基于网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的作用机制
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分析平台(TCMSP数据库)、
TCMID数据库、
化学专业数据库、
SwissTarget Prediction 数据库和Uniprot数据
库获取并筛选温胆汤活性成分及靶点;
通过Genecard、
OMIM、
Drugbank 数据库收集高血压疾病的相关基
因。将所得到的温胆汤的药物靶点与高血压相关靶点进行映射,
35
甘草
31
甘草
59.29
36.16
69.67
49.6
49.22
0.21
0.25
0.21
0.31
0.34
中医药通报 2021 年 2 月 第 20 卷 第 1 期
·40·
2. 2
疾病靶点筛选结果
通过 Genecard 数据库检索
出高血压疾病相关基因 735 个,OMIM 数据库中获得
97 个基因,Drugbank 数据库中获得 16 个基因,去除重
复基因后,
最后获得 816 个高血压疾病基因。
2. 3
网络构建与结果分析
将所得到的温胆汤的药
物靶点与高血压相关靶点进行映射,得到 94 个共有
靶点,对应温胆汤活性成分 142 个。利用 Cytoscape
软件构建药物-靶点网络,见图 1。对药物-靶点网络
的拓扑属性进行分析,先筛选出度值(Degree)与介数
取得交集基因后通过Cytoscape 3.6.0 软件
构建
“成分-靶点”
网络,
String 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过BiocManager软件包对
温胆汤治疗高血压的交集靶点进行基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)
通路富集分析。结果:
获得药物-疾病交集基因94个。通过拓扑分析和MCC算法筛选出槲皮素、
靶 点 的 相 互 作 用 。 然 后 在 Tools 工 具 栏 中 的
NetworkAnalyzer 模块中选择 Analyze Network 功能对
药物进行拓扑分析。在 String 数据库(http://stringdb.
org/),通过交集得到的靶点构建蛋白质-蛋白质相互
作用(PPI)网络。物种设为“Homo sapiens”(人类),最
中医药通报 2021 年 2 月 第 20 卷 第 1 期
·38·
TCMJ,
Vol. 20,
No. 1,
Feb 2021
·方药研究·
基于网络药理学探讨温胆汤治疗
高血压的作用机制
● 李人亮 1 胡子毅 2▲
张 平2
摘 要 目的:
通过网络药理学方法探讨温胆汤治疗高血压的作用机制。方法:
通过中药系统药理学
[8]
·39·
低 相 互 作 用 阀 值 设 为 最 高 置 信 度 0.9“highest
confidence”,其 余 参 数 保 持 默 认 设 置 。 然 后 借 助
Cytoscape 3.6.0 软件中 CytoHubba 插件,依据 MCC 得
分进行核心(Hub)基因的筛选,选出得分排名前 10 位
“essential hypertension”为关键词进行检索,收集高血
压疾病的相关基因。
1. 3 网络构建与分析 将获取到的温胆汤活性成分
的预测靶点与高血压疾病相关靶点取交集,药物-疾
病的交集基因。利用 Cytoscape 3.6.0 软件构建温胆汤
的“成分-靶点”网络图,探究温胆汤活性成分和相关
接医疗费用达 366 亿元人民币[3]。根据 2010 年第六
次全国人口普查数据测算,我国高血压患病人数约为
2.45 亿[4]。高血压对我国造成了巨大的社会经济压力
和公共卫生负担,因此积极防治高血压具有重大意
其它轻微症状,正是由于高血压病缺乏典型的症状, 义。随着现代医学的飞速发展,尽管在血压的控制方
的基因。
痰浊中阻型高血压。有研究表明 ,温胆汤对心脏间
1. 4
质成纤维细胞的过度增殖有一定的抑制作用,对高血
基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
压的心肌纤维化有预防与逆转作用,但具体机制尚不
清楚,因此本研究运用网络药理学方法,探寻温胆汤
治疗高血压的关键活性成分和主要靶点通路。
1 材料与方法
1. 1
温胆汤治疗高血压疾病 PPI 网络
注: 靶点; 成分; 靶点; 枳实; 甘草; 茯苓; 陈皮;
半夏; 竹茹; 陈皮、甘草、枳实共有成分; 陈皮、枳实共有成分
药物-疾病交集靶点网络
基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和
基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
利用 R 软
件的 BiocManager 软件包对温胆汤治疗高血压的交集
1. 2 高 血 压 靶 点 筛 选 在 疾 病 基 因 数 据 库
(Genecard 数据库,https:///;OMIM 数
据库,https:///;Drugbank 数据库,https://www.
