人感染H7N9禽流感病毒PCR检测操作程序
pcr检查操作流程
pcr检查操作流程PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种用于复制DNA片段的技术,它可以在短时间内扩增出数百万份目标DNA片段。
PCR检查操作流程是一个非常重要的实验步骤,它需要严格的操作和精确的控制,以确保实验结果的准确性和可靠性。
首先,进行PCR检查前需要准备好所有必要的试剂和设备,包括PCR试剂盒、PCR仪、PCR管、DNA模板、引物等。
接着,将PCR 试剂盒中的Master Mix均匀混合,并分装到每个PCR管中。
然后,加入DNA模板和引物到PCR管中,轻轻摇匀混合。
接下来是PCR反应的温度循环步骤。
首先是变性步骤,将PCR 管放入PCR仪中,加热至95°C,使DNA双链解旋成两条单链。
然后是退火步骤,降温至55-65°C,使引物与目标DNA片段结合。
最后是延伸步骤,加热至72°C,让DNA聚合酶在引物的引导下合成新的DNA链。
PCR反应完成后,需要进行PCR产物的分析和检测。
可以通过琼脂糖凝胶电泳或实时荧光定量PCR等方法来检测PCR产物的数量和大小。
最后,根据实验设计和研究目的,对PCR结果进行解读和分析,得出结论并撰写实验报告。
在进行PCR检查操作流程时,需要注意以下几点:首先是严格控制实验条件,避免污染和误操作对实验结果的影响;其次是准确计量试剂和DNA模板,确保PCR反应的准确性和稳定性;最后是及时记录实验数据和结果,以备后续分析和验证。
总的来说,PCR检查操作流程是一个复杂而重要的实验步骤,需要熟练的操作技巧和严格的实验控制,只有这样才能保证PCR实验的准确性和可靠性,为科研工作提供有力的支持。
PCR技术的广泛应用已经在许多领域取得了重要的成果,如医学诊断、疾病治疗、基因工程等,为人类健康和生活质量的提高做出了重要贡献。
PCR检查操作流程的规范化和标准化将进一步促进PCR技术的发展和应用,为科学研究和医学实践提供更多的可能性和机会。
人感染H7N9禽流感采样以及实验室检测技术
病原学检测
• (1)甲型流感病毒抗原筛查。呼吸道标本甲 型流感病毒抗原快速检测阳性。但仅可作为初 筛实验。 • (2)核酸检测。对患者呼吸道标本采用real time PCR(或RT-PCR)检测H7N9禽流感病。 • (4)动态检测双份血清H7N9禽流感病毒特异 性抗体水平呈4倍或以上升高。
样品采集/接收
• 对于人禽流感,咽拭子比鼻拭子检出率高。病毒滴度:气 管吸取物>咽拭子>鼻拭子,粪便中可能可检出。 • 标本送至实验室后,立即进行处理,避免反复冻融。将原 始标本分为三份,取一份进行检测,其余保存在-70 ℃或 -70 ℃以下,短时间保存在4℃ ,不要保存在-20 ℃ 。
• 在生物安全二级实验室从事相关实验室活动时,操作者应 穿戴眼罩、N95及以上水平的医学防护口罩、防护服、帽 子、双层乳胶手套、鞋套等个体防护装备;实验活动应当 有2名以上的工作人员共同进行。
•
•
结果判断
• 4 .所有的临床标本RNA 检测都必须为阳性,且CT 值在35.0 以内才足可以证明样品的质量是可接受的。如果临床标本 RNA 检测为阴性,则可能是以下原因: • 4.1 临床样本核酸提取不正确导致RNA 的丢失或临床标本 里存在大量的RT-PCR 反应抑制剂。 • 4.2 样品中人细胞成分太少,以至于不能检测到。 • 4.3 反应液配制错误或程序设置错误。
呼吸道灌洗液:
将收集器头部从鼻孔或气管插口处插入气管(约30cm深 处),注入5ml生理盐水,接通负压,旋转收集器头部并缓 慢退出;收集抽取的粘液,并用采样液涮洗收集器1次(可 用小孩导尿管接在50ml注射器上来代替收集)。
禽流感环境标本采集
• 采集粪便时一定要采集新鲜的(一般较湿润)粪 便,太陈旧(干燥)的粪便对我们的检测意义不 大; • 在养殖户家中采集粪便标本时,由于多鸡鸭混养 难以分辨鸭粪和鸡粪,最好能找到鸭子刚排泄的 新鲜粪便;
人感染H7N9禽流感采样以及实验室检测技术
用真空负压采血管采集血液标本5ml,室温静置30分钟, 1500~2000rpm离心10分钟,收集血清于2ml无菌螺口塑料管 中。
样本采集方法 (5)
鼻咽抽取物或呼吸道抽取物:
用与负压泵相连的收集器从鼻咽部抽取粘液或从气管抽取 呼吸道分泌物。先将收集器头部插入鼻腔或气管,接通负 压,旋转收集器头部并缓慢退出;收集抽取的粘液,并用 采样液3ml涮洗收集器1次(可用小孩导尿管接在50ml注射 器上来代替收集)。
注:应当尽量采集病例发病早期的呼吸道标本(尤其是下呼 吸道标本)和发病7天内急性期血清以及间隔2-4周的恢复 期血清。
要求 呼吸道标本:发病早期采样,每份不少于3ml 血清标本每份分为2管,每管不少于0.5ml
样本采集方法 (1)
咽拭子:左手用压舌板压住患者舌头,右手用2根聚丙烯纤
维头的塑料杆拭子同时檫拭双侧咽扁桃体及咽后壁,应避免 接触舌头,将拭子头浸入含3ml采样液的管中,弃去尾部,旋 紧管盖。
胞分类计数减少; 4. 不能从临床或实验室角度诊断为常见病原所
致的肺炎。
