3100型遗传分析仪的应用和维护
botest-3100操作手册
Botest-3100全自动血液细胞分析仪说明书桂林高新区宝利泰医疗电子有限公司版序:1.0目 录版权及声明 (I)如何使用本说明书 (1)第1章仪器介绍 (2)1.1仪器概述 (2)1.1.1仪器前面板 (2)1.1.2仪器后面板 (3)1.1.3仪器右侧板 (4)1.2测量参数 (4)1.3仪器组成 (5)1.3.1主机部分 (5)1.3.2显示部分 (5)1.3.3试剂 (7)第2章仪器测量原理 (9)2.1测量原理 (9)2.1.1电阻抗法测量血液细胞数量、体积 (9)2.1.2流动比色法测量HGB (10)2.2试剂的作用 (10)2.3仪器参数测量的方法 (10)第3章安装及样本分析 (12)3.1开箱并检查 (12)3.2安装要求 (12)3.3电源检查 (13)3.4试剂导液管连接 (13)3.4.1溶血剂(LYSE)导液管连接 (14)3.4.2稀释液(DILUENT)导液管连接 (14)3.4.3废液(WASTE)导液管连接 (14)3.5记录仪纸安装 (14)3.6打印机的安装(如装备) (15)3.7条形码扫描器的安装(如装备) (15)3.8键盘、鼠标垫、鼠标的安装 (15)3.9电源线连接 (16)3.10开机启动 (16)3.11本底测试 (17)3.12质量控制 (17)3.13标定 (18)3.14血液样本的采集 (18)3.14.1静脉血(全血)的采集 (18)3.14.2末梢血(预稀释)的采集 (18)3.15血样计数、分析 (19)3.15.2血样计数、分析过程 (20)3.16测量结果分析、处理 (21)3.17报告输出 (22)3.18分析结果修改 (23)3.19关机 (23)3.20检测结果查询 (24)3.20.1历史样本数据的选择、浏览、修改、输出、删除 (25)3.20.2检测数据的全部删除 (26)第4章仪器设置 (27)4.1仪器设置 (27)4.1.1我的仪器 (27)4.1.2时间/日期 (28)4.1.3记录/打印 (28)4.1.4传输 (28)4.1.5选项 (28)4.1.6我的报告 (30)4.1.7报告参数 (30)第5章质量控制 (31)5.1质控编辑 (31)5.2质控运行 (34)5.3质控图 (35)5.4质控数据 (36)第6章标定 (38)6.1标定准备 (39)6.1.1本底测试 (39)6.1.2仪器重复精度的评估 (39)6.2标定系数修改 (40)6.3标定浏览 (42)第7章参数界限 (43)7.1参数界限的浏览 (43)7.2参数界限的调整 (44)第8章保养与维护 (46)8.1每日保养、维护 (46)8.2每周保养、维护 (46)8.3每月保养、维护 (47)8.4每年保养、维护 (47)8.5仪器长期不用或运输前的保养、维护 (48)第9章故障处理 (49)9.1故障处理指引 (49)9.3故障处理方法 (50)9.3.1WBC堵孔或RBC堵孔(WBC CLOG 或RBC CLOG) (50)9.3.2WBC测试数值异常变大 (51)9.3.3WBC气泡或RBC气泡(WBC BUBBLES RBC BUBBLES) (51)9.3.4真空度低(VACUUM LOW) (51)9.3.5温度低(WBC TEMP LOW) (51)9.3.6废液满(WASTE FULL) (52)9.3.7HGB故障(HGB LAMP F AILURE) (52)9.3.8HGB 气泡(HGB BUBBLES) (52)9.3.9无稀释液(DILUENT EMPTY) (52)9.3.10无溶血剂(LYSE EMPTY) (52)9.3.11记录仪缺纸(RECRDER NO P APER) (53)9.3.12记录仪温度高(RECRDER TEMP OVER) (53)9.3.13记录仪头位置错(RECRDER HEAD ERROR) (54)9.3.14记录仪故障(RECRDER ERROR) (54)9.3.15记录仪卡纸(RECRDER P APER OUT) (54)第10章预防、限制和危害 (55)10.1使用限制 (55)10.2安装限制 (55)10.3人身防护和传染控制 (56)附录1:产品规格 (57)附录2:简体中文输入方法 (59)附录3:符号 (60)版权及声明版权©桂林高新区宝利泰医疗电子有限公司2001,保留所有权利。
ABI3100简介及其常见问题解析
实际原因:
气泡引起的峰 使信号达到饱 和,显示不通 过。
解决方案:
尽量保证胶及 通道中没有气 泡。
(下图是放大 图)
3. 软件提示:Bad dye order detected. 表现:
实际原因:引物峰过高,检测范围包括引物峰部分。 解决方案:调整检测范围到引物峰之后,包括所有目的峰。
4. 软件提示:Failed quality check: q=0.93807 is less than minQ threshold (0.95000) 表现:
ABI3100简介 及 其常见问题解析
姜艳艳 2007.3.9
主要内容
ABI遗传分析仪简介 ABI3100相关简介
ABI 3100构造及毛细管工作原理 数据收集软件的简介 数据分析软件的简介 常见问题解析
一. ABI遗传分析仪系列
ABI测序仪和遗传分析仪系列: 377 DNA 测序仪
所采用的是板胶
3100为16道毛细管
3100Avant为4道毛细管
使用96孔板或384孔板进 行电泳
使用注射器将胶注入毛细 管,且有两支注射器
3130 和 3130xl 基因分析仪
3130为四道, 3130xl为16道。
从胶瓶中自动吸胶 注入毛细管。
软件方面与3100基 本相同。
3730 和 3730xl 基因分析仪
