表3在Genebank中同部分标准菌株ITS序列同源性比较结果
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
将0712-2序列在NCB I网站中使用blast程序在Genebank /EMBL /DDBJ基因库中进行同源性搜索,所得结果中相似性最高的前10个标准菌株比较结果见表1。
从表1可见,J0712-2与雅致放射状毛霉ITS序列相似性高达99% ;且全部为雅致放射状毛霉菌株。
因此,确定毛霉J0712-2为雅致放射状毛霉。
表1在Gene bank中同部分标准菌株ITS序列同源性比较结果
Tab. 1The homology comparison result of ITS sequence with part standard strain
菌株名称
菌株号
序列号
相似性
Actinomucor elegans strain
ATCC 52370
148578147
99%
Actinomucor elegans strain
ATCC 46123
148578145
99%
Actinomucor elegans strain
Ac-116
46325826
99%
Actinomucor elegans strain ATCC 22963 148578144
99%
Actinomucor elegans strain CBS 111562
32170776
99%
Actinomucor elegans strain SCD12
237769600
99%
Actinomucor elegans strain UAMH 10931 209363440
99%
Mucor mucedo strain MHC-7-10
121144330
99%
Mucor mucedo strain
MHC-7-1
121144329
99%
Actinomucor elegans strain
Ac-3
46325824
99%
系统发育树构建综合同源性比对结果和雅致放射毛霉菌株在真菌发育系统中的位置,从Gene bank中选择10个标准菌株的ITS序列,结果见表2;应用MEGA4软件中Phylogeny程序绘制系统发育树,结果见图1。
表2所使用的ITS序列在Gene bank中的登陆号
Tab.2The practical ITS sequence g i in Gene bank
菌株名称
菌株号
序列gi号
Actinomucor elegans strain
ATCC 52370
148578147
Actinomucor elegans strain
UAMH 10931
209363440
Ambomucor seriatoinflatus strain SmD71-1
311404309
Actinomucor elegans
ATCC 22963
148578144
Mucor circinelloides strain CBS 195.68
75266447
Mucor circinelloides isolate
R6
261277547
Mucor hiemalis f. luteus strain FSU 6171
175940707
Mucor mucedo strain
WA0000017113
226354725
Mucor plumbeus strain
A162
146218316
Fungal sp.
ENTOK073 O-3
223558157
Pilaira sp.
Pi-5
146706170
图1 结果表明,0712-2菌株与雅致放射毛霉菌株的遗传距离比其他菌株小,且J0712-2菌株和雅致放射毛霉菌株在一个分支中。
由此进一步证明,J0712-2 菌株为雅致放射毛霉Actinom ucor elegans。
图1系统发育树。