• 包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物、咽漱 液和鼻洗液);
◆下呼吸道标本(如气管吸取物、肺洗液、肺组织标本);
◆ 血清标本;
◆ 如病人死亡,应当尽可能说服家属同意尸检,及时进行尸 体解剖,采集组织(如肺组织、气管、支气管组织)标本;
样本采集方法 (4)
鼻洗液 患者取坐姿,头微后仰,用移液管将5 ml生理盐水注入一侧鼻孔,嘱患 者同时发K音以关闭咽腔。然后让患者低头使生理盐水流出,用平皿或烧 杯收集洗液。重复此过程洗两侧鼻孔
漱口液 用10 ml生理盐水漱喉。漱时让患者头部微后仰,发“噢”声,让生理
盐水在咽部转动。然后,用50ml的无菌螺口塑料管收集洗液。
人感染H7N9禽流感“监测病例”报告方法
人感染H7N9禽流感“监测病例”报告方法第一篇:人感染H7N9禽流感“监测病例”报告方法人感染H7N9禽流感“监测病例”报告方法一、人感染H7N9监测病例定义监测病例要求同时具备以下4项条件:(1)发热(腋下体温≥38℃);(2)具有肺炎的影像学特征;(3)发病早期白细胞总数降低或正常,或淋巴细胞分类计数减少;(4)不能从临床或实验室角度诊断为常见病原所致肺炎。
二、发现与报告各级各类医疗机构发现符合人感染H7N9禽流感监测定义的病例后,须于24小时内进行网络直报。
报告疾病名称选择“其他传染病”中“H7N9监测病例”。
尚不具备网络直报条件的医疗机构,应当于24小时内以最快的通讯方式(电话、传真等)向当地县级疾病预防控制机构报告,并寄出传染病报告卡,县级疾病预防控制机构在接到报告后立即进行网络直报。
“H7N9监测病例”病例类型选择为“临床诊断”。
“H7N9监测病例”一旦诊断为“人感染H7N9禽流感疑似病例与确诊病例”,要求对相应的报告卡进行订正。
第二篇:医院感染病例监测报告制度医院感染病例监测报告制度1、院感办应对住院病人开展医院感染病例感染监测,以掌握本院医院感染发病特点,为医院感染控制提供科学依据。
2、医院感染病例由临床主管医生按照《医院感染诊断标准》进行初步诊断,及时进行病原微生物检测,并且保证感染病例病原微生物生物检测率>50%。
科室监控医生认真如实记录本科室抗菌药物使用情况、医院感染登记表以及相关消毒情况。
3、诊断明确的感染病例,应于24小时内认真填报“医院感染病例报告卡”报告院感办,同时在出院病历首页院内感染名称栏内写医院感染疾病名称。
4、感控科应每月月进行归类整理,并将结果反馈相关部门。
5、确诊为传染病的医院感染病例,应按《中华人民共和国传染病防治法》的有关规定进行报告。
6、临床医护人员发现有医院感染流行趋势时,立即向院感办报告,积极调查发病原因,寻找感染源和途径,控制蔓延,采取有效控制措施;确定为医院感染暴发时,按照《医院感染暴发报告及处置管理规范》进行上报。
《人感染H7N9禽流感医院感染预防与控制技术指南(2021年版)》
《人感染H7N9禽流感医院感染预防与控制技术指南(2021年版)》人感染h7n9禽流感是由h7n9亚型禽流感病毒引起的急性呼吸道传染病。
自2021年2月以来,上海市、安徽省、江苏省先后发生不明原因重症肺炎病例,其中确诊人感染h7n9禽流感3例,2例死亡。
3例均为散发病例,目前尚未发现3例病例间有流行病学关联。
一、病原学禽流感病毒属于正黏病毒科甲型流感病毒属于。
禽甲型流感病毒颗粒呈圆形多形性,其中球形直径80~120nm,存有囊膜。
基因组为分节段单股负链rna。
依据其外膜血凝素(h)和神经氨酸酶(n)蛋白抗原性相同,目前可以分成16个h亚型(h1~h1⑴和9个n亚型(n1~n9)。
甲型流感病毒除病毒感染禽外,还可以病毒感染人、猪、马、水貂和海洋哺乳动物。
可以病毒感染人的禽流感病毒亚型为h5n1、h9n2、h7n7、h7n2、h7n3,此次报导的为人病毒感染h7n9禽流感病毒。
该病毒为新型重配病毒,其内部基因源自于h9n2禽流感病毒。
禽流感病毒广泛对热脆弱,对低温抵抗力较强,65℃冷却30分钟或煮熟(100℃)2分钟以上可以灭活。
病毒在较低温度粪便中可以存活1周,在4℃水中可以存活1个月,对酸性环境存有一定抵抗力,在ph4.0的条件下也具备一定的存活能力。
在存有甘油存有的情况下可以维持活力1年以上。
二、流行病学(一)传染源。
目前尚不明晰,根据以往经验及本次病例流行病学调查,推断可能将为随身携带h7n9禽流感病毒的禽类及其分泌物或排泄物。
(二)传播途径。
经呼吸道传播,也可通过密切接触感染的禽类分泌物或排泄物等被感染,直接接触病毒也可被感染。
现尚无人与人之间传播的确切证据。
(三)极易感人群。
目前未有清楚证据表明人类对h7n9禽流感病毒极易感。
现有诊断病例均为****。
(四)高危人群。
现阶段主要是从事禽类养殖、销售、宰杀、加工业者,以及在发病前1周内接触过禽类者。
三、临床表现根据流感的潜伏期及现有h7n9禽流感病毒感染病例的调查结果,潜伏期一般为7天以内。
人感染H7N9禽流感诊断报告流程
人感染H7N9禽流感诊断报告流程一、流行病学调查流行病学调查是诊断人感染H7N9禽流感的第一步,主要目的是了解病例的相关信息,如接触禽类及禽类排泄物的情况、旅游史、近期接触史等。