310 是单道 的毛细管,不 能使用96孔板, 而是使用 0.5ml 的离心 管上样。
2.毛细管工作原理
毛细管两端:
阳极有电极插在buffer中
阴极没有电极,而是在毛细管外包裹着一层金属, 插在buffer中。
与3100不同,310在毛细管旁边有一根金属电极插在buffer中。
ABI-310使用说明
ABI PRISM310型基因分析仪说明书发布日期:2010-11-17 来源:丁香通浏览次数:1487DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。
自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。
美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。
本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。
DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。
自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。
美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型号。
本实验介绍的是ABI PRISM 310型DNA测序仪的测序原理和操作规程。
【原理】ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单引物PCR测序反应,生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DNA混合物,使得四种荧光染料的测序PCR产物可在一根毛细管内电泳,从而避免了泳道间迁移率差异的影响,大大提高了测序的精确度。
由于分子大小不同,在毛细管电泳中的迁移率也不同,当其通过毛细管读数窗口段时,激光检测器窗口中的CCD(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测,激发的荧光经光栅分光,以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光,并在CCD摄影机上同步成像,分析软件可自动将不同荧光转变为DNA序列,从而达到DNA测序的目的。
分析结果能以凝胶电泳图谱、荧光吸收峰图或碱基排列顺序等多种形式输出。
3100-Avant遗传分析仪操作规程及注意事项
ZX/C-001-20053100-Avant遗传分析仪操作规程及注意事项1 概述本仪器是用于核酸和蛋白质序列分析和片段分析的专业毛细管电泳设备。
2 操作程序2.1 仪器的启动2.1.1 打开Dell电脑,进入win2000操作系统。
2.1.2 等win2000完全启动后,开启3100主机电源开关,仪器进入自检状态。
2.1.3 等仪器的绿色状态灯亮后,双击Run 3100-Avant Data Collection(V2.0)快捷键进入数据收集软件。
3 片段分析步骤3.1 样品扩增结束后,将一次上样的PCR产物转移到96孔板上,每孔各加10ul。
每孔上样量是:8.8μl甲酰胺+0.2μl分子量内标+(1-1.5)μl各座位混合PCR 产物(试剂盒或标准品的上样按照说明书进行),先将96孔板放入9700PCR 仪中95℃变性5min,4℃保存10min,取出后将板放到仪器的自动进样器上。
3.2 编辑样品表。
在Data Collection 窗口中,点击Protocol Magager,再点击Instrument protocol窗口中的New按钮,打开protocol Editor,新建一个protocol,在Name栏为新建的protocol 命名,Type中选Regular,然后根据使用的试剂的要求,分别在Run module、DyeSet(微卫星选D,亲子鉴定选F)中选出正确的程序,选择完毕后,点击OK。
每一种荧光组合的protocol 运行过一次以后,下次再用该组合,调出相应的protocol确认一下即可。
3.3 设置Result Group。
在其窗口的第一个format中,选择date of run, plate name,sample name, well position, capillary number;第二个format中,选择date of run, plate name,指定结果保存的路径,设置完成后,点击OK。
基因分析仪的使用与应用毛细管电泳带电悬浮颗粒或大分子在一定
毛细管电泳
带电悬浮颗粒或大分子在一定介质 中因电场作用而发生移位运动的物理化 学现象。 颗粒或大分子的迁移速率取决于电 势差、颗粒带电量和颗粒大小、形状。
1937年瑞典化学家Tiselius蒂塞利乌斯运用电泳成功 分离血清蛋白,获得1948年诺贝尔化学奖,开创了电 泳技术的新纪元。
毛细管电泳(CE) 以毛细管为分离通道,高压直流电场为 驱动力的新型液相分析技术。
可将有生物化学意义的复杂化合物在不改变 其性质的前提下进行分离.
应用:蛋白质分离、糖分析、DNA测序、手
性分离、单细胞分离。
毛细管电泳(CE)分离 开始阶段,样品自由迁移,位置由速 度决定 组分分开后,位置由介质性质决定
自由迁移
L tR V
组分沿毛细管轴的速度V 一定时间t所迁移距离L
定长分离:固定位置安装检 测器记录分子通过该位置的 情况(tR),可得图形信号- -电泳谱图
电泳介质
不连续介质:由前导(TE)+终末(TE)电解质组成。
各组分分开形成的区带按速度大 带与LE,TE都以 VLE 等速前进。 小排列,区
310 DNBiblioteka 测序仪原理简图基因序列测定
基因扫描分析
主要特点 1. 2. 3. 4.