drugbank. ca/) 中 以 “hypertension”“hypertensive”
柚皮素、
川皮苷等关键活性成分10个,
STAT3、
JUN、
IL6等关键基因10个。通过GO分类富集分析确定了1837个条
目,
其中涉及生物过程的有1686条,
涉及细胞组成的有61条,
涉及分子功能的有90条。通过KEGG 通路富
集分析,
找到了126条信号通路。结论:
温胆汤中的关键成分可能为黄酮类化合物,
作用于STAT3、
使得其在人群中具有潜伏性,难以及时发现[1]。长期
面取得了显著的进步,但在缓解症状、改善血管内皮
的高血压可致使动脉粥样硬化,而动脉粥样硬化也会
促使血压进一步升高,两者互相关联、相互促进,最终
功能、保护靶器官等方面,
中医药治疗更具优势。
高血压病在中医学理论中归属于“眩晕”
“ 头痛”
导致心、脑、肾等重要靶器官功能障碍,其常见始
症有冠心病、脑卒中、急性主动脉综合征、外周动脉疾
终,其中火、饮、虚是病机关键,三者往往合并存在,交
病 。根据 2010 年全球疾病负担研究,中国每年由于
[2]
血压升高而导致的过早死亡人数高达 200 万,每年直
▲通讯作者 胡子毅,
男,
医学博士,
副主任中医师。从事心脑
第 20 卷
第1期
TCMJ,
Vol. 20,
No. 1,
Feb 2021
盛证、肝肾阴虚证、阴阳两虚证、肝火亢盛证。近年来
的研究显示痰湿证候在高血压病中颇为常见[7]。温胆
汤出自《三因极一病证方论·惊悸证治》,其组成包括
半夏、陈皮、竹茹、枳实、茯苓、甘草六味药物,具有理
气化痰,利胆和胃之功,临床常应用于治疗痰湿壅盛、
活性成分,预测靶标 2179 个,见表 1。将预测靶标去
除重复值后,得到 312 个靶点。表 2 中列举出了温胆
汤中靶点数排前 10 位的成分信息。
表1
中药
半夏
陈皮
茯苓
温胆汤
“中药-活性成分-预测靶标”
信息
活性成分
预测靶
(个)
标(个)
12
155
甘草
6
25
竹茹
5
89
中药
枳实
活性成分 预测靶标
(个)
(个)
基因进行 GO 分类富集和 KEGG 通路富集分析。依据
利用中
药系统药理学分析平台(TCMSP,.
cn/tcmsp.php),以陈皮、半夏、茯苓、甘草、枳实、竹茹
为关键词,对温胆汤中 6 味中药的全部化学成分进行
收集。若在 TCMSP 数据库中无法获取数据,则通过
TCMID 数 据 库(http://bidd. nus. edu. sg/group/TCMsite/
88
1530
107
129
18
251
表 2 温胆汤靶点数前 10 位成分信息
OB
靶点数
来源
(个)
中药
(%)
DL
quercetin(槲皮素)
154
甘草
46.43
0.28
kaempferol(山奈酚)
59
甘草
41.88
0.24
化学成分
naringenin(柚皮素)
97
陈皮
57
枳实
38
甘草
42.56
0.2
beta-sitosterol(β-谷固醇)
10
8
0.474,见图 2。利用 Cytoscape 软件进行 Hub 基因的
筛选,根据 MCC 算法筛选出 10 个得分最高的基因,即
STAT3、JUN、IL6、MAPK3、VEGFA、IL1B、AKT1、
TIMP1、IL4、IL2,说明这 10 个基因是温胆汤治疗高血
压的关键靶标,
见图 3。
图2
窍; 大病久病及肾,肾阴亏虚,水不涵木,脑窍失养。
武玉琳等人[6] 对 2001 年至 2017 年已发表的关于中医
药治疗原发性高血压的文献进行收集整理,筛选出有
效处方 1042 个,通过复杂网络分析,得出了 6 个最为
常见的中医证型,即肝阳上亢证、阴虚阳亢证、痰湿壅
中医药通报 2021 年 2 月