流行病学调查有助于确定病例是否存在暴露的风险因素,进一步指导诊断过程。
二、临床表现评估对于疑似病例,医生需对其进行详细的临床评估。
人感染H7N9禽流感的症状与其他呼吸道感染病症相似,包括高热、咳嗽、咳痰、头痛、肌肉酸痛、流鼻涕、咽痛、乏力等。
但H7N9禽流感的特点是病情进展迅速,容易导致重症甚至死亡。
三、实验室检测在临床表现评估的基础上,通过实验室检测来确认人感染H7N9禽流感。
主要的实验室检测方法包括呼吸道标本分离病毒和测定病毒感染相关的生物标志物。
常见的呼吸道标本有咽拭子、鼻拭子、痰液、呼吸道分泌物等。
分离病毒可通过病毒培养、免疫荧光试验、RT-PCR等方法进行。
此外,还可以通过血清学检测尼群诺酮结合试验等,测定抗原和抗体水平。
四、病例报告一旦诊断出病例为H7N9禽流感感染,医生应立即向当地卫生部门进行报告。
涉及到人感染H7N9禽流感等副职医学事故的报告、处理和追踪管理等,都需要严格按照当地卫生部门的要求操作。
五、鉴别诊断确认人感染H7N9禽流感的临床症状与其他冠状病毒感染病症相似,如人感染SARS、MERS等。
因此,在诊断H7N9禽流感之前,需要排除其他疾病的可能性。
此外,应与常见的流感、金黄色葡萄球菌感染等进行鉴别诊断。
总之,诊断人感染H7N9禽流感的流程包括流行病学调查、临床表现评估、实验室检测、病例报告和鉴别诊断确认等。
及时、准确地诊断人感染H7N9禽流感对于疫情的防控以及患者的治疗具有重要意义。
H7N9禽流感病毒核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)说明书
H7N9禽流感病毒核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)说明书【产品名称】通用名称:H7N9禽流感病毒核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法)英文名称:Detection Kit for Avian Influenza Virus Subtype H7N9 RNA (PCR-Fluorescence Probing)【包装规格】大包装,48反应/盒【预期用途】流感病毒可分为甲(A)、乙(B)、丙(C)三型。
其中,甲型流感依据流感病毒血凝素蛋白(HA)的不同可分为1-16种亚型,根据病毒神经氨酸酶蛋白(NA)的不同可分为1-9种亚型,HA不同亚型可以与NA的不同亚型相互组合形成不同的流感病毒。
而禽类特别是水禽是所有这些流感病毒的自然宿主,H7N9禽流感病毒是其中的一种。
H7N9流感病毒既可以感染禽类,也可以感染人。
人感染H7N9禽流感会出现严重肺炎,症状包括发烧、咳嗽、呼吸困难等。
本试剂盒适用于检测呼吸道样本、血清、肺组织等样本中H7N9禽流感病毒RNA,可用于该病毒感染的实验室诊断和宿主动物的监控。
检测结果仅供研究,不用于临床诊断。
【检验原理】本试剂盒基于实时荧光PCR技术,分别选取H7N9禽流感病毒的HA 基因和NA基因保守区作为扩增靶区域,设计特异性引物探针,通过一步法实时荧光PCR体系扩增对H7N9禽流感病毒进行定性检测。
反应体系中除特异性引物和特异性荧光探针外,还配以对应的PCR反应Buffer、逆转录酶、Hot-Start Taq酶、核苷酸单体(dNTPs)、Mg2+等成分,可实现对H7N9禽流感病毒核酸灵敏特异地检测。
【主要组成成分】【储存条件及有效期】保存于-20±5℃,反复冻融次数<5次,有效期9个月。
【适用仪器】ABI 7500、ABI 7300、LightCycler480等荧光定量PCR 仪。
【样本要求】1 适用样本类型:呼吸道样本、血清、肺组织。
2 样品采集、保存与运送。
人感染H7N9采样方法及实验室检测策略
采集鼻咽拭子注意事项
• 1、采样时用干拭子采,不能蘸采样液,因为采样 液中有抗菌素,防止过敏。
• 2、采样液平时保存在-20℃或-70℃,采样前融化 到4℃。
• 3、采样液颜色呈紫色时失效不能用了。
人感染H7N9禽流感病毒鼻咽拭子标本 采集方法(2)
• 三、标本运送:
• • 新鲜的临床采集标本应在4℃条件下随样品送检单24小时
(二)标本转送和检测
• 1.H7N9禽流感病毒实验室活动和样本运输按照《人间传染 的病原微生物名录》中高致病性禽流感病毒进行管理。病 例的临床标本采集后,县级疾病预防控制机构和病例收治 的医疗机构要密切配合,按照生物安全的相关规定进行包 装,在24 小时内送到当地流感监测网络实验室进行检测。
• 2.当地流感监测网络实验室收到标本后24 小时内,立即对 呼吸道标本开展甲、乙型流感病毒通用引物、H5、H7亚型 的检测。
内运送至市CDC流感检测实验室。未能24小时内送至实验 室的,应置-70℃或以下保存;冻存的标本应在冻存条件 下,低温送至实验室。
• 四、采样时的生物安全防护:
• 采样时应带口罩,穿隔离衣,带一次性手套及帽子。若在 现场进行快速检测,应将现场用过的所有废物带回销毁。
谢谢,祝大家工作顺利!
