蛋白质组学技术应用于特发性间质性肺炎的研究进展
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【关 键 词 】 特发 性间 质 比肺 炎 ；蛋 白组学 乡技 术
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度上是 相对稳定 的 ，而蛋 白质 的质 和量 却 随细胞 类 型和 细胞内外环 境的变 化而处 于不断 变化的动 态过
程 中。因此 ，基 因组 学和 蛋 白组学 是两 个相 互补 充 的 领 域 。 蛋 白 质 组 学 是 １９９４ 年 澳 大 利 亚 Ｍａｃｑｕａｒｌｅ大学的科学家 ＷＩＩｋｉｎ；在意大利的一次 科学会议上 首次提出，并 首次在 １９９５年 ７月的 “ＥＬＥＣＴＲＯＰＨＯＲＥｓＩＳ”上发表 的 。后 来经 不断 完 善将其定义为细胞内全部蛋白的集合体，包括基因 组表达 的蛋 白质 ，还包 括 修饰后 的 各种 形式 的蛋 白 质 。蛋 白质组学 是基 因组 学后兴 起的一项 新 的研 究
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国际呼吸杂志 ２ｏ０７ 年 第 盯 卷 第 ”期 Ｉｎｔ ＪＲ汗Ｐｌｒ，介ｐ．２。。７，Ｖｏ１２７．Ｎ。招
蛋 白质组学技术应用于特发性间质性肺炎 的研究进展
顾 莹莹 洗 慧仪 陈国勤 李时悦
【摘 要 】 蛋白质组学是后基因时代出现的一门新兴科学，它是以细胞内全部蛋自质的存在及其活动方 式为研究对象，其研究月的是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。其核心技术包括双向 电泳、质谱分析、微阵列技术和生物信息技术。本文综述了蛋白质组学研究技术及其在特发性间质性肺炎 研究应用巾的最新进展，对特发性间质性肺炎的诊断和治疗提供新的方向
最高 、重复 性最 好 的分离技 术 。其基 本原 理 是基 于 不 同蛋 白质 的等 电点 和 分子 量 不 同的 特 征将 其 分 离。第一相是基于不同等电点 的等 电聚焦 电泳 （ｉｓｏｅｌｅｃｔｒｉ。ｆｏｃｕｓｉｎｇｌＥＦ），第二相是基于不同分子 量 的 ＳＤＳ聚 丙烯 酞 胺凝 胶 电泳 （ｓ ＤＳ－Ｐ八ＧＥ） 。但 ２刁布 具有许多先天局限性，如对低丰度蛋白（１。ｗ ａ加ｎｄａｎｃｅｐｒｏｔｅｉｎ）的分辨率太低，而低丰度蛋白往 往具有比高 丰度 蛋 白更为 重要 的生 理功 能 。因此
或组织所表达的全部蛋白质成分，也就是指全部蛋 白质 的 存 在 形 式 和 表 达 形式。蛋 白 质 组 学 （Ｐｒｏｔｅｏｍｌｃｓ）是以蛋白质组研究对象，对机体或细
基 金 项 目 广州市科技 局资助项目〔编号、Ｇ‘ｎＺ之。７ｏ９的 作 者 单 位：５１０１别 广州医学院第一附属医院病理科（顾莹莹、 陈国勤Ｊ，呼吸科〔冼慧仪，李时锐 ）
蛋 白 质 组研 究与 基因 组研究 相 比有 许多难 点 ， 这就要求 必 须有 适 合蛋 白质特 性 的研 究 策 略和 技
术 。在 蛋白质组学 研究 的主要技 术步骤 包括 蛋白质 样品制 备、蛋 白质和 肤的分 离 以及 蛋 白质定 量分 析
和鉴定 。 目前应用 的主要 技术有 二维聚 丙烯酸胺 醚 胶电泳 （ｔｗｏｄｉｍｅｎｓ；ｏｎａｌｇｅｌｃｌｅｃｔｒｏｐｌｌｏｒｅ、，５２－ ＤＥ）、质谱技术（ｎｌｏ５５。ｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，Ｍｓ）、蛋白质芯 片技 术 （ｐｒｏｔｅｉｎｍ，ｃｒｏａｆｒａｙ）、酵 母 双杂 交系 统 （ｙｅａｓｔ，ｗ。ｈｙｂｒｉｄ，ｙｓ，ｅｒｎ）、表面等离子共振技术 （Ｓｕｒｆａｃｏｐｌａｓｎｌｏｎ：ｅ、ｏｎａｎｃｅ）以及 生 物 信 息 学 （ｂｌｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ） ２．１ 蛋白质分离技术 目前，在蛋白质组学研究中 应用最多的是 ２一ＤＥ，它也是目前对蛋白质组分辨率
