16S rRNA基因在微生物生态学中的应用

16S rRNA基因在微生物生态学中的应用
刘驰;李家宝;芮俊鹏;安家兴;李香真
【期刊名称】《生态学报》
【年(卷),期】2015(35)9
【摘要】16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中.近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于
16SrRNA基因的研究使得微生物生态学得到了快速发展,然而使用16S rRNA基因作为分子标志物时也存在诸多问题,比如水平基因转移、多拷贝的异质性、基因扩增效率的差异、数据分析方法的选择等,这些问题影响了微生物群落组成和多样性分析时的准确性.对当前使用16S rRNA基因分析微生物群落组成和多样性的进展情况做一总结,重点讨论当前存在的主要问题以及各种分析方法的发展,尤其是与高通量测序技术有关的实验和数据处理问题.
【总页数】20页(P2769-2788)
【作者】刘驰;李家宝;芮俊鹏;安家兴;李香真
【作者单位】中国科学院环境与应用微生物重点实验室,成都610041;环境微生物四川省重点实验室,中国科学院成都生物研究所,成都610041;中国科学院大学,北京100049;中国科学院环境与应用微生物重点实验室,成都610041;环境微生物四川省重点实验室,中国科学院成都生物研究所,成都610041;中国科学院环境与应用微生物重点实验室,成都610041;环境微生物四川省重点实验室,中国科学院成都生物研究所,成都610041;中国科学院环境与应用微生物重点实验室,成都610041;环境
微生物四川省重点实验室,中国科学院成都生物研究所,成都610041;中国科学院环境与应用微生物重点实验室,成都610041;环境微生物四川省重点实验室,中国科学院成都生物研究所,成都610041
【正文语种】中文
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