• 若当地流感监测网络实验室检测结果为H5、H7核酸检测 阳性时,应当于24小时内将其中2管呼吸道相关原始标本 分别送省级疾控中心流感网络实验室和国家具备相应生物安全条件的网络实验室可开展病毒 分离,并将分离的毒株按要求及时送国家流感中 心。
• 3.若当地流感监测网络实验室检测结果为甲型流 感和乙型流感通用引物均阴性时,应当立即将1管 原始呼吸道标本送省级疾控中心。省级疾控中心 收到标本后,应当立即对其中1管进行SARS 、新 型冠状病毒等相关病原体的检测,另1管送国家流 感中心。
标准操作规程(SOP)——禽流感病毒RT PCR 检测
一、目的确保疑似禽流感病例标本得到有效的检测,为禽流感病毒感染提供可靠的实验室诊断依据。
国家流感中心实验室按照规定方法对疑似禽流感感染病例的标本进行处理和检测,使疑似禽流感病例标本的处理和检测得到有效的控制。
保证检测结果的快速性和可靠性,同时确保样本不被污染和污染环境。
二、范围适用于中国国家流感中心所有技术人员进行疑似禽流感病例标本的检测。
三、背景本SOP 是为配合疑似H5N1禽流感感染病例的诊断而制定,确保禽流感病例诊断的快速性和可靠性,同时要求实验操作过程中标本不被污染或污染环境。
四、程序(一)生物安全要求分装标本、裂解病毒需在BSL-3级实验室操作;核酸提取可在BSL-2级实验室生物安全柜内操作;PCR 反应体系配制在体系配制区;PCR 产物检测在电泳区操作。
要遵守相应生物安全规定(见“生物安全个人防护SOP ”)。
(二)材料及仪器1.提RNA Kit :QIAGEN RNeasy Mini Kit (catalog #74104)2.β-巯基乙醇(SIGMA β-Mercaptoethanol Lot 062K0115)3.70%乙醇4.RT-PCR Kit :QIAGEN One step RT-PCR Kit (catalog #210212)5.Promega RNasin Ribonuclease Inhibitor (catalog #N2111)6.检测引物:Forword and Reverse Primers (均为10μM ),序列如下:标准操作规程(SOP )——PCR 检测类型序列甲型通用FluA-M-F173FluA-M-R3825’-GAC CAA TCC TGT CAC CTC TGA C-3’5’-AGC TGA GTG CGA CCT CCT TAG-3’H5 H5HA-F920H5HA-R11385’-GCC ATT CCA CAA CAT ACA CCC-3’5’-CTC CCC TGC TCA TTG CTA TG-3’N1 AN1-F550AN1-R11645’-TTG CTT GGT CAG CAA GTG C-3’5’-CAG TCA CAC CAT TTG GA TCC-3’H7 H7HA-F245H7HA-R4285’-CCC AAT GTG AYC AAT TCC T-3’5’-GCT CCA TTR GTT CTT ATT CC-3’N7 N7-F1126N7-R14075’-ATG YTG AAR ATA CCT AAT GC-3’5’-GTA TTN GAT YTG TGC CCC ATC-3’H9 H9HA-F426H9HA-R8085’-GAA TCC AGA TCT TTC CAG AC-3’5’-CCA TAC CAT GGG GCA ATT AG-3’N2AN2-F1121AN2-R14015’-CGC TAC GGT TAT GAG ACT TTC AG-3’5’-ATA TTC GCC CCA TCA GGC CAT GAG-3’ 7.Axygen 1.5mL离心管,货号:MCT-150-C8.Axygen 0.2mL PCR管,货号:PCR-02-C9.Axygen 10μL,100μL,200μL,1000μL带滤芯枪头10.BIOHIT 10μL,100μL,200μL,1000μL加样器11.可调转速14K离心机:Eppendorf 5417R12.旋涡混合器:QL-901(国产)13.生物安全柜:LABCONCO(CLASS11)14.PCR仪:Biometra15.琼脂糖:Biowest Agarose Distributed by Gene Tech(Shanghai)Company Limited Lot No. 10168516.核酸染料:Gold View,北京赛百盛基因技术有限公司,cat# HGV-1。
人感染高致病性禽流感标本采集及实验室检测技术方案
