最长公共子序列算法
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最长公共子序列算法
最长公共子序列算法
概述
最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)是一种
常见的字符串匹配问题。
给定两个字符串S和T,求它们的最长公共
子序列,即在S和T中都出现的最长的子序列。
该问题可以用动态规
划算法解决。
算法原理
动态规划算法是一种将复杂问题分解成更小的子问题来解决的方法。
在LCS算法中,我们将两个字符串S和T分别看作X和Y,并定义一个二维数组c[i][j]表示X[1..i]和Y[1..j]的LCS长度。
则有以下递推公式:
c[i][j] = 0, if i=0 or j=0
c[i][j] = c[i-1][j-1]+1, if X[i]=Y[j]
c[i][j] = max(c[i-1][j], c[i][j-1]), if X[i]!=Y[j]
其中第一行和第一列均初始化为0,因为空字符串与任何字符串的LCS
长度均为0。
当X[i]=Y[j]时,说明当前字符相同,那么当前字符可以
加入到LCS中,所以LCS长度加1;否则当前字符不能加入到LCS中,则需要从上一个状态继承得到当前状态。
最终结果即为c[m][n],其中m和n分别表示X和Y的长度。
算法实现
以下是LCS算法的Python实现:
def lcs(X, Y):
m = len(X)
n = len(Y)
c = [[0] * (n+1) for i in range(m+1)]
for i in range(1, m+1):
for j in range(1, n+1):
if X[i-1] == Y[j-1]:
c[i][j] = c[i-1][j-1] + 1
else:
c[i][j] = max(c[i-1][j], c[i][j-1])
return c[m][n]
其中X和Y分别为两个字符串。
算法优化
以上算法的时间复杂度为O(mn),其中m和n分别表示X和Y的长度。
如果X和Y较长,算法会很慢。
但是我们可以通过一些优化来降
低时间复杂度。
一种常见的优化方法是使用滚动数组(rolling array)来减少空间占用。
由于c[i][j]只依赖于c[i-1][j-1]、c[i-1][j]和c[i][j-1],因此我们可以将
二维数组压缩成一维数组,并使用滚动数组来避免重复计算。
另一种优化方法是使用二分查找来加速查找操作。
具体来说,我们可
以将Y中的字符按照顺序存储在一个列表中,并对每个字符记录其最
后出现位置。
然后在计算c[i][j]时,可以使用二分查找来查找Y中第一个大于等于X[i]的字符的位置,从而加速查找操作。
总结
最长公共子序列算法是一种常见的字符串匹配问题。
该问题可以用动
态规划算法解决,时间复杂度为O(mn)。
通过使用滚动数组和二分查
找等优化方法,可以降低时间复杂度。