红花低分子量油体蛋白基因的克隆与系统进化分析
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红花 ( C a r t h a mu s t i n c t o r i u s L. )为 菊科 红 花 属 取 野 生 型 红 花 种 子 置 于 液 氮 中 ,利 用 R NAi s o 的植 物 ,含 油 率 高 、产 量 也 高 , 因此 成 为 新 兴 的 P l u s( 大 连 宝 生 物 工 程 有 限公 司 )提 取 红 花 种 子
1 材料 与方法
1 . 1 种子与植株
野生红花种子, 来源于新疆塔城, 本实验室保存。 1 . 2 试 剂 R NA提 取试 剂 盒 ,R T - P C R 试 剂 盒 ,T 载体 试 剂 盒 ,T 4 D N A 连接酶 ,核酸 内切酶等 为大连宝生物 公 司产品;其他试剂均为国产分析纯产品。
CATT AT 一 3’
参 照R T - P C R 试 剂盒 说 明书 ,将 提取 的红 花种 子 总R NA反 转 录 为 c D NA。 经优 化 后 的P CR 扩 增 程 序 为 :9 4 ℃ ,4 0 S ,5 5 o C,4 0 S ,7 2 o C 5 0 S ,共 3 0 个 循 环 ,最后 7 2 再 延伸 6 mi n 。 1 . 5红花L — O l e o s i n 基 因测 序与 系统发生分 析 P C R扩增 的 目的 基 因产 物 回收并 纯 化 之 后 ,克 隆 人 p MD1 8 一 T 载体 中。 酶切 鉴定 阳性 的克 隆委 托上 海 英 骏测 序公 司 ( I n v i t r o g e n) 进 行 测序 。 获 得测 序 结果 之后 ,检 索NC B I 数 据库 已公
( 长春 师范大 学 生命科 学 学院 ,吉林 长 春 1 3 0 0 3 2 )
摘
要 目的:克隆红花低 分子量 油体蛋 白基 因L . O l e o s i n ,并进行测序和序列 比较分析。方法 :参考 已完成的红花 转录组测序
结果 ,设计特异性 引物 ,从野生型红花种子 中提取R NA,以 R 1 1 - P C R方法扩增L . Ol e o s i n 全长基 因,测序之后 ,进行 不同物种 同 源基 因间的 系统发生分析 ,应 )  ̄ P h y l i p 软件绘制分子进化树。 结果:克隆了红花低 分子量油体蛋 白基 因,系统发生分析表 明 ,
ห้องสมุดไป่ตู้
油料作物 ,其含亚油酸高达7 0 % 8 0 %…。红花种 子油在 医药上常用作抗 氧化剂 和维 生素A和D 的稳 定剂[ 2 】 。用 红 花 油 体 系统 作 为 生 物 反应 器 生 产 药 用 蛋 白具有生产成本低 、易于分离纯化 、提高农业生 产 附加值 等优 点 【 3 】 。 Ol e o s i n 是 与 油 体 特 异 性 结 合 的 一 种 碱 性 蛋 白 质 ,也是油体 中发现最早且含量最高的蛋 白质 ,只 存 在 于植 物 中[ 4 ] 。Ol e o s i n 在被 子 植 物 主要 存 在 高 分 子量 和低分子量两种 同型体 [ 5 】 ,为 了探索油体蛋 白 与红 花 含 油量 的关 系 ,便 于利 用基 因 工程 改 造提 高 红花 的含油量 ,以及利用油体表达系统表达外源蛋 白 ,本研 究 通 过提 取 野生 红 花种 子  ̄ , R NA,反 转 录 成c DNA之 后 ,设 计 特 异 引 物 克 隆 了 红花 低 分 子 量 ( L — O l e o s i n) 油体蛋 白基 因,测序之后 ,进行了系 统发生分析 ,为后续研究奠定基础。
1 . 3 红花种子总RN A 提取
收稿 日期 :2 0 1 4 - 1 2 - 1 8
开资料 ,以B L AS T 检索 比对L . Ol e o s i n 基 因在不 同 物 种 间 的 全 长 编 码 序 列 ,下 载 处 理 之 后 ,利 用 p h y l i p 软件 ( 3 . 6 9 5)采 取邻 接 分 析 的最 大 似 然距 离 ( Ma x i m u m L i k e l i h o o d ,ML) 法建立系统进化树 , 进 而 分析 红花 L — O l e o s i n 基 因 的系统 进化关 系 。
L — Ol e o s i n  ̄ 因的 变异很 大,物种 间差异明显。 结论 进行 油体蛋 白基 因相 关功能研 究和建立油体 蛋 白表 达 系统等方面的研 究应
该 以同种属植物或 亲缘关 系较 近的植物之间应用为主,基 因工程 改造和功能验证应在本物种上进行 ,然后拓展至近缘 物种 。 关键词 红花油体蛋 白;基 因克 隆;系统发 生分析 中图分类号 :R 2 8 4 . 2;R 2 8 5 文献标志码 :A 文章编 号 :1 6 7 3 — 8 9 0 X( 2 0 1 5) 0 3 — 0 0 1 — 0 2
引 物序 列设 计 参 考 课题 组 红 花 种子 转 录 组测 序 结 果 的参 考序 列设 计如 下 :
F o l 上游 5 ’一 CC C T T CA A A T C C A T C G C AC C T
TCTTCC 一 3’
R o l 下游 5 ’一 AAC GG AG CC T T T A T T C AC A T T
第9 卷第 3 期
V0 1 . 9 No . 3
南方 农业
S o u t h Ch i n a A c u l t u r e
2 0 1 5 年1 月
J a n . 2 o】 5
红花低 分子 量油体蛋 白基 因 的克 隆 与系统进 化分析
候 文静 ,王 旺,方 锐 ,沃 思宇 ,张 捷 ,丁亦男
R N A,按照反转 录试剂盒操 作说 明将 其反转 录成 c D N A,作为P C R 模板 ,应用 自行设计的O l e o s i n 基 因特 异 性 引物 建 立 反应 条 件进 行 目的基 因克 隆 ,提 取的 . 8 0 冰箱保存备用。
1 . 4 红花L — Ol e o s i n 基 因P CR 扩增 的 引物设 计