重症监护室耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制和同源性分析
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各 1 μL,无菌去离子水 9.5 μL,模板1 μL。反应体
系: 预变性 ; 变性 , 退 95 ℃
5 min 95 ℃ 1 min 55 ~ 68 ℃
火 1 , min 72 ℃ 延伸 1 , min 35 个循环;72 ℃ 延伸
基金项目:国家自然科学基金(81171606)。 作者简介:宋国滨,1994 年生,男,硕士研究生,研究方向为临床微生物检验和耐药机制研究。 通信作者:徐元宏,教授,主任技师,博士研究生导师,从事临床微生物学研究,Email:xyhong1964@ 。 163.com
测定临床常见抗菌药物的敏感性,用 Carba NP 试验对碳青霉烯酶进行筛选,同时对超广谱 β内酰胺酶(ESBLs)、头孢菌素酶
(AmpC 酶)、碳青霉烯酶基因进行 PCR 扩增和序列分析,用基质辅助激光解吸电离飞行质谱(MALDITOF MS)技术及多位点
序列分型(MLST)进行同源性分析。结果 PCR 检测基因型显示 36 株 CRKP 以产 KPC2 型酶为主,部分菌株同时拥有 ESBL
。 , , 、 、 、 和 耐药基因 将 株 分为 大簇 结果显示 株菌均为 型 AmpC
MALDITOF MS 39 CRKP
3
MLST
35
ST11 ST379 ST751 ST307
ST490 各有 1 株,经 eBURST 在线软件分析 ST11 与 、 ST379 ST751 的亲缘关系较近,来源于同一克隆株。结论 4 个 ICU 病房
林贸易有分离划线于血平
板,长出菌落后,用 Vitek 质谱仪重新鉴定。采用纸
片扩散(KB)法及 Vitek 2 Compact 仪器法进行药敏
试验,结果判读及解释根据 2018 年美国临床和实验
室标准化协会(CLSI)文件进行。
1.4 试验 Carba NP 参照文献[2]进行。
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临床检验杂志 年 月第 卷第 期 , , , 2019 4 37 4 Chin J Clin Lab Sci Apr. 2019 Vol.37 No.4
10 min,最后于 4 ℃保存。取扩增产物行 15 g/ L 琼 脂糖凝胶电泳,并将扩增阳性产物送上海生工公司 进行测序,测序结果与 NCBI 数据库比对,从而确定 耐药基因亚型。
临床检验杂志 年 月第 卷第 期 , , , 2019 4 37 4 Chin J Clin Lab Sci Apr. 2019 Vol.37 No.4
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: DOI 10.13602 / j.cnki.jcls.2019.04.10
·临床实验研究·
重症监护室耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制和同源性分析
琼脂糖、引物(合成)购自上海生工生物公司;DNA
、 (日本 公司); marker Premix TaqTM
TaKaRa
Vitek MS
CHCA 基质液(法国生物梅里埃公司);药敏试验纸
片(英国 Oxoid 公司);哥伦比亚血平板(合肥天达
诊断试剂有限公司);MullerHinton 琼脂(江门市凯
1.2 仪器与试剂 高速冷冻离心机(中国 heal force
公司);GeneAmp970 基因扩增仪(美国 PE 公司);
CRa8d8公0V司C)O;2V孵ite箱k 、2紫Co外mp线ac凝t 全胶自成动像细系菌统鉴(定美及国药Bi敏o
分析系统、Vitek 质谱仪(法国生物梅里埃公司)。
中 CRKP 以产 KPC2 型酶为主,是 CRKP 对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要机制。37 株 CRKP 高度同源,提示不同 ICU 病房
间应进一步加强感染控制。
关键词:基质辅助激光解吸电离飞行质谱技术;多位点序列分型;肺炎克雷伯菌
中图分类号:R446.5 文献标志码:A
肺炎克雷伯菌是引起临床感染常见的致病菌之 一,主要引起呼吸道、泌尿道、创口、胸腔积液和血流 的感染。近年来,随着临床大量应用抗菌药物,尤其 是碳青霉烯类抗菌药物的广泛使用,耐碳青霉烯类 肺炎克雷伯菌(carbapenemresistant Klebsiella pneu , moniae CRKP)已在国内广泛流行,引起临床医生 的高度重视。CRKP 除对以亚胺培南、美罗培南为 代表的碳青霉烯类抗菌药物耐药外,对青霉素类、头 孢菌素类、氨基糖苷类、喹诺酮类抗菌药物也具有耐 药性,呈现多重耐药的现象[1]。本研究对我院 4 个 重症监护室(ICU)病房中收集的 39 株 CRKP 的耐 药性及耐药机制进行分析,同时分析菌株之间的同 源性,为医院感染预防提供依据。
宋国滨,黄颖,徐元宏(安徽医科大学第一附属医院检验科,合肥 230022 )
摘要:目的 探讨安徽医科大学第一附属医院 4 个重症监护室(ICU)中耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药机制和流
行状况,为医院感染控制提供依据。方法 收集 4 个 ICU 病房中 CRKP 菌株 39 株,采用纸片扩散法和 Vitek 2 Compact 仪器法
1.5 耐药基因检测[35] 煮沸法提取细菌基因组
DNA,以此作为扩增模板,分别扩增碳青霉烯酶、超
广谱 β内酰胺酶(ESBLs)、AmpC 酶耐药基因,其耐
药基因类型及引物序列见表 1。反应体系为 25 , μL
包括 ,上、下游引物( ) Premix Taq 12.5 μL
10 μmol / L
1 材料与方法
1.1 菌株来源 收集安徽医科大学第一附属医院 检验科 2018 年 1 月至 6 月保存的来源于 ICU 的 CRKP 共 39 株,其中 ICU 病房 17 株,急诊 ICU 17 株,干部病房 ICU 4 株,心血管外科 ICU 1 株。筛选 标准为至少对碳青霉烯类抗菌药物(亚胺培南、美 罗培南、厄他培南)3 种药物中的 1 种药物耐药即认 定为 CRKP。剔除同一患者相同部位的重复菌株。 大肠埃希菌 ATCC 8739 为质谱鉴定实验质控菌株, 肺炎克雷伯菌质控细菌 ATCC 700603 为本实验室 保存。