化合物名称
48
0.275
MOL005828 nobiletin(川皮苷)
25
0.100
MOL004328 naringenin(柚皮素)
MOL000422 kaempferol(山奈酚)
MOL000006 luteolin(木犀草素)
7-Methoxy-2-methyl isoflavone
43
23
Default.aspx)和化学专业数据库(Chemsitry Database,
/scdb/default.asp),以及检
索国内外相关文献获取相关信息。通过限制口服吸
收利用度(OB)≥30%、药物相似性(DL)≥0.18 对温胆汤
的活性成分筛选[9]。然后将筛选好的候选活性成分在
TCMSP 数据库和 SwissTarget Prediction 数据库(http://
swisstargetprediction.ch/)中收集蛋白靶点。最后通过
Uniprot 数据库(https:///)进一步将收集
到的蛋白靶点转化为对应的基因名称,获取与活性成
分作用的相关蛋白靶点(人源)。
温胆汤活性成分的获取及靶点的筛选
基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和
利用 R 软
件中的 BiocManager 软件包对上述交集基因进行 GO
和 KEGG 通路富集分析。
1. 5 温胆汤治疗高血压的成分及机制的文献验证
通过检索国内外文献,分析温胆汤治疗高血压的相关
成分与机制,为网络药理学所预测的结果提供文献
36
半夏
36.91
0.75
baicalein(三羟黄酮)
34
半夏
33.52
0.21
31
甘草
luteolin(木犀草素)
7-Methoxy-2-methyl isoflavone
(7-甲氧基-2-甲基异黄酮)
formononetin(刺芒柄花素)
isorhamnetin(异鼠李素)
Medicarpin(10-二甲氧基紫檀烷)
JUN、
IL6
等靶点,
可能通过调控AGE-RAGE、
流体剪应力与动脉粥样硬化、
TNF等信号通路从而发挥降压作用 。
关键词 网络药理学;温胆汤;高血压;作用机制
高血压是一种以体循环动脉压力升高为主要特
征的心血管综合征,是临床常见的慢性疾病,是心脑
血管疾病最常见但可逆的危险因素之一。大多数高
血压患者没有明显的症状,少数可出现头晕、头痛和
验证。
2 结果
2. 1
活性成分筛选及靶点筛选
本研究中半夏、陈
皮 、茯 苓 、甘 草 、枳 实 五 味 药 物 的 化 学 成 分 通 过
TCMSP 数据库获得,竹茹化合物的基本信息通过化
学专业数据库获得,通过限定 OB≥30% 和 DL≥0.18 进
行筛选,剔除未找到靶点的化学成分,共得到 236 个
(Betweenness)均大于平均值的化合物,然后依照度值
大小排序筛选出前 10 的化合物,见表 3。利用 String
数据库将映射所得的 94 个靶点制作成 PPI 网络,限
表3
No.
1
2
3
4
5
TCMSP 编号
TCMJ,
Vol. 20,
No. 1,
Feb 2021
度值前十的化合物
度值
介数
MOL000098 quercetin(槲皮素)
21
(7-甲氧基-2-甲基异黄酮)
13
0.022
7
MOL000392 formononetin(刺芒柄花素)
13
0.032
9
MOL000354 isorhamnetin(异鼠李素)
10
0.016
8
10
MOL002565 Medicarpin(10-二甲氧基紫檀烷)
MOL000497 licochalcone a(甘草查尔酮 A)
血管疾病的中西医结合防治研究。 E-mail:huziyi0829@163.
