第四章蛋白质化学
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第四章 蛋白质化学
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蛋白质一、二、三、四级结构示意图
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第四章 蛋白质化学
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五、维持蛋白质分子空间构象的主要化学键
氢键、疏水键、离子键、范德华力、二硫键等
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第四章 蛋白质化学
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蛋白质分子中的主要次级键
氢键
范德华力
离子键
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疏水键
二硫键
第四章 蛋白质化学
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第四章 蛋白质化学
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(二)透析 (dialysis)
用透析袋(半透膜)把大分子和小分子分开的方法
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第四章 蛋白质化学
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(三)沉淀(precipitation)
定义:蛋白质分子相互聚集从溶液中析出的现象 原理:破坏同种电荷和水化膜
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第四章 蛋白质化学
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(一)一级结构与功能的关系
一级结构的改变可引起某些疾病的发生 由于蛋白质分子的变异或缺失而产生的疾病,称为
分子病(molecular disease)。 如镰状红细胞性贫血
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第四章 蛋白质化学
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(二)空间结构与功能的关系
空间构象决定蛋白质功能 构象改变,功能改变
第四章 蛋白质化学 (Chemistry of Protein)
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第四章 蛋白质化学
1
导学
1. 掌握蛋白质的分子组成与结构 2. 熟悉蛋白质的理化;常用分离、纯化技术的
基本原理。 3. 了解蛋白质分子结构与功能的关系;蛋白质
的分类以及重要的活性肽。
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教学内容
任何一个亚基接受氧分子后,会增进其它亚基吸附氧分子的能力
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环境氧浓度高时 Hb快速吸收氧分子
动脉
环境氧浓度低时 Hb快速释出氧分子
静脉
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第三节 蛋白质的理化性质与分离纯化
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第四章 蛋白质化学
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一、蛋白质的理化性质 (一)蛋白质的一般性质
1.蛋白质的紫外吸收特征
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三、肽 (一)肽的形成和命名
1. 肽键
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肽键的形成
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肽键平面
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第四章 蛋白质化学
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2.肽的形成与命名
肽、寡肽(oligopeptide)、多肽(polypeptide) 多肽链(polypeptide chain) 主链骨架(backbone) 侧链部分(side chain) 羧基末端或C-末端(C-terminus) 氨基末端或N-末端(N-terminus)
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氢键
α-碳原子 侧链
0.54nm
0.50nm
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2. β-折叠 (β-sheet)
锯齿状
顺向平行、逆向平行
俯俯视视
作用键:氢键
侧侧视视
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平反行平行 26
3.β-转角( β-turn)
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4.无规卷曲(random coil)
定义 蛋白质分子中由于肽键平面的相对旋转,构成 的局部空间构象。
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(一)二级结构的类型
α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规则卷曲
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1.α-螺旋(α-helix)
• 右手螺旋 • 每周含3.6个残基 • 螺距0.54nm • 作用键:氢键
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H
N-末端
多肽链的结构
侧链
主链骨架
OH
C-末端
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(二)体内重要的肽
Glu-Cys-Gly
谷胱甘肽(GSH)的结构
• 功能基:-SH • 解毒剂、抗氧化剂
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第二节 蛋白质的分子结构
蛋白质的分子结构
基本结构
蛋白质分子大,扩散速度慢 沉降:通过超速离心克服布朗运动使
蛋白质颗粒下沉的现象 沉降系数(S)可粗略反映蛋白质分子大小
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3.蛋白质的变性与复性
变性剂
蛋白质空间 构象破坏
生物学活性丧失 理化性质改变
加热蛋、白酸质碱非、共有价机键溶剂、 尿素和、二盐硫酸键胍破、坏去,污剂
空间结构
一级结构 二级结构 三级结构 四级结构
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一、一级结构
概念:多肽链中氨基酸的组成与排列顺序 主键:肽键 意义:决定蛋白质的空间结构
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胰岛素的一级结构
B链 A链
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二、二级结构 (secondary structure)
离子键
极性基团
二硫键
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四、四级结构 (quaternary structre)
定义:两个或两个以上独立三级结构的多肽链 通过次级键结合而形成的空间结构
疏水键、氢键、盐键
亚 基
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血红蛋白四级结构示意图
4个亚基构成 2α-亚基 2β-亚基
定义: 在二级结构基础上,所有原子(主链+侧链) 相互作用形成的空间构象
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三、三级结构 (tertiary structure)
化学键 --氢键、疏水键、离子键、二硫键等次级键 --亲水基团:分子表面;疏水基团:分子内部
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三级结构示意图
肽链的肽键平面不规则排列,形成松散的二级 结构。
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(二)超二级结构与结构域
超二级结构(super secondary structure) 二级结构单元进一步聚集和组合在一起——模
序(motif) 如αα、βαβ、βββ等
亮氨酸拉链和锌指结构
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蛋白质的分子组成 蛋白质的分子结构 蛋白质的理化性质与分离纯化 蛋白质的分类
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第四章 蛋白质化学
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第一节 蛋白质的分子组成
一、蛋白质元素组成: CH O N S
蛋白质的特征元素,平均含量:16% 蛋白质含量=样品所含氮量×6.25
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二、蛋白质的基本组成单位—氨基酸