分辨率 灵敏度 高效性,高信息含量 自动化: 灌胶、进样、数据收集
2 仪器使用
注意室温恒定20±5℃
3 应用范围 1.基因测序 未知序列 序列比较 真菌细菌鉴定分型的 rRNA测序 器官移植配型分析的HLA基因测序 HIV病毒突变检测 2.SNP分型 77,000个SNP位点
连续介质:区带相互分开,以各自速度独立迁移. PH梯度:弱解离样品变速迁移--按平均速度分析。两性样
3100测序仪使用注意事项
仪器与零件
更换泵的液封Water Trap中的水
清洗胶块及管路系统,
Water Wash Wizard(3130系列)
或用注射器清洗(3100系列)
以防损坏毛细管
0.2mm以下气泡不需要排除, 3100系列使用手动排气泡
常温, 勿冷藏
左侧管路接头
检查漏胶,并清洁
散热风扇
保持仪器和激光散热风扇出口畅通
电脑 Spatial空间定位
电脑与软件
重新启动电脑与仪器,
仅E:盘磁盘碎片整理,
重启间隔30秒
切勿清理其他分区
打开过毛细管检测窗口,搬动过仪器后,均需要校正
连接仪器和电脑的网线不可以拔 下,网线接头方向不能互调;切勿更 改电脑名称,分区卷标,网络设置
Spectra光谱校正
不同的染料,不同长度的毛细管,不同类型的胶进行的新组合;实验结果中不同荧光颜色间出现互相干扰,均需要校正
注射器(3100系列)
清洗注射器,活塞要保持湿润
建议三个月~半年更换
手套
无粉
96孔板上样组件组装 96孔板上样组件安装
PDP泵(3130系列) 上下胶块 左侧管路系统
确保Retainer和Septa的孔对齐 确保上样组件正确并稳固地安 装到AutoSampler上
检查气泡, Bubble Remove Wizard
状况
毛细管检测窗口
室温可保存1周; 使用前需要先回温到室温
2℃~8℃
正常条件y Wizard更换毛细管; Update Cap Array Info更新信息
可使用无水甲醇冲淋检测窗口
(新毛细管) 常温,干燥
Hi-Di™甲酰胺
第一次使用建议根据使用量分装保存 -15℃~-25℃
NTRON3100氧气分析仪 中文操作手册
MODEL 3100 氧化锆氧气分析仪—百分比到PPM量程操作手册2004-1-19Ntron目录安全提示 (3)第一部分操作原理1.1概括 (4)1.2特征 (4)1.3系统组成 (5)1.4 分析仪输入与输出 (7)1.5 控制面板 (8)第二部分 1100分析仪操作2.1安装 (10)2.1.1 分析仪的安装位置 (10)2.1.2 远传传感器的安装 (11)2.1.3 分析仪安装 (11)2.2开始 (15)2.2.1 通电 (15)2.2.2 校准 (15)2.2.3 报警设置 (15)第三部分操作形式3.1系统机构 (16)3.2 用户形式 (16)3.3 系统模式 (17)第四部分维护 (19)4.1系统设置 (19)4.2定期维护表格 (28)4.3 发现并维修故障 (28)安全提示:安装或操作之前请详细阅读操作手册。
在没有完全明白型号3100的特征和功能之前而进行操作,可能会造成危险。
⏹气体加压时,使用保护眼罩和遵守安全的程序。
⏹测量气体要在相同压力和流速下校准。
⏹确保在使用之前已经校准仪器。
⏹3100分析仪外壳不具有防水功能,避免放置在液面,潮湿等地方。
⏹不要放置在易燃或高温环境的地方。
⏹3100分析仪不具有防爆等级或本安型,避免放置在有易燃气体或水蒸汽的地方。
⏹确保分析仪的操作温度,不要置于高温的表面,不要阻塞通风口。
第一部分操作原理1.1概括Ntron 公司的3100系列分析仪,它提供了在微氧测量和控制运用中的有效解决。
它针对于精确测量百分比范围氧而设计的分析仪。
氧气精确测量从0.1PPM到100%。
3100分析仪内置Ntron公司的远控传感器机箱(RSM),传感器机箱的主体部分是Ntron公司独有的“氧化锆传感器”。
氧化锆传感器是一个具有可靠性和反映快功能的固态装置,由于它是固态,所以不受干燥环境影响,在极冷的冷藏库下不受损坏。
3100分析仪的全图:1.2 特征型号3100分析仪为嵌板或控制台的装置。
ABI3100简介及其常见问题解析
2.分析数据 添加要分析的文件夹:
panel
Size standard
Analysis method
分析后如果如下图所示:不通过,查找原因。
查看原始数据:
查看内标:
结果所得图形:
分析工具栏:
实际原因:
气泡引起的峰 使信号达到饱 和,显示不通 过。
解决方案:
尽量保证胶及 通道中没有气 泡。
(下图是放大 图)
3. 软件提示:Bad dye order detected. 表现:
实际原因:引物峰过高,检测范围包括引物峰部分。 解决方案:调整检测范围到引物峰之后,包括所有目的峰。
4. 软件提示:Failed quality check: q=0.93807 is less than minQ threshold (0.95000) 表现:
为保证DNA片段分离的重复性,必须包埋毛细管内壁 以除去电渗流,ABI3100采用能进行DNA分离的POP-4或 POP-6胶线性包埋毛细管内壁,阻止电渗流,使DNA从阴 极到阳极没有液体的流动。毛细管的包埋使之随着时间而 性能有所降低,影响使用寿命。
检测:
一束激光被分成两束从毛细管的两侧同时照亮16根毛 细管,当DNA片段经过检测室时,所带荧光染料被激发, 荧光被检测到,形成胶图。
其他与3130基本相同
主要性能参数:
型号 377 310 3100Avant 3100 3130 3130xl 3730 3730xl
毛细管状态 无 1根 4根 16根 4根 16根 48根 96根