com
•
作 者 单 位 1. 江 西 中 医 药 大 学 附 属 医 院(江 西 南 昌
330006);
2. 江西中医药大学(江西 南昌 330004)
互为病[5]。肝阳上亢,肝火上炎,阳升风动,上冲脑窍;
脾胃虚弱,痰饮内生,肝风、肝阳夹痰浊之邪上冲清
TCMID数据库、
化学专业数据库、
SwissTarget Prediction 数据库和Uniprot数据
库获取并筛选温胆汤活性成分及靶点;
通过Genecard、
OMIM、
Drugbank 数据库收集高血压疾病的相关基
因。将所得到的温胆汤的药物靶点与高血压相关靶点进行映射,
35
甘草
31
甘草
59.29
36.16
69.67
49.6
49.22
0.21
0.25
0.21
0.31
0.34
中医药通报 2021 年 2 月 第 20 卷 第 1 期
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2. 2
疾病靶点筛选结果
通过 Genecard 数据库检索
出高血压疾病相关基因 735 个,OMIM 数据库中获得
97 个基因,Drugbank 数据库中获得 16 个基因,去除重
复基因后,
最后获得 816 个高血压疾病基因。
2. 3
网络构建与结果分析
将所得到的温胆汤的药
物靶点与高血压相关靶点进行映射,得到 94 个共有
靶点,对应温胆汤活性成分 142 个。利用 Cytoscape
软件构建药物-靶点网络,见图 1。对药物-靶点网络
的拓扑属性进行分析,先筛选出度值(Degree)与介数
取得交集基因后通过Cytoscape 3.6.0 软件
构建
“成分-靶点”
网络,
String 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过BiocManager软件包对
温胆汤治疗高血压的交集靶点进行基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)
通路富集分析。结果:
获得药物-疾病交集基因94个。通过拓扑分析和MCC算法筛选出槲皮素、
靶 点 的 相 互 作 用 。 然 后 在 Tools 工 具 栏 中 的
NetworkAnalyzer 模块中选择 Analyze Network 功能对
药物进行拓扑分析。在 String 数据库(http://stringdb.
org/),通过交集得到的靶点构建蛋白质-蛋白质相互
作用(PPI)网络。物种设为“Homo sapiens”(人类),最
中医药通报 2021 年 2 月 第 20 卷 第 1 期
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TCMJ,
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No. 1,
Feb 2021
·方药研究·
基于网络药理学探讨温胆汤治疗
高血压的作用机制
● 李人亮 1 胡子毅 2▲
张 平2
摘 要 目的:
通过网络药理学方法探讨温胆汤治疗高血压的作用机制。方法:
通过中药系统药理学
[8]
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低 相 互 作 用 阀 值 设 为 最 高 置 信 度 0.9“highest
confidence”,其 余 参 数 保 持 默 认 设 置 。 然 后 借 助
Cytoscape 3.6.0 软件中 CytoHubba 插件,依据 MCC 得
分进行核心(Hub)基因的筛选,选出得分排名前 10 位
“essential hypertension”为关键词进行检索,收集高血
压疾病的相关基因。
1. 3 网络构建与分析 将获取到的温胆汤活性成分
的预测靶点与高血压疾病相关靶点取交集,药物-疾
病的交集基因。利用 Cytoscape 3.6.0 软件构建温胆汤
的“成分-靶点”网络图,探究温胆汤活性成分和相关
接医疗费用达 366 亿元人民币[3]。根据 2010 年第六
次全国人口普查数据测算,我国高血压患病人数约为
2.45 亿[4]。高血压对我国造成了巨大的社会经济压力
和公共卫生负担,因此积极防治高血压具有重大意
其它轻微症状,正是由于高血压病缺乏典型的症状, 义。随着现代医学的飞速发展,尽管在血压的控制方
的基因。
痰浊中阻型高血压。有研究表明 ,温胆汤对心脏间
1. 4
质成纤维细胞的过度增殖有一定的抑制作用,对高血
基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
压的心肌纤维化有预防与逆转作用,但具体机制尚不
清楚,因此本研究运用网络药理学方法,探寻温胆汤
治疗高血压的关键活性成分和主要靶点通路。
1 材料与方法
1. 1
温胆汤治疗高血压疾病 PPI 网络
注: 靶点; 成分; 靶点; 枳实; 甘草; 茯苓; 陈皮;
半夏; 竹茹; 陈皮、甘草、枳实共有成分; 陈皮、枳实共有成分
药物-疾病交集靶点网络
基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和
基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
利用 R 软
件的 BiocManager 软件包对温胆汤治疗高血压的交集
1. 2 高 血 压 靶 点 筛 选 在 疾 病 基 因 数 据 库
(Genecard 数据库,https:///;OMIM 数
据库,https:///;Drugbank 数据库,https://www.