⼈感染⾼致病性禽流感标本采集及实验室检测技术⽅案⼈感染⾼致病性禽流感标本采集及实验室检测技术⽅案⼀、采集对象⼆、采集要求三、标本种类四、标本采集⽅法五、标本包装六、标本保存七、标本送检⼋、实验室⽣物安全九、标本的实验室检测⼗、检测结果的判断和报告⼗⼀、实验室检测流程⼗⼆、⼈禽流感实验室检测职责为及时、科学地采集和运送⼈禽流感病例或疑似污染环境等各种类型的标本,规范实验室检测程序和检测⽅法,提⾼检测质量,明确诊断或开展相关科学研究,特制定本⽅案。
⼀、采集对象1. ⼈禽流感医学观察病例、疑似病例、临床诊断病例及需要进⼀步研究的确诊病例。
2. 其他需要进⾏⼈禽流感诊断或排除者。
3. 需要采集的环境标本。
⼆、采集要求1. 从事⼈禽流感检测标本采集的技术⼈员必须经过⽣物安全培训和具备相应的实验技能。
在标本采集过程中,采样⼈员参照规定的防护措施进⾏安全防护。
2. 住院病例的标本由所在医院医护⼈员在当地疾病预防控制机构专业⼈员指导下采集。
3. 标本采集具体种类和数量由现场⼯作组确定。
4. 密切接触者标本由当地疾病预防控制机构负责采集。
5. 根据实验室检测⼯作的需要,结合病程再次采样。
三、标本种类每个病例应尽可能同时采集上、下呼吸道标本;需要排除⼈禽流感的死亡病例则依据《传染病病⼈或疑似传染病病⼈⼫体解剖查验规定》(中华⼈民共和国卫⽣部令第43号)的规定采集⼫体标本,没有条件进⾏⼫体解剖的,可采集呼吸道灌洗液或经⽪穿刺采集肺组织标本。
1. 上呼吸道标本:包括咽拭⼦、⿐拭⼦、⿐咽抽取物、咽漱液、深咳痰液。
最佳采集时间为发病后3天内。
2. 下呼吸道标本:包括呼吸道抽取物、⽀⽓管灌洗液、肺组织活检标本。
3. ⼫检标本:病⼈死亡后应依法尽早进⾏解剖,在严格按照⽣物安全防护的条件下,进⾏⼫检,主要采集肺、⽓管组织标本,条件允许下也可采集肝、肾、脾、⼼脏、脑、淋巴结等组织标本。
4. ⾎清标本:每⼀病例必须采集⾎清标本,须采集急性期、恢复期双份⾎清。
禽流感病毒RT-PCR试验方法
二水乙二铵四乙酸二钠
18.61 g
灭菌双蒸水
80 mL
氢氧化钠
调 pH 至 8.0
灭菌双蒸水 A.5.2 TAE 电泳缓冲液(50×)配制
加至 100 mL
羟基甲基氨基甲烷(Tris)
242 g
冰乙酸
57.1 mL
0.5mol/L 乙二铵四乙酸二钠溶液(Ph8.0)
100 mL
灭菌双蒸水 用时用灭菌双蒸水稀释使用 A.6 溴化乙锭(EB)溶液
蜡(约 20μL)。循环参数为 95℃5 min,94℃ 45 sec,52℃ 45 sec,72℃ 45 sec,循环 30 次,
72℃延伸 6 min 结束。设立阳性对照和阴性对照。
5.5 电泳
5.5.1 制备 1.0%琼脂糖凝胶板,见附录 A.4。
5.5.2 取 5 μL PCR 产物与 0.5µL 加样缓冲液混合,加入琼脂糖凝胶板的加样孔中。
附录 A (规范性附录) 相关试剂的配制 A.1 变性液 4M 异硫氰酸胍 25mM 柠檬酸钠.2H2O, 0.5%(m/V) 十二烷基肌酸钠 0.1M β-巯基乙醇 具体配制:将 250g 异硫氰酸胍、0.75M( PH7.0)柠檬酸钠 17.6ml 和 26.4ml 10%(m/V) 十二烷基肌酸钠溶 293ml 水中。65℃条件下搅拌、混匀,直至完全溶解。室温条件下保存, 每次临用前按每 50ml 变性液加入 14.4 mol/L 的β-巯基乙醇 0.36ml 的剂量加入。变性液可 在室温下避光保存数月。
下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款,凡是注日期的引用文件,其 随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本标准,然而,鼓励根据本标 准达成协议的各方研究是否可使用这些文件的最新版本。凡是不注明日期的引用文件,其最 新版本适用于本标准。
禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测方法
禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测方法1、范围禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测的操作方法,适用于活禽及其产品中禽流感病毒的检测。
2、缩略语缩略语:荧光RT-PCR,荧光反转录-聚合酶链反应。
Ct值,每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。
RNA,核糖核酸。
DEPC,焦碳酸乙二酯。
PBs,磷酸盐缓冲盐水。
Taq酶,TaqDNA聚合酶。
3、原理禽流感病毒各亚型均属A型流感病毒,根据A型流感病毒共有基因特定的序列,合成一对特异性引物和一条特异性的荧光双标记探针。