胶的状态 聚丙稀酰胺凝胶 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4 POP-6和 POP-4
ge的dsa3100参数
ge的dsa3100参数在工业自动化领域,GE(General Electric)的DSA3100是一款广泛使用的参数监测仪器。
该仪器以其高精度、稳定性和可靠性而备受赞誉。
本文将对GE的DSA3100参数进行详细介绍,帮助读者更好地了解该仪器的功能和特点。
1. 型号和外观GE的DSA3100是一款台式监测仪器,具有紧凑而坚固的外观设计。
它的尺寸为30厘米(宽)x 20厘米(高)x 10厘米(深),重量约为2千克。
该仪器的操控面板简单直观,便于使用者进行参数设定和操作。
2. 参数测量DSA3100可用于测量多种参数,如温度、压力、流量、电流和电压等。
它配有丰富的测量通道,可以同时监测多个参数。
该仪器的测量范围广泛,可满足不同应用场景的需求。
测量精度高,可达到0.1%FS(满量程)。
3. 数据显示和记录DSA3100具有大屏幕液晶显示屏,能清晰地显示当前各个参数的数值。
此外,它还支持数据记录功能,可以将测量数据保存在内部存储器中或通过USB接口导出到外部存储设备。
通过配套的软件,用户可以方便地分析、导出和打印记录的数据。
4. 报警功能DSA3100具备报警功能,当被测参数超出设定的范围时,会及时发出声音或光线提示,提醒用户注意异常情况。
同时,仪器还可以通过RS485接口与上位机或控制器通信,实现远程报警和控制。
5. 通信接口DSA3100支持多种通信接口,包括RS232、RS485和Modbus等。
这些接口使得仪器可以与其他设备或系统进行数据交互和集成,实现自动化控制和数据管理。
6. 软件功能GE提供了全面而易用的软件套件,可与DSA3100配套使用。
该软件可以对仪器进行远程控制、参数设定和数据管理。
用户可以根据需求生成报表和图表,分析和监控参数数据,提高生产过程的控制和效率。
总结:GE的DSA3100是一款功能强大的参数监测仪器,具备多种参数测量、数据显示与记录、报警功能和通信接口等特点。
该仪器通过高精度、稳定性和可靠性,为工业自动化领域的用户提供了一种优秀的解决方案。
multiNC3100维护指南
德国耶拿分析仪器股份公司
2 / 31
1 维护工作
基本设备 建议维护周期 每天
德国耶拿分析仪器股份公司
3 / 31
建议维护周 期 每天
每周 每月
每6个月
TIC 模块
部件
氧气流量应该设定在10 l/h 检查试剂瓶中磷酸体积 如果卤素捕集器变色,更换消耗掉的铜丝 根据干燥剂的外观,更换块状的干燥剂 清洁和干燥载气的管路
检查所有管路确保不漏气 检查各紧固螺丝确保完全紧固
每周 每月 每6个月 每12个月
部件
超纯水瓶 气体流量 气源氧气的检查 废液瓶检查 盐酸瓶 磷酸 卤素捕集器检查 检查铜丝是否变色
清洗收集盘和试剂瓶 清洁设备
检查所有管子接头是否紧 检查指拧接头是否紧
更换水份捕集器
更换燃烧管 清洗TIC冷凝器 更换蠕动泵管 更换注射器 更换CHD电池 更换导管组件
建议维护周 期 每天
1.3 TIC模块 ..................................................................................................................................18 1.3.1 水份捕集器 ........................................................................................................................18 1.3.2 更换卤素捕集器填充物......................................................................................................19 1.3.3 更换干燥剂..........................................................................................................................19
3100测序操作步骤
1.PCR2.PCR产物纯化割胶纯化/直接纯化,PCR产物为非单一条带时,要割胶纯化。
如果为单一条带可直接进行PCR产物纯化。
测量纯化后PCR产物浓度,可根据电泳条带亮度粗略估计或测OD260 3.测序PCR体系:PCR产物:根据PCR产物长度决定BigDye :4ul Array测序引物:3.2pmol纯水补足体积总体积 10ul反应条件:96 ︒C 1 min → (96 ︒C 10 sec → 50 ︒C 5 sec → 60 ︒C 4 min) x 25个循环→ 4 ︒C保温4.测序PCR产物纯化4.1 每管加入2 μL 125 mM EDTA到管底,每管加入2 μL 3M NaAc到管底。
4.2 每管加入30 μL 100%酒精,震荡混匀,避光室温放置15 min。
4.3 12000rpm离心20 min,去上清。
4.4 每管加入30 μL 70% 酒精,12000rpm离心10 min,去上清。
4.5 重复上步1次。
4.6 室温挥发净酒精,加入10 μL Hi-Di Formamide振荡溶解DNA。
4.7 溶解后的样品在 95 ︒C变性5 min,迅速置冰中冷却4 min后,准备上样电泳。
5.测序5.1加样:变性后的测序产物加入与基因分析仪配套的96孔板,盖好,记录加样顺序。
