已经维护过的物料全部的显示在大家的页面里,这个数量是很庞的数据,有好多页,如下怎么才能快速,准确的找到我们要的材料呢,我们就在这张页面的右上角,找他,在里面输入我要的材料。
SPM数据处理流程

本次演示数据是采自于SIEMENT 3.0T的MR,用到其中的2个序列:全脑解剖像t1_mpr_ns_sag_p2_iso功能像扫描ep2d_bold_moco本示例所用的刺激方案是经典棋盘格的视觉刺激。
具体刺激时间安排见下图PPT2SPM是一款以MA TLAB为平台的软件,所以使用SPM前一定要安装MA TLAB。
SPM一般来说根据个人习惯放在电脑的不同位置。
本文所讲的SPM放在C盘的根目录下。
PPT3设置SPM的路径指定数据所在目录(提示:数据目录不要用中文,否则spm使用过程中会出现乱码)指定完目录后,数据文件在左边栏就可见。
二、SPM使用1.数据导入2.数据预处理3.数据分析启动SPM(可直接spm fmri 回车)数据导入(GE的数据没有问题,大多数的siemens也没问题,但philip的数据直接导不行,建议用mricroN里的的dcm2nii)数据输入之选择MR扫描的DICOM图像选择文件夹保存输出文件选择好相应的文件夹后,单击“.\”选择输出文件格式(可以根据习惯选择,都可用,spm5也支持4d的数据)开始转换上面讲的是如何导入数据\如何导出并保存处理完成的数据下面讲如何进行预处理Realign 头动校正,也称对齐;因为在扫描的过程中被试不可避免会发生头动现象,此功能就是把整个实验中的头动造成的影响缩减到最小。
选择功能像文件选中经过转换的功能图像文件(f开头的文件)当“Run”键变黑就说明已经可以开始运行了经过“Realign”的文件名前会加上字母“r”,同时会生成mean文件等处理结束后,会出现头动曲线,上图显示的是在X、Y、Z三个轴向的平移,下图显示的是在3个方向上的旋转。
如果旋转超过0.5度,或者平移超过半个体素,就可以认为这个volume的数据质量不好,可以抛弃这个时间点的数据。
我的建议是质量不好的数据就重扫,实在没办法可以舍弃个别点的数据,但需要记录相应的时间点,在design时候去除,也可以用相邻数据的平均值替代。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
第一步Realign,选estimate&reslice,结果生成mean文件。
第二步Coregister,先选择Coregister estimate ,reference选择mean 文件,source image选择解剖像文件,然后选Coreg reslice,Image Defining Space和Image to reslice都选解剖像文件,run
第三步是Normalise,A:选estimate&Write ,source文件选择解剖像文件,image to write选择还是解剖像文件,Estimation里template 选择SPM自带的标准解剖像(template T1)文件,Write options里体素大小改为 1 1 1,运行。
B:然后功能像也要再做一遍,这次选择write,parameter选择sn.mat文件(解剖像里),image to wright选择功能像文件(rb文件),Write options里体素大小改为3 3 3,再运行。
第四步,smooth平滑(wr文件)。
半宽全高改为6 6 6,再运行
数据分析:选择Specify 1st-level
选择路径,,unit选择scan,输入TR时间,然后scans选择功能像文件(swr文件),然后condition里name命名,onsets 1:20:120,duration输入10,其他都可以用默认值。
然后run,
再estimate(SPM.mat)。
结束后点result,左下角define new contrast,选t test,contrast输入1,done。
最后在xjview里调用SPMT文件。
如果加解剖像,选择other里找解剖像文件。