drugbank. ca/) 中 以 “hypertension”“hypertensive”
柚皮素、
川皮苷等关键活性成分10个,
STAT3、
JUN、
IL6等关键基因10个。通过GO分类富集分析确定了1837个条
目,
其中涉及生物过程的有1686条,
涉及细胞组成的有61条,
涉及分子功能的有90条。通过KEGG 通路富
集分析,
找到了126条信号通路。结论:
温胆汤中的关键成分可能为黄酮类化合物,
作用于STAT3、
使得其在人群中具有潜伏性,难以及时发现[1]。长期
面取得了显著的进步,但在缓解症状、改善血管内皮
的高血压可致使动脉粥样硬化,而动脉粥样硬化也会
促使血压进一步升高,两者互相关联、相互促进,最终
功能、保护靶器官等方面,
中医药治疗更具优势。
高血压病在中医学理论中归属于“眩晕”
“ 头痛”
导致心、脑、肾等重要靶器官功能障碍,其常见始
症有冠心病、脑卒中、急性主动脉综合征、外周动脉疾
终,其中火、饮、虚是病机关键,三者往往合并存在,交
病 。根据 2010 年全球疾病负担研究,中国每年由于
[2]
血压升高而导致的过早死亡人数高达 200 万,每年直
▲通讯作者 胡子毅,
男,
医学博士,
副主任中医师。从事心脑
第 20 卷
第1期
TCMJ,
Vol. 20,
No. 1,
Feb 2021
盛证、肝肾阴虚证、阴阳两虚证、肝火亢盛证。近年来
的研究显示痰湿证候在高血压病中颇为常见[7]。温胆
汤出自《三因极一病证方论·惊悸证治》,其组成包括
半夏、陈皮、竹茹、枳实、茯苓、甘草六味药物,具有理
气化痰,利胆和胃之功,临床常应用于治疗痰湿壅盛、
活性成分,预测靶标 2179 个,见表 1。将预测靶标去
除重复值后,得到 312 个靶点。表 2 中列举出了温胆
汤中靶点数排前 10 位的成分信息。
表1
中药
半夏
陈皮
茯苓
温胆汤
“中药-活性成分-预测靶标”
信息
活性成分
预测靶
(个)
标(个)
12
155
甘草
6
25
竹茹
5
89
中药
枳实
活性成分 预测靶标
(个)
(个)
基因进行 GO 分类富集和 KEGG 通路富集分析。依据
利用中
药系统药理学分析平台(TCMSP,.
cn/tcmsp.php),以陈皮、半夏、茯苓、甘草、枳实、竹茹
为关键词,对温胆汤中 6 味中药的全部化学成分进行
收集。若在 TCMSP 数据库中无法获取数据,则通过
TCMID 数 据 库(http://bidd. nus. edu. sg/group/TCMsite/
88
1530
107
129
18
251
表 2 温胆汤靶点数前 10 位成分信息
OB
靶点数
来源
(个)
中药
(%)
DL
quercetin(槲皮素)
154
甘草
46.43
0.28
kaempferol(山奈酚)
59
甘草
41.88
0.24
化学成分
naringenin(柚皮素)
97
陈皮
57
枳实
38
甘草
42.56
0.2
beta-sitosterol(β-谷固醇)
10
8
0.474,见图 2。利用 Cytoscape 软件进行 Hub 基因的
筛选,根据 MCC 算法筛选出 10 个得分最高的基因,即
STAT3、JUN、IL6、MAPK3、VEGFA、IL1B、AKT1、
TIMP1、IL4、IL2,说明这 10 个基因是温胆汤治疗高血
压的关键靶标,
见图 3。
图2
窍; 大病久病及肾,肾阴亏虚,水不涵木,脑窍失养。
武玉琳等人[6] 对 2001 年至 2017 年已发表的关于中医
药治疗原发性高血压的文献进行收集整理,筛选出有
效处方 1042 个,通过复杂网络分析,得出了 6 个最为
常见的中医证型,即肝阳上亢证、阴虚阳亢证、痰湿壅
中医药通报 2021 年 2 月
化合物名称
48
0.275
MOL005828 nobiletin(川皮苷)
25
0.100
MOL004328 naringenin(柚皮素)