5.2 程序设置5.2.1打开软件“run ga3100 avant”,软件开始质检,等质检完成后(绿色)弹出界面。
选择“Plate manager”,单击“new”按钮:Name:输入想要保存的文件名Applocation:选择sequencing analysisplate type:选择96-wellowner name:输入想要保存的文件名operater name:输入想要保存的文件名点击“OK”按钮。
弹出新的界面Name:输入每个孔的名字result group1:选择保存的文件命或新建一个instrument group l:选择BDV3-50-pop6-runanalysis method :选择BDV3-50-pop6完成后,点击“OK”按钮在弹出的界面中选择“3100 avant”选择“run scheduer”输入保存的文件名,单击search,下框中出现保存的文件,选中文件,单击右边的黄色6.结果分析使用ABI基因分析仪时,应用ABI公司seguencing analysis 5.1.1软件进行数据收集和分析。
Theworldleaderinservingscience
Applied Biosystems™ 3130系列基因分析仪简明中文手册第一部分:操作指南英潍捷基(上海)贸易有限公司赛默飞世尔科技公司简明中文操作指南Applied Biosystems™ 3130系列基因分析仪一、仪器准备1. 开机:1.1 开启UPS电源,确保UPS处于电池供电状态,稳定5分钟;1.2 打开显示器和电脑的电源开关,登录到Windows界面;1.3 确保仪器的加热炉门和仪器前门关闭;1.4 打开仪器电源开关,待绿灯长亮,仪器启动完成。
注意:开机顺序是先开电脑再开仪器。
2. 打开Data Collection软件2.1 选择Start> Programs >Applied Biosystems >Data Collection >Run 3130 DataCollection或Run 3130xl Data Collection 或双击桌面快捷方式。
2.2 等待Service Console窗口中的指示灯全部变成绿色后,DC软件的界面打开,过程如下:3. 准备缓冲液3.1 将5ml 10X缓冲液与45ml水(满足18.2兆欧要求)混合成1X缓冲液;3.2 取下阴极缓冲液槽(下图1号槽),废液槽(下图2号槽)和水槽(下图4号槽):a 各自拆下用水清洗;b 阴极缓冲液槽用水冲洗再用1X缓冲液润洗后加入16ml的1X缓冲液;c 废液槽和水槽用水冲洗后加入16ml水;d 扣上干净的Septa,擦干外壁放回相应位置(3号槽空着不加液体)。
简明中文操作指南3.3 取下阳极缓冲液水杯,弃去缓冲液后,先用水清洗,再用1X 缓冲液润洗,最后加入16ml 的1X 缓冲液后放回仪器。
二、 运行试验1.设置测序实验流程1.1 创建Instrument Protocol1.1.1 点击GA Instrument > ga3130xl 或ga3130 > Protocol Manager, 在InstrumentProtocol 界面中,点击New 。
ABI3100简介及其常见问题解析
15. 电泳时出现目的片断以外的其他杂峰
原因:主要原因是甲酰胺质量不好,或者是甲酰胺长期在4度放置有降解。 解决方案: 更换质量好的甲酰胺。(确定不是扩增产物。)
16.出现电泳峰
说明:所出现的尖锐的小峰实际上是四种颜色都有的,位置不固定,杂乱无章, 内标中相对明显,影响分析结果。当室温过高时明显会增多,可能是胶中有气泡, 受热膨胀,易形成。严重影响分析结果的建议重新电泳。
脱离buffer超过30min 如有离子影响结果,可用水上样试一次
其它注意事项:
16道毛细管每个run约用胶50μl ,注意在整板上样时查看胶够不够。 做阳性对照和阴性对照。 如所提的DNA浓度大,做PCR时适量少加入模板,防止产物量过大影响电 泳。 每个run加ladder用于分析时校正bin。 实验进行过程中不要一陈不变的遵循操作手册,而是要观察结果,调整内 标及ladder的使用量。(内标高度控制在200 rfu左右,ladder 控制在和内标相 当的高度)
三.数据收集软件的简介 1.开关机器 顺序:电脑,3100机器,收集软件(关机相反)
2.空间校正
空间校正表明在CCD上呈现每一根毛细管发出荧光的正确位置,而不 反应毛细管的任何信息。
更换毛细管,毛细管的被拆卸安装后时要进行空间校正。
3.光谱校正
是为了校正荧光染料发射光谱的重叠,可以消除不同荧光染料间的 相互影响。以下情况必需做校正:机器使用了新的dye set,激光器或 CCD更换,结果不好有 pull up,pull down的峰。
5.结果的存储
先在“我的电脑”的E盘上建一个文件夹用于储存结果,
在数据收集软件中有
可以进行设定。
结果的重新导出:
结果可以重新导出,或将所需要的部分结果重新导出到指定文件夹。
测序仪遗传分析仪安全操作及保养规程
测序仪遗传分析仪安全操作及保养规程随着遗传分析技术的不断发展,测序仪遗传分析仪在科学研究和生物医学领域中的应用越来越广泛。
随之而来的问题是如何正确地进行操作和保养,以确保设备的安全性和可靠性。
本文将简要介绍测序仪遗传分析仪的安全操作和保养规程。
安全操作规程1.遵守操作手册。
首先,用户应当认真阅读测序仪遗传分析仪的操作手册,并按照步骤进行操作。
操作手册中包括重要的安全说明和维护建议,用户必须遵守这些说明,以免发生安全事故或设备故障。
2.熟悉设备结构。
在操作测序仪遗传分析仪之前,用户应该熟悉设备的结构、部件和参数。
掌握这些信息有助于正确地进行操作,并避免不必要的损坏。
3.使用合适的工具和材料。
