一个巴西橡胶树过氧化物酶基因克隆与生物信息学分析

一个巴西橡胶树过氧化物酶基因克隆与生物信息学分析
邓玉杰;余海洋;张宇;王萌
【期刊名称】《热带农业工程》
【年(卷),期】2014(038)004
【摘要】采用分子生物学和生物信息学技术,在橡胶树热研7-33-97的叶片中扩增了一个过氧化物酶基因的全长cDNA,命名为HbPRX2.该基因全长1 179 bp,5’端29 bp,3’端145 bp,阅读框1 005 bp,编码335个氨基酸.推导的氨基酸理论分子量34.85 u,等电点4.98.推导的氨基酸含有过氧化物酶蛋白特征性的Peroxidase4结构域.HbPRX2蛋白与巴西橡胶树HbPRX1、HbPRX42、拟南芥AtPER42和水稻OsPRX33的过氧化物酶蛋白相似性分别为63.22％、32.37％、33.73％和37.80％.生物信息学分析表明,橡胶树HbPRX2蛋白定位于分泌途径中,属于亲水性蛋白,性质稳定,在7-24、36-55、130-151和278-301氨基酸处具有跨膜结构域,在29-30氨基酸处具有信号肽结构.本研究为深入研究HbPRX2基因的结构与功能及其抗逆机制奠定基础.
【总页数】8页(P1-8)
【作者】邓玉杰;余海洋;张宇;王萌
【作者单位】海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228
【正文语种】中文
【中图分类】S794.1
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