基于TCGA和GEO数据库探讨VCAN基因及其甲基化在胃癌预后判断中的价值
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基于TCGA和GEO数据库探讨VCAN基因及其甲基化在胃
癌预后判断中的价值
张谦;梁鱼;安彩艳
【期刊名称】《国际检验医学杂志》
【年(卷),期】2022(43)4
【摘要】目的探讨多功能蛋白聚糖基因(VCAN基因)表达和甲基化在胃癌患者预后判断中的价值。
方法通过生物信息学方法分析、研究了VCAN基因的表达及甲基化水平,以及其在预后和免疫方面的意义。
此外,通过Meta分析验证VCAN基因在胃癌预后判断中的作用。
结果VCAN基因受到甲基化的负调控,导致其在胃癌组织中高表达。
根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库,VCAN基因表达和甲基化水平均与胃癌患者的总生存率(OS)和无进展生存率(PFS)有关。
Meta分析显示,VCAN基因低表达与较高的生存率密切相关。
VCAN基因的表达与某些免疫细胞或分子密切相关,尤其是CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、CD2、CD3D和CD3E。
结论VCAN基因在胃癌免疫细胞的浸润中起着重要作用,并可作为一个潜在的胃癌预后生物标志物。
【总页数】6页(P388-393)
【作者】张谦;梁鱼;安彩艳
【作者单位】内蒙古医科大学新药安全评价研究中心/内蒙古自治区新药筛选工程研究中心/内蒙古医科大学药学院;内蒙古医科大学内蒙古临床医学院;内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心
【正文语种】中文
【中图分类】R735.2
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