用户在进行维护和维修时,必须使用合适的工具和材料,以防止对设备造成不必要的损坏。
4.避免使用损坏的设备。
用户必须确认设备在运输和使用过程中没有受到损坏,如果发现损坏,应该立即停止使用。
5.使用防静电手环。
测序仪遗传分析仪灵敏的电子元件对静电电荷非常敏感。
在操作前,用户应戴上防静电手环,并将设备放在防静电工作台上。
6.定期清洁和维护设备。
设备在使用的过程中会积累灰尘和污垢,影响设备的运行。
用户应该定期清洁和维护设备,以确保设备的可靠性和使用寿命。
7.警惕设备的异常情况。
用户在使用设备时应始终保持警惕,及时发现设备的异常情况,并做出相应的处理。
保养规程1.定期清洁设备。
设备使用一段时间后会积累灰尘和污垢,影响设备的性能和寿命。
用户应该定期清洁设备,以确保设备的可靠性和使用寿命。
2.定期更换耗材。
测序仪遗传分析仪需要一些耗材,如电极、滤芯、滤网等。
这些耗材使用一段时间后需要更换,用户应该按照操作手册中的说明更换这些耗材。
3.注意存放和运输。
设备在存放和运输过程中需要注意防震、防水和防静电。
存放时应该放在干燥、洁净和防尘的环境中,运输时应该采取防震和防静电措施。
4.定期进行保养。
用户应该定期对设备进行保养,清洁设备和更换耗材。
31303130xl遗传分析仪介绍及Data Collection v3.0软件使用
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样品运行前的设置 样品运行前的设置
Result group的设置
Instrument protocols的设置
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Results Group的设置
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Results Group的设置- 的设置-General
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仪器结构
加热炉 自动灌胶系统
毛细管
检测窗口 胶瓶 自动进样器,包括阴极杯
阳极杯
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仪器结构
自动灌胶系统
胶瓶
阳极杯
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仪器结构
自动灌胶系统
胶瓶 自动进样器,包括阴极杯
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to save the calibration data to the database
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空间定位失败
Click for any failed calibration
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7
仪器工作原理 -激发出的荧光由于波长不同而被分离, 并被CCD相机收集
CCD 相机收集波长范围。。 520nm到650nm 虚拟的光栅设置 氩离子激光,激发波长 488nm,514nm. TRIVIA: 什么是CCD? Charged Coupled Device电荷耦合器件
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法医签订3100使用注意
法医DNA实验室实验操作规范中的几个主要问题童大跃,伍新尧,陆惠玲,李建金,陈丽娴(中山大学法医鉴定中心,广东广州 510080)摘要目的探讨法医DNA实验室实验操作规范中的几个主要问题。
方法应用powerplus 16 system和identifier试剂合在不同的电泳环境温度、扩增试剂用量,模板用量等对亲子鉴定结果影响。
结果电泳环境温度、试剂用量,模板用量等对亲子鉴定结果影响如不按照操作规程,结果会出现较大变异。
结论法医DNA实验操作必须遵循操作规程,充分注意易于忽视的“小”问题。
关键词亲子鉴定;个体识别;GeneMapperID目前,应用于亲子鉴定和个体识别的仪器主要是ABI及BECKMAN等公司。
主要用凝胶电泳和毛细管电泳为原理分离PCR扩增产物。
分析用软件有genescan与genotyper,genemapperID等。
用于亲权鉴定和个体认定的商品化试剂盒多种多样,可检测的STR位点数也不尽相同。
大多数实验室使用的是promega公司powerplus 16 system (4色荧光)和ABI公司的identifiler(5色荧光)试剂合。
本鉴定中心在使用这两种16位点的STR分型试剂盒的实验过程中,遇到一些问题,现将相关的一些报道如下。
1 材料与方法1.1主要仪器与试剂:1.5%的Chelex-100液(BIO-RAD);Powerplus16system (Promega Biotech Co.Ltd);Identifiler (ABI Co.Ltd);Pop4电泳胶(ABI Co.Ltd);甲酰胺(ABI Co.Ltd);Glod Taq polymorase;3100遗传分析仪(ABI Co.Ltd);MWG Biotech PCR 仪(Eppendorffer);PTC-100 PCR仪(MJ)。
1.2方法1.2.1 DNA的提取用5%Chelex-100法,特殊检材除外[1];1.2.2 PCR扩增及电泳分离扩增按Powerplus 16 system 使用说明进行。
基于ABI PRISM 3100遗传分析仪的基因分型技术