该探针与禽流感病毒特有的共同基因特异性结合,结合部位位于引物结合区域内。
探针的5’端和3’端分别标记不同的荧光素,如5’端标记FAM荧光素,它发出的荧光能够被检测仪器接收,称为报告荧光基团(用R表示),3’端一般标记TAMRA荧光素,它在近距离内能吸收5’端报告荧光基团发出的荧光信号,称为淬灭荧光基团(用Q表示)。
当PCR反应在退火阶段时,一对引物和一条探针同时与目的基因片段结合,此时探针上R基团发出的荧光信号被Q 基团所吸收,仪器检测不到R所发出的荧光信号;当PCR反应进行到延伸阶段时,Taq酶在引物的引导下,以四种核苷酸为底物,根据碱基配对的原则,沿着模板链合成新链;当链的延伸进行到探面结合部位时,受到探针的阻碍而无法继续,此时的Taq酶发挥它的5’→3’外切核酸酶的功能,将探针水解成单核苷酸,消除阻碍,与此同时标记在探针上的R基团游离出来,所发出的荧光再不为Q所吸收而被检测仪所接收;在Taq酶的作用下继续延伸过程合成完整的新链,R和Q 基团均游离于溶液中,仪器可继续检测到R所发出的荧光信号。
4材料与试剂4.1仪器与器材荧光RT-PCR检测仪高速台式冷冻离心机(离心速度12000r/min以上)台式离心机(离心速度3000r/min)混匀器冰箱(2℃~8℃和-20℃两种)微量可调移液器(10L、100uL、1000uL)及配套带滤芯吸头Eppendorf管(1.5mL)4.2试剂除特别说明以外,本标准所用试剂均为分析纯,所有试剂均用无RNA酶污染的容器(用DEPC水处理后高压灭菌)分装。
卫计委印发《医院人感染H7N9禽流感病毒核酸检测标准操作程序》等技术规范
卫计委印发《医院人感染H7N9禽流感病毒核酸检测标准操
作程序》等技术规范
国家卫生和计划生育委员会
【期刊名称】《上海医药》
【年(卷),期】2013(000)011
【摘要】根据人感染H7N9禽流感疫情联防联控工作机制会议议定事项及《关于医院开展人感染H7N9禽流感病毒核酸检测有关工作的通知》(卫办医政函[2013]383号,以下简称《通知》)精神,为指导医院做好人感染H7N9禽流感病毒核酸检测工作,国家卫生和计划生育委员会组织制定了《医院人感染H7N9禽流感病毒核酸检测标准操作程序》,并委托中国疾控中心制定了《人感染
H7N9禽流感病毒核酸检测实验室生物安全保障基本要求》等技术规范,供医院在开展人感染H7N9禽流感病毒核酸检测时参考使用。
【总页数】1页(P35-35)
【作者】国家卫生和计划生育委员会
【作者单位】国家卫生和计划生育委员会
【正文语种】中文
【相关文献】
1.人感染H7N9禽流感病毒核酸检测实验室生物安全管理 [J], 孙唤;刘蓉;罗美庭
2.人感染H7N9禽流感病毒核酸检测的筛查标准验证及反思 [J], 王吉文;丘宇茹
3.卫计委:印发三级综合医院医疗服务能力指南 [J],
4.国家卫计委印发人感染H7N9禽流感疫情防控方案(第三版) [J],
5.国家卫生和计划生育委员会印发《医院人感染H7N9禽流感病毒核酸检测标准操作程序》等技术规范 [J],
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.附件医院人感染禽流感病毒核酸检测标准操作程序一、目的确保人感染禽流感病毒核酸检测过程标准化、规范化,降低人为不规范操作对检测结果造成的影响,保证结果的准确性和可重复性。
二、适用范围医疗机构临床基因扩增检验实验室按照《关于医院开展人感染禽流感病毒核酸检测有关工作的通知》(卫办医政函〔〕号)和《关于做好医疗机构人感染禽流感检测试剂供给保障工作的通知》(卫发明电〔〕号)有关要求,使用国家疾病预防控制中心制备或商品化试剂盒开展人感染禽流感病毒核酸检测工作。
三、样本采集、运送和保存尽量采集病例发病早期的呼吸道样本(上呼吸道样本包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物、咽漱液和鼻洗液, 下呼吸道样本包括痰液、气管吸取物、肺洗液、肺组织等)。
可将鼻、咽拭子收集于同一采样管中,以便提高检出率。
患者有下呼吸道样本时,应优先采集。
根据试剂说明书对样本采集方法有关要求,制订样本采集标准操作程序(),并组织样本采集人员进行培训及考核。
样本的采集应当严格按照进行。
样本采集后,按照《人间传染病的病原微生物名录》中高致病性禽流感病毒的相关规定进行包装,用密封容器立即送往实验室。
若气温高时,需放入冰块降温。
样本抵达实验室后,应尽快进行检测,小时内能检测的样本可置于~℃暂时保存,小时内无法检测的样本则应置于≤-70℃状态保存。
如无-70℃保存条件时,可于-20℃冰箱暂存。