MOL000422 kaempferol(山奈酚)
MOL000006 luteolin(木犀草素)
7-Methoxy-2-methyl isoflavone
43
23
Default.aspx)和化学专业数据库(Chemsitry Database,
/scdb/default.asp),以及检
索国内外相关文献获取相关信息。通过限制口服吸
收利用度(OB)≥30%、药物相似性(DL)≥0.18 对温胆汤
的活性成分筛选[9]。然后将筛选好的候选活性成分在
TCMSP 数据库和 SwissTarget Prediction 数据库(http://
swisstargetprediction.ch/)中收集蛋白靶点。最后通过
Uniprot 数据库(https:///)进一步将收集
到的蛋白靶点转化为对应的基因名称,获取与活性成
分作用的相关蛋白靶点(人源)。
温胆汤活性成分的获取及靶点的筛选
基因本体论(GO)分类富集分析及京都基因和
利用 R 软
件中的 BiocManager 软件包对上述交集基因进行 GO
和 KEGG 通路富集分析。
1. 5 温胆汤治疗高血压的成分及机制的文献验证
通过检索国内外文献,分析温胆汤治疗高血压的相关
成分与机制,为网络药理学所预测的结果提供文献
36
半夏
36.91
0.75
baicalein(三羟黄酮)
34
半夏
33.52
0.21
31
甘草
luteolin(木犀草素)
7-Methoxy-2-methyl isoflavone
(7-甲氧基-2-甲基异黄酮)
formononetin(刺芒柄花素)
isorhamnetin(异鼠李素)
Medicarpin(10-二甲氧基紫檀烷)
JUN、
IL6
等靶点,
可能通过调控AGE-RAGE、
流体剪应力与动脉粥样硬化、
TNF等信号通路从而发挥降压作用 。
关键词 网络药理学;温胆汤;高血压;作用机制
高血压是一种以体循环动脉压力升高为主要特
征的心血管综合征,是临床常见的慢性疾病,是心脑
血管疾病最常见但可逆的危险因素之一。大多数高
血压患者没有明显的症状,少数可出现头晕、头痛和
验证。
2 结果
2. 1
活性成分筛选及靶点筛选
本研究中半夏、陈
皮 、茯 苓 、甘 草 、枳 实 五 味 药 物 的 化 学 成 分 通 过
TCMSP 数据库获得,竹茹化合物的基本信息通过化
学专业数据库获得,通过限定 OB≥30% 和 DL≥0.18 进
行筛选,剔除未找到靶点的化学成分,共得到 236 个
(Betweenness)均大于平均值的化合物,然后依照度值
大小排序筛选出前 10 的化合物,见表 3。利用 String
数据库将映射所得的 94 个靶点制作成 PPI 网络,限
表3
No.
1
2
3
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5
TCMSP 编号
TCMJ,
Vol. 20,
No. 1,
Feb 2021
度值前十的化合物
度值
介数
MOL000098 quercetin(槲皮素)
21
(7-甲氧基-2-甲基异黄酮)
13
0.022
7
MOL000392 formononetin(刺芒柄花素)
13
0.032
9
MOL000354 isorhamnetin(异鼠李素)
10
0.016
8
10
MOL002565 Medicarpin(10-二甲氧基紫檀烷)
MOL000497 licochalcone a(甘草查尔酮 A)
血管疾病的中西医结合防治研究。 E-mail:huziyi0829@163.
com
•
作 者 单 位 1. 江 西 中 医 药 大 学 附 属 医 院(江 西 南 昌
330006);
2. 江西中医药大学(江西 南昌 330004)
互为病[5]。肝阳上亢,肝火上炎,阳升风动,上冲脑窍;
脾胃虚弱,痰饮内生,肝风、肝阳夹痰浊之邪上冲清