基于ABI PRISM 3100遗传分析仪的基因分型技术近年来,随着人类基因组计划的完成和基因工程技术的发展,基因分型技术在医学、生物学和法医学等领域得到了广泛应用。
ABI PRISM 3100遗传分析仪是一种先进的自动化基因分型系统,它能够快速、准确、可靠地对基因进行分型,为科学研究和临床诊断提供了有力的支持。
一、ABI PRISM 3100遗传分析仪的基本原理和工作流程ABI PRISM 3100遗传分析仪采用荧光定量PCR技术,即在PCR反应中加入一定浓度的荧光探针,通过检测荧光信号从而确定PCR反应产物的数量。
该系统可以同时检测多个位点的基因型,并具有高分辨率、高通量和高灵敏度等优点。
其工作流程如下:1. 样本准备。
将待测样本DNA分离并纯化,保证DNA的质量和浓度满足实验要求。
2. PCR反应。
在PCR反应管中加入PCR反应体系,包括PCR引物、荧光探针、Taq酶、dNTPs等,同时加入DNA模板,进行PCR扩增反应。
3. 分型检测。
将PCR反应体系加入自动筛选芯片中,通过芯片上的荧光检测仪检测荧光信号,用软件分析检测结果并输出分型数据。
二、ABI PRISM 3100遗传分析仪的应用1. 法医学和犯罪侦查。
通过基因分型技术可以对DNA进行个体识别和亲子鉴定,有助于犯罪现场证据的鉴定和嫌疑人的追踪。
2. 医学研究。
基因分型技术可以用于疾病的遗传性研究、个体化治疗方案的制定和药物疗效的预测。
3. 植物和动物遗传育种。
基因分型技术可以通过对植物和动物基因型的检测分析,为育种工作提供有效的技术手段。
三、ABI PRISM 3100遗传分析仪的优缺点和发展趋势1. 优点。
ABI PRISM 3100遗传分析仪具有高性能、高通量、高分辨率和高灵敏度的特点,可以同时检测多个位点的基因型,并且具有自动化操作,减少人工误差和检测成本的优势。
2. 缺点。
ABI PRISM 3100遗传分析仪虽然具有高效性和准确性,但需要一定的仪器维护和操作技能,而且其商业化程度较高,价格较昂贵,有些实验室可能难以承受。
ABI3130测序仪的日常维护
• 当运行仪器时,被告知已经没有足够的磁盘空间,因为C
盘中生成了一个很大的数据:EPFdata
• 处理方法
– 1. 在C盘下找到该文件直接删除即可; – 2. 产生这种文件的原因是没有按正常的顺序开、关机。
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12
每二天要做的事情
• 更换水、buffer,且buffer要新鲜配制
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每周要做的事情
更换新鲜的胶 清洗大小注射器(3100) 3130测序仪 PDP water seal trap 重新启动电脑和测序仪
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故障10:污染现象
• 故障现象
– 荧光物质污染 – 有机物质污染 – 灰尘、颗粒污染
• 处理方法
– 不戴有滑石粉的手套 – 定期清洗注射器、block – 注意一定要使用合格的水
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7相关耗材的使用?hidi分装以避免反复冻融hidi分装以避免反复冻融?胶4?c保存用之前2小时从冰箱中取出回温并且不同种类的胶不中取出回温并且不同种类的胶不能混用pop4pop6pop7更换胶时请使用相关的wizard?水请使用电导率为182兆欧的水?buffer请新鲜配制buffer请新鲜配制?毛细管未使用过的毛细管请置于干燥的地方保存用过的毛细管两干燥的地方保存用过的毛细管两端一定不能离开水2010年8月13日星期五?2009appliedbiosystems
3130xl基因分析仪简明使用手册-3130XLDNA测序仪操作规程
3130xl 基因分析仪简明使用手册- 3130XL DNA 测序仪操作规程3130XL DNA 测序仪操作规程1、样品要求,DNA模板的纯度与用量,,(1)DNA纯度,OD260/OD280=1.6-2.0;,2,DNA用量,PCR产物,10-30ng; 质粒,双链DNA,150-300ng ; 引物浓度,3.2pmol/ul.PCR扩增,96?1min.?(96?10sec. ?50?5sec. ?60?4min.)×2、25个循环?4?保温。
3、反应体系,10ul反应体系,BigDye0.5ul, sequencing Buffer(5×)1.8ul,模板,150-300ng(质粒),用去离子超纯水补充到10ul。
4、PCR产物纯化,96孔板,酒精/EDTA/NaAc法。
,1,每管加入25ul 100%酒精,1ul 125mM EDTA,1ul 3M NaAc,轻微离心,室温放置15min.,,2,9600rpm离心15min,弃去上清夜。
,3,每管加入50ul70%酒精,震荡,9600rpm离心15min弃去上清液.(4)重复第,3,步一次。
,5,让残余的酒精在室温下挥发干,加入10ul Hi-Di Formamide轻离,95?变性4min,迅速置冰中冷却4min后,再上机电泳。
5、开机,,1,打开电瓶后开关,听到“咔”一声后,再按下前面“on”按纽,这时全部指示灯变绿。
,2,打开计算机。
,3,按下3130XL主机开关,左面第一个,,等中间指示灯由黄变绿后,表明开机完成。
6、编程。
由Run 3130XL Data collect软件完成。
7、上样电泳,数据收集单96孔板,需电泳6个小时,双96孔板,需电泳12个小时。