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血红蛋白结合氧前后构象的变化
15º
当α1 血红蛋白结合β1 氧以后,α 1β 1与α 2β 2两个 二聚体彼此滑动15°,其构象由T(tense)型 转变为R(relaxed)型。
β2
α2
Hb (T态)
HbO2 (R态)
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血红蛋白对氧的运输
蛋白质(色氨酸、酪氨酸)(苯丙氨酸)
λ=280nm
λ=260nm
紫外吸收(与蛋白质浓度成正比)
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蛋白质的紫外吸收
摩 10,000 尔 吸 光 度 ( 1000
) 100
Trp Tyr
M-1cm-1
10 200
Phe
250
300
波长(nm)
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第四章 蛋白质化学
不涉及肽键
易水解 易沉淀
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3.蛋白质的变性与复性
复性:去除变性因素,蛋白质恢复空间构象 与生物学活性的过程
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核糖核酸酶的变性与复性示意图
8M尿素或 β-巯基乙醇
透析
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某些蛋白质在发生热变性后,松散的多肽链相 互缠绕在一起,变成固体状态,称为蛋白质的 凝固(coagulation)。
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二、蛋白质的分离纯化鉴定技术
蛋白质在细胞内常与核酸、多糖、脂类及 其它小分子物质结合在一起,需要对其进行分 离、纯化与鉴定。
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(一)离心
原理:分子大小、密度不同→沉降速度不同 分类:
普通离心:3~10 kr/min 高速离心:10~25 kr/min 超速离心:>25 kr/min 常用S值表示蛋白质分子质量相对大小
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极
性
中
性
Cys,
氨
基
酸
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9
酸性氨基酸
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碱性氨基酸
=
H2N-C-NH— NH
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(三)氨基酸的理化性质 1. 两性电离和等电点
氨基酸具有氨基、羧基等
能接受H+而成——NH3+ 具碱性
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(二)超二级结构与结构域
结构域(domain) 超二级结构的进一步组合、折叠形成的球状区
域。 是蛋白质的功能部位
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免疫球蛋白结构域
结构域
轻链 重链
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三、三级结构 (tertiary structure)
磷钼酸
蓝色化合物
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3.蛋白质的呈色反应
颜色反应→光吸收→定量分析
米伦试剂反应:
米伦试剂 蛋白质
△
红色沉淀
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第四章 蛋白质化学
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3.蛋白质的呈色反应
颜色反应→光吸收→定量分析
考马斯亮蓝反应: 考马斯亮蓝
蛋白质
(R-250)红蓝色 (G-250)蓝绿色
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4.生物碱试剂与某些酸类沉淀蛋白质
原理:中和正电荷 条件:pH<pI 特点:蛋白质变性 常用酸类:苦味酸、鞣酸、钨酸、三氯醋酸、硝
酸、过氯酸等层析 (chromatography)
定义:待分离的液体(流动相mobile phase )经 过一个固态物质(固定相solid phase)后所发生的 各组分在两相中分布的变化。
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六、蛋白质结构与功能的关系
蛋白质的一级结构决定其高级结构 蛋白质的空间构象决定蛋白质的生物学功能。
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(一)一级结构与功能的关系
某些蛋白质的一级结构加工后,才具有生物学活 性。
如胰岛素原(proinsulin)的一级结构加工
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第四章 蛋白质化学
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第四章 蛋白质化学
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(二)蛋白质的高分子性质
1.蛋白质的胶体性质 蛋白质分子的直径在胶体颗粒的范围(1~100nm) 蛋白质溶液是稳定亲水胶体溶液 稳定因素:水化膜、同种电荷
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碱
碱
酸
酸
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第四章 蛋白质化学
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2.蛋白质的扩散与沉降
能电离出H+而成——COO具酸性
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氨基酸的两性电离
pH<pI
pH=pI(兼性离子)
pH>pI
等电点: 氨基酸所带正负电荷相等时溶液的pH (pI) 值即该氨基酸的等电点
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2.茚三酮反应
(蓝紫色)
脯氨酸、羟脯氨酸与茚三酮反应生成黄色化合物
(一)氨基酸的结构
共同结构
CCOOOO H_ +HH2 N3 N -- C C- αH - H
RR
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氨基酸结构特点:
20种编码氨基酸 氨基酸的不同在于R侧链不同 均为L-α-氨基酸 (甘氨酸、脯氨酸除外)
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(二)氨基酸的分类
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2.有机溶剂沉淀蛋白质
原理:破坏水化膜 条件:pH=pI 特点:常在低温下进行 常用有机溶剂:乙醇、丙酮等
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第四章 蛋白质化学
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3.重金属盐沉淀蛋白质
原理:中和负电荷 条件:pH>pI 特点:蛋白质变性
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蛋白质的沉淀示意图
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第四章 蛋白质化学
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(三)沉淀(precipitation)
方法: 盐析法 有机溶剂沉淀法 重金属盐沉淀法 生物碱试剂沉淀法
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1.盐析(salting out)法
定义:高浓度中性盐使蛋白质从溶液中析出沉淀 的方法
原理:破坏水化膜、中和电荷 特点:蛋白质不变性 分段盐析:不同浓度的中性盐分离不同蛋白质
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2.蛋白质的两性电离和等电点
与氨基酸的两性电离、等电点相同
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第四章 蛋白质化学
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3.蛋白质的呈色反应
颜色反应→光吸收→定量分析
双缩脲反应: Cu2+
蛋白质 OH-
紫色络合物
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第四章 蛋白质化学
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3.蛋白质的呈色反应
颜色反应→光吸收→定量分析
酚试剂反应:
磷钨酸 蛋白质
根据R基极性大小分: 1. 非极性中性氨基酸 2. 极性中性基氨基酸 3. 极性酸性氨基酸 4. 极性碱性氨基酸
R基无极性, 呈疏水性
R基有极性, 电离R后基R有基极带性, R基有负极但电性不荷,带电, 电离后R呈基亲带水性
正电荷
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第四章 蛋白质化学
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非
极
性
中
性
氨
CH3 CH2 2
基
酸
N H