利用Solexa测序技术鉴定苋菜试管开花过程中的miRNAs

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ＬＵＳｅｇａ，ＬＮＹｕｉｇ，ＣＨＥＮＸｉｏｏｇ，ＬＡＩＺｈｎｘｏｇＩｈｎｅｉＩｌｎａｄｎｏｇｉｎ
ＩｓｉｔｏＨｏｔｕｔｒｌＢｏｃｎｌｙｎｔｕｅｆｒｃｌａｉｔｈｏｏ，ｔｉｕｅｇｍｇｉｕｕｅａｄＦｒｓｙＵｉｅｉ，Ｆｚｏ，Ａｒｈｒｎｏｅｔｎｖｒｔｃｒｓｙｕｈｕｉ５０２，Ｃｉｏ３００ｎｈｎａ
苋菜ｍＲＡ．构成２ｉＮ０个家族．不同家族间成员数量存在巨大差异：苋菜保守ｍｉＮ的长度主要集中在２ｔＲＡ１ｎ
和２ｎ：另外总共获得ｌ０ｔ４个候选的新ｍＲＡ．其中有８ｍｉＮｉＮ个ＲＡ含单个基因座．另６ｍＲＡ具备多个基个ｉＮ
谢途径数据库对靶基因进行功能注释和分类。结果显示：共得到ｓＮｎｑｅ列５４７８ＲＡＵｉ序ｕ５６条，其中与拟南４
芥基因组完全匹配有２９７５６条，仅仅占Ｏ１；ｍＲＡ主要分布在１ｔ２ｔ间，其中长度为２ｔ列数．％５ｉＮ８～５ｎ之ｎ４ｎ序量最多；苋菜试管开花过程中ｍＲＡ的表达丰度存在明显差异，主要低丰度表达：总共鉴定了２５个已知的ｉＮ３
ＡｂｔａｔＩｈｓｓｕｙｏｅｎｏｓｒｅＲＮＡｓｗｅｅｆｔｒｄａｄｄｎｉｃｔｄｂｏｅａｓｑｅｃｎｕｉｇｓｒｃｎｔｉｔｄ．ｎｖｌａｄｃｎｅｖｄｍｉｒｌｅｎｉｅｔｉａｅｙＳｌｘｅｕｎｉｇｄｒｉｅｆｎ
ｖｔｏｒｇｏｍａａｔｕ．ａｄｕｔｅａｇｔｆｎｔｎａａｙｉａｅｎｔｅＧ０ａａａｅｎｈＫＧｉｏｆｗｅｉｆａｒｎｈｓｎａｆｒｒｔｒｅｕｃｉｎｌｓｓｓｄｏｈｄｔｂｓａｄｔｅＥＧｒｌｎｈｏｂｐｔｗａａａａｅｗｒｄ．Ｔｅｒｓｌｓｏｄｈｔｈｒｒ５８ｎｑｅｓｑｅｃｓａｄ７５６０５１ａｈｙｄｔｂｓｅｅｍａｅｈｅｕｔｈｗｅｔａ：ｔｅｅｗｅｅ５４７４６ｕｉｕｅｕｎｅ．ｎ２９（．ｓ
热带作物学报２１，３（）２６１００１２７：１９ — ３３
ＣｈｎｓｏｒａｆｒｐｃｌＣｏｓｉｅｅＪｕｎｌｏｏｉａｒｐＴ
利用Ｓｌａ测序技术鉴定苋菜试管ｏｅｘ开花过程中的ｍｉＮｓＲＡ
因座：Ｉ个候选的ｍＲＡ预测到了靶基因，总共对应着约４１ｉＮ６个基因符合靶标特征。这些靶标参与植物生物体
