逆转录病毒试用装操作手册
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汉恒逆转录病毒操作手册
一、逆转录病毒的试用装分装与储存
1.收到汉恒生物逆转录病毒产品后,请先对逆转录病毒产品进行分装处理,建议20-50μl/管。
如1-2天内使用,则留足够量病毒4℃保存,余下逆转录病毒置于-80℃长期保存。
2.病毒可以存放于-80℃ 6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,建议在使用前重新测定病毒滴度。
3.反复冻融会降低逆转录病毒滴度:逆转录病毒滴度越低,冻融对滴度的影响越大,108IU/ml的逆转录病毒冻融2次滴度没有显著性差异,第3次冻融开始,每冻融一次滴度降低约10%;滴度107IU/ml滴度逆转录病毒,从第2次冻融开始,每次冻融病毒滴度下降10%-15%。
二、逆转录病毒试用装实验策略与关键知识点
1.逆转录病毒感染策略:逆转录病毒本身的病毒滴度不高,感染细胞时病毒消耗量较大,试用装体积较小,建议使用96孔板进行MOI梯度感染测试。
逆转录病毒感染细胞后会反转录并插入基因组形成稳转,因此逆转录病毒感染一般采用感染少量细胞,然后将细胞放大化培养。
而不是直接大量感染。
注意:对于一些传代能力较差的原代细胞,比如BMSC等,建议采用腺病毒感染。
2.逆转录病毒感染关键知识点
1)细胞准备:由于试用装体积有限,请使用96孔板准备细胞,逆转录病毒感染细胞前,请确保目的细胞状态良好、无支原体污染。
逆转录病毒感染的时候细胞汇合率为40%~60%间为宜。
2)感染细胞最佳MOI的测定:MOI(感染复数)是指每个细胞感染的病毒数。
逆转录病毒对于不同种类不同来源的细胞,其最适MOI各有差别,原则上最适MOI是感染效率较好的最低MOI。
MOI一般以3:10:30:100的比例递增进行梯度摸索,一般的细胞基础逆转录病毒感染MOI 可从3为开始,即设立4个常规的MOI摸索,即3,10,30,100。
3)助转剂polybrene的选择:实验证明,polybrene可提高逆转录病毒对大部分细胞的感染效率,但polybrene 有一定的细胞毒性,不同细胞对polybrene的敏感度不同,polybrene最常用的工作浓度为5~8μg/ml。
4)MOI对应病毒体积的换算(非常重要)
感染时细胞数(一般以传代计数细胞数×2计算)×MOI=病毒个数;则加入的病毒体积数=病毒个数/病毒滴度。
比如第一天传代104细胞到96孔板一个孔,第二天长到2×104细胞,按照MOI=20计算,需加入病毒总量为2×104×20=4×105,按照逆转录病毒1×108IU/ml的滴度,则加入的病毒体积数为
(4×105)/(1×108IU/ml)=4×10-3 ml=4μl。
三、逆转录病毒感染细胞步骤:(1/2小体积感染法)
1.感染前准备
1)按实验需要将细胞铺96孔板,37℃培养过夜。
细胞数以第2天密度约40%~60%间为宜。
2)从冰箱取出逆转录病毒并在冰上缓慢融化,待完全融化后开始病毒感染实验。
2. 目的细胞的感染(1/2体积4小时感染法)
1)吸去细胞原有培养基,加入1/2体积新鲜培养基,并往新鲜培养基里加入终浓度5~8μg/ml的polybrene(部分polybrene不耐受细胞除外),再根据选定的MOI值,换算对应的病毒原液体积,并按体积将病毒原液加入细胞中,摇匀。
1/2体积4小时病毒感染体积表
培养皿类型表面积/cm21倍细胞培养基体积1/2培养基体积
96-well 0.3cm2100ul 50ul
24-well 2cm2500ul 250ul
2)针对贴壁细胞,细胞中加入病毒液后直接置于37℃培养箱感染4小时。
若目的细胞是悬浮或半悬浮细胞,则需要通过平角离心转染法进一步促进病毒对细胞的感染性吸附,即将适量的病毒液加入细胞培养板后,封好口,放入平角离心机后,低速(300g)离心1h,然后放入37℃培养箱中继续积感染3小时。
3)37℃培养箱中感染完毕后,取出细胞,直接往含病毒的培养基中加入另外1/2体积新鲜培养基(含终浓度5~8μg/ml的polybrene,部分polybrene不耐受细胞除外)。
4)感染后第二天(约12-16小时),吸去含病毒的培养液,换上新鲜的完全培养液(不含polybrene),继续37℃培养。
5)感染72小时后,荧光显微镜检测GFP等荧光表达效率,确定最适MOI。
6)稳转株的初筛选:如病毒载体携带puromycin抗性,感染72小时后置换含适当浓度的puromycin(1~3μg/ml,)的新鲜完全培养液,同时准备一组普通目的细胞(简称Blank组,其细胞数量、密度和病毒感染组细胞一致),加入等终浓度的puromycin。
每2-3天换含puromycin的完全培养液一次,直到Blank组细胞被puromycin杀光。
7)稳转株的二次筛选与培养放大:将puromycin终浓度减半(简称:1/2 puro培养基)培养存活的病毒感染组的细胞(包括目的基因和对照病毒组),并在细胞长密到80%左右进行细胞传代,传代后的细胞为P2代稳转株,P2代-P4代继续用1/2 puro培养基培养细胞,大量扩增细胞至4代,并大量冻存P4代的稳转细胞株,以备后续实验。
注:为保证实验结果的稳定性及可重复性,稳转细胞株的后续功能检测都用相同代数的稳转细胞株,尽量选择P4代冻存后3代内,即P7代以内的稳转株进行功能实验。
部分细胞Puromycin参考值:
Cell line Species Puromycin 筛选浓度(µg/ml)
293系列Human 2
HeLa Human 2
B16 Mouse 1-3
H9C2 Rat 1
MCF-7 Human 1-3
MDA-MB-×××Human 1-3
HepG2 Human 2
HT1080 Human 1
A549 Human 2
H1299 Human 2
Human embroyonic
Human 1
stem cells(Human
ESCs)
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