样本避免反复冻融。
样本采集、处理、运输及保存不当时,可因病毒降解出现假阴性结果,也可因为样本“污染”出现假阳性结果。
四、检测(一)样本处理样本的核酸提取应当在样本处理区进行。
按所采用的商品化试剂盒说明书要求,取适量待检样本、阳性及阴性对照进行核酸提取。
样本应尽可能新鲜,提取过程应严防酶污染及操作不当导致的降解。
提取过程如涉及离心步骤,应采用低温冷冻离心机;在生物安全柜内进行加样、提取过程中,为防止降解,可将试管架置于托盘内平铺的碎冰上。
提取好的应及时用于检测,否则应当-70℃保存。
如无-70℃保存条件,可于-20℃冰箱暂存。
(二)试剂准备试剂准备应当在试剂准备区进行。
根据所用的试剂盒,样本可进行甲型流感病毒核酸、禽流感亚型或病毒核酸的检测。
试剂的配制按所用商品化试剂盒说明书进行。
除酶混合物外,其它试剂在使用前应当在室温充分复融,混匀并瞬时低速离心。
反应液分装时尽量避免产生气泡,上机前注意检查各反应管是否盖紧,以免管内溶液泄露污染仪器。
分装有扩增反应液的反应管应当扣盖或装入密实袋内再转移至样本处理区。
(三)加样加样应当在样本处理区进行。
加样时应当使样品完全落入反应液中,不应有样品粘附于管壁上,加样后应尽快盖紧管盖。
按试剂、仪器说明书完成加样和反应管准备。
(四)扩增检测扩增检测在扩增区进行。
待检管转移至扩增区,按顺序置于仪上,编辑样本信息,按试剂和仪器说明书设定循环参数。
(五)结果分析根据所用试剂盒说明书设置基线值()。
荧光阈值()设定以阈值线刚好超过阴性对照品扩增曲线(无规则的噪音线)的最高点为原则,且值应大于所设置的扩增循环数(或显示为)。
使用仪器配套软件自动分析结果。
(六)质量控制检测过程对可能出现的假阳性和假阴性进行质量控制,除了检测商品试剂盒所提供阳性和阴性对照外,每次临床样本检测时,至少应当有份弱阳性和份阴性质控样本(多份阴性质控样本设置对实验室“污染”所致假阳性的监控更为有效),随机放在所检测标本的中间。
弱阳性质控样本可为检测阳性的灭活稀释后保存的临床样本、灭活病毒或假病毒颗粒等,如所采用的商品化试剂盒有“内标”控制假阴性,或弱阳性质控样本来源困难,可暂不设弱阳性质控。
阴性质控样本采用标本采集管内溶液即可。
质控样本应与临床标本同等对待,参与样本核酸提取和扩增检测全过程。
试剂盒中的阳性和阴性对照用于判断实验室的有效性,按试剂盒说明书进行。
(七)实验结果的判定与解释。
按照试剂盒说明书进行。
对于出现弱阳性结果的样本应进行重复检测,并注意与可能的实验室轻度或样本交叉“污染”所致假阳性结果区别。
五、检测结果报告按照试剂盒说明书进行。
六、其它注意事项(一)人感染禽流感病毒实验室活动、样本采集和运输按照《人间传染的病原微生物名录》中高致病性禽流感病毒进行管理。
从事人感染禽流感检测的技术人员必须经过生物安全培训并具备相应的实验技能,在检测过程中必须采取生物安全防护措施(使用眼罩、型口罩等)。
样本核酸提取必须在Ⅱ级生物安全实验室,经过年检合格的二级生物安全柜内进行。
实验室应具有良好的通风。
(二)注意仪器设备的日常和定期维护,加样器、扩增仪和温育设备应进行定期校准。
试剂盒及一次性使用的无酶和酶反应管、离心管、带滤芯吸头等应进行每批质检。
(三)实验应严格分区操作;各区物品、工作服等均应当专区专用,不得交叉使用。
实验后应及时清洁工作台,以防污染。
(四)每批实验室后,可采取实验室通风、次氯酸钠溶液擦洗地台面、紫外照射等措施,消除可能存在的扩增产物气溶胶污染。
(五)使用中国疾控中心制备试剂开展检测工作时,可参考相应试剂盒说明书(见附件、)有关要求。
附件:亚型禽流感病毒检测试剂盒(荧光法)说明书禽流感病毒核酸检测试剂盒(荧光探针法)说明书附件亚型禽流感病毒检测试剂盒(荧光法)说明书【产品名称】通用名称:亚型禽流感病毒检测试剂盒(荧光法)英文名称:()【包装规格】人份盒。
【预期用途】本试剂用于对咽拭子样本中亚型禽流感病毒进行定性检测,用于禽流感病毒感染的辅助诊断及流行病学监控。
【检验原理】根据荧光技术原理,针对亚型禽流感病毒的基因和基因设计特异性引物和探针,通过荧光检测仪进行检测,从而实现对亚型禽流感病毒的定性检测。
试剂盒以正常人上皮细胞中广泛存在的核糖核酸酶()的为正常人体细胞对照,对提取和检测过程进行监控。
【主要组成成分】本品不包含,但对实验必须的设备和试剂:生物安全柜、台式离心机、旋涡震荡器、拭子、采样管、无菌病毒采样液、无核酸酶的离心管、全自动荧光检测仪专用扩增管和核酸分离试剂盒(硅胶膜吸附法,北京金豪制药股份有限公司,:)。
【储存条件及有效期】-20℃冷冻保存,有效期个月,阳性对照反复冻融次数不得超过次。
【适用仪器】、、、型全自动荧光检测仪。