的各个发育进程，在苋菜试管开花过程中对生物过程、细胞组分及分子功能起到重要作刚。
刘生财，林玉玲，陈晓东，赖钟雄
福建农林大学园艺植物生物工程研究所．福建福州３００５０２
摘要利用Ｓｌｘｏｅａ测序技术对苋菜试管开花过程中的ｍｉＮｓ行筛选和鉴定．使用ＧＲＡ进Ｏ数据库和ＫＧ代ＥＧ
关键词
苋菜；试管开花；ｍＲＡ；ｓｌａ测序ｉＮｏｅｘ
Ｓ３．６６４文号
ＮｏｅｎｎｅｖｄｍｉｖｌａｄＣｏｓｒｅＲＮＡｓＩｅｉｃｔｏｕｒｎｇｉｉｏｄｎｔｆａｉｎｄｉｖｔｉｎｒＦｌｗｅｉｆＡｍａａｔｕｓｂｏｅａＳｅｕｅｉｇｏｒｎｇｏｒｎｈｙＳｌｘｑｎｃｎ
％）ｆｔｅｎｑｅｅｕｎｅｗｒｄｓｉｕｅｃｏｓｉｅｅｔｃｒｍｏｏｓｆＡｒｂｄｐｉｈｌｎ．ＴｅｌｎｔｏｏｈｕｉｕｓｑｅｃｓｅｅｉｔｂｔｄａｒｓｄｆｒｎｈｏｓｍｅｏａｉｏｓｓａｉａｒｉｔａｈｅｇｈｆｓＡｓｗａｍａｎｙｉｔｂｔｄａｇｎｆｍ１ｎｔ２ｔａｄ４ｔｅｎｔｅｒｄｍｉａｔＴｅｘｒｓｉｎＲＮｓｉｌｄｓｉｕｅｒｎｉｇｒｒｏｔｏ５ｎ．ｎ２ｎｂｉｇｈｐｅｏｎｎ．ｈｅｐｅｓｏ８ｐｔｒｓｆｄｆｒｎｎｑｅＲＮＡｓａｉｄｒｓｉａｌ．ａｄａｔｎｏｉｅｅｔｕｉｕｓｅｉｖｒｄａｔｌｅｃｙｎｍｏｔｆｔｅｓｏｈｍｗｒａｔｅＯｌｖｌ；２５ｃｎｅｖｄｅｅｔｈｌＷｅｅｓ３ｏｓｒｅｍｉＡｓｈｄｂｅｄｎｉｅ．ｗｈｃｏｓｓｅｆ２ａｌｓｈｕｅｆｔｅｍｅｅｓｖｒｄｄａｔａｌｍｏｇＲＮａｅｎｉｅｔｄｉｆｉｈｃｎｉｄｏ０ｆｍｉｅ．Ｔｅｎｍｂｒｏｈｍｂｒａｅｒｓｉｌａｎｔｉｉｃｙｄｆｒｎａｌｓｈｅｇｈｆｍｏｔｃｎｅｖｄｍｉｉｅｅｔｆｍｉｅ．ＴｅｌｎｔｏｓｏｓｒｅＲＮＡｓｗｓ１ｎｎ０ｎ．Ｍｏｅｖｒ１ｏｅｍｉｆｉａ２ｔａｄ２ｔｒｏｅ．４ｎｖｌＲＮＡｓｗｒｅｅｐｅｉｔｄｆｔｅｗｔｉｇｅｌＣＳａｄｔｅｒｓｗｉｌｐｅｌｃ．Ａｂｕ６ｔｒｅｓｏｌｎｖｌｍｉＮＡｓｗｒｒｄｃｅ。８ｏｈｍｉｓｎｌＯＵｎｈｅｔｔｍｕｔｌｏｉｈｈｉｏｔ４ａｇｔｆ１ｏｅＲｅｅａｓｐｅｉｔｄｌｏｒｄｃｅ．ＴｅｅａｇｔｒｖｄｄｎｉｈｓｎｏｈｓｔｒｅｓｏｉｅｉｓｔｐｇｉｔｍｉＲＮＡｉｇｎｓｓｎｅｐｅｓｏｄｒｇｌｎｄｖｌｐｎ，ｂｏｅｅｉａｄｘｒｓｉｎｕｉｐａｔｅｅｏｍｅｔｎ