［Ｋ ｅｙ ｗＯ ｒｄｓ】 ｍｌｏｐａ山ｉｃ眨ｎ比ｒｓｔｉｔｉａｌｐｎｅｕｍ。几ｉａ；Ｐｒｏｔ如 ｉｃｓ：Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ
随着 人 类 基因组计划的完成，后基周时代的帷 幕正在拉开。人们利用基因组学技术 在 ＤＮＡ和 ＲＮＡ水平开展了基因 与各种疾病关系的研究，取 得了很大的成就。但同时又清楚地认识到，作为细 胞结构 和功能主 要执 行者 的 蛋 白质虽 由基 因编 码 ， 但两 者之间却不 是线性 对应关 系 。基 因组在很 大程
领域［ｌｊ 目前蛋白质组学技术在研究炎症、免疫、肿
瘤形成 等方面取得 了重 大进展 。现就特发 性 间质 性 肺炎（ｉｄｉｐａｔｈｌｃｉｎ屯ｅｒｓｔｌｔｉａｌｐｎｅｎｍｏｎｌａ，ＩＩＰ）的蛋白 质组学 研究的进展 作一综 述
１ 蛋 白质组和 蛋白质组 学及其 研究 内容 蛋白 质 组 （Ｐｒｏｔｅｏｍ的是指一个基因、一个细胞
胞的所 有蛋 白质进行鉴 定和结 构功能 分析 。蛋白质 组学的研究包括以下三个方面：①蛋白质的大规模 鉴定和转 录后修 饰 的微特 征 研究 ；⑧差 异显 示蛋 白 组学 ，比较疾病 与正 常状态蛋 白质表达 的差异 ，为疾
病诊断 寻找生物 学标 志；③通过 各种技术 ，如 质谱技术和酵母 双杂 交 体系 对蛋 白质一蛋 白质 间相 互作 用 的研究，并绘制蛋白质作用的图谱匡。 ２ 蛋白质组学研究的相关技术
Ｐｒｉ唱ｒ．５５，ｌｆｐｒｏｔｅｏ而 侣 ｌｅ由ｎＯｌｏ盯 ｉｎｉｄｉｏｐａｔｈｉｃｉｎｔｅ比ｔ妞１幻ｐｎｅｕｍ皿１． 以Ｊ戮”９ 少了刀９，ＸＩＡＮ ＪＩ“艺夕２，ＣＨＥＮ
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基 金 项 目 广州市科技 局资助项目〔编号、Ｇ‘ｎＺ之。７ｏ９的 作 者 单 位：５１０１别 广州医学院第一附属医院病理科（顾莹莹、 陈国勤Ｊ，呼吸科〔冼慧仪，李时锐 ）
蛋 白 质 组研 究与 基因 组研究 相 比有 许多难 点 ， 这就要求 必 须有 适 合蛋 白质特 性 的研 究 策 略和 技
术 。在 蛋白质组学 研究 的主要技 术步骤 包括 蛋白质 样品制 备、蛋 白质和 肤的分 离 以及 蛋 白质定 量分 析
和鉴定 。 目前应用 的主要 技术有 二维聚 丙烯酸胺 醚 胶电泳 （ｔｗｏｄｉｍｅｎｓ；ｏｎａｌｇｅｌｃｌｅｃｔｒｏｐｌｌｏｒｅ、，５２－ ＤＥ）、质谱技术（ｎｌｏ５５。ｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，Ｍｓ）、蛋白质芯 片技 术 （ｐｒｏｔｅｉｎｍ，ｃｒｏａｆｒａｙ）、酵 母 双杂 交系 统 （ｙｅａｓｔ，ｗ。ｈｙｂｒｉｄ，ｙｓ，ｅｒｎ）、表面等离子共振技术 （Ｓｕｒｆａｃｏｐｌａｓｎｌｏｎ：ｅ、ｏｎａｎｃｅ）以及 生 物 信 息 学 （ｂｌｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ） ２．１ 蛋白质分离技术 目前，在蛋白质组学研究中 应用最多的是 ２一ＤＥ，它也是目前对蛋白质组分辨率
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１ 蛋 白质组和 蛋白质组 学及其 研究 内容 蛋白 质 组 （Ｐｒｏｔｅｏｍ的是指一个基因、一个细胞
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