野生型KRAS2基因对结肠癌细胞的抑制效应和其在结肠癌中杂合性缺失的研究
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A
B
图3变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图箭头所示为等位基因丢失
^D12s310位点在正常组织及癌旁组织均为杂合型,癌组织发生等位基因丢失。
B基因型的半定量分析10—l癌组织,lo-2癌旁组织,10一3正常粘膜组织。
4、12p12—13区域LOH发生频率与l临床特征之间相关分析
利用拟然比x2检验比较LoH与临床病理参数之间的关系,得出LoH与患者年
龄、性别、肿瘤大小、淋巴结有无转移均无关(表4)。
表412p12—13区域LOH与临床病理参数的关系
合计
比例P值
组织分类癌旁组织371030%癌组织6
4
lO
60%
年龄(岁)
≤5043770%>50
2
l
3
30%
性别男
52770%女
1
2
3
30%
肿瘤大小(cm)
<53l440%≥5
3
3
6
60%
淋巴结转移有
4
2
6
60%
O.17753
O.77816
O.25979
0.42919
O.59816
垂!!
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细胞数为5×106/ml,1000rpm离心5分钟,弃去培养液;
(2)PBs洗涤,1000rpm离心5分钟,弃去PBs。该步骤重复3次;
(3)加入100u1冰乙醇固定,一20℃过夜;
(4)1000rpm离心,弃去冰乙醇;
(5)加lOg几RNase酶200ul,37℃水浴30分钟;
(6)加PI染色30分钟后,在流式细胞仪测定细胞的荧光强度,数据经计算机软件分析,得出样本群体在细胞周期各个时相的比例分布和细胞凋亡的百分率。
结果
l、KRAs2基因PcR扩增产物
PcR扩增KRAs2cDNA,得到567bp大小的扩增产物(图3)。
2000bp
1000bp
750bp
500bp
250bp
100bp
AB
图3PcR扩增产物琼脂糖电泳图
AKRAS2基因BDNAlIarker2000
2、中介重组体PcR产物克隆和酶切鉴定
从E.coliDH5Q菌株中提取中介重组体pGEM_T—Kras2质粒,经过PcR鉴定示4、5克隆为阳性克隆(图4)。阳性质粒用Sall酶切鉴定,酶切产物用1.0%琼脂糖凝胶电泳,结果显示载体和插入的KRAs2片段(图5)。
123456
图4中介重组体pGEM—T—I【ras2PcR结果
L∞e4、5:PcR阳性条带Lane1、2、6:阴性结果Lane3:llarker2000
pG肼-TVector
100bp
250hp
500bD
750bp
1000bD
2000bp
AB
图5中介重组体pGEM—T—I(ras2酶切鉴定图
A酶切鉴定图(3.Okb,567bp)BDNAMarker2000
3、中介重组体pGEM—T—Kras2DNA序列分析
将测序的结果用B1asten程序在NR数据库中进行检索和分析,结果证实:插入的KRAS2基因无任何突变(附录1)。
4、真核表达重组体pcI—neo—l(ras2PcR产物克隆和酶切鉴定
根据KRAS2基因的限制性酶切图谱和真核细胞表达载体pcI—neo的多接头酶切位点,选用M1u1和sall双酶分别消化KRAs2基因和pcI—neo载体,连接转化后,构建pcI—neo—Kras2重组体。将该重组体质粒扩增、抽提和纯化后,经过PcR鉴定示1、2、3、6、8克隆为阳性克隆(图6)。阳性质粒用Mlul,Sall双酶消化鉴定,得到5.4kb和567bp大小的片断(图7)。
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图6真核表达重组体pcI—neo—Kras2PcR结果
LaIlel、2、3、6、8;PcR阳性条带L∞e4、7:阴性结果
1Z345
图7真核表达重组体pcI—neo—Kras2酶切鉴定图
L∞e3:阳性克隆L∞e1、4:阴性结果Lane2:空载体pcI-Ileo5、真核表达重组体pcI—neo—Kras2DNA序列分析
将测序的结果用B1asten程序在NR数据库中进行检索和分析,结果证实:包括起始密码子和终止密码子的KRAs2cDNA片段正向插入真核表达载体pcI—neo,KRAs2基因无任何突变,表明真核表达重组体pcI—neo—I(ras2已成功构建(附录2)。
6、结肠癌细胞株Caco一2细胞总RNA的质量
RNA样品(约1ug)用2.2%甲醛变性凝胶电泳1小时后,于紫外透射
仪下观察,可见清楚的28s、18S和5s条带,且28S的吸光度约为18S的两倍,表明RNA完整性好,无降解现象。样品的0D260/0D280=1.931,表明样品纯度高(图8)。
图8结肠癌细胞株Caco一2细胞总RNA表达
7、结肠癌细胞株Caco一2KRAs2mRNA转录水平
以beta-actin为内参照,NorthernB10t测定结果证实结肠癌细胞株Caco一2KRAs2mRNA表达处于极低水平。该结果与ATCC公司提供的信息一致(图9)。
图9Caco-2细胞KRAS2基因mRNA表达
8、G418筛选浓度的确立
将caco.2细胞接种到6孔板中,待细胞的密度达50%时,分别加入不同浓度的G418溶液,观察细胞生长情况。结果表明:第10天,G418浓度为1100ug/m1、1200ug/ml、1300ug/m1的孔中细胞死亡率分别是50%、70%、90%:第12天,相应的孔中细胞死亡率分别是60%、90%、100%;第14天,相应的孔中细胞死亡率分别是80%、10096、100%;根据以杀死全部细胞的最小剂量