电泳时绿色指示灯连续闪烁,电泳完成后指示灯保持稳定。
8、关机,,1,关掉主机开关。
,2,关掉计算机。
,3,先按下电瓶前边“off”按纽,“beep”声过后,指示灯变绿后,关掉后部电源开关。
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应 中, 除了含有D A N 聚合酶和四种正常的d T # 还有用 N Pb 非放射性荧光素标记的d N P d T 的3 H 取代了 d T ,d N P - 普通脱氧核糖 3 O ,, N 链的延伸时d T 与d N P 在D A H N P dT 展开竞争,如果是d T ,延伸反应继续进行,如果是 NP
的聚丙烯酰胺平板进行D A N 序列分析,繁琐的灌胶和上 样过程全部由泵和 自动进样器完成,实现了自动灌胶、 自动进样、 自动数据收集。但由于其一次只能进行单一
样 品测 定,凶此远远不 能满足我 院的使用 ,我们又于 2 0 年购置 了A I r 1 0 04 B P i m 3 0 型遗传分析系统 ,它是 s
dN P d T ,由于缺少3 O 将会阻断后续d T 形成磷脂二 一H NP 脂键 ,延伸进 一步 被终止 ,反应产 生大量 的寡核苷酸 链,这些产 物可用 凝胶 电泳分离 ,染料分子用激光激
种长度选择的 自动涂层毛细管 ( 2 m 6 m 0 m 2 c ,3 c ,5 c ,
8 c ),可 以满足不 同的应用需求 ( 0m 见表1 )。
断分析软件 ( e e a p r 可以对结果进行 自动分析。 GnMpe)
3 3 O 型遗传分析仪的应用 . 10
品,足以满足中高等样 品量实验室 的需要 ,与3 0 1 型遗 传分析仪相 比其 自动化程度更高,应用更广泛。
一
3 0 0 型遗传分析仪能够完成对新基 因序列的测 定 1 或比较测序工作。此外,还可进行多种片段分析,包括
表 1 3 0 1 0遗传分析仪应 用举例
应用举例
快速 期序 I 标准 测序
性 能指 标
分离 毛 细管 电泳时 问和 分析 2 小时产 事 4
介质 长度 30 6m 温度 长度
比较测序 9. 测 序 85 SP 究 N研 精度 PP6 O
-
5c 0m 3C 6B 3c 6m
25 r6℃ 60p h 0 5 b 4m n6 ℃ 40 p 5l 0 0b
9,2b 0 ?0p 760 ,8 枭
片 段大 撖卫星 分析 4 0p 内 0b 以 PP O 小 分析 准偏 差 0 1 6 标 4 突变 检测
维普资讯
中 砚代埘 装 国 各
2 7 第期总 4 ) 0 年 l (第 7 0 期
3 型遗传分析仪的应用和维护 0 1 0
鲍 蕾
(北京师范大学 北京 107 ) 0 85
摘 要 :随着分子 生物学的发 展 ,测序技 术以及 片断分析技 术的应 用越来越广泛 。本文简要 介绍 了 3 00遗 1
3 0 0 型遗传分析仪操作简单,仅需安装毛细管、 1
注射器,将装有预处理样品的样 品板放置于 自 动进样器
上后便可运行。在 自动进样器上一次可放置2 6 L 个9 ;或 f 3 孔板。一旦样 品板放好后,样品被 自动吸入毛细 4 8
的遗传变异信息。但由于在公司进行样品测序及片断分 析存在着耗时耗力 以及准确性较差等缺点,因此很 多高 等院校及科研院所为了满足 自身教学科研发展 的需要, 都购置 了遗传分 析仪 。我 院于 1 引进 了ABI 99年 9
2 7第期总 4 0 年 1 (第 。 0
微卫星D A N 分析 ( S )、限制性片段长度多态性分析 SR
、
3 O 遗传 分析仪 的应用 1 型 O
1 工作原理 . 在合成的寡核苷酸引物同单链 D A 模板退火的反 N
(F P A L )、比较基因型分析、单核苷酸多态性 (N ) SP、
单链构象多态性分析 ( S P S C )等。3 O 遗传分析仪有 10 两种专利液体分离胶,分别 为P P  ̄P P ,并且有多 O 4 IO 6
s 检测 舯
1 b 以内 . 0 p 0 四色判 定 PP4 O
11 ,5 2十样 2 nn6 ℃ 1 b 0i 0 0 p 0 品
( 下转 1 页) 8
/ 6
嘲 睇 固
维普资讯
中 砚代皋 装备 目
袁 2 类l 型 i放电电压值 ‘ . I f 螅髓)
8ma 0 0 i6℃ 50 p 14 30p 0b 8 2 b
活,并且荧光信号被放大再被光 电倍增管捕获,根据每
种不 同染料的颜色来判断不同的核苷酸,根据荧光峰的 形状 和连续峰之间 的距离识别每一个碱基。
2 主要 特 点 .
D^ N 测序
9 . 测序 85 精度 PP 6 O
传分析仪 的特点 ,并对 31OO遗传分析仪 的正 确使用及 日常维护提 出了 自己的观点 。
关键词 :A I R M 1 遗传分析仪 应用 维护 B I 3 0 s O
2 世纪末 ,分子生物学技术 的发展极大 的促进了 0
生物科学各个领域的研究。与形态学、细胞学和同工酶 提供的信息相比,D A ̄ N f够提供更直接,更准确和更多
P I MM1 型遗传分析仪,其采用毛细管技术取代传统 RS T 0 3
管,在电场作用下泳动,并根据用户设定的参数进行分 析,可连续分析多达7 8 6 个样品。每一轮1 个样品的测 6 定工作均为自动完成 。直至测完样品盘中的所有样品 3 O 型遗体分析仪采用光栅C D 1 O C 荧光检测技术
光源发出的光线被光学元件分成两股,1 根毛细管被一 6
束激光 同时从两面照射,有效提 高荧光检测灵敏度和均
一
性。
3 0 型专用 的序列分析软件 (e A a y ) 10 S q n l s a 和片 i
个全 自动化多泳道 的操作平 台,可 同时分析 1 个样 6