5年生存以上胃癌患者的基因表达谱

世界胃癌发病率
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
胃癌的发病率
在世界范围内，胃癌的发病率次于肺癌、乳腺 癌和结直肠癌，居第4位（93/1070万）。
在中国，胃癌的发病率略次于肺癌，居第2位 （39/216万）。
moderate
89
42
47.2
24
27.0
poor
71
39
54.9
13
18.3
实验结果－TNM
I(38) II(46) III(87) IV(21)
B A B A B A B A
0
20 40 60 80 100
5-year survival(%) median time
N
TNM(n) Type N Median time 5-year survival(%)
中国依然是胃癌大国
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
2019年世界新发癌症病例
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
Cytoplasmatic
材料一（cohort1）
Characteristics Age, years Sex Differentiation
Type
T stage
Mean Male Female Well Moderate Poor Adenocarcinoma Mucinous Undifferentiated Ring-cell T1 T2 T3 T4
59.5(27-81) 134 58 32 89 71 168 13 6 5 38 46 87 21
Guanzhen Yu, Ying Chen, Xi Wang, Jun Pan, Jiejun Wang. Tissue microarray analysis reveals strong clinical evidence for a close association between loss of annexin A1 expression and nodal metastasis in gastric cancer. Clin Exp Metastasis, 2019, Epub.
团块>巢状>弥漫
腺癌>未分化癌
高/中>低/未
NO > YES
胃体>其他
NO > YES
＞6cm < ≤6cm
Clinicopathological factor Age > 60 years ≤ 60 years Tumor size > 6 cm ≤ 6 cm LN metastasis N0 N1-3 Differentiation High/ Medium Low/undifferentiated Anemia Yes No TNM stage I II III IV
Differentiation
I(32) II(89) III(71)
B A B A B A
0 20 40 60 80 100
5-year survival(%) median time
N
Differentiation type N median time 5-year survival(%)
I(32) -/-/+
II
46
12
26.1
15
32.6
III
87
Байду номын сангаас51
58.6
18
20.7
IV
21
17
81.0
0
0.0
基因表型与分化关系
100
80 百 60 分 比 40
20
0
well
moderate
poor
Differentiation
type B type A
n
type B
%
type A
%
well
32
3
9.4
23
71.9
55.7(27-80) 43 28 1 31 39 52 11 4 4 2 14 37 18
1.Guan-Zhen Y, Ying C, Can-Rong N, Guo-Dong W, Jian-Xin Q, Jie-Jun W. Reduced protein expression of metastasis-related genes (nm23, KISS1, KAI1 and p53) in lymph node and liver metastases of gastric cancer. Int J Exp Pathol. 2019 Jun; 88(3):175-83.
统计学方法
1、数据包：SPSS11.0 2、组内变量：卡方检验 3、组间变量：Pearson or Spearman 4、生存分析：Cox regression 5、生存曲线：Kaplan-Meier 6、统计学差异：P<0.05
结果1
实验结果－阳性判定
p53 VEGF mTOR
PCNA Grb2
材料二（cohort2）
Characteristics Age, years Sex Differentiation
Type
TNM stage
Mean Male Female Well Moderate Poor Adenocarcinoma Mucinous Ring-like Ring-cell I II III IV
5年生存以上胃癌患者的基因表达谱
胃癌的分布
胃癌（Gastric Cancer）是人类最常见的恶性 肿瘤之一，其发病具有明显的地域性，以东亚（朝 鲜半岛、日本、中国）、中亚、南美地区等地区高 发。而北美、西欧、北欧等地区胃癌比较少见。
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
研究背景—机遇和挑战
中国依然是胃癌大国，胃癌 的危害依然严重。
影响胃癌预后的三大因素
临床因素
病理因素
遗传学因素
前期的工作积累
＞60 vs ≤60
初诊年龄
根治 vs 姑息 手术方式
临临床床因因素素
切缘残留 R0 vs R1
YES vs NO 术中输血
贫血 YES vs NO
GH>PH>SH T1>T2>T3>T4 NO > YES
• 方法：组织芯片结合免疫组化 • 结果判定：二级计分法
Antibody HER2 EGFR VEGF P53 PCNA GRB2 mTOR p-mTOR ANXA1
分子指标及其特点
Clone clone SP3 clone 111.6 clone SP28 DO-7 XXX clone Y237 clone Y391 cloneYY Rb-10659
实验结果（cohort2）
p-mTOR/VEGF/ANXA1
实验结果－空间分布
p-mTOR/VEGF/ANXA1
实验结果－直方图（5年生存率）
生存率
100
100 93.3
90
80
80
70
60
56
50
40
30
20
10
3.6 1.2
0
+/+/-
-/-/+
p-mTOR/VEGF/ANXA1
1 year 3 year 5 year
+/+/-(type B) -/-/+(type A)
Total
% 59.4 46.5 64.5
Abcam, Cambridge, MA 1:50
CST
1:100
Lab Vision, Fremont, CA 1:25
Staining stype Membrane
Membrane
Cytoplasmatic
Nuclear Nuclear Cytoplasmatic
Cytoplasmatic
Cytoplasmatic or Membrane
lo w /u n d iffer en tiated
lo w /u n d iffer en tiated - c en so r ed
medium
med iu m- c en so r ed
high
h ig h - c en so r ed
20
40
60
80
Cum Survival
同一期别、同一类型、同一分化、同一
Company Lab Vision, Fremont, CA
Dilution 1:100
Lab Vision, Fremont, CA 1:100
Lab Vision, Fremont, CA 1:100
DAKO, Denmark DAKO, Denmark
1:200 1:150
Abcam, Cambridge, MA 1:100
状态的病人预后存在显著差异
hypothesis
遗传学因素?
现状
预后相关的分子生物学指标 ➢癌基因和抑癌基因:P53, PCNA, ING1, APC, DCC,
EGFR, MET, KRAS, HER2, Survinin, Cyclin, VEGF, bFGF, DNA错配修复基因, p16等
前期工作
Univariate analysis
n
χ2
P
Multivariate analysis
Wald
P
373
18.27
296
< 0.0001
9.957
0.002
519
24.99
150
< 0.0001
0.300
0.584
233
188.42
436
< 0.0001
17.419
0.001
396
30.25
2019年世界癌症死亡病例
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
2019年中国癌症死亡病例
GLOBOCAN 2019. IARC CancerBase No.5, V 2.0. IARCPress, Lyon, 2019.
N +/+/-(type B) -/-/+(type A)
1 year 84 60
3 year
5 year
47
3
1
60
56
48
基因表型与TNM关系
100
80
百 60 分 比 40
20
0
I
II
III
IV
TNM分期
type B type A
TNM
n
type B
%
type A
%
I
38
4
10.5
27
71.1
p53 PCNA
5 year survival increase of overall survival
VEGF/p-mTOR/ANXA1呈现规律性的分布
实验结果－Cox regression
Cox regression
独立预后因素
TNM Differentiation
p-mTOR ANXA1 VEGF
+/+/23 62.8 91.3
II(89)
III(71)
-/-/+
+/+/-
-/-/+
+/+/-
3
24
42
13
40
6.2
57.2
14.8
53.9
17.5
0
95.8
2.4
92
2.5
讨论
靶目标的表达 率或缺失率均 在50%左右
基因表型A和B 占总数的75%
Gene VEGF positive p-mTOR positive ANXA1 negative
I(38) -/-/+
27 62.7 100
+/+/4
22.7 0
II(46) -/-/+
15 58.9 100
+/+/12
11.3 0
III(87) -/-/+
18 54.8 77.8
+/+/51
18.1 2.0
IV(21) -/-/+
2 27.3
0
+/+/17 7.3 0
实验结果－Differentiation
➢转移相关基因：S100A4, SPARC, MTA, Rhoc, OPN,
CD44; nm23, CDH1, TIMPs, Mapsin, KAI1, KISS1
结论不一,矛盾重重,无既定标准
研究目的
• 优化组合影响胃癌预后的分子生物 学标志物
材料和方法
• 材料：第一组(建模)为2019－2000年71例 胃癌患者，用于初筛。 第二组（验证）为2019－2019年192例 胃癌患者，用于验证。
273
< 0.0001
12.714
0.002
250
13.84
419
0.0002
0.168
0.682
134
185.84
141
289
105
< 0.0001
13.034
0.011
Survival Functions
1.1
1.0
.9
.8
.7
.6
.5
.4
.3
-20
0
S URVIVAL
Differentiation
HER2 EGFR
p-mTOR
ANXA1
实验结果－cohort1的表达率
Gene
%
P53
55.1
PCNA
89.3
HER2
28.6
EGFR
19.0
VEGF
59.4
GRB2
48.0
mTOR
50.8
P-mTOR
46.5
ANXA1
35.5
实验结果－cohort1总的分布
GRB2
patients
HER2 EGFR mTOR p-mTOR VEGF ANXA1