人类白细胞抗原E基因全长序列测定及两个新等位基因的鉴定

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人类白细胞抗原E基因全长序列测定及两个新等位基因的鉴

何柳媚;王宋兴;徐筠娉
【期刊名称】《中国组织工程研究》
【年(卷),期】2017(021)025
【摘要】背景:人类白细胞抗原E是非经典的人类白细胞抗原I类分子,目前的多态性分析研究主要针对其第3外显子人类白细胞抗原E*01:01及人类白细胞抗原E*01:03进行区分,然而其全基因序列测定方法及新等位基因报道尚不多见。

目的:利用中国深圳地区无偿献血正常个体建立人类白细胞抗原E基因全长序列测序分型方法,鉴定人类白细胞抗原E基因全长序列新的等位基因。

方法:提取研究对象外周血DNA,根据IMGT/HLA数据库中公布的人类白细胞抗原E基因序列,在保守区设计全基因扩增及测序引物,利用高保真反应体系对人类白细胞抗原E全长序列进行扩增,随后测序、拼接、序列确认及基因定型。

结果与结论:①成功建立了人类白细胞抗原E的全基因扩增及测序分型方法,发现了两个人类白细胞抗原E新等位基因——人类白细胞抗原E*01:01:01:06与人类白细胞抗原E*01:01:01:07,获得了WHO人类白细胞抗原命名因子委员会的命名;②人类白细胞抗原E*01:01:01:06与其最接近的等位基因人类白细胞抗原E*01:01:01:01相比,突变位点在5’-启动子区的NT-26(G->T),人类白细胞抗原E*01:01:01:07与其最接近的等位基因人类白细胞抗原E*01:01:01:01相比,突变位点在3’-非翻译区的NT3345位(T->C);③结果提示,中国人群中人类白细胞抗原E全基因序列多态性数据有待填补,试验建立的方法为该项研究提供了关键的技术。

【总页数】7页(P4071-4077)
【作者】何柳媚;王宋兴;徐筠娉
【作者单位】[1]深圳市血液中心,深圳市组织配型与免疫遗传重点实验室,广东省深圳市518035
【正文语种】中文
【中图分类】R394.2
【相关文献】
1.人类白细胞抗原E基因全长序列测定及两个新等位基因的鉴定 [J], 何柳媚;王宋兴;徐筠娉
2.人类白细胞抗原新等位基因B*07:110的序列分析及确认 [J], 周月;李剑平;;;
3.汉族人群中新等位基因人类白细胞抗原-DPA101:11的鉴定 [J], 何柳媚;王大明;徐筠娉;邓志辉
4.汉族人群中新等位基因人类白细胞抗原-DPA1~*01:11的鉴定 [J], 何柳媚;王大明;徐筠娉;邓志辉;
5.新等位基因人类白细胞抗原B*15:133的鉴定及其原核表达 [J], 王琳;宋长兴;张志欣
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