【样本要求】. 样本类型:咽拭子。
推荐使用金豪公司生产的微生物采样及运送管(人份盒)。
. 拭子、采样管和保存液:拭子选择:应使用头部为合成纤维(例如,聚酯纤维),杆部为铝或塑料的拭子。
采样管:外螺旋口、耐-70℃冻存,可容纳病毒采样液。
无菌病毒采样液:应含有蛋白质稳定剂,阻止细菌和真菌生产的抗生素,缓冲液,经无菌处理。
.样本采集、运输和保存:由于亚型禽流感病毒为呼吸道传播病毒,有关生物安全应按照“《人间传染的病原微生物名录》”中高致病性禽流感病毒进行管理。
采集:采集病人发病日内的咽拭子标本,用于病原检测。
用微生物采样及运送管内的采样棉签,适度用力拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位,应避免触及舌部;迅速将棉签放入装有保存液的外螺旋盖采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封,以防干燥,外表贴上带有唯一识别号码的标签。
4℃暂存并在小时内送达实验室。
保存和运输:新鲜采集样本应在4℃条件下小时运送到检测实验室。
保存样本可在-20℃以下低温冷冻保藏,需长期保存的标本存于-70℃冰箱。
冷冻样本应在冷冻条件下送至实验室。
运输时在包装箱内填充吸水材料,运输过程中保持标本采集管直立状态,不能倾斜。
样本送至实验室后,立即进行处理和分装,避免反复冻融。
临床样本保存在4℃不能超过天。
.咽拭子标本的处理咽拭子要在标本保存液中充分搅动(至少下),以洗脱拭子上粘附的病毒及含有病毒的细胞等,用于病毒分离时,需要冻融一次(防止多次冻融),使细胞破裂,释放病毒颗粒。
然后在4℃条件下,离心分钟,用上清接种细胞或直接提取。
如果发现有细菌污染,须用滤器过滤除菌。
【检验方法】. 核酸提取:取μ咽拭子样本进行核酸提取。
采用北京金豪制药股份有限公司的核酸分离试剂盒(硅胶膜吸附法),该试剂盒可用于对呼吸道悬浮液样本中的病毒提取,并按试剂盒说明书要求操作。
本品的阳性对照和阴性对照均参与核酸提取。
. 准备及注意事项:1.1.1 分别在洗液瓶和洗液瓶中加入和无水乙醇,颠倒充分混匀,并在瓶身上加以标识。
1.1.2 吸取所需的洗脱液,加至一无核酸酶的管中,于70℃预热。
1.1.3 冷冻样本应室温融化,轻微震荡混匀后使用。
1.1.4 区分操作中的离心设置(和),本产品操作过程均为室温离心。
1.1.5 助沉剂在低温保存时可能呈胶状,吹打混匀即可使用。
. 样本裂解及核酸吸附1.2.1 在无核酸酶的离心管中加入μ助沉剂和μ裂解液,加入μ待处理样本,剧烈震荡分钟,室温静置分钟。
注:如样本体积小于或大于μ,需按比例改变助沉剂、裂解液以及无水乙醇体积。
体积大于μ样本应分多次进行处理。
1.2.2 加入μ无水乙醇,颠倒混匀,吸取μ裂解混合物转移到核酸吸附柱中。
注:如样本体积小于或大于μ,需按比例改变乙醇用量。
3500g离心分钟,取下套管,倒掉套管中的液体。
将剩余裂解混合物转移至核酸吸附柱,重新离心一次,弃套管中的液体。
1.2.4 将核酸吸附柱重新装入套管,6000g离心分钟,倒掉套管中的液体。
. 核酸纯化1.3.1 将核酸吸附柱重新装入套管,在核酸吸附柱中加入μ洗液,6000g离心分钟,将核酸吸附柱装入一个干净套管中。
1.3.2 在核酸吸附柱中加入μ洗液,静置分钟,6000g 离心分钟。
1.3.3 倒掉套管中的液体,将核酸吸附柱重新装入套管。
1.3.4 重复一次步骤(本步骤不用静置分钟)。
1.3.5 将核酸吸附柱换一新套管,离心分钟。
. 核酸洗脱1.4.1 将核酸吸附柱装入一无核酸酶离心管,小心在吸附膜中央加入μ预热洗脱液,室温静置分钟。
离心分钟,离心管中液体即待测样本。
. 扩增:实验设计:2.1.1待检样本检测:每份样本分别使用种反应液(和反应液)进行检测,综合种反应液的检测结果对样本进行判定。
2.1.2对照品检测:每次实验都应设置阴性对照和阳性对照。
反应体系的配制:2.2.1准备工作:将种反应液(和反应液)融化后振荡混匀,离心秒。
2.2.2 种反应体系(和)的配制:取个无核酸酶离心管,计算待测样本数量(),分别取μ×()反应液(和)、μ×()聚合酶和μ×()逆转录酶充分混匀,离心秒。
份样本份阳性对照份阴性对照;反应体系分管:每份待测样本设置个扩增管(和),分别将每种反应体系按μ管分装至对应的扩增管中。
加样:每份待测样本、阳性对照、阴性对照以μ管分别加入个扩增管中。
扩增检测:将加样后的扩增管分别转移到全自动荧光定量检测仪上进行扩增检测,不同仪器的设置如下:2.5.1全自动荧光定量检测仪(、、型)扩增程序:对于、型全自动荧光定量检测仪,荧光信号